Krooninen sairaus

tiivistelmä

Background

Poly (ADP-riboosi) polymeraasi-1 (PARP-1) näyttelee kriittistä roolit havaitsemiseen ja korjaamiseen vahingoittuneet DNA, sekä solujen lisääntymisen ja kuolema. Lukuisat tutkimukset ovat tutkineet assosiaatiot

PARP1

Val762Ala (rs1136410 T C) polymorfismi ja syöpäalttiutta; Tuloksista ilmeni kuitenkin eri tutkimusryhmää pysyvät kiistelty.

Methods

etsittiin kirjallisuudesta peräisin MEDLINE-, EMBASE ja CBM liittyvät tällaiseen liittoon, ja sitten lasketaan yhdistettiin kerroinsuhde (OR) ja 95% luottamusväli (CI) käyttämällä random-vaikutus malli. Väärien positiivisten raportin todennäköisyys (FPRP) analyysiä käytettiin päteviksi merkittäviä havaintoja. Lisäksi mahdolliset vaikutukset rs1136410 varianttien on

PARP1

mRNA ilmaisun analysoitiin kolme etniseltä yhdistelemällä tietoja HapMap (genotyyppi) ja SNPexp (mRNA: n ilmentymisen).

Tulokset

lopullinen meta-analyysi sisällytetty 43 tutkimuksia, jotka koostuvat 17351 tapauksia ja 22401 valvontaa. Kaiken kaikkiaan tuloksemme eivät viittaa merkittäviä assosiaatioita Ala variantin (Ala /Ala tai Ala /Vai genotyyppi) ja syöpäriskiä. Kuitenkin edelleen kerrostuneisuus analyysi osoitti merkitsevästi suurentunut riski mahasyövän (Ala /Ala vs. Val /Val: OR = 1,56, 95% CI = 1,01-2,42, Ala /Val vs. Val /Val: OR = 1,34, 95% CI = 1,14-1,58, hallitseva malli: OR = 1,41, 95% CI = 1,21-1,65 ja Ala vs. Val: OR = 1,29, 95% CI = 1,07-1,55). Päinvastoin, laski riskiä aivokasvain (Ala /Val vs. Val /Val: OR = 0,77, 95% CI = +0,68-+0,87, hallitseva malli: OR = 0,77, 95% CI = +0,68-+0,87 ja Ala vs. Val : OR = 0,82, 95% CI = 0,74-0,91). Lisäksi huomasimme, että Ala harjoittajat oli merkittävästi lisääntynyt riski kaikissa malleissa aasialaiset. Meidän mRNA ilmaisu tietojen lisäksi biologisia todisteita vahvistaa tätä päätelmää.

Johtopäätökset

huolimatta joitakin rajoituksia, tämä meta-analyysissä havaittiin näyttöä yhdistyksen välillä

PAPR1

Val762Ala ja syöpäalttiutta kuluessa mahasyövän, aivokasvain ja Aasian alaryhmien.

Citation: Hua RX, Li HP, Liang YB, Zhu JH, Zhang B, Ye S, et al. (2014) välisestä assosiaatiosta

PARP1

Val762Ala polymorfismi ja syöpäriski: Evidence from 43 Studies. PLoS ONE 9 (1): e87057. doi: 10,1371 /journal.pone.0087057

Editor: Balraj Mittal, Sanjay Gandhi Medical Institute, Intia

vastaanotettu: 24 lokakuu 2013; Hyväksytty: 18 joulukuu 2013; Julkaistu: 28 tammikuu 2014

Copyright: © 2014 Hua et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä tutkimus tukivat avustuksia tieteen ja teknologian hankkeita Foundation Guangdong (nro 2012B031800501) ja Natural Science Foundation of Guangdong (nro S2012010008827 ja nro S2011010005282). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

maailmanlaajuinen syövän aiheuttamaa rasitetta nousee jatkuvasti, lähinnä ikääntymisestä ja kasvu väestön kaikkialla maailmassa, syöpää aiheuttavia käyttäytymistä, kuten tupakointi ja juominen, sekä ympäristön saastumisen. Tämän seurauksena syöpä on tunnustettu yhdeksi johtavista kuolinsyy maailmanlaajuisesti nyt. Mukaan arvion GLOBOCAN, noin 12,7 miljoonaa uutta tapausta ja 7,6 miljoonaa kuolemantapausta syövän oli tapahtunut vuonna 2008. On huomionarvoista, että noin 56% uusista tapauksista ja 63% kuolemista tapahtui taloudellisesti kehitysmaissa [1]. Syöpä selviytymisen yleensä huonompi kehitysmaissa kuin kehittyneissä maissa, todennäköisesti johtuu myöhään diagnoosin yhdistettynä rajoitettu pääsy ajoissa ja tavanomaista hoitoa. Syövän aiheuttamaa rasitetta voidaan suurelta osin vähentynyt soveltamalla varhaisen havaitsemisen ja hoidon, tupakoinnin, rokotuksen, terveellisempiä ravinnon saanti ja niin edelleen [2]. Syöpä voi aloittaa DNA-vaurioita aiheuttama altistuminen erilaisille ympäristötekijöille, kuten UV, ionisoiva säteily, genotoksinen kemikaalien ja saatujen tuotteiden oksidatiivisen hengitys sekä tuotteiden lipidiperoksidaation jotka voivat aiheuttaa DNA rakenteen muutoksia. Kuitenkin syöpätapausten on suhteellisen alhainen, koska ihmiset ovat kehittäneet joukon DNA korjaus- turvata eheys genomin korjaamalla haitallista DNA-vaurioita. Siksi DNA korjaus kapasiteetti on merkittäviä rooleja ylläpitämisessä vakauden ja eheyden ihmisen genomin [3].

Ihmisillä on olemassa ainakin neljä DNA korjaukseen polkuja, joka koostuu yli 130 geenejä. Yksi neljästä polkuja, base Leikkauskorjauksessa (BER) reitin, vastaa vaurioituneen DNA: ta altistumisesta eri endogeenisen ja eksogeenisen karsinogeenejä. Tämä polku ensisijaisesti poistaa virheellisiä ja vaurioitunut emäksiä, ja voi erityisesti poistaa metyloitu, hapettunut, tai pienentää yhden emäsparin muutokset [4]. On varmistettu, että monet proteiinit ovat osallisena BER reitin, joista yksi on poly (ADP-riboosi) polymeraasin perheenjäsen 1 (PARP1), joka tunnetaan myös adenosiinidifosfaattia ribosyl transferaasi (ADPRT) [5].

PARP1

geeni sijaitsee kromosomissa 1q41-Q42, joka koodaa 113 kDa sinkki sormen DNA: ta sitovan proteiinin poly (ADP ribosyl) transferaasi, joka voi muuttaa eri tumaproteiinien poly (ADP-ribosyl) ation [6]. Geneettistä vaihtelua DNA: n korjaukseen geenit voivat moduloida DNA-korjaus kapasiteetti johtaa kertyminen DNA-vaurioita, näin ollen johtaa ohjelmoidun solukuoleman tai säätelemätön solukasvu ja syövän [7]. On olemassa ainakin 1287 raportoi yhden emäksen monimuotoisuus (SNP) sisällä

PARP1

geeni, mukaan lukien 202 koodaava-alue yhden emäksen monimuotoisuus (cSNPs). Kaikista cSNPs on

PARP1

geeni, yksi tutkittu SNP on Val762Ala polymorfismi (rs1136410 T C), joissa on vähäisiä alleelin frekvenssi (MAF) 0,05. Hyvin SNP sijaitsee kuudennessa helix katalyyttisen domeenin, ja se voi aiheuttaa Val Ala aminohapposubstituutio kodonissa 762 eksonin 17. Aiemmat tutkimukset ovat osoittaneet, että

PARP1

Val762Ala polymorfismi liittyy toiminnallinen muuttaminen PARP1 ja Ala alleeli voisi merkittävästi vähentää poly (ADP-ribosyl) ation toiminta PARP1 in alleeli annos-riippuvaisella tavalla [7]. Tähän mennessä monet tutkimukset ovat tutkineet yhdistyksen välillä

PARP1

Val762Ala polymorfismia caner riski [7] – [45]; kuitenkin, tulokset olivat ristiriitaisia. Erot joukossa tutkimuksia voidaan katsoa johtuvan seuraavista tekijöistä otoskoko kussakin julkaisu oli luultavasti suhteellisen pieni, ja että johtopäätökset miten on poimittu eri etnisten ryhmien. Siksi teimme esillä päivitetty meta-analyysi lisäämällä hiljattain julkaistu tutkimuksia edellä mainituista yhdistyksen edelleen valaista roolia

PARP1

Val762Ala polymorfismi syöpäalttiutta.

Materiaalit ja menetelmät

kirjallisuus hakustrategia

ensimmäinen etsitään kirjallisuudessa päässä MEDLINE- ja EMBASE käyttäen seuraavia termejä ”

PARP

tai

PARP1

tai

PARP-1

tai

poly (ADP-riboosi) polymeraasin 1

tai

ADPRT

tai

ADPRT1

tai

ADPRT 1

”; ”Polymorfismi tai variantin tai vaihtelu”; ”Syöpä tai syöpä tai kasvain tai neoplasia” (edellinen haku päivitys 28. heinäkuuta 2013). Olemme myös etsinyt julkaisuja kirjoitettu kiinaksi kiinalaisten Biomedical (CBM) tietokanta (https://cbmwww.imicams.ae.cn/cbmbin) (1978-) käyttäen yhdistelmiä ehdot ”

PARP1

”, ”polymorfismi ”ja” syöpä ”Kiinan laajentaa kattavuutta nykyiseen tutkimuksen. Muita asiaan tutkimukset viitetiedot, kuten tarkastelu artikkeleita, alkuperäinen tutkimuksia myös itse hakea. Olemme vain mukana tutkimuksissa kokotekstien saatavilla. Vain uusin tutkimus tai tutkimuksia suurimman otoskoko oli mukana meidän lopulliseen meta-analyysi välttää päällekkäisyyksiä synny tietoja.

valinta ja poissulkemisperusteet

Tutkimukset mukana oli täytettävä seuraavat kriteerit : arvioida yhdistyksen välillä

PARP1

Val762Ala polymorfismi ja syövän riskiä; tapauskontrollitutkimuksessa suunnittelu; riittävät tiedot arvioimiseksi kertoimet suhdeluvut (syrjäisimmillä alueilla) ja niiden 95% luottamusväli (CI); riippumaton muista tutkimuksista; kirjoitettu Englanti tai Kiinan; lisäksi, genotyyppi taajuudet tiedot säätimet Val762Ala lähtö Hardy-Weinberg tasapaino (HWE) ilman lisätodisteita muista SNP jätettiin vuonna meidän kädessä.

Data louhinta

Kaksi tekijää ( Rui Xi Hua ja He-Ping Li) itsenäisesti uutetaan seuraavat tiedot kustakin tutkimus: ensimmäinen kirjoittajien sukunimi, julkaisuvuosi, alkuperämaan, etnisyyden, syövän tyypistä, ohjaus lähde, genotyypitysmenetelmiä, kokonaismäärät tapausten ja kontrollien , numerot tapausten ja kontrollien kanssa Val /Val, Val /Ala ja Ala /Ala genotyyppien varten

PARP1

Val762Ala polymorfismi, vähäinen alleelin taajuus (MMM),

P

vastinetta HWE, ja erimielisyys ratkaistiin keskustelut näiden kahden tekijän kunnes päästiin. Tutkimuksia varten myös aiheita eri rotua descents, tiedot poimittiin erikseen jokaiselle etninen ryhmä (luokitella Aasian ja Kaukasian tai Afrikkalainen).

genotyypin ja geenien ilmentymisen korrelaatioanalyysiä

genotyyppi ja mRNA ilmaisun tasot tiedot

PARP1

Val762Ala (rs1136410 T C) oli saatavilla HapMap (https://hapmap.ncbi.nlm.nih.gov/) ja SNPexp (http: //app3.titan.uio. no /biotools /tool.php? app = snpexp), vastaavasti, kuten aiemmin on kuvattu [46] – [50]. Genotyyppi tiedot

PARP1

Val762Ala haettiin HapMap vaiheen II julkaisu 23 tietokokonaisuus, jotka koostuvat yhteensä 3.960.000 SNP genotyyppiä johdettu 270 yksilöiden kolmen etnisten ryhmien. MRNA ilmaisu tiedot saatiin suorittamalla genominlaajuisten ilmaisun paneelit EBV-transformoituja lymfoblastoidisolulinjat jotka olivat peräisin samasta 270 yksilöä.

Tilastolliset menetelmät

assosiaatioita

PARP1

Val762Ala polymorfismi ja syövän riskiä arvioitiin raakaöljyn syrjäisimpien alueiden ja niiden vastaavat 95% CI tutkimusta varten. Yhdistettiin syrjäisimmillä alueilla ja 95% CI varten

PARP1

Val762Ala laskettiin alle homotsygoottinen malli (Ala /Ala vs. Val /Val) heterotsygoottista malli (Val /Ala vs. Val /Val), resessiivinen malli [Ala /Ala vs. (Val /Ala Val /Val)], hallitseva malli [(Val /Ala Ala /Ala) vs. Val /Val], ja alleeli verrataan (Ala vs. Val).

hyvyys fit chi-neliö testi suoritettiin sen testaamiseksi poikkeama HWE ja

P

arvo alle 0,05 pidettiin merkittävänä. Chi square-pohjainen Q-testiä käytettiin arvioimaan tasalaatuisuuden tutkimuksista. Kiinteän vaikutukset malli (Mantel-Haenszel menetelmä) [51] valittiin kun tutkimukset olivat homogeenisia (jossa

P

0,10 Q-testi); muuten, random-vaikutukset malli (jäljempänä Dersimonian ja Laird menetelmä) hyväksyttiin [52]. Heterogeenisyys testattiin myös

I

2

tilastotieto, jossa 0% tarkoittaa, ettei havaittujen heterogeenisyys, ja suuremmat arvot osoittavat nousua heterogeenisyys [53]. Alaryhmä analyysit tehtiin mukaan syöpätyypin, etnisyys ja lähde ohjaus. Keskivirhettä log (OR) tutkimusta varten piirrettiin sen log (OR) arvioimaan mahdolliset julkaisun harhaa. Suppilo juoni epäsymmetria arvioitiin Egger n lineaarisen regression testi [54]. Herkkyys analyysit suoritettiin jättämällä jokaisen tutkimuksen erikseen ja laskematta yhdistetyistä arvioista ja niiden vastaavat 95% CI vaikutuksen määrittämiseksi kunkin tutkimuksen yhteenveto arvioon. Erot mRNA ekspressiotasoja joukossa genotyypit testattiin yksisuuntaisella ANOVA, ja mRNA ekspressiotaso suuntauksia keskuudessa genotyypit arvioitiin käyttäen yleistä lineaarista mallia.

Jotta väärät positiiviset tulokset, väärien positiivisten raportin todennäköisyys (FPRP ) arvot ja tilastollisia valtuudet laskettiin myös kaikki merkittävät löydökset nykyisessä meta-analyysi [55] – [57]. FPRP arvot ennen todennäköisyydet 0,25, 0,1, 0,01, 0,001 ja 0,0001 saatiin, jossa FPRP arvo 0,2 pidetään huomionarvoista. Kaikki tilastot suoritettiin käyttäen STATA versio 11.0 (Stata Corporation, College Station, TX) ja SAS versio 9.1 (SAS Institute, Cary, NC). Kaikki

P

arvot olivat kaksipuolisia, ja

P

0,05 pidettiin merkittävänä.

Tulokset

Tutkimus ominaisuudet

kuten kuvassa 1, yhteensä 282 julkaisua tunnistettavissa päässä MEDLINE- ja EMBASE, ja kahdeksan lisätutkimuksia päässä CBM tietokannasta. Sen jälkeen tiivistelmät ja tekstit arviointi, vain 46 julkaisut täytti raakaöljyn kriteereillä ja alistettiin lisäarviointia. Heistä neljä tutkimusta [58] – [60] ei otettu käsitelty muissa tutkimuksissa. Genotyyppi jakelu

PARP1

Val762Ala polymorfismi kontrolleissa oli noudattaen HWE, paitsi kahdeksan tutkimuksissa [13], [19], [34], [37], [41], [61] – [63]. Laajentamiseksi otoskoko ja minimoida valinta bias, viisi näistä tutkimuksista [13], [19], [34], [37], [41] sisällytettiin meidän kädessä, sillä genotyyppi jakaumat muiden geenien (esim,

XRCC1

tai

APE

) kontrolleissa näiden tutkimukset olivat yhdenmukaisia ​​HWE. Loput tutkimukset [61] – [64], ainoastaan ​​tutkimalla Val762Ala polymorfismi, jätettiin yhdistetty analyysi, koska Koska muita todisteita siitä voimassaolon näytteenotto. Lopuksi vain 39 julkaisua mukana meta-analyysissä (taulukko 1).

Tutkimukset kuten useiden etnisten ryhmien [7], [22] tai useita syöpiä [27] katsottiin useina tutkimukset. Tutkimus suoritettiin Ye et al. [32] osoittivat vain arvioita hallitseva malli esittämättä genotyypin laskea erikseen. Kaiken tämän päivitetyn meta-analyysi tutkii yhdistyksen välillä

PARP1

Val762Ala polymorfismi ja syövän riskiä, ​​43 tutkimuksessa yhteensä määrä 17351 tapaukset ja 22401 kontrollia sisällytettiin. Näistä 43 tutkimuksissa otoskoot vaihteli 50-1736 tapauksissa, kun taas vaihtelee 72-1935 valvontaa. Lopullinen meta-analyysi koostui kuudesta tutkimukset keskittyivät rintasyövästä ja aivosyövän, viisi tutkimuksia mahasyöpä, neljä tutkimuksia peräsuolen syöpä, kolme tutkimusta eturauhassyöpä, virtsarakon syöpä ja melanooma, toiset joissa on enintään kaksi tutkimusta. Aikavälillä etnisyyden, 18 tutkimuksia tehtiin keskuudessa aasialaiset, 23 tutkimukset valkoihoisilla ja kahdessa tutkimuksessa keskuudessa afrikkalaisia. Näistä tutkimuksista, 10 oli väestöpohjainen, 32 olivat sairaala-pohjainen ja vain yksi oli perhe-pohjainen.

Meta-analyysin tulokset

Todettiin, että ei ollut merkittävää yhdistyksen välillä

PARP1

Val762Ala polymorfismi ja yleistä syöpäriskiä (homotsygoottinen malli: OR = 1,10, 95% CI = 0,96-1,25; heterotsygoottinen malli: OR = 1,04, 95% CI = +0,96-+1,12, väistyvä malli: OR = 1,07, 95% CI = 0,95-1,20, hallitseva malli: OR = 1,05, 95% CI = 0,97-1,14, ja alleeli vertaamalla: OR = 1,04, 95% CI = 0,98-1,11) (taulukko 2). Ositusmenetelmässä analyysejä syövän tyypeissä polymorfismi havaittiin olevan tilastollisesti merkitsevästi liittyy lisääntynyt mahalaukun syövän riski (homotsygoottinen malli: OR = 1,56, 95% CI = 1,01-2,42; heterotsygoottinen malli: OR = 1,34, 95% CI = 1,14-1,58, hallitseva malli: OR = 1,41, 95% CI = 1,21-1,65, ja alleeli vertaamalla: OR = 1,29, 95% CI = 1,07-1,55), mutta vähennys riski aivokasvain (heterotsygoottinen malli: OR = 0,77, 95% CI = 0,68-0,87, hallitseva malli: OR = 0,77, 95% CI = 0,68-0,87, ja alleeli vertaamalla: OR = 0,82, 95% CI = 0,74-0,91). Kerrostuminen analyyseja etnisyys selvitetty, että Ala harjoittajat keskuudessa aasialaiset ovat huomattavasti lisääntynyt riski syövän kaikissa genetiikan malleissa (homotsygoottinen malli: OR = 1,23, 95% CI = 1,05-1,44; heterotsygoottinen malli: OR = 1,13, 95% CI = 1,05 -1,22, väistyvä malli: OR = 1,14, 95% CI = 1,00-1,30, hallitseva malli: OR = 1,16, 95% CI = 1,07-1,26, ja alleeli vertaamalla: OR = 1,12, 95% CI = 1,04-1,20). Kuitenkin ositus analyyseja lähde säädettyjen tarkastusten ei ole havaittu merkittävästi yhdistys Val762Ala syöpäriskiä.

validoimiseksi tulosten FPRP arvot eri ennen todennäköisyydellä tasot laskettiin merkittäviä havaintoja ja esitetään Taulukko 3. ennalta todennäköisyys 0,01, FPRP arvo oli alle 20%, tilastollinen teho oli 0,980 ja FPRP arvo oli 0,046 heterotsygoottisten mallia; tilastollinen teho oli 0,831 ja FPRP arvo oli 0,002 ja hallitseva malli mahasyövän, ja tilastollinen teho oli 0,987 ja FPRP arvo oli 0,003 heterotsygoottisten mallia; tilastollinen teho oli 0,991 ja FPRP arvo oli 0,002 varten hallitseva malli ja tilastollinen voima oli 1.000, FPRP arvo oli 0,014 alleelin vertaamalla varten aivokasvain. Positiivinen assosiaatioita Ala /Ala genotyypin havaittiin alaryhmiin Aasialaisille at heterotsygoottinen (FPRP = 0,090) ja hallitseva mallit (FPRP = 0,043). Suurempi FPRP arvot havaittiin muita merkittäviä havaintoja.

Korrelaatio mRNA ilmaisun ja genotyyppien

mahdollisia vaikutuksia

PARP1

Val762Ala polymorfismin vaikutus mRNA ilmaisun tasot

PARP1

geeni kartoitettiin kesken kolmen etnisen ryhmän. Ala variantit merkitsevästi liittyy lisääntynyt mRNA ekspressiotasot

PARP1

geeni keskuudessa aasialaiset (heterotsygoottinen:

P

= 0,025 ja hallitseva:

P

= 0,030), mutta tällaisia ​​vaikutuksia ei todettu valkoihoiset tai afrikkalaiset (taulukko 4).

heterogeenisuus ja herkkyysanalyysit

Huomattava keskuudessa-tutkimus erilaisuuteen havaittiin, kun taas laskettaessa riski arvio yhdistyksen välillä

PARP1

Val762Ala polymorfismi ja yleistä syöpäriskiä (homotsygoottinen malli:

P

0,001,

I

2 = 50,4%; heterotsygoottinen malli:

P

0,001,

I

2 = 56,2%; väistyvä malli:

P

= 0,002,

I

2 = 43,9%; hallitseva malli :

P

0,001,

I

2 = 63,0% ja alleeli vertaamalla:

P

0,001,

I

2 = 68,4%). Siksi random-vaikutukset malli valittiin luotu laajempaa CI kaikille genetiikan malleissa. Lisäksi jätettävissä one-out Herkkyysanalyysit osoittivat, että ei ollut mitään tutkimusta, joka voisi muuttaa yhdistettyä syrjäisimmät alueet tietenkään (tuloksia ei ole esitetty).

Julkaisu bias

muoto suppilon tonttien tuntuu epäsymmetria, ja Egger n testi

PARP1

Val762Ala ehdotti, että ei ollut merkittävää julkaisua bias nykyisessä meta-analyysi (homotsygoottinen malli:

P

= 0,463, heterotsygoottinen malli:

P

= 0,367, väistyvä malli:

P

= 0,603, hallitseva malli:

P

= 0,319, ja alleeli vertaamalla:

P

= 0,660).

keskustelu

tässä päivitetty meta-analyysi 43 tutkimuksissa 17351 tapauksia ja 22401 valvontaa, yhdistetty analyysi ei tuottanut merkittävää yhteyttä välillä

PARP1

Val762Ala polymorfismi ja yleistä syöpäriskiä. Kuitenkin edelleen kerrostunut analyysit paljastivat, että tämä polymorfismi liittyy suurentunut riski mahasyövän, mutta laski riskiä aivokasvain. Siellä tuloksia vielä vahvistanut FPRP analyysi. Lisäksi yhdistettiin riskisuhde yhdistyksen välillä Ala varianttien (Ala /Ala tai Ala /Vai genotyyppi) ja syövän riski oli tilastollisesti merkitsevä keskuudessa aasialaiset. Kiinnostavaa kyllä, se todettiin myös, että

PARP1

Val762Ala polymorfismi merkittävästi vaikuttanut mRNA ekspressiotasot

PARP1

geenin aasialaiset, mutta ei valkoihoisista tai afrikkalaiset, mikä saattaa auttaa selittämään havaintomme että yhdistys välillä polymorfismin ja syövän riski oli vain löytyy aasialaisia.

Koska toistaiseksi, oli vain kaksi meta-analyysit ovat tutkitaan roolia

PARP1

Val762Ala polymorfismi yleistä syöpäriski [65], [66]. Parhaan tietämyksemme, jossa sisällyttäminen 15 lisätutkimusten jotka olivat poissa kahdessa edellisessä meta-analyysi, nykyinen meta-analyysi on kaikkein kattava tutkimus, joka on arvioinut yhdistys

PARP1

Val762Ala polymorfismi kanssa yleistä syöpäriskiä. Mukaisesti meidän havainnon, ei merkittävää yhteyttä ei havaittu tämän polymorfismin ja yleisen syöpäriskin yksi meta-analyysi Yu et al. [65], joka myös 21 tutkimukset, joissa on yhteensä 12027 tapausta ja 14106 valvontaa. Ositetulla analyysit osoittivat, että Ala-alleeli oli yhdistetty lisääntynyttä syöpäriskiä keskuudessa aasialaiset, mutta laskua riski valkoihoisilla, sillä gliooma riskiä erityisesti. Samoin muut meta-analyysi 28 julkaisuja 13745 potilasta ja 16947 valvonta ehdotti tätä polymorfismia ei merkittävästi liittynyt yleistä syöpäriski, paitsi Kiinan väestöstä [66]. Yksi eduista nykyisen meta-analyysi oli, että FPRP analyysi suoritettiin estä todennäköisyys vääriä positiivisia tuloksia. On tärkeää suorittaa FPRP analyysi laskea tilastollisia voimaa ja mahdollisuuden olla vääriä positiivisia löydöksiä, varsinkin kun otoskoko kerroksissa ei ole riittävän suuri, joidenkin löydökset voivat olla vääriä positiivisia johtuen Pienemmän näytekoon sekä heikko yhdistys joissakin alaryhmissä, jotka tarvitsevat lisävalidointia suuremmissa tutkimuksissa. FPRP analyysi varmisti, että tämä yhdistys polymorfismin lisääntynyt riski aasialaiset, mahasyövän, ja vähentynyt riski aivokasvaimen todellakin olemassa heterotsygoottisessa ja hallitseva malleja.

Nykyisessä meta-analyysi,

PARP1

Val762Ala polymorfismi näytti aikaan vastakkaiset vaikutukset riskeistä mahalaukun ja aivosyövän. On edelleen epäselvää,

PARP1

Val762Ala polymorfismi vaikuttaa syövän riskiä sama biologinen mekanismi eri syöpien tai etnisen ryhmän. Oli kuitenkin huomionarvoista, että vastakkaiset tuloksia maha- ja aivosyövän riskit olivat peräisin eri etnisten ryhmien. Tutkimukset aivokasvain olivat yksinomaan suoritetaan valkoihoisilla. Sen sijaan kaikki tutkimukset mahalaukun syövän olivat aasialaisia. Kuitenkin muutama näyttö viittasi

PARP1

Val762Ala polymorfismi voisi olla ero rooleja aasialaiset ja valkoihoiset. Ensinnäkin taajuudet alaikäisen alleelin

PARP1

Val762Ala polymorfismi kontrollien joukossa oli noin 0,423 ja 0,166 varten aasialaiset ja valkoihoiset, vastaavasti [65]. Ero on MAF on

PARP1

Val762Ala polymorfismia välillä kansallisuus saattaa hieman valaista havaintoon, että tämä polymorfismi differentiaalisesti säätelee syöpäalttiutta välillä aasialaiset ja valkoihoiset. Suojaava vaikutus

PARP1

Val762Ala polymorfismin vaikutus aivojen syöpäriskin valkoihoinen saattaa liittyä suhteellisen korkea Val (T) alleelin tiheydestä etninen ryhmä. Toiseksi, huomasimme, että

PARP1

Val762Ala polymorfismi merkittävästi muuttunut mRNA ekspressiotasot

PARP1

geeni aasialaisilla, mutta ei valkoihoisista tai afrikkalaisia.

PARP1

762Ala (C) alleeli voidaan merkittävästi vähentää poly (ADP-ribo-syl) toiminta-aktiivisuuden annos-riippuvaisella tavalla. Lisäksi muutos katalyyttinen domeeni Ala alleelin voi heikentää entsymaattinen aktiivisuus [7].

PARP1

-geeni koodaa 113 kDa: n DNA: ta sitovan proteiinin ADPRT /PARP1 entsyymiä. PARP1 entsyymi on olennaisia ​​rooleja BER koulutusjakson kautta havaitseminen DNA säikeen katkoksia ja poly (ADP-ribosyl) ation ydinvoiman hyväksyjä proteiinien vastaa DNA: n korjaukseen ohjelmia ja /tai apoptoosin päätös [67]. Se osallistuu myös DNA-vaurioita signalointi, DNA rekombinaatiota genomin vakautta, ja transkription säätely tuumorisuppressorigeeneille (esim p53) [68], [69]. Siksi geneettinen vaihtelusta DNA korjaus geenit, jotka voivat moduloida DNA korjaus kapasiteetti voi myötävaikuttaa syöpään alttiuteen. Val762Ala polymorfismi sijaitsee COOH-terminaalisen katalyyttisen domeenin liittyy puutteellinen poly (ADP-ribosyyli) ation toimintaa, joka voi estää DNA-korjausta kapasiteetti BER, ja siten aiheuttaa genomin epävakautta [7].

Aiemmin jotkut tutkimukset osoittivat, että geneettinen muutos on

PARP1

Val762Ala voi moduloida syöpäalttiutta, ja että taajuus Ala /Ala-genotyyppi oli merkittävästi suurempi potilailla verrattuna kontrolleihin [7], [9], [ ,,,0],13], [24], [43] yhtä poikkeusta lukuun ottamatta, jossa sen taajuus havaittiin olevan merkitsevästi pienempi potilailla [21]. Kuitenkin yhdistys Ala varianttien ja syövän riskiä ei ole vahvistanut muut [8], [10] – [12], [14] – [20], [22] – [38], [40] – [42] , [44], [45]. Mukaisesti suurin osa aiempien tutkimusten, nykyinen meta-analyysi ei antanut todisteita siitä, että yksilöiden Ala genotyyppi oli merkittävästi lisätä riskiä sairastua syöpään, verrattuna Val /Val genotyyppi. Vuonna alaryhmäanalyysi syöpä tyyppi,

PARP1

Ala genotyyppi merkitsevästi yhteydessä mahasyövän ja aivokasvaimen, jotka voidaan katsoa johtuvan syövän spesifisyys ja otoskoko. Todettiin myös aasialaiset oli suhteellisesti suurempi syöpäriski kuin valkoihoisilla, jotka voivat johtua etnisyyden eroa.

Useat rajoitukset tämän päivitetyn meta-analyysi olisi harkittava, vaikka se vahvistettiin myös uusin julkaisu sekä tutkimuksia kirjoitettu kiinaksi. Ensinnäkin, kun kaikki voivat tiedot yhdistettiin yhteen, merkittävästi erilaisuuteen eri tutkimuksissa. Tuloksia tulee tulkita varovaisesti. Toiseksi puute alkuperäiset tiedot ja sisällyttäminen vain yhden SNP voi jarruttaa edelleen arvioinnin geeni-geeni ja geeni-ympäristön vuorovaikutukset. Kolmanneksi otoskoko useimpien mukana tutkimuksissa on suhteellisen pieni (alle 500 tapausta), lukuun ottamatta 11 tutkimuksissa [9], [11] – [13], [16], [18], [19], [21] , [26], [31], [45]. Forth, tuloksemme saatiin perustuvat oikaisematon arvioihin. Tarkempi analyysi olisi tehty, jos yksittäiset tiedot, kuten ikä, sukupuoli, rotu, tupakointi ja juominen tila, pakkaus-vuotta, ja ympäristötekijät olivat saatavilla. Lopuksi, koska erilaiset genotyypitysmenetelmiä otettiin eri tutkimuksissa eri laadunvalvonta kysymyksiä ja genotyypityksen poikkeama voi olla väistämätöntä.

Kaiken kaikkiaan tämä päivitetty meta-analyysi lisäämällä viisitoista viimeksi julkaistussa tutkimuksessa pystyimme täsmällisemmän suhteellinen riskiarvio koskevat yhdistyksen välillä

PARP1

Val762Ala polymorfismia syöpäalttiutta. Nämä havainnot ehdottivat, että

PARP1

Val762Ala polymorfismi voi olla rooli syövän kehittymisessä, ainakin Aasian ryhmä tai tiettyjä syöpätyyppejä. Esimerkiksi tuloksemme osoittivat lisääntynyttä mahalaukun syövän riski, mutta pienentää aivokasvaimen riski Ala harjoittajille, mikä osoittaa tämä polymorfismi voi käyttää erilaisia ​​vaikutuksia eri syöpätyyppien.

tukeminen Information

tarkistuslista S1 ..

doi: 10,1371 /journal.pone.0087057.s001

(DOC) B