Krooninen sairaus

tiivistelmä

Pitkän koodaamattomalla RNA on ollut mukana syövän etenemiseen, ja korkea HOX transkripti antisense intergeeniset RNA (

hotair

) arvellaan olevan huono prognostinen indikaattori kasvainten synnyssä useiden syöpätyyppien. Siksi tässä tutkimuksessa edelleen paljastaa sen ennusteen arvioinnissa kasvaimen maligniteetti. Systemaattinen tarkastelu PubMed ja Web of Science suoritettiin valita kirjallisuuden merkitystä korrelaatio

hotair

ekspressiotasot ja kliininen tulos eri kasvaimia. Kokonaiselinaika (OS), etäpesäke-elinaika (MFS), toistuminen-elinaika (RFS), ja taudista vapaan eloonjäämisen (DFS) analysoitiin myöhemmin. Tiedot tutkimuksista suoraan raportoi riskisuhde (HR) ja vastaavat 95%: n luottamusväli (CI) tai

P

arvo sekä eloonjäämiskäyrien yhdistettiin nykyisessä meta-analyysi. Kaikkiaan 2255 potilasta 19 kirjallisuutta lähes julkaistu vuonna 2011 tai myöhemmin otettiin mukaan analyysiin. Tulokset viittaavat siihen, että

hotair

oli erittäin liittyy HR OS 2,33 (95% CI = 1,77-3,09,

P

heterogeenisyys = 0,016). Kerrostunut analyysit osoittavat, että kohonneet

hotair

näyttää olevan tehokas ennustetekijöitä biomarkkereiden potilailla, joilla peräsuolen syöpä (HR = 3,02, 95CI% = 1,84-4,95,

P

heterogeenisyys = 0,699) ja ruokatorven okasolusyöpää (HR = 2,24, 95CI% = 1,67-3,01,

P

heterogeenisyys = 0,711), samanlainen vaikutus havaittiin myös analyysimenetelmä ja näyte, paitsi etnisyys. Lisäksi Hazard tunnusluvut säätely ylöspäin

hotair

varten MFS, RFS, ja DFS oli 2,32 (

P

0,001), 1,98 (

P

= 0,369 ), ja 3,29 (

P

= 0,001), tässä järjestyksessä. Yhteenvetona, korkea

hotair

on läheisesti liittynyt haitallisia OS lukuisissa syövissä, mikä viittaa siihen, että

hotair

voi toimia mahdollisena biomarkkeri pahanlaatuisten kasvainten kehittymiseen.

Citation: Deng Q, Sun H, hän B, Pan Y, Gao T, Chen J, et al. (2014) ennusteen arvioinnissa Long koodaamattoman RNA

hotair

erilaisissa syövissä. PLoS ONE 9 (10): e110059. doi: 10,1371 /journal.pone.0110059

Editor: Balraj Mittal, Sanjay Gandhi Medical Institute, Intia

vastaanotettu: 20 heinäkuu 2014; Hyväksytty: 02 syyskuu 2014; Julkaistu: 10 lokakuu 2014

Copyright: © 2014 Deng et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Data Saatavuus: Tällä kirjoittajat vahvistavat, että kaikki tiedot taustalla olevat havainnot ovat täysin saatavilla rajoituksetta. Kaikki asiaankuuluvat tiedot ovat paperi- ja sen tukeminen Information tiedostoja.

Rahoitus: Hanke tukivat avustuksia National Nature Science Foundation of China (no. 81172141, 81200401), Nanjing Science and Technology komitea Project ( no. 201108025), Nanjing Medical Technology Development Project (no. ZKX11025), Nanjing Health Young Talent Project, Jiangsun maakunnan Key Medical kykyjä SKW, ja Nanjing lääketieteen ja Technique Development Foundation on YQP (No. QRX11255) ja B.S.H. (No. QRX11254). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

ei-koodaavat RNA: t (ncRNA) ovat alun perin tunnistettiin sekvensoimalla ja mikrosirujen varten koko genomin ja transcriptome, ja vähintään 90% ncRNAs on todettu aktiivisesti puhtaaksi [1], [2]. Transkriptiota ncRNA paljasti sen komplikaatio biogeneesissä kuin proteiinia koodaavan RNA, kuten laaja antisense, päällekkäisiä ja ei-koodaavan RNA ilmaisun [3], [4], [5]. Huolimatta alkuperäisen väitteen väitti ncRNA voi olla väärennetty transkription melua, yhä todisteita ehdotti, että ncRNAs voi olla hallitseva biologinen rooli solujen aineenvaihduntaan ja eloonjääminen [6], [7], [8], [9]. Lisäksi viimeaikaisissa tutkimuksissa osoitettu, että pitkän ei-koodaavat RNA: t (lncRNA, 200nt pituus) ilmaistava kudosspesifisiä malleja ja että on poikkeuksellisen säännelty erilaisia ​​sairauksia, mukaan lukien syöpä [10], [11], [12] , [13]. Useita sääntelyn emäksiä ovat osallistuneet säätelyyn lncRNA, kuten kopioinnin säätely, epigeneettiset sääntelyn, ja posttranskriptionaalisella asetus [9], [14]. Lisäksi lncRNAs ainutlaatuisia profiilit monenlaisia ​​syöpiä, jotka edustavat syövän synnyn ja etenemisen pitää ennustaja hoitotuloksia [15], [16], [17].

hotair

, näkyvästi keskittynyt lncRNA, alun perin raportoitu olevan osallisena ensisijainen rintasyövän ja rintasyövän metastaasi, jossa kohonnut

hotair

edistänyt kasvainten invasiivisuus ja etäpesäkkeiden [18].

hotair

yli-ilmentyminen on osoitettu liittyvän ekspression Polycomb tukahduttavia kompleksin 2 (PRC2), joka indusoi sen liittyvät metylaatio histoni H3 lysiinin 27 (H3K27) [10], [18]. Sen lisäksi, että rintasyövän [18], viimeaikaiset kliiniset todisteet osoittavat

hotair

on myös mukana etenemistä monien muiden syöpien, kuten maksasolukarsinoomat (HCC) [19], peräsuolen syöpä (CRC) [ ,,,0],20], ruokatorven levyepiteelikarsinoomien (ESCC) [21], mikä viittaa siihen, että

hotair

ilmaisu toimii ennustetekijä kasvaimien synnyn. Vaikka

hotair

ilmentymisen katsotaan liittyviä kliinisiä ennusteen useita syöpiä, vaikutus

hotair

syövän kehittymisen edelleen vaikeasti. Joissakin tutkimuksissa on raportoitu, että säätely ylöspäin

hotair

vaikuttavan kasvainten kehittymiseen, mukaan lukien virtsarakon syöpä [22], kohdunkaulan syöpä [23], peräsuolen syöpä [24], jne., Kun taas muutama todisteena näytteillä haitallisia vaikutuksia tunnustettu suojaavana tekijä vastaan ​​syövän synnyn [25]. Sen vuoksi on tarpeen selkeyttää suhdetta

hotair

ja syöpä. Siten esillä tutkimuksen ensimmäinen meta-analyysi käyttäen pätevä asiaan kirjallisuus saavuttaa tarkka arviointi yhdistyksen välillä

hotair

ilmaisun ja syövän kliinistä ennustetta.

Materiaalit ja menetelmät

Tietolähteet ja hakujen

julkaistut tiedot etsimällä suoritettiin käyttäen kirjallisuuskatsauksen, jossa Preferred Reporting Kohteiden-katsaukseen ja meta-analyysi suuntaviivojen [26]. Valitut kirjallisuuden määritettiin kautta sähköinen haku PubMed ja Web of Science käyttää näitä seuraavaa: ”

hotair

”, ”syöpä tai kasvain tai karsinoomia” ja ”prognoosi tai tulos”. Viimeinen etsintä päivitettiin 18. heinäkuuta 2014. Citation luettelot haetaan artikkeleita etsittiin manuaalisesti varmistaa herkkyyden hakustrategiaa.

Tutkimus valinta

Tutkimukset kelpuuteta täyttivät seuraavat kriteerit: 1 ) tutkittiin potilailla, joilla tahansa syövät; 2) tutkivat yhteys

hotair

ja kliininen ennuste; 3) saatavuus riskisuhde (HR) ja 95%: n luottamusväli (CI) tai

P

vastinetta yleistä (OS). Toissijaisen analyysi, tutkimukset mukaan lukien HR etäpesäke-elinaika (MFS), tautivapaan elinajan (DFS), tai toistumista-elinaika (RFS) käytettiin myös analysoimaan edelleen. OS [27], MFS [28], DFS [27], ja RFS [29] kuvattiin aikaisemmin; 4) julkaistiin koko paperi Englanti. Tutkimukset jätettiin perustuvat seuraavat kriteerit: 1) kahdennettu, arviot, kirjeitä, julkaisemattomat tiedot ja kommentit; 2), jotka on julkaistu kielellä kuin Englanti; 3) puute keskeisten tietojen tarkempaa analysointia varten; 4) ei-ihmisen tutkimus.

Data louhinta

Kaksi tutkijat (QWD, HLS) arvioitu riippumattomasti ja uutetaan tiedot kustakin määriteltyjä tutkimuksia perustunut osallisuutta ja syrjäytymistä. Vastaavat kirjoittajat otettiin yhteyttä selventää puuttuvat tai epäselviä tietoja. OS käsiteltiin määräävä tulos kiinnostava, mutta MFS, RFS ja DFS asetettiin toissijainen tuloksia. Seuraavat tiedot huolellisesti uutettu: nimi ensimmäinen kirjoittaja, julkaisuvuosi, alkuperämaan, etnisen tutkimuksen väestöstä, tyyppi yksilö, syövän tyypistä, potilaiden määrä sisällyttää analyysiin, tunnistusmenetelmä on

hotair

cut-off määrittelyssä korkea

hotair

, seuranta-aika, ja HR sekä vastaavat 95%: n luottamusväli OS, MFS, RFS tai DFS soveltuvin osin. Cancer tyyppi alaryhmiä luotiin tärkeimpien lopputulokseen, jos vähintään kaksi tutkimusta syöpätyypin ollut käytettävissä; ainoa tutkimuksessa yhdistettiin alaryhmässä kutsutaan ”Muut”. HR oli ensinnäkin uutetaan monimuuttujaisen mittaamiseen, kun käytettävissä. Muutoin HR uutettiin univariate analyysiin, ja laskettiin Kaplan-Meierin selviytymisen käyrän HR digitoinut ohjelmisto Engauge 4,0 kuten aiemmin on kuvattu [30].

Tilastolliset analyysit

Kaikki uutettu tiedot yhdistettiin meta-analyysin avulla STATA ohjelmistoversio 11.0 (STATA Corporation, College Station, TX, USA). Riskisuhteita vastaavan 95% CI käytettiin arvioimaan vahvuus välisen

hotair

ja kliinistä ennustetta. Jos HR ei suoraan ilmoiteta, matemaattinen arviointi tehtiin laskemalla tarvittavat tiedot pohjalta aikaisemmin raportoitu menetelmillä [31]. Cochranin Q testiä ja Higgins I-squared tilastoa käytettiin arvioimaan heterogeenisyys yhdistetyissä tuloksissa. Jos

P

0,05 Q-testi osoitti merkittävän heterogeenisuus tutkimuksissa random-vaikutusten malli (DerSimoian-Laird menetelmä) toteutettiin laskemiseen yhdistettyä HRS [32]. Muussa tapauksessa kiinteiden vaikutusten malli (Mantel-Haenszelin menetelmää) käytettiin [33]. Tutkimaan edelleen mahdollinen lähde heterogeenisuus tutkimusten meta-regressio suoritettiin käyttäen muuttujia kuten syövän tyypistä, etnisyys, analyysimenetelmä, tyyppi yksilö. Validoida vakaus tulosten meta-analyysi, herkkyysanalyysi suoritettiin peräkkäisellä jättäminen kunkin yksittäisen tutkimuksen. Julkaisu bias suoritti Begg n suppilo juoni ja Egger n lineaarinen regressio testi ja

P

0,05 katsottiin edustavan tilastollisesti merkitsevä julkaisun bias.

Tulokset

Ominaisuudet tutkimusten

oli 71 paperit sähköinen haku PubMed ja EMBASE. Pohjalta mukaanottokriteereihin, 19 voivat paperit otettiin tämä meta-analyysi (esitetty kuviossa 1). Tärkeimmät ominaisuudet sisältyvät tutkimukset on esitetty taulukossa 1; kaikki tutkimukset olivat lähes julkaistiin vuonna 2011 tai myöhemmin. Oli 16 tutkimuksissa OS, 3 MFS, 3 RFS, ja 2 DFS meta-analyysi. Osallistujat 16 tutkimukset olivat Aasian ja muut 3 tutkimuksissa oli valkoihoisia. Erilaisiin syöpiin kirjattiin Tutkimuksessamme kuten BC, HCC, CRC, ESCC jne tyypit näyte oli kudosta kaksikymmentäkaksi tutkimuksia ja verta yhdessä tutkimuksessa. Raja-arvot sisältyvät tutkimukset olivat epäjohdonmukaisia ​​johtuen eri havaitsemismenetelmät, jopa 6 tutkimuksissa ei raportoitu. Riskisuhteita vastaavan 95% CI poimittiin yhden muuttujan analyysin ja graafisen selviytymistä tontit 6 tutkimuksissa ja monimuuttujamenetelmin 18 tutkimuksissa.

Kokonaiselossaoloaika

tärkeimmät tulokset meta-analyysi on esitetty taulukossa 2. 16 tutkimuksesta, johon 1844 potilasta ilmoitti HR OS. On ehdotettu, että kohonnut

hotair

ennusti huono tulos OS (HR = 2,33, 95% CI = 1,77-3,09,

P

H = 0,016; Kuva 2). Kerrostunut analyysit syövän tyypin osoitti, että ennustetekijöiden vaikutus

hotair

oli korkein CRC (HR = 3,02, 95% CI = 1,84-4,95,

P

H = 0,699), seurasi ESCC (HR = 2,24, 95% CI = 1,67-3,01,

P

H = 0,016). HR Alakonsernista muiden syöpien oli 2,18 (95% CI = 1,25-3,78,

P

H = 0,001).

vaikutus kohonneen

hotair

OS eri rotuja on esitetty taulukossa 2. riskisuhteita olivat 2,43 (95% CI = 1,99-2,97,

P

H = 0,894) Aasian, ja 1,92 (95% CI = 0,31-11,91,

P

H = 0,001) ja valkoihoisia. Kun erilaiset analyysimenetelmät katsottiin,

hotair

oli vahva prognostinen markkeri sekä yhden muuttujan analyysin (HR = 2,13, 95% CI = 1,71-2,65,

P

H = 0,329) ja monimuuttujamenetelmin (HR = 2,26, 95% CI = 1,59-3,20,

P

H = 0,009). Performing alaryhmäanalyyseissa ositettu näyte, lisääntynyt

hotair

oli tiiviisti yhteydessä huonoon ennusteeseen sekä kudoksen (HR = 2,29, 95% CI = 1,72-3,04,

P

H = 0,015 ) ja veren (HR = 4,96, 95% CI = 1,10-22,37).

Herkkyysanalyysi esitetään kuviossa 3. tuloksena malli ei vaikuttanut merkittävästi poistamalla yhden tutkimuksen joka kerta. Begg n suppilo juoni ja Egger n lineaarisen regression testi tehtiin arvioimaan julkaisun bias. Muoto suppilon juoni ei ollut merkittävää epäsymmetriaa kuviossa 4. Tämän jälkeen Egger testi ehdotti myös mitään todisteita julkaisun bias (

P

= 0,110).

Jokaisessa tutkimuksessa edustaa yksi ympyrä. Vaakasuora viiva edustaa yhdistettyä vaikutusta arvioon.

Etäpesäke-elinaika, uusiutumista elinaika ja taudista vapaan eloonjäämisen

Kolme tutkimusta, joka käsittää 421 potilasta ilmoitti tuntiin MFS. Kaiken

hotair

suurempi kuin cut-off liittyi HR varten MFS 2,32 (95% CI = 1,62-3,33,

P

H = 0,080). Kolme tutkimusta, joka käsittää 506 potilasta osoitti tuntiin RFS.

hotair

ei liity huono RFS. Kahdessa tutkimuksessa, joka käsittää 141 potilasta ilmoitti tuntiin DFS. Up-regulation

hotair

ennusti huono kliininen tulos DFS (HR = 3,29, 95% CI = 1,61-6,70,

P

H = 0,969).

keskustelu

Koska uusi molekyyli perusteella tutkimus lncRNA on keskittynyt vaikutuksista lncRNA syövän synnyssä ja ennusteen, joka tarjoaa uutta tietoa syövän terapeuttiseen strategiaan [34], [35]. Huolimatta merkittävää edistymistä lncRNAs syövän nosogenesis ja ennusteen, ennustetyöväline vaikutus lncRNAs on edelleen sekava. Tutkitaan ennustetekijöiden vaikutus lncRNAs syövän, tämä järjestelmä tarkastelu ja meta-analyysi suoritettiin tutkimaan vaikutusta

hotair

kasvaimen ennusteeseen saavuttaa yhdenmukaisempi ja täsmällistä päätelmää.

Täällä sitoutui meta-analyysi 18 kirjallisuus käsittää 2255 potilasta, joilla kasvaimia arvioida ennustetekijöiden vaikutus

hotair

. Huomasimme, että yhtäpitävä vaikutus kohonnut

hotair

OS (HR = 2,33) kanssa samankaltainen riskisuhteita kesken eri syöpätyypin alaryhmien ja kaikkialla analyysimenetelmät, tai yksilöitä, lukuun ottamatta etnisyys alaryhmiin.

hotair

on osoitettu myötävaikuttavan etenemistä monien syöpien ja nykyään pidetään tunnusmerkki syövän [36]. Voimakas vaikutus OS oli korkein CRC, joka tukee lisäksi todisteita siitä, että

hotair

on keskeisessä asemassa karsinogeneesi CRC seurauksena edistetään multipotentteina solujen erilaistumista [20]. Erityisesti kohonneet tasot

hotair

liittyvät erittäin suuresti huonompi OS Aasian, mutta ei Caucasian, viittaa siihen, että vuorovaikutus geneettisten ja ympäristötekijöiden voivat myötävaikuttaa syövän kehittymisen. Lisäksi kliinis-ja lääkehoidon asema voisi muuttaa vaikutus

hotair

[25]. Kuitenkin tutkimuksessa raportoitiin, että

hotair

indusoi tukahduttavaa kromatiinin tila edistämällä muodostumista H3K27, viittaa siihen, että

hotair

voi toimia kasvaimia estävä geeni proliferaation syövän kantasoluja [18] . Tämä tutkimus lisäksi tarkistaa, että tasot

hotair

on erittäin liittyy syövän kehittymisen, vaikka ennustetekijöiden vaikutus

hotair

MFS ja DFS on edelleen pysynyt tulevaisuuden tutkimuksissa. Tärkeää on, että tulokset ovat yhdenmukaisia ​​testatussa syöpätyyppien riippumatta eri tietovarantoja ja analyysimenetelmiä.

mekanismit yhdistyksen välillä korkeita

hotair

ja huono tulos syövistä vielä epäselvä. Tämä tutkimus voi ennustaa seuraavia mahdollisia mekanismeja ennustetekijöiden vaikutus

hotair

karsinogeenisuutta.

hotair

säätelee chromatin metylaatiotila indusoimalla genominlaajuisten uudelleenkohdennusta PRC2 ja edistää etäpesäke rintasyövän hiljentämällä useita etäpesäkkeiden-estäviä geenejä [18]. Niinpä PRC2 on raportoitu olevan mukana kantasolujen pluripotenttisuus ja etenemisen ofEZH2, SUZ12, ja TE [36], [37]. Johdonmukaisesti,

hotair

Knockdown paitsi tukahdutetaan solujen invaasiota, mutta myös vähentynyt soluproliferaatiota, muuttaa solusyklin etenemistä, ja indusoi apoptoosin [38].

Lääkärit käyttävät mieluummin ennustetekijöitä tietoja puhuessaan potilaille . Kuten

hotair

tarjoaa riippumatonta prognostista tietoa, voimme sisällyttää

hotair

yksinkertaisella pisteet luoda asianmukaiset terapeuttinen strategia. Viime vuosina muutamia kliiniset tutkimukset syöpäpotilailla osoittivat, että määrän vähentäminen

hotair

liittyy läheisesti hyvä hoitovaste [39]. Lisäksi

hotair

on todettu voivan olla itsenäinen ennustetekijöiden indikaattorin CRC potilailla [24]. Ehdotettiin, että muuttamalla blood

hotair

tasoja voisi olla hyödyllistä räätälöinti hoidon syöpäpotilaille.

Joitakin rajoituksia tässä tutkimuksessa olisi tunnustettava. Ensinnäkin vain tiivistää datalla yksittäisen potilaan tietoja käytettiin. Toiseksi, osa tutkimuksista, erityisesti alaryhmään analyysit, oli kevyesti suhteellinen. Kolmanneksi, koska jotkut raja-arvoja ei ole raportoitu ja kriteereitä laskettaessa raja-arvon olivat epäjohdonmukaisia, ositettu analyysi raja-arvoja ei suoritettu ehdottaa onko raja-arvot olivat alkuperä heterogeenisyys. Neljänneksi mukana vain tutkimuksiin raportointi HR tai eloonjäämiskäyrien, ja näin ollen jotkin julkaisuista raportointi ennustetekijöiden arvosta

hotair

suljettiin pois. Esimerkiksi vain kertoimet suhdeluvut raportoitu, joten valinta bias saattaa ilmestyi. Lopuksi, useimmat mukana tutkimuksissa ei nimenomaisesti kontrolloida tällaisia ​​samanaikaisia ​​häiriöitä, ja nämä saattavat häpeään mittaus

hotair

.

Yhteenvetona ylös-säätely

hotair

liittyy haitallisia selviytymisen monissa syöpätyyppien, ja

hotair

voi toimia tehokkaana ennustetekijöitä biomarkkeri syövän diagnoosi. Siksi kliininen tarkkailun tasot

hotair

ilmaisu voi antaa lupaava lähestymistapa tunnistaa potilaat, jotka vaatisivat enemmän läheisesti hoitaa henkilökohtaisesti räätälöityjä lääketieteen tarkastus seurata syövän ennaltaehkäisyyn ja hoitoon.

tukeminen tiedot

Kuva S1.

Vuokaavio.

doi: 10,1371 /journal.pone.0110059.s001

(TIF) B Kuva S2.

metsäviljelmien.

doi: 10,1371 /journal.pone.0110059.s002

(TIF) B Kuva S3.

Herkkyysanalyysi.

doi: 10,1371 /journal.pone.0110059.s003

(TIF) B Kuva S4.

suppilo juoni.

doi: 10,1371 /journal.pone.0110059.s004

(TIF) B Taulukko S1.

pääpiirteet.

doi: 10,1371 /journal.pone.0110059.s005

(XLSX) B