PLoS ONE: MicroRNA Expression Profiili siittimen Cancer paljasti seuraavan sukupolven Small RNA Sequencing
tiivistelmä
Peniksen syöpä (PECA) on suhteellisen harvinainen kasvain kokonaisuus mutta hänellä suurempi sairastavuus ja kuolleisuus erityisesti kehitysmaissa. Tähän mennessä konkreettisia patogeeninen signalointireittejä ja core koneiden kasvaimien syntyyn liittyvien ja etenemisen Peca jäävät selvittämättä. Useat tutkimukset ehdotti miRNA, jotka moduloivat geeni ilmentymistä posttranskriptionaalisella tasolla, olivat usein mis-säänneltyjen ja poikkeuksellisesti ilmaistu ihmisen syövissä. Kuitenkin miRNA profiili ihmisen Peca ei ole raportoitu aikaisemmin. Tässä Tässä tutkimuksessa miRNA profiilin saatiin 10 tuoretta peniksen syöpäkudoksiin ja sovitettu viereisen ei-syöpä kudoksiin kautta seuraavan sukupolven sekvensointi. Tämän tuloksena yhteensä 751 ja 806 selityksin miRNA havaittiin normaalissa ja syöpä- peniksen kudosten, vastaavasti. Joista 56 miRNA huomattavasti eri ekspressiotasoja välillä pariksi kudokset tunnistettiin. Tämän jälkeen useat selityksin miRNA valittiin satunnaisesti ja vahvistetaan käyttämällä kvantitatiivista reaaliaikaista PCR. Verrattuna edelliseen julkaisuja koskien muuttuneisiin miRNA ilmentymistä erilaisissa syövissä ja erityisesti urogenitaalinen (eturauhasen, virtsarakon, munuaisten, kives) syövät, kaikkein suurin osa vapautetuilla miRNA osoitti samanlaisia ilmentämiskuviota siittimen syöpä. Lisäksi bioinformatiikan analyysissä todettiin, että oletetun kohdegeenien differentiaalisesti ilmaisi miRNA välillä syöpä- ja vastaaviin normaaleihin peniksen kudosten olivat tiukasti liittyy soluliitos, proliferaatio, kasvu sekä genomista epävakautta ja niin edelleen, moduloimalla Wnt, MAPK, p53, PI3K -Akt, Notch ja TGF-β signalointireitteihin, jotka kaikki vakiintuneet osallistua syövän taudin alkamisen ja etenemisen. Työmme esittelee yleiskuva differentiaalisesti ilmaisi miRNA ja mahdollisesti säätelyverkkoja niiden kohdegeenien selvittämiseksi patogeenisten muutosta normaalin peniksen Peca, jossa tutkimus resurssi tarjoaa myös uusia näkökulmia tuleviin tutkimuksiin selvitti syvällistä mekanismit miRNA ja muut pienet RNA: t, mukaan lukien piRNAs siittimen syövän synnyn sääntelyn ja tehokkaan kohdespesifiset theragnosis.
Citation: Zhang L, Wei P, Shen X, Zhang Y, Xu B, Zhou J, et al. (2015) MicroRNA Expression Profiili siittimen Cancer paljasti seuraavan sukupolven Small RNA Sequencing. PLoS ONE 10 (7): e0131336. doi: 10,1371 /journal.pone.0131336
Editor: Yu Xue, Huazhong tiede ja teknologia, Kiina
vastaanotettu: 10 helmikuu 2015; Hyväksytty: 1 kesäkuu 2015; Julkaistu: 09 heinäkuu 2015
Copyright: © 2015 Zhang et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään
Data Saatavuus: Kaikki raaka sekvensointi tiedostot ovat saatavilla ArrayExpress tietokannasta (hakunumero: E-MTAB-3087).
Rahoitus: Tätä työtä tuki National Natural Science Foundation of China (No.81401518, nro 31430028, http: //www.nsfc.gov.cn/) (LZ); National Natural Science Foundation of China (nro 81170698, No. 81370856, https://www.nsfc.gov.cn/) (CZL); National Natural Science Foundation of China (nro 31370983, https://www.nsfc.gov.cn/) (DHZ); Anhui Provincial Natural Science Foundation (No.1408085QH180, https://www.ahkjt.gov.cn/) (LZ), kliinisen Key aiheet ohjelma Ministry of Public Health of China (Urology, http: //www.nhfpc .gov.cn /) (CZL), viljelyn hanke NSFC klo Anhuin lääketieteellinen yliopisto (nro 2013KJ14, https://www.ayfy.com) (LZ) ja keskeinen hanke Kiinan opetusministeriö (No. 2