PLoS ONE: PIK3CA Mutaatiot Usein rinnalla RAS ja BRAF Mutaatiot Potilaat, joilla Advanced Cancers
tiivistelmä
Background
onkogeeninen mutaatioita
PIK3CA
,
RAS
(
KRAS
,
sääntelyviranomaisten
), ja
BRAF
on tunnistettu oli erilaisia pahanlaatuisia kasvaimia, ja aktivoi PI3K /AKT /mTOR ja RAS /RAF /MEK reittejä vastaavasti. Molemmat reitit ovat keskeisessä asemassa tumorigeneesin.
Methods
Kasvain kudoksissa 504 potilasta, jolla on erilaisia syöpiä viittasi Clinical Center for Kohdennettu Therapy MD Anderson Cancer Center alkaen lokakuussa 2008 analysoitiin
PIK3CA
,
RAS
(
KRAS
,
sääntelyviranomaisten
), ja
BRAF
mutaatioita käyttäen polymeraasiketjureaktio-pohjainen DNA-sekvensoinnilla.
tulokset
PIK3CA
mutaatiot löydettiin 54 (11%) 504 potilaasta, jotka testattiin;
KRAS
vuonna 69 (19%) 367;
sääntelyviranomaisten
19 (8%) 225; ja
BRAF
31 (9%) 361 potilaalla.
PIK3CA
mutaatiot olivat yleisintä levyepiteelin kohdunkaulan (5/14, 36%), kohdun (7/28, 25%), rintojen (6/29, 21%), ja peräsuolen syöpiä (18/105 , 17%);
KRAS
haiman (5/9, 56%), peräsuolen (49/97, 51%), ja kohdun syöpiä (3/20, 15%);
sääntelyviranomaisten
melanooma (12/40, 30%), ja kohdun syöpä (2/11, 18%);
BRAF
melanooma (23/52, 44%), ja peräsuolen syöpä (5/88, 6%). Riippumatta histologia,
KRAS
mutaatiot löydettiin 38%: lla potilaista
PIK3CA
mutaatioita verrattuna 16% potilaista, joilla villityypin (wt)
PIK3CA
(p = 0,001). Kaikkiaan
RAS
(
KRAS
,
sääntelyviranomaisten
) tai
BRAF
mutaatiot löydettiin 47%: lla potilaista
PIK3CA
mutaatiot vs. 24%: lla potilaista paino-
PIK3CA
(p = 0,001).
PIK3CA
mutaatiot löydettiin 28%: lla potilaista
KRAS
mutaatioita verrattuna 10% paino
KRAS
(p = 0,001) ja 20%: lla
RAS
(
KRAS
,
sääntelyviranomaisten
) tai
BRAF
mutaatioita verrattuna 8% kanssa paino
RAS
(
KRAS
,
sääntelyviranomaisten
) tai p-
BRAF
(p = 0,001).
Johtopäätökset
PIK3CA
,
RAS
(
KRAS
,
sääntelyviranomaisten
), ja
BRAF
mutaatiot ovat yleisiä erilaisissa kasvaimissa. Vuonna monenlaisia kasvaimia,
PIK3CA
mutaatioita rinnalla
RAS
(
KRAS
,
sääntelyviranomaisten
) ja
BRAF
mutaatioita .
Citation: Janku F, Lee JJ, Tsimberidou AM, Hong DS, Naing A, Falchook GS, et al. (2011)
PIK3CA
Mutaatiot Usein rinnalla
RAS
ja
BRAF
Mutaatiot Potilaat, joilla on pitkälle edenneitä syöpiä. PLoS ONE 6 (7): e22769. doi: 10,1371 /journal.pone.0022769
Editor: Mikhail V. Blagosklonny, Roswell Park Cancer Institute, Yhdysvallat
vastaanotettu: toukokuu 18, 2011; Hyväksytty: 29 Kesäkuu 2011; Julkaistu: 29 heinäkuu 2011
Copyright: © 2011 Janku et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.
Rahoitus: Tämä tutkimus tuettiin osittain Grant Number RR024148 National Center for Research Resources, komponentti NIH tiekartta for Medical Research (https://nihroadmap.nih.gov/clinicalresearch/overview-translational.asp). Ei ollut mitään ylimääräistä ulkoista rahoitusta saanut tätä tutkimusta varten. Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.
Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.
Johdanto
Viime aikoina merkittäviä löytöjä molekyylibiologian ihmisen syöpien ohella lisääntynyt ymmärrys onkogeenisten mutaatioiden ja solun signalointireittejä johti menestyksekäs soveltaminen uusia kohdennettuja hoitomuotojen useissa syövissä. [1], [2], [3], [4] Näitä ovat käytön KIT kinaasiestäjinä
KIT
-mutant ruuansulatuskanavan tukikudosten kasvaimet (GIST), ABL kinaasiestäjinä
BCR-ABL
positiivisten krooninen myelooinen leukemia (KML), EGFR tyrosiinikinaasin estäjien
EGFR
-mutant keuhkosyövässä, ja BRAF estäjillä
BRAF
-mutant ihosyövän. [2], [3], [4], [5 ] Se vaikuttaa uskottavalta, että yleisimmistä syövistä on ollut vaikea hoitaa, osittain koska ne ovat heterogeenisiä, jossa kukin potilasryhmässä, joilla on erilaiset molekyyli- poikkeavuuksia. Kartoittamalla sellaiset molekyyli alatyyppiin heterogeeninen syövät on tärkeää tulevaisuuden kohdennettua terapeuttista edistystä. [6], [7]
Key signaaleja, jotka oletettavasti aktivoituvat eri kasvaintyypeissä ovat fosfatidyyli 3-kinaasi (PI3K) /AKT /mTOR ja RAS /RAF /MEK signalointireittejä, jotka säätelevät solujen lisääntymistä ja kasvua, apoptoosin, autophagy, invaasio, ja muuttoliike. [8], [9] aktivointi usein välittyy mutaatioita p110α alayksikössä
PI3K, PIK3CA
, useimmat mutaatiot ( 80%), jotka ilmenevät joko eksonissa 9, joka koodaa kierteiset verkkotunnus tai eksonin 20, joka koodaa kinaasialue. [8] Prekliiniset tutkimukset ehdotti, että
PIK3CA
mutaatiot voivat ennustaa vastaus PI3K-estäjien, vaikka samanaikaisesti mutaatiot
RAS
(
KRAS
,
sääntelyviranomaisten
) tai
BRAF
voisi sovitella vastus. [10]
Vaikka useissa prekliinisissä tutkimuksissa mukaan poikkeamia PI3K /AKT /mTOR ja MAP-kinaasin reitti voi rinnakkain vain rajallinen tutkimukset ovat tehty, ja ovat enimmäkseen keskittynyt peräsuolen syöpä. [8], [10], [11] Me siis tutki
PIK3CA, RAS
(
KRAS
ja
sääntelyviranomaisten
) ja
BRAF
mutaatio asema suuri joukko potilaita (N = 504) kehittyneitä syöpiä viittasi Clinical Center for Kohdennettu Therapy (CCTT) The University of Texas MD Anderson Cancer Center (MD Anderson). Osoitamme, että kaikkialla kasvaintyypit, potilailla on usein samanaikaisesti satama
PIK3CA
mutaatioita ja
RAS Twitter /
BRAF
mutaatioita. Nämä havainnot kliinisessä ympäristössä on merkittäviä vaikutuksia kliinisten kokeiden suunnitteluun ja hoitoja PI3K /AKT /mTOR ja BRAF tai MEK estäjiä.
Methods
Potilaat
tutki
PIK3CA
,
RAS
(
KRAS
,
sääntelyviranomaisten
),
BRAF
mutaatio aseman joilla on pitkälle edennyt kasvaimia ja käytettävissä kudoksen viittasi MD Anderson CCTT (vaihe I klinikka) alkaen lokakuussa 2008. rekisteröinti potilaiden tietokantaan, patologian arviointi, ja mutaatio analyysi suoritettiin MD Anderson. Sopivaa potilasta tarkoitettuja vaiheen I kliinisissä tutkimuksissa kohdennettujen terapeuttisten aineiden, jotka oli riittävästi kasvainkudoksen käytettävissä
PIK3CA
ja, mikäli mahdollista, muiden mutaatio analyysejä. Tutkimus toteutettiin alaisuudessa IMPACT-protokollan, joka hyväksyttiin Teksasin yliopiston MD Anderson Cancer Center Institutional Review Board I.
kudosnäytteitä ja mutaatio analyysien
PIK3CA
,
RAS
(
KRAS
,
sääntelyviranomaisten
),
BRAF
mutaatioita tutkittiin arkistointi formaliinilla kiinnitetyt, parafiiniin upotetut kudosblokeista tai materiaalia hieno neula pyrkimys biopsia saadaan diagnostisten ja /tai terapeuttisten menettelyjen. Kaikki histologialtaan olivat keskitetysti tarkistetaan MD Anderson. Mutaatio testaus suoritettiin Clinical Laboratory Improvement Tarkistuksen-sertifioitu Molecular Diagnostic Laboratory sisällä osasto patologian ja laboratorio lääketieteen MD Anderson. DNA uutettiin mikropaloitelluista parafinoidut kasvaimen osat ja analysoitiin käyttäen polymeraasiketjureaktio-pohjainen DNA-sekvensoinnin menetelmä
PIK3CA
mutaatiot kodoneissa [c] 532-554: n eksonin 9 (kierukka domain) ja c1011-1062 eksonin 20 (kinaasidomeenia). Tähän sisältyi mutaatio hot spot alueella
PIK3CA
esikasvaintekijän merkitään Sangerin sekvensoinnilla, amplifikaation jälkeen 276 emäsparin ja 198 emäsparin amplikonien, vastaavasti; alukkeiden käyttöön suunnitellut MD Anderson Molecular Diagnostic Laboratory. Aina kun mahdollista, lisäksi
PIK3CA
, mutaatio Analyysi tehtiin
KRAS
ja
sääntelyviranomaisten
c12, c13, ja C61 mutaatiot eksonien 1-2; ja
BRAF
kodonin 595-600 mutaatioiden eksonin 15 pyrosekvensointi kuten aikaisemmin on kuvattu. [12]
Tilastollinen
Fisherin testiä käytettiin arvioimaan yhdistys keskuudessa kategorinen muuttujat ja mutaatio asema. Kaikki testit olivat kaksipuolisia, ja P-arvo alle 0,05 pidettiin tilastollisesti merkitsevä. Kaikki tilastolliset analyysit tehtiin SPSS 17 tietokoneohjelmiston (SPSS Chicago, IL).
Tulokset
Potilaat
Kaikkiaan 504 potilasta monipuolista pitkälle edenneitä syöpiä analysoitiin läsnäolo
PIK3CA
mutaatioita. Näistä 504 potilasta, 367 (73%) potilaista testattiin myös
KRAS
mutaatioita, 225 (45%) läsnäolo
sääntelyviranomaisten
mutaatioita, ja 361 (72%) ja
BRAF
mutaatioita. Kaksisataa-ja-yhdeksänkymmentä (58%) oli naisia ja 214 (42%) oli miehiä. Mediaani-ikä oli 57 vuotta (vaihteluväli 13-91 vuotta). Sadan ja viisi (21%) potilaalla oli paksusuolen ja peräsuolen syöpiä, 62 (12%) munasarjasyövistä, 55 (11%) melanoomia, 34 (7%), okasolusyöpä syöpien pään ja kaulan, 29 (6%), rintojen syöpiä, 28 (6%) kohdun syöpiä, 26 (5%) sarkoomat, 22 (4%) ei-pienisoluisen keuhkosyövässä (NSCLC), 16 (3%) kilpirauhassyövän, 15 (3%) ei-levyepiteeliperäinen syöpiä pään ja kaulan, 14 (3%) levyepiteelisyöpä kohdunkaulan syöpiä, 12 (2%) adenokarsinoomat ruokatorven ja mahan, 11 (2%) haimasyövistä, 8 (2%) kohdunkaulan adenokarsinoomat, 8 (2%) munuaisten syövistä ja 59 (11%) oli muita kasvaimia. Potilaan ominaisuudet on lueteltu taulukossa 1.
PIK3CA mutaatioita
PIK3CA
proto-onkogeenin mutaatioista havaittiin 54 (11%) ja 504 potilasta.
PIK3CA
mutaatiostatus ei merkittävästi liittynyt iän, sukupuolen tai rodun. Kasvaimen tyypit, joissa on enemmän kuin 10 potilaasta, jotka testattiin,
PIK3CA
mutaatiot olivat yleisimpiä okasolusyöpä kohdunkaulan syövän, 5 (36%), ja 14 potilasta. Mutaatiot olivat läsnä myös 7 (25%) ja 28 potilasta, joilla kohdun syöpä, 6 (21%) 29 potilailla, joilla on rintasyöpä, 18 (17%) 105 potilasta, joilla peräsuolen syöpä, 5 (15%) 34 potilaalla levyepiteelisyöpä syövät pään ja kaulan alueen syöpä, 7 (11%) 62 munasarjasyöpäpotilaalle, 1 (9%) 11 potilaasta, joilla haimasyöpä, 1 (6%) 16 potilaasta, joilla kilpirauhassyöpä, 1 (5%) 22 potilasta NSCLC ja 1 (2%) 55 Melanoomapotilaiden (kuvio 1A). Niistä tauti yhteisöihin yli 10 potilaalla testattu, ei
PIK3CA
mutaatioita löydettiin sarkoomaa ja adenokarsinoomat mahan ja ruokatorven.
.
PIK3CA
mutaatioita. B.
KRAS
mutaatioita. C.
sääntelyviranomaisten
mutaatioita. D.
BRAF
mutaatioita.
Mutaatiot eksonissa 9 koodaava kierteisen domain (E545K, E542K, E545G, E545K /D549H, Q546K) löydettiin 28 potilasta. Eksoni 20 mutaatiot koodaavan kinaasidomeenissa (H1047R, H1047L, G1049R, M1043V, M1043I) löytyi 26 potilaalla. Yleisimpiä mutaatiot olivat H1047R (mutaatio kodonissa 1047
PIK3CA
joka muuttaa koodatun aminohapon histidiinin arginiini) ja E545K (mutaatio kodonissa 545
PIK3CA
, joka muuttaa koodatun aminohapon glutamiinihappo ja lysiini) kukin esiintyy 16 (30%) 54 potilaalla, joilla
PIK3CA
mutaatioita (kuvio 2A). Kasvaimen tyypit, joissa on vähintään 5
PIK3CA
mutaatiot tunnistettiin analyysi taajuus mutaatioita kierteisen vs. kinaasidomeeni suoritettiin. Vallitsevana kierteisen verkkotunnuksen
PIK3CA
mutaatioita havaittiin potilailla, joilla kohdunkaulan levyepiteelikarsinooma (100% vs. 0%), peräsuolen (67% vs. 33%), ja okasolusyöpä pään ja kaulan (60% vs. 40%), kun taas
PIK3CA
kinaasidomeenin mutaatiot olivat hallitseva potilailla, joilla on kohdun (86% vs. 14%), rintojen (83% vs. 17%), ja munasarjasyöpä (71% vs. 29%; p = 0,002).
.
PIK3CA
mutaatioita (n = 54). B.
KRAS
mutaatioita (n = 69). C.
sääntelyviranomaisten
mutaatioita (n = 19). D.
BRAF
mutaatioita (n = 31).
Analysoimme taajuudet
PIK3CA
mutaatioita eri sairauksissa, joissa tiettyjä mutaatioita tunnistettiin ainakin 5 tuumorinäytteessä. Kolorektaalisyövässä, yleisin mutaatio oli E545K (8/18, 44%); kohdun syöpä, H1047R (4/7, 57%); munasarjasyövän, H1047R (3/7, 43%), rintasyövässä H1047R (4/6, 67%), kohdunkaulan syövän E545K (4/5, 80%) ja okasolusyöpä pään ja kaulan E542K (2/5, 40%). Pieni määrä potilaita kunkin alaryhmän esti pitämästä suorittamalla tarkempi tilastollinen analyysi.
KRAS mutaatioita
KRAS
esikasvaintekijän mutaatioita havaittiin 69 (19%) ja 367 potilasta testattiin.
kasvaintyypeille yli 10 potilasta testattiin,
KRAS
mutaatiot olivat yleisimmät kolorektaalisyövässä, 49 (51%) 97 testattujen potilaiden.
KRAS
mutaatiot olivat läsnä myös 3 (15%) 20 testattu potilaiden kohdun syöpää, 5 (11%) ja 46 testattiin munasarjasyöpäpotilaalle, 2 (9%) 22 arvioitiin potilailla, joilla on NSCLC , 1 (6%) 17 testattu potilailla, joilla on rintasyöpä, 1 (5%) 22 testattiin potilaalla on melanooma, ja vuonna 1 (4%) 28 testattiin potilaalla on okasolusyöpä pään ja kaulan (kuvio 1 B). Niistä tauti yhteisöihin yli 10 potilaalla testattu, ei
KRAS
mutaatioita löydettiin sarkoomaa ja adenokarsinoomat mahan ja ruokatorven.
KRAS
mutaatiostatus ei merkittävästi liittynyt iän, sukupuolen tai rodun.
Mutaatiot c12 havaittiin 53 potilaalla, C13 mutaatiot 10 potilaalla, ja C61 mutaatioita 6 potilasta. Yleisin mutaatio oli G12D (mutaatio kodonissa 12
KRAS
joka muuttaa koodatun aminohapon glysiinin asparagiini) havaittiin 21 potilaalla (kuvio 2B). Analysoimme taajuudet erityisten
KRAS
mutaatioita eri sairauksissa, joissa mutaatiot tunnistettu vähintään 5 kasvainnäytteestä. Kolorektaalisyövässä, yleisin mutaatio oli G12D (15/49, 31%); munasarjasyövän Q61H (2/5, 40%) ja haimasyövän G12V (2/5, 40%) ja G12R (2/5, 40%). Pieni potilas numerot kunkin alaryhmän esti pitämästä suorittamalla varmemmalla tilastollista analyysiä.
sääntelyviranomaisten mutaatioita
sääntelyviranomaisten
esikasvaintekijän mutaatiot löydettiin 19 (8%) 225 potilaat analysoitiin. Vuonna kasvaintyypeille yli 10 potilasta testattiin,
sääntelyviranomaisten
mutaatioita sattui eniten melanoomaa, 12 (30%) 40 testattujen potilaiden. Mutaatiot olivat läsnä myös 2 (18%) 11 testattu potilaiden kohdun syöpä ja 2 (6%) ja 31 testattiin potilaalla on peräsuolen syöpä (kuvio 1 C). Niistä tauti yhteisöihin yli 10 potilaalla testattu, ei
sääntelyviranomaiset
mutaatioita löydettiin munasarjasyövän, ja okasolusyöpä pään ja kaulan.
sääntelyviranomaisten
mutaatiostatus ei merkittävästi liittynyt iän, sukupuolen tai rodun.
Mutaatiot c61 havaittiin 18 potilaalla, ja 1 potilas oli c13 mutaatio. Yleisin mutaatio oli Q61R (mutaatio kodonissa 61
sääntelyviranomaisten
joka muuttaa koodatun aminohapon glutamiinin arginiinia) havaittiin 10 potilaalla (kuvio 2C).
BRAF mutaatioita
BRAF
proto-onkogeenin mutaatioista havaittiin 31 (9%) 361 potilaasta, jotka testattiin. Vuonna kasvaintyypeille yli 10 potilasta testattiin,
BRAF
mutaatioita sattui eniten melanoomaa, 23 (44%) 52 testattujen potilaiden. Mutaatiot olivat läsnä myös 1 (8%) 12 testattu potilaiden kilpirauhassyöpä, 5 (6%) ja 88 testattiin potilaalla on peräsuolen syöpä ja 2 (5%) 43 testattu munasarjasyöpäpotilaalle (kuvio 1 D) . Niistä tauti yhteisöihin yli 10 potilaalla testattu, ei
BRAF
mutaatioita löydettiin levyepiteelisyövän syöpiä pään ja kaulan, kohdun syöpien, rintasyöpiä, NSCLC, sarkoomat, ja adenokarsinoomat mahan ja ruokatorven.
BRAF
mutaatiostatus ei merkittävästi liittynyt iän, sukupuolen tai rodun.
Kaikki mutaatiot olivat C600. Yleisin mutaatio oli V600E (mutaatio kodonissa 600
BRAF
joka muuttaa koodaus aminohapon valiinin glutamiinihappo) 26 potilaalla (kuvio 2D).
Samanaikainen PIK3CA ja RAS (KRAS, NRA) tai BRAF mutaatioita
Joko
RAS
(
KRAS
,
sääntelyviranomaisten
) tai
BRAF
mutaatiot olivat yleisempiä potilailla, joilla mutantti
PIK3CA
kuin ne, joilla on villityypin (wt)
PIK3CA
(p = 0,001) (kuvio 3A). Nämä mutaatiot löydettiin 24 (47%) 51 potilaalla mutantti
PIK3CA
, joka testattiin myös
RAS
(
KRAS
,
sääntelyviranomaisten
) tai
BRAF
mutaatiot, mutta vain 94 (24%) 385 potilasta, joilla paino
PIK3CA
, joka testattiin myös
RAS
(
KRAS
,
sääntelyviranomaisten
) tai
BRAF
mutaatiot (taulukko 2). Samanlaisia assosiaatioita osuus
RAS
(
KRAS
,
sääntelyviranomaisten
) tai
BRAF
mutaatioita mutantti
PIK3CA
ja
wtPIK3CA
, vaikkakaan ei aina tilastollisesti merkitsevä, havaittiin tautikohtaista ala-analyysissä kolorektaalisyövässä (14/18 [78%] vs. 42/86 [49%]; p = 0,04), munasarjasyöpä (5 /7 [71%] vs. 2/43 [5%]; p 0,001), ja kaikki testattiin syövät ilman peräsuolen (10/33 [30%] vs. 52/299 [17%]; p = 0,1) ( Kuva 3B-D) Meillä myös analysoi taajuus
PIK3CA
mutaatioita potilailla, joilla mutantti
RAS
(
KRAS
,
sääntelyviranomaisten
) tai
BRAF
verrattuna potilaisiin ilman
RAS
(
KRAS
,
sääntelyviranomaisten
) tai
BRAF
mutaatioita. Potilaat, joilla on
RAS
(
KRAS
,
sääntelyviranomaisten
) tai
BRAF
mutaatioita oli korkeampi taajuus
PIK3CA
mutaatioita (24 118 potilasta, 20%) verrattuna ilman
RAS
(
KRAS
,
sääntelyviranomaisten
) tai
BRAF
mutaatioita (27 318 potilasta, 8%; p = 0,001).
Wild-type
RAS
(
KRAS, kansallisten sääntelyviranomaisten
) tai
BRAF
(sininen palkki) ja mutantti
RAS
(
KRAS, kansallisten sääntelyviranomaisten
) tai
BRAF
(punainen palkki) in: A. Kaikki kasvaintyypit (testattu, n = 436); B. Kaikki syövät paitsi peräsuolen syöpiä (testattu, n = 332); C. peräsuolen syöpiä (testattu, n = 104); D. Munasarjojen syöpiä (testattu, n = 50).
Kun analysoidaan
KRAS
yksin, nämä mutaatiot havaittiin 19 (38%) 50 potilasta, joilla
PIK3CA
mutaatioita, jotka testattiin myös
KRAS
. Potilailla, joilla
wtPIK3CA
,
KRAS
mutaatioita havaittiin 50 (16%) 317 potilaasta, jotka testattiin sekä onkogeenien (taulukko 2). Ero oli tilastollisesti merkitsevä (p = 0,001) (kuvio 4A). Samanlaisia assosiaatioita osuus
KRAS
mutaatioita potilailla, joilla mutantti
PIK3CA
ja paino
PIK3CA
, vaikkakaan ei aina tilastollisesti merkitsevä ehkä siksi pienempi määrä potilaita, havaittiin kohteena olevan taudin aiheuttaman ala-analyysissä kolorektaalisyövässä (13/18 [72%] vs. 36/79 [46%]; p = 0,07), munasarjasyöpä (4/7 [57%] vs. 1/39 [3%] ; p = 0,001), ja kaikki testattiin syövät lukuun ottamatta paksu- ja peräsuolen (6/32 [19%] vs. 14/238 [6%]; p = 0,02) (kuvio 4B-D). Olemme myös analysoineet taajuus
PIK3CA
mutaatioita potilailla, joilla mutantti
KRAS
vs. potilaat
wtKRAS
. Potilaat, joilla on
KRAS
mutaatioita oli korkeampi taajuus
PIK3CA
mutaatioita verrattuna
wtKRAS
(19/69 [28%] vs. 31/298 [10%] ; p = 0,001). Lopuksi analysoidaan assosiaatioita eksoni 9
PIK3CA
ja
KRAS
mutaatioiden ja välillä eksonissa 20
PIK3CA
ja
KRAS
mutaatioita. Eksoni 9
PIK3CA
mutaatioita olivat yhteydessä
KRAS
mutaatioita (12/62 [19%] vuonna
KRAS
mutantti vs. 16/283 [6%] vuonna p-
KRAS
; p = 0,001), kun taas yhdistyksen välillä eksonissa 20
PIK3CA
ja
KRAS
mutaatiot eivät saavuttaneet tilastollista merkittävyyttä (7/57 [12%] vuonna
KRAS
mutantti vs. 15/282 [5%] vuonna paino-
KRAS
; p = 0,07). Lisäksi olemme analysoineet assosiaatioita eksoni 9
PIK3CA
ja
KRAS
mutaatioiden ja välillä eksonissa 20
PIK3CA
ja
KRAS
mutaatiot peräsuolen ja munasarjasyöpiin , jotka olivat kaksi suurinta tauti alaryhmää. Kolorektaalisyövässä, eksoni 9
PIK3CA
mutaatioita osoittivat suuntauksen useammin potilailla, joilla
KRAS
mutaatioita (9/45; 20%) verrattuna potilaisiin, joiden paino
KRAS
(3/46; 6%) (p = 0,07), kun taas taajuus eksonin 20
PIK3CA
mutaatiot eivät merkittävästi eroa (4/40 [10%] vuonna
KRAS
mutantti vs. 2/45 [4%] vuonna paino-
KRAS
; p = 0,4). Munasarjasyövän, oli vahvan yhteyden eksoni 20
PIK3CA
ja
KRAS
mutaatioita (3/4 [75%] vuonna
KRAS
mutantti vs. 2/40 [5%] vuonna paino-
KRAS
; p = 0,003), kun taas yhdistyksen välillä eksoni 9
PIK3CA
ja
KRAS
mutaatiot eivät saavuttaneet tilastollista merkittävyyttä (1/2 [50%] vuonna
KRAS
mutantti vs. 1/39 [3%] vuonna paino-
KRAS
; p = 0,1). Kuitenkin potilaiden määrä näissä alaryhmissä olivat pieniä, mikä viittaa varovaisuutta tulkittaessa tuloksia.
Wild-type
KRAS
(sininen palkki) ja mutantti
KRAS
(punainen palkki ) in: A. Kaikki kasvaintyypit (testattu, n = 367); B. Kaikki syövät paitsi peräsuolen syöpiä (testattu, n = 270); C. peräsuolen syöpiä (testattu, n = 97); D. Munasarjojen syöpiä (testattu, n = 46).
ei ollut merkitsevää eroa esiintyvyys
sääntelyviranomaisten
mutaatioiden välillä
wtPIK3CA
ja mutantti
PIK3CA
ryhmät kuitenkin pieni määrä potilaita testattu mutantti
PIK3CA
ryhmä esti pitämästä piirustus lopullisia päätelmiä.
osuus
BRAF
mutaatioita oli samanlainen (8-9%) sekä
wtPIK3CA
ja mutantti
PIK3CA
ryhmiä. Alhainen potilas numeroita mutantti
PIK3CA
ryhmä teki ongelmalliseksi päästä lopullisia johtopäätöksiä.
Keskustelu
Across kasvaintyypit, osoitimme muita yleisemmin
RAS
(
KRAS
,
sääntelyviranomaisten
) tai
BRAF
mutaatioiden (47%) ja
KRAS
mutaatioita (38%) potilailla, joilla mutantti
PIK3CA
verrattuna niihin, joilla
wtPIK3CA
(mutantti
RAS
tai
BRAF
läsnä 24%, p = 0,001; mutantti
KRAS
läsnä 16%, p = 0,001). Useimmat aiemmin julkaistu joissa tutkitaan samanaikaisesti
PIK3CA
, ja
RAS
tai
BRAF
mutaatioita keskittyi peräsuolen syövän. [11], [13], [14], [15 ], [16] Jotkut tutkimukset ehdotti, että
PIK3CA
mutaatiot liittyvät
KRAS
mutaatioita, [11], [13], [15] kun taas toiset eivät ilmoittaneet, että. [16] [17] suuri retrospektiivinen tutkimus, joka analysoi 1022 kasvaimen DNA-näytteitä potilaista, joilla peräsuolen syöpä Setuksimabihoitoa saaneilla useita unionin toimielimissä paljasti yhteydestä eksoni 9
PIK3CA
ja
KRAS
mutaatioita (14,7% in
KRAS
mutantti vs. 6,8% paino
KRAS
; p = 0,0006), mutta ei välillä eksonissa 20
PIK3CA
ja
KRAS
mutaatioita ( 3,8%
KRAS
mutantti vs. 2,3% paino
KRAS
; p = 0,27). [11] kanssa tässä artikkelissa, kun tarkasteltiin kaikkia histologialtaan, löysimme myös vahvan assosiaatio eksoni 9
PIK3CA
ja
KRAS
mutaatioita (19%
KRAS
mutantti vs. 6% paino
KRAS
; p = 0,001) kuitenkin taajuus eksonin 20
PIK3CA
mutaatioita osoitti myös suuntauksena on yleisempää potilailla, joiden
KRAS
mutaatioita verrattuna p-
KRAS
(12%
KRAS
mutantti vs. 5% paino
KRAS
), vaikka oli tilastollisesti merkityksetöntä (p = 0,07). Eräässä tautikohtaiset ala-analyysissä peräsuolen ja munasarjasyövän huomasimme suuntaus yhdistyksen välillä eksoni 9
PIK3CA
ja
KRAS
mutaatioita peräsuolen syöpä (20% vuonna
KRAS
mutantti vs. 6% paino
KRAS
; p = 0,07) ja tilastollisesti merkitsevä assosiaatio eksoni 20
PIK3CA
ja
KRAS
mutaatioita munasarjasyöpä (75% in
KRAS
mutantti vs. 5% paino
KRAS
; p = 0,003). Kuitenkin potilaiden määrä on alhainen ja peräsuolen, ja munasarjasyöpä alaryhmäanalyyseissa viittaa siihen, että lisävarmistusmenetelmää tutkimuksia tarvitaan.
Yhdistyksen välillä
PIK3CA
ja
RAS
tai
BRAF
mutaatioita on vaikutuksia syövän hoidossa. Prekliinisissä ehdotti, että solulinja johdettu ksenografteissa kanssa
PIK3CA
mutaatiot ovat herkkiä PI3K estäjä PX-866, ellei heillä ole
RAS
mutaatioita. [10] Lähes identtinen tuloksia saatiin prekliinisistä ja Varhaisissa kliinisissä kokeissa kanssa mTOR-estäjä everolimuusin. [18] Samanlaisia havaintoja on raportoitu varhaisesta kliinisistä kokeista, kun
RAS
tai
BRAF
mutaatioita potilailla, joilla mutantti
PIK3CA
olivat liittyy vastustuskykyä PI3K /AKT /mTOR useissa syövissä paitsi munasarjasyöpä. [19], [20] Nämä tiedot viittaavat siihen, että
PIK3CA
mutaatioita saattaa ennustaa vastaus PI3K /AKT /mTOR-reitin inhibiittorit vain osa potilaista. Potilailla, joilla samanaikaisesti
PIK3CA
ja
RAS
tai
BRAF
mutaatioita, PI3K /AKT /mTOR esto ei välttämättä riitä saavuttamiseksi merkittävä antituumorivaikutus, ja koska
RAS
tai
BRAF
mutaatiot ovat yleisempiä potilailla, joilla mutantti
PIK3CA
on suositeltavaa selvittää mutaatiostatuksesta asema
RAS
ja
BRAF
lisäksi
PIK3CA
tila. Erityisen kiinnostavia, kliinisissä tutkimuksissa yhdistyvät MEK ja PI3K /AKT /mTOR-inhibiittorit ovat alkuvaiheessa kliinisen kehityksen. [21] Lisäksi jotkut prekliinisissä kokeissa ehdotti, että PI3K esto saattaa heikentää migraation ja adheesion kasvainsolujen ja siten estää etäpesäkkeiden pikemmin kuin primaarikasvaimen, joilla voi olla merkittäviä vaikutuksia hoitoon; kuitenkin, nämä havainnot on vahvistettava lisäkokeella. [22], [23]
Mitä tulee yksittäisiä poikkeavuuksia, onkogeeninen mutaatiot kaksi hot spot alueiden (eksonit 9 ja 20)
PIK3CA
on tunnistettu oli erilaisia pahanlaatuisia kasvaimia, mukaan lukien yhteiset kasvaimia kuten rinta-, keuhko-, peräsuolen, munasarjojen ja kohdun. [11], [24], [25], [26], [27], [28], [29 ] tässä tutkimuksessa
PIK3CA
mutaatioita tunnistettiin 11% erilaisten kasvaintyypeille. Kasvaimet, joilla on korkea esiintyvyys
PIK3CA
mutaatiot olivat levyepiteelisyöpä kohdunkaulan (36%), kohdun (25%), rintojen (21%), peräsuolen (17%), levyepiteelisyöpä pään ja kaulan (15%) ja munasarjojen syöpien (11%). Nämä tiedot ovat samankaltaisia kuin aiemmin julkaistu paitsi kohdunkaulan syöpä, joka on osoitettu olevan esiintyvyys
PIK3CA
mutaatiot vaihtelee 8% (8/98) on COSMIC tietokannan 16% (2/12) julkaissut Miyake et ai. [29], [30] ja peräsuolen ja squamous kohdunkaulan syöpiä havaittiin hallitseva E545K (eksoni 9) mutaatio (44%, 80%, vastaavasti); kohdun, munasarjojen ja rintasyöpiä, vallitseva H1047R (eksoni 20) mutaatio (57%, 43%, 67%, vastaavasti); ja levyepiteelisyöpä syövät pään ja kaulan, joka on E542K (eksoni 9) mutaatio (40%). Nämä erot voivat olla kliinistä merkitystä kuin jotkut prekliinisten syntyy hypoteesi, että kun eksoni 20 mutaatiot ovat läsnä kinaasidomeenista, he saattavat olla herkempiä PI3K /AKT /mTOR-inhibiittorit kuin eksoni 9 mutaatioita kierteisen domain. [18]
KRAS
mutaatioita esiintyy eri kasvaintyypeissä, ja ovat erityisen tärkeitä peräsuolen, haiman, ja NSCLC syövän syntymistä. [11], [31], [32], [33], [34 ]
KRAS
mutaatioiden ennustaa puute terapeuttista hyötyä anti-EGFR monoklonaalisia vasta-aineita peräsuolen mutta ei vakuuttavasti, keuhkosyövässä. [35], [36], [37] Toiminnalliset RAS voi myös olla potentiaalisesti tärkeä säätelemiseksi aktiinisytoskeletonin, joka ehdotettiin olevan kriittinen kuljettaja onkogeenisten muutosta. [38] tutkimuksessamme korkea esiintyvyys
KRAS
mutaatioita havaittiin haiman (56%), peräsuolen (51% ), kohdun (15%), ja munasarjojen (11%) syövistä, joka on samanlainen kuin aiemmin julkaistu havaintojen ja tietojen COSMIC tietokannasta. [11], [29] ja peräsuolen syöpiä havaittiin hallitseva G12D mutaatio (31% ); haimasyöpä, G12V ja G12R mutaatioiden (40% kumpikin); ja munasarjasyövät, Q61H mutaatiot (40%). Nämä erot voivat olla kliinisesti merkityksellisiä, koska jotkin prekliiniset tiedot viittaavat siihen, että eri mutaatiot saattavat aktivoida erilaisia reittejä. Ihle et al. [39] osoitti, että G12D mutaatio aktivoi sekä PI3K /AKT /mTOR ja MAPK polkuja, kun taas G12C mutaatio aiheuttaa vankka RAL signalointia.
sääntelyviranomaisten
mutaatioita on pääosin kuvattu melanoomissa ja leukemiat ja niiden prognostiset merkitys on epäselvä, joidenkin tietojen mielikuvan kyseessä mutantin
sääntelyviranomaisten
ja huonompi ennuste melanooma. [40], [41], [42] tutkimuksessamme siellä oli korkea esiintyvyys
sääntelyviranomaisten
mutaatioita melanooman (44%), ja kohdun syöpä (15%). Esiintyvyys
sääntelyviranomaisten
mutaatioita oli korkeampi kuin raportoitu muissa tutkimuksissa tai COSMIC tietokannassa (14-20%). [29], [43]
BRAF
mutaatioita on raportoitu pääasiassa melanooma, peräsuolen, papillaarinen kilpirauhasen, ja munasarjasyöpä. [44], [45] in kolorektaalisyövän ne liittyvät synkkä ennuste, mutta toisin kuin
KRAS
mutaatioita,
BRAF
mutaatiot eivät välttämättä ennusta puute setuksimabin hyötyä. [46] Vuonna melanooma, ennustetyöväline merkitys
BRAF
mutaatioita on vähemmän ilmeinen, vaikka potilaat, joilla
BRAF
mutantti melanooma näyttävät vastata erittäin hyvin
BRAF
estäjiä. [4], [42], [47] papillaarinen kilpirauhassyöpä,
BRAF
mutaatioita havaittiin upregulate microenviromental geenejä, mikä voi lisätä kasvaimen aggressiivisuutta . [48] kanssa aiemmin julkaistu tietoja, tutkimuksemme osoitti hyvin yleisiä
BRAF
mutaatioita melanooman (44%) ja paljon vähäisemmässä määrin myös kilpirauhasen, peräsuolen, ja munasarjasyöpä (8% , 6%, ja 5%, vastaavasti). Vaikka esiintyvyys
BRAF
mutaatioita kilpirauhassyöpä oli paljon pienempi kuin 51% aiemmin julkaistu, tämä ristiriita voidaan selittää läsnäolo histologialtaan muut sitten papillaarinen. [49]
Yhteenvetona tutkimme esiintyvyys
PIK3CA
,
RAS
(
KRAS
,
sääntelyviranomaisten
), ja
BRAF
mutaatioita monipuolinen kasvain näytteet ja tunnistetaan tiheä rinnakkain elävien
PIK3CA
ja
BRAF
tai
RAS
mutaatioita. Samanaikainen aktivoituminen PI3K /AKT /mTOR ja RAS /RAF /MEK reitit voi liittyä vastustuskyvyn PI3K /AKT /mTOR-estäjät. [10], [18] Nämä tulokset ovat erityisen tärkeitä, koska monet PI3K /AKT /mTOR ja RAS /RAF /MEK kohdentamisaineita parhaillaan kliinistä testausta ja viittaavat siihen, että molekyyli profilointi ja vastaavia potilaita, joilla näiden yhdistelmät kohdennettuja lääkkeitä täytyy tutkia perusteellisesti.
Kiitokset
kiitos Ms. Joann Aaron tieteellistä tarkastelua ja muokkausta tämän artikkelin.