Krooninen sairaus

tiivistelmä

Johdanto

MikroRNA tärkeä rooli monissa ihmisen maligniteettien; toistaiseksi, niiden ilmaisua vielä tutkittu ylemmässä virtsateiden uroteelisyöpä (UUTUC).

Materiaalit ja menetelmät

Ilmaisu yksitoista MikroRNA (miR-10a, miR-21, asennuspalveli- 96, miR-135, miR-141, miR-182, miR-200b, miR-205, miR-429, miR-520b, miR-1244) aiemmin osoitettu olevan yliaktiivista urothelial virtsarakon syövän tutkittiin vastaavassa normaalissa ja syöpä- kudosnäytteet olevia potilaita nephroureterectomy varten UUTUC. Voimistunut MikroRNA Sitten mitattavissa seerumista sairastavien potilaiden UUTUC ja potilailla, joilla on ei-pahanlaatuinen urologiset sairaudet arvioida niiden potentiaalia ei-invasiivisia biomarkkereita UUTUC.

Tulokset

MicroRNA ilmaus sallitaan eriyttäminen normaali ja syöpäkudoksen: miR-21, miR-96, miR-135, miR-141, miR-182, miR-205, miR-429 ja miR-520b merkittävästi yliekspressoidaan. Lisäksi miR-205 oli yläreguloituja huonosti eriytetty UUTUC. Analyysi kiertävän RNA seerumissa osoitti kasvua miR-141 potilailla, joilla on UUTUC; vastaanotin operaattori ominaisuus analyysi osoittivat AUC on 0,726 Mir-141 diagnostisena biomarkkereiden. Lisäksi havaitsimme alhaisempi miR-10a ja miR-135 UUTUC potilailla.

Johtopäätökset

MicroRNA ilmentyminen muuttunut UUTUC. Analyysi verenkierrossa miR-141 voi olla hyödyllistä tunnistaa potilaat, joilla UUTUC.

Citation: Kriebel S, Schmidt D, Holdenrieder S, Goltz D, Kristiansen G, Moritz R, et ai. (2015) analyysi Tissue ja Serum MicroRNA Expression potilailla, joilla Ylä virtsateiden uroteelisyöpä. PLoS ONE 10 (1): e0117284. doi: 10,1371 /journal.pone.0117284

Academic Editor: Georgios Gakis, Eberhard-Karls University, SAKSA

vastaanotettu: 13 huhtikuu 2014; Hyväksytty: 20 joulukuu 2014; Julkaistu: 28 tammikuu 2015

Copyright: © 2015 Kriebel et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään

Data Saatavuus: kaikki asiaankuuluvat tiedot kuuluvat paperin ja sen tukeminen Information tiedostoja.

Rahoitus: kokoelma seerumin ja kudoksen näytteitä Universitätsklinikum Bonn suoritettiin puitteissa biopankin aloitteen Centrum für integrierte Onkologie (CIO) Köln Bonn ( https://www.cio-koelnbonn.de/mediziner/biobank/), joka tukee taloudellisesti Deutsche Krebshilfe. Rahoittaja ei ollut roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

urothelial carcinoma on yksi yleisimmistä ihmisen maligniteettien [1]; noin 5-10% näistä urothelial karsinoomien sijaitsevat ylemmässä virtsateiden (UUTUC, pyelocaliceal onteloita ja virtsanjohdin). Vaikka etiologia UUTUC ja virtsarakon syöpä on samanlainen, luonnollinen historia UUTUC eroaa virtsarakon syövän: UUTUC ovat usein invasiivisia diagnoosin, ja siten ennuste on huonompi. Useat ennustetekijöitä (eli vaihe, laatu, imusolmuke invaasio, lymphovascular invaasio, kasvaimen sijainti) on tunnistettu [2]. Silti ennustaminen kliinistä kulkua tietyn potilaan on edelleen vaikeaa, koska kaikki edellä mainitut tekijät voidaan määrittää ainoastaan ​​leikkauksesta. Tunnistaminen preoperative merkki, eli seerumi biomarkkereiden, olisi hyödyllistä, jotta paremmin riski kerrostumista [3].

MikroRNA ovat pieniä, ei-koodaavan RNA-molekyylejä, jotka muuttavat ilmentymistä monista ihmisen geenien ja siten säätelevät tärkeitä solun toimintoja, kuten solusykliä, kehittäminen, apoptoosin ja erilaistumisen [4]. Expression profilointi tutkimukset osoittivat kasvainspesifisiä microRNA ilme. Tuore tutkimus osoitti eri microRNA ekspressioprofiileja normaalissa munuaisten kudoksessa, UUTUC ja munuaissolukarsinooma kuitenkaan UUTUC ei verrattu normaaliin urothelial kudokseen [5]. Kun otetaan huomioon yhtäläisyyksiä UUTUC ja uroteelisyöpä virtsarakon, on todennäköistä, että microRNA ekspressio on vastaavasti muutettu. MikroRNA ovat havaittavissa eri kehon nesteissä, kuten seerumissa [6]. Vakaus vastaan ​​hajoamista RNaaseista ja ulkoiset tekijät (pH-muutos, varastointi, jäädytys /sulatus) täyttää kiertävän MikroRNA kuin ei-invasiivisia biomarkkerit [7,8]. Tämän seurauksena, seerumin MikroRNA on tutkittu monissa maligniteettien (esim virtsarakon syöpä [9], munuaissyöpä [10], eturauhassyöpä [11], kivessyöpä [12]).

Tutkiakseen rooli MikroRNA ei-invasiivisia biomarkkerit potilailla, joilla UUTUC, ilmaus yksitoista MikroRNA (miR-10a, miR-21, miR-96, miR-135, miR-141, miR-182, miR-200b, miR-205 , miR-429, miR-520b, miR-1244) aikaisemmin osoitettu olevan yliaktiivista uroteelisyöpä virtsarakon [13-20], analysoitiin [11] vastaavassa normaalissa virtsanjohdin ja UUTUC kudosta. Sitten tutkimme seerumin Näissä kohde MikroRNA korkein ylösajon potilailla, joilla UUTUC ja potilailla, joilla on ei-pahanlaatuinen urologiset sairaudet, tutkia niiden diagnostista /prognostista potentiaalia.

Materiaalit ja menetelmät

2.1. Näytteiden kerääminen

Kirjallinen suostumus saatiin kunkin yksittäisen ja tutkimuksen hyväksyi paikallinen eettinen komitea (hyväksynnän numero: 036/08 ja 049/13). Näytteiden kerääminen oli johdetaan 2005-2012 (kudosta) ja 2008-2013 (seerumi). Kliiniset-patologinen parametrit tutkimuskohortissa esitetään taulukossa 1.

2.2. Kudosnäytteet

MicroRNA tasot syöpä- kudosnäytteitä 47 potilaalla, joille nephroureterectomy laitoksella urologian yliopistollisessa sairaalassa Bonnin tutkittiin. Histologisesti normaalissa virtsanjohtimen kudos oli saatavilla 36 näistä potilaista. Näytteet kiinnitettiin formaliiniin, upotetaan parafiini ja arkistoitu Institute of Pathology yliopistollisessa sairaalassa Bonn.

Käyttäen mikrotomin, 5-10 kohdissa (20 gm) tuotettiin kustakin parafiiniblokkiin. Leikkeet upotettiin lämpimän veden ja asetettiin mikroskoopin. Kun oli kuivattu 24 tuntia, näytteet poistettiin parafiini käyttäen ksyleenissä ja laimennoksen etanolia. Pohjalta hematoksyliinillä-eosiini värjättyä kohdat, joihin kasvain ja normaali kudos oli merkitty etukäteen, makro-leikkely tehtiin, erottelevat kasvain ja vieressä normaali urothelial kudosnäytteistä ( 1 cm välein).

kokonais-RNA uutettiin sitten käyttäen RECOVERALL- yhteensä Nucleic Acid Isolation Kit (Life Technologies, Carlsbad, CA, USA) valmistajan suosittelemia. Lopullinen eluutiotilavuus oli 50 ui. Määrä ja puhtaus RNA määritettiin käyttäen NanoDrop 2000 spektrofotometrillä (PeqLab, Erlangen, Saksa). Käänteiskopiointi suoritettiin käyttäen miScript II RT Kit (Qiagen, Hilden, Saksa) mukaan valmistajan ohjeiden 400 ng RNA: ta (laimennettu kokonaistilavuudessa 12 ui). cDNA laimennettiin lopuksi konsentraatiossa 5 ng /ul in HiSpec-puskuri.

2,3. Seeruminäytteet

takautuvasti kerättyjä verinäytteitä urologinen osastojen yliopistollisen sairaalan Bonn (n = 10) ja Münster (n = 34). Seeruminäytteet hoidetaan suurimmalta osin vakiomenetelmät biopankin aloitteita. Kontrollina ikä Hyväksytty kohortin 34 yksilöiden ei-pahanlaatuisia sairauksia (hyvänlaatuinen eturauhasen liikakasvu, virtsaputken kurouma, inkontinenssi, virtsan kivet) joille tehdään pieniä urologisissa toimintaan käytettiin. Laskimoverta otettiin Seerumin S-Monovette Gel putket hyytymiseen aktivaattori (Sarstedt, Nümbrecht, Saksa) ennen leikkausta. Sen jälkeen, kun vähintään 60 minuuttia, hyytynyt seerumi sentrifugoitiin (10 min, 2500 g), erotettiin ja tallennetaan kryoputkiin -80 ° C: ssa käyttöön asti.

Kokonais-RNA eristettiin 400 ui seerumista käyttäen Mirvana PARIS Kit (Life Technologies, Carlsbad, CA, USA), lisäämisen jälkeen 25 fmol synteettisen miRNA cel-miR-39 (Qiagen, Hilden, Saksa), joka sallii määrällisesti RNA: n eristys tehokkuutta. Uutto suoritettiin seuraten valmistajan antamat protokollaa. Lopullinen eluutiotilavuus oli 50 ui. Käänteistranskriptio tehtiin käyttäen miScript II RT Kit (Qiagen, Hilden, Saksa). Ennen reaaliaikaisen PCR, joka on esivahvistus tehtiin, jotta saataisiin riittävästi materiaalia (miScript preamp PCR Kit, Qiagen, Hilden, Saksa), koska alustavat testit osoittivat, että seerumin microRNA tasot olivat liian alhaiset suoraan kvantifiointiin. Esivahvistus tehtiin mukaan Valmistajan protokollaa käyttäen seuraavia sykliolosuhteita: Initial aktivointi vaihe (95 ° C, 15 minuuttia), 2-vaihe pyöräily (denaturaatio 94 ° C: ssa 30 sekuntia, pariutuminen ja pidennys 60 ° C: ssa 3 minuuttia) 12 kierrosta.

2.4. Kvantitatiivisen tosiaikaisen PCR

Kaikki PCR-kokeet suoritettiin kolmena rinnakkaisena 10 ul kutakin koskevasta ABIPrism 7900HT (Life Technologies, Carlsbad, CA, USA) 384 kuoppalevyillä käyttäen miScript SYBR Green PCR Kit (Qiagen, Hilden, Saksa). Kaikki PCR-alukkeet ostettiin Qiagen. Jokainen ajaa sisältyi solulinja RT112 positiivisena kontrollina sekä vettä, ei-RT, TE-puskuria ja genomista DNA negatiiviset (esivahvistetaan seerumin PCR-ajoa). Sarjalaimennokselle RT112 pystyimme mitata PCR-monistuksen tehokkuus kunkin PCR-ajon. PCR suoritettiin seuraavan protokollan: 1.Hot Start (95 ° C, 15 minuuttia), 2.Denaturation (94 ° C, 15 sekuntia), 3.Annealing (55 ° C, 30 sekuntia), 4.Extension (70 ° C, 30 sekuntia). Jokainen ajaa koostui 40 sykliä vaihe 2 4 Sulamiskäyräanalyysi vahvisti spesifisyys PCR-tuotteiden. MicroRNA tasot näytteissä on Cq-arvot 35 katsottiin nollaksi; harha kanssa Cq eroa kolmen rinnakkaisen 1 jätettiin pois. PCR Aineisto analysoitiin SDS Suhteellinen kvantifiointitietokoneohjelmaa v2.4 (Life Technologies, Carlsbad, CA, USA) ja Qbase + v2.5 (Biogazelle, Zwijnaarde, Belgia). Yksittäiset microRNA ekspressiotietojen annetaan S1 taulukossa (kudosten tutkimus) ja S2 Table (seerumin tutkimus).

MicroRNA ilmentymistä kudoksessa normalisoitui vastaan ​​RNU1-4, SNORD43 ja SNORD48. MicroRNA ilmentyminen seerumissa normalisoitui vastaan ​​RNU1-4 ja SNORD43, koska SNORD48 ei luotettavasti mitata seerumista. Soveltuvuus näiden RNA: iden referenssinä geeni osoitettiin aiemmin [21].

2.5. Tilastollinen analyysi

Mann-Whitneyn-U-testiä ja Kruskal-Wallisin testiä käytettiin arvioimaan eroja syöpäpotilaiden ja terveiden verrokkien ja liittää microRNA ilmaisutapoja kliinisiä-patologinen parametrit tarvittaessa. Vastaanotin Operator Curve (ROC) analyysit suoritettiin määrittämiseksi herkkyys ja spesifisyys MikroRNA diagnostisia biomarkkereita; Youdenin indeksiä käytettiin tunnistamaan optimaaliset kynnys. Tilastollinen merkittävyys päätökseen p 0,05, ja Bonferronin korjausta useille hypoteesin testaus suoritettiin (kudos kokeita p 0,0045, seerumin kokeita p 0,0063). Valvomatta kaksisuuntainen hierarkkinen klusterin analyysi euklidinen etäisyys suoritettiin luokitella kasvain ja normaali urothelial kudosnäytteistä. Tilastolliset analyysit tehtiin SPSS tilastot v21 (IBM, Chicago, Illinois, USA).

Tulokset

3.1 Analyysi mikroRNA ilmaisun ylemmässä virtsateiden uroteelisyöpä kudoksen

MicroRNA ilmaisu ei ole tutkittu UUTUC kudoksessa toistaiseksi. Meillä on siis määritelty ilmaisu yhdentoista MikroRNA aiemmin osoitettu yliekspressoituvan urothelial virtsarakon syövän 47 UUTUC kudosnäytteistä ja 36 vastaavien näytteiden histologisesti normaalin ureters. Havaitsimme merkittävän yli-ilmentymisen miR-21, miR-96, miR-135, miR-141, miR-182, miR-205, miR-429, miR-520b (kaikki p 0,001) UUTUC; MikroRNA miR-10a (p = 0,012) ja miR-200B (p = 0,006) osoitti selvä suuntaus voimistumista, kun taas miR-1244 (p = 0,600) oli samankaltainen normaaleilla ja pahanlaatuinen kudos. miR-205 (p = 0,002) oli yliaktiivista eriytymättömissä UUTUC (G3 vs. G2 /G1). Katso kuva. 1.

log2-kertamuutosta käytettiin rakentaa heatmap joka osoittaa, että microRNA ilmaus profilointi mahdollistaa erilaistumisen normaalin virtsanjohdin ja urothelial karsinooma kudosta. Näytteet normaalista urothelial kudoksesta koodataan ”N”, syöpä näytteiden ”T”. Boxplot kaaviot osoittavat suhteellisia tasoja kullekin kohteena mikroRNA.

3.2 Analyysi kiertävän seerumin MikroRNA Ylä virtsateiden syöpäpotilailla

Seuraava tutkittu seerumin ehdokkaan MikroRNA havaitut kudos profilointi: potilaiden seeruminäytteistä kanssa UUTUC (n = 44) verrattuna potilaisiin, joilla ei-pahanlaatuisia urologiset sairaudet (n = 34) hoidettiin kaksi kolmannen asian klinikoilla tutkittiin. MicroRNA ekspressiotasot seerumin näkyvät kuvassa. 2. miR-141 oli verenkierrossa olevan huomattavasti korkeampi (p 0,001) seerumissa UUTUC potilailla kuin verrokeilla (keskiarvo 1,30 vs. 0,69). ROC-analyysi osoitti AUC 0,726 (95%: n luottamusväli 0,609-0,843) Mir-141 diagnostisia biomarkkerina; ks. 3 ja taulukko 2. miR-200b (p = 0,041), miR-205 (p = 0,008), miR-425 (p = 0,025), miR-96 (0,013) oli suuntaus kohti korkeampia tasoja syöpäpotilailla, mutta p-arvo oli 0,0065 joka määriteltiin merkitsevyystasolla korjauksen jälkeen useiden hypoteesin testaukseen. miR-182 (p = 0,083), miR-21 (p = 0,532) ja miR-135 (p = 0,261) olivat samankaltaisia ​​UUTUC potilaiden ja verrokkien.

Mann-Whitney-U-testiä käytettiin arvioida eroja ryhmien.

Sitten me korreloivat seerumin microRNA tasoilla kliinisiä-patologinen parametreja. Seerumin miR-10a (p = 0,003) aleni lihas-invasiivisia UUTUC (PTA /pT1: 1.79 vs. pT2-4: 0,79). miR-135 osoitti myös suuntaus kohti alempia syöpäpotilailla lihasten-invasiivisen kasvaimet (2,18 vs. 0,96; p = 0,040). Emme havainneet korrelaatiota iän, sukupuolen, etäpesäke tai luokittelu (kaikki p 0,05) ja kiertävän microRNA tasolla.

Keskustelu

Kiinnostus microRNA kasvanut räjähdysmäisesti viime vuosina, ja kudosten ja kasvain-erityisiä ekspressioprofiileja on ominaista. Koska yhtäläisyyksiä uroteelisyöpä virtsarakon ja ylemmän virtsateiden, teimme kirjallisuudesta tunnistaa joukko säädeltyyn MikroRNA virtsarakon syöpään [13-19], joka ovat kiinnostavia ilmentymisen profiloinnin UUTUC kudos- ja seeruminäytteistä. Aivan hiljattain, kudos microRNA ilmaisun profiileja UUTUC on julkaistu [5,22]: kuitenkin, määrä UUTUC näytteitä (n = 5) oli hyvin pieni eikä verrattuna normaaliin urothelial kudokseen [5], tai tutkimus oli rajoitettu pahanlaatuinen näytteitä [22].

ensin, että MikroRNA ekspressioprofiileja sallittu erottavien syöpä- ja normaali virtsanjohdin /munuaisaltaan näytteitä suurella tarkkuudella. Varsinkin miR-21, miR-96, miR-135, miR-141, miR-182, miR-205, miR-429 ja miR-520b oli selvästi yli-ilmennetään UUTUC. Kiinnostavaa kyllä, tämä osittain päällekkäinen microRNA ilme profiilin aiemmin perustettu Eturauhassyöpätutkimuksessa, jossa miR-205, miR-96 ja miR-182 havaittiin juuri säädetä [23]. Voisimme myös vahvistaa samankaltainen molekyyli syövän synnyn of uroteelisyöpä virtsarakon ja ylemmän virtsateiden niin ylösajon paljon MikroRNA aikaisemmin tunnistettu oncomirs virtsarakon syöpään havaittiin myös UUTUC [13-19]. Äskettäin Zaravinos et ai. [20] tutki microRNA ilmentymistä normaalissa munuaisten kudosten ja munuaisten kasvaimet (munuaissolukarsinooma ja UUTUC): 21 MikroRNA varta vapautettiin UUTUC (5 MikroRNA voimistunut ja 16 MikroRNA vaimentua-the UUTUC profiilin erosi meidän tavoite MikroRNA); miR-10a, miR-200b ja miR-205 oli säädelty verrattuna munuaiskudoksen. On huomattava, että puute normaalin urothelial kudoksen tarvittaessa ohjaus rajoittaa informatiivinen arvo (uroteeliin erityinen ilmaus, ei valvota) [20].

vieressä tutkittiin seerumin nämä MikroRNA on kahden keskus -cohort potilailla, joilla on UUTUC ja ei-pahanlaatuisia tauteja. Havaitsimme merkittävää lisäystä miR-141 UUTUC potilaat: keskimääräinen taso oli lähes kaksi kertaa niin korkea verrattuna kontrolleihin; useat muut ehdokkaat (miR-200b miR-205, miR-425 ja miR-96) osoitti myös lisääntymässä tasoa UUTUC potilailla. ROC-analyysit osoittivat, että miR-141 sallittu erottaa UUTUC potilaiden ja verrokkien kanssa AUC 0,726 (herkkyys 71% ja spesifisyys 74%), mikä osoittaa, että liikkeessä miR-141 on sopiva diagnostinen biomarkkereiden. Parhaan tietomme mukaan tämä on ensimmäinen kuvaus nukleiinihapon biomarkkereiden veren potilaiden kanssa UUTUC. Aiemmassa tutkimuksessa potilailla, joilla urothelial virtsarakon syöpä, merkittävää lisäystä miR-141 seerumissa syöpäpotilaita ei havaittu, vaikka suuntaus korkeamman miR-141 tasot verrattuna hallita aiheita voitiin nähdä [9]. Stage ja laatu voisi selittää tämän eron: korkea seerumin miR-141 tasot havaittiin monissa tutkimuksissa edennyt pitkälle [24,25] tai potilailla, joiden tauti uusiutui leikkauksen jälkeen [25-27]; kuitenkin, miR-141 ei yhdistellä mihinkään ennustetekijöiden parametrin meidän tutkimus UUTUC. Havainto on lisääntynyt virtsan miR-141 tasot virtsarakon syöpäpotilailla kannattaa miR-141 diagnostiikkatyökaluna [28]. On huomattava, että kiertävän miR-141-tasot kohoavat useita kasvaimen yksiköt mukaan lukien eturauhassyöpä [25], paksusuolen syöpä [29] ja kohdunkaulan syöpä [30]. Yli-miR-141 on mukana KEAP1 sääntelemättömien sisplatiini kestävyys [31], ja näin miR-141 mittausten voisi olla avuksi seurannassa olevia potilaita sisplatiinin kemoterapiaa metastasoineeseen UUTUC. TarBase 6.0 [32], tietokanta, jossa kokeellisesti validoitu microRNA-geenin vuorovaikutusta, osoittaa, että miR-141 säätelee eri geenit (esim PTEN [33], ERBB2IP [34], HOXB5 [34], E2F3 [33], sykliini D1 [33]) mukana urothelial karsinogeneesissä (tietokantakyselyn: 06.03.2014).

miR-205 kudos tasot olivat myös korreloivat erilaistumattoman UUTUC, ja miR-10a ja miR-135 laskivat seerumin potilailla, joilla on lihas-invasiivisen UUTUC. Kasvaimen ja vaihe yleensä korreloi uroteelisyöpä, ja siten voisi odottaa merkittäviä korrelaatioita kanssa vaiheessa (miR-205) tai luokan (miR-10a, miR-135), tässä järjestyksessä. Useat selitykset ovat mahdollisia:

(i)

tiettyjä biologisia prosesseja aiheuttaa microRNA muutoksia myöhemmissä vaiheissa syövän synnyn; (

ii

) kolme (kymmenestä) potilailla, joilla on ei-lihas- invasiivisen sairauden oli G3 kasvaimia, ja siten rajoittaa korrelaatio vaiheessa ja luokka; ja (

iii

) toteaminen sattumalta ei voida sulkea pois. Siten analyysi MikroRNA voisi olla hyötyä prognoositarkoituksessa, vaikka tulevissa tutkimuksissa on vahvistettava tuloksemme. Varsinkin miR-205 [35] ja miR-10a [36] liittyivät elinaika potilailla, joilla on virtsarakon syöpä. Tuore raportti Izquierdo et al. osoittaa, että miR-149 tasot kasvainkudoksessa ennustavat syöpäspesifisessä selviytymisen potilailla, joilla UUTUC [22]; analyysi tämän mikroRNA seerumissa tulevassa tutkimuksessa olisi kiinnostava. Kuitenkin miR-149 ei ollut havaittavissa seerumissa ei ole potilaan eturauhasen syöpä eikä terveessä kohteessa, vaikka esivahvistus vaiheessa käytettiin mukaisesti Mitchell et ai. [37], todetaan, että miR-149 pitoisuuksia veressä näytteet saattavat olla liian alhainen havaita.

A novel biomarkkereiden on todistettava itseään vastaan ​​perustettu markkereita; virtsan sytologian potilailla kärsii huonosta herkkyydestä [38], myös potilailla, joilla on korkea laatu UUTUC. Sisällyttäminen conjunctive markkereita (BTA stat testi [39] tai FISH [40]) lähestyy voi lisätä diagnostisen tiedon merkittävästi, mutta matala-asteista syöpä on edelleen vaikea havaita. Suorituskyky seerumin miR-141 näyttää olevan hieman pienempi kuin virtsan merkkiaineita (herkkyys 71%, spesifisyys 74%), mutta samanlaisia ​​havaitseminen hinnat lihasten-invasiivisia ja ei-lihas- invasiivisia UUTUC perustella tulevan tutkimuksen tutkia sen arvoa.

Joitakin rajoituksia olisi tunnustettava: vertasimme microRNA ilmaisun syöpä- ja viereiseen normaaliin kudokseen. Vaikka normaali kudos oli histologisesti normaali ja joka sijaitsee vähintään 1 cm: n etäisyydellä kasvain, niin kutsuttu ”field effect” voi aiheuttaa molekyylipainon muutoksia tämän valvonnan kudoksessa. Kuitenkin vertailun pahanlaatuisen ja normaalin kudoksen samasta potilaiden minimoi vaikutuksen yksilöiden välisiä mikroRNA ilmentymisen eroja. Otoskoko tutkimuksessamme oli vain kohtalainen (47 syöpä vs. 36 normaaleista kudoksista, ja 44 UUTUC vs. 34 kontrolliseerumin näytettä), mutta suhteellinen harvinaisuus UUTUC verrattuna virtsarakon syöpä tai munuaissyöpä tehdä analyysin suuret ikäluokat vaikeaa .

Johtopäätökset

MicroRNA ilmaisua väärin säädellystä in UUTUC kudoksessa; nämä muutokset johtavat muuttunut microRNA profiileja potilaiden liikkeessä. Havaitseminen lisääntynyt miR-141 tasot voidaan tunnistaa potilaat, joilla UUTUC; jos tulevaisuudessa tutkimukset vahvistavat tämän havainnon, mittaamalla seerumin MikroRNA avulla lääkärit hallita näitä potilaita.

tukeminen Information

S1 Taulukko. Yhteenveto kudoksen mikroRNA ekspressiotasoja potilailla, joilla on ylempi virtsatietulehdusten uroteelisyöpä.

Doi: 10,1371 /journal.pone.0117284.s001

(XLSX)

S2 Taulukko. Yhteenveto seerumin mikroRNA ekspressiotasoja potilailla, joilla on ylempi virtsatietulehdusten uroteelisyöpä.

Doi: 10,1371 /journal.pone.0117284.s002

(XLSX) B

Kiitokset

Kiitos Jennifer Bräunig kriittisiin käsikirjoitusta lukiessaan.