Krooninen sairaus

tiivistelmä

Background

Useat tapausverrokkitutkimukset tehtiin tutkia yhdistyksen SULT1A1 R213H polymorfismit kanssa peräsuolen syöpä (CRC) ihmisillä. Mutta tulokset eivät olleet aina yhdenmukaisia. Suoritimme meta-analyysin tutkia assosiaatiota SULT1A1 R213H polymorfismin ja CRC.

menetelmät ja havainnot

Tietoja kerättiin seuraavista sähköisistä tietokannoista: PubMed, Elsevier Science Direct, Excerpta Medica tietokanta, ja Kiinan Biomedical kirjallisuuden tietokanta, jossa viime raportissa asti syyskuuta 2010. kaikkiaan 12 tutkimuksessa myös 3549 tapaukset ja 5610 hallinta perustuu hakuehtoja osallistuivat tähän meta-analyysiin. Kaiken kaikkiaan ei ole merkittäviä yhdistys tämän polymorfismin kanssa CRC löydettiin (H vs. R: OR = 1,04, 95% CI = 0,94-1,16,

P

= 0,46; HR + HH versus RR: OR = 1,01, 95 % CI = 0,92-1,11,

P

= 0,81; HH versus RR + HR: OR = 1,01, 95% CI = 0,74-1,38,

P

= 0,95; HH versus RR: OR = 1,00, 95% CI = 0,77-1,31,

P

= 0,98; HR versus RR: OR = 1,01, 95% CI = 0,92-1,11,

P

= 0,86). Vuonna Alaryhmäanalyysissä, myös ei löytänyt mitään merkittävää yhdistys Cauasians (H vs. R: OR = 1,02, 95% CI = +0,92-+1,15,

P

= 0,68; HR + HH versus RR: OR = 0,99 , 95% CI = 0,91-1,09,

P

= 0,90; HH versus RR + HR: OR = 1,01, 95% CI = 0,73-1,39,

P

= 0,97; HH versus RR : OR = 0,99, 95% CI = +0,75-+1,31,

P

= 0,94; HR versus RR: OR = 0,99, 95% CI = +0,90-+1,09,

P

= 0,85). Tuloksia ole merkittävästi muuttuneet sen jälkeen, kun tutkimukset, jotka eivät täyttäneet Hardy-Weinberg tasapaino jätettiin (H vs. R: OR = 1,06, 95% CI = 0,95-1,19,

P

= 0,31; HR + HH versus RR: OR = 1,03, 95% CI = +0,93-+1,13,

P

= 0,56; HH versus RR + HR: OR = 1,10, 95% CI = 0,78-1,56,

P

= 0.57; HH versus RR: OR = 1,09, 95% CI = 0,83-1,44,

P

= 0,53; HR versus RR: OR = 1,02, 95% CI = 0,92-1,13,

P

= 0,75).

Johtopäätös

Tämä meta-analyysi osoittaa, että ei ole mitään assosiaatiota SULT1A1 R213H polymorfismin ja CRC.

Citation: Zhang C, Li JP, Lv GQ, Yu XM, Gu YL, Zhou P (2011) puuttuminen Association of SULT1A1 R213H polymorfismin kanssa peräsuolen syövän: meta-analyysi. PLoS ONE 6 (6): e19127. doi: 10,1371 /journal.pone.0019127

Editor: Jan-Hendrik Niess, Ulm University, Saksa

vastaanotettu: 07 tammikuu 2011; Hyväksytty: 16 maaliskuu 2011; Julkaistu: 13 kesäkuu 2011

Copyright: © 2011 Zhang et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Kirjoittajat ei ole tukea tai rahoitusta raportoida.

kilpailevat edut: kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

peräsuolen syöpä (CRC) on koolonin tai peräsuolen ja se on yhtä yleinen miehillä ja naisilla. With 655000 kuolemantapausta maailmanlaajuisesti vuodessa, se on kolmanneksi suurin syy syöpään liittyvät kuolemat maailmassa [1], [2]. Vuonna 2010 oli 142570 uutta CRC tapauksissa ja 51370 kuolemantapaukset CRC Yhdysvalloissa [2]. Nykyisin CRC on merkittävä kansanterveydellinen taakka monissa maissa. Näin ymmärtämään syitä tämän taudin on ala voimakasta kiinnostusta. Nykyiset todisteet tukevat merkittävä rooli genetiikan määritetään riski CRC [3].

sulfotransferaasien (Sults) on tärkeä rooli normaalissa fysiologinen prosessi ja pahanlaatuisiksi [4]. Ihmisillä on kolme jäsentä fenoli sulfotransferaasien perhe (SULT1A1, SULT1A2, ja SULT1A3). SULT1A1 ilmentyy maksassa sekä monissa maksan ulkopuolisiin kudoksiin kuten paksusuolen limakalvo, ja on osa vieroitus koulutusjakson lukuisten vierasaineiden [5], [6]. Se on tärkeä rooli aineenvaihdunnassa ja bioaktivaatiosta monet ruokavalion ja ympäristön perimän muutoksia, mukaan lukien heterosykliset amiinit osallisena syövän synnyn ja peräsuolen ja muiden syöpien [7], [8]. Siten SULT1A1 geeni voi olla hyvä ehdokas genetiikan tutkimusten CRC.

SULT1A1 geeni sijaitsee kromosomissa 16p12.1-p11.2 [9]. Polymorfismi (R213H) on SULT1A1 geeni on tunnistettu koodaavan alueen nukleotidin 638 (G A: ksi). Tämä emäksen muutos johtaa muutokseen aminohapposekvenssissä arginiinista histidiiniin (Arg213His), mikä johtaa vähenemiseen entsymaattinen aktiivisuus [10].

Koska sen löydön vuonna 1997, tämä polymorfismi on herättänyt laajaa huomiota, ja useita tapausverrokkitutkimukset tehtiin tutkia yhdistyksen tämän polymorfismin kanssa CRC ihmisellä [11] – [24]. Mutta tulokset eivät ole aina johdonmukaisia. On olemassa useita mahdollisia selityksiä discordance, kuten pieni otoskoko, etninen tausta, korjaamaton useita hypoteesin testaukseen, ja julkaisu bias. Meta-analyysi on tilastollinen menetelmä yhdistämällä useiden tutkimusten tulosten kanssa yksittäisen arvion suuri vaikutus tiiviimmän tarkasti [25]. Siitä on tullut tärkeä syövän genetiikan takia nopean kasvun määrän ja koon aineistoja. Tavoitteena tässä tutkimuksessa on haluat suorittaa meta-analyysi arvioida assosiaatiota SULT1A1 R213H polymorfismin ja CRC.

Methods

Haku strategia

Tässä meta -analyysiohjelman teimme tyhjentävä haku tutkimuksiin, tutki yhdistys on SULT1A1 geenipolymorfismien CRC. Tiedot kerättiin seuraavista sähköisistä tietokannoista: PubMed, Elsevier Science Direct, Excerpta Medica Database (EMBASE), ja kiinalaiset Biomedical Kirjallisuus Database (CBM). Haimme artikkelit käyttäen hakusanoja ”sulfotransferaasien”, ”Sult”, ”SULT1A1”, ”peräsuolen”, ”paksusuoli”, ”peräsuoleen”, ja ”colorectum”. Lisätutkimukset tunnistettiin käsin viittauksia alkuperäisen tutkimusten ja katsaus artikkeleita assosiaatiota SULT1A1 R213H polymorfismin ja CRC. Ei kieli rajoituksia sovellettiin. Tutkimus oli mukana nykyisessä meta-analyysi, jos (1) se julkaistiin syyskuuhun 2010; (2) se oli tapauskontrollitutkimuksessa on SULT1A1 R213H polymorfismin ja CRC. Me jätetty tutkimuksen, jossa perheenjäsenet tutkittiin. Kun oli useita tutkimuksia samasta väestöstä, vain suurimmat tutkimuksessa oli mukana.

Lisäksi kaksi tutkijaa itsenäisesti etsinyt sähköisiin tietokantoihin. Riippumaton PubMed haku tehtiin (Zhou P ja Zhang C) samalla menetelmällä. Riippumaton Elsevier Science Direct hakua tehtiin (by Lv GQ ja Yu XM) samalla menetelmällä. Riippumaton EMBASE hakua tehtiin (Gu YL ja Li JP) samalla menetelmällä. Riippumaton CBM etsintä tehtiin (by Lv GQ ja Yu XM) samalla menetelmällä. Viittaukset alkuperäisessä tutkimuksessa ja katsaukset tarkistettiin (Gu YL ja Li JP) tunnistaa lisätutkimuksia.

Data louhinta

Kaksi tutkijat (Zhou P ja Zhang C) itsenäisesti kopioi tietoa ja saavutti konsensus seuraavat ominaisuudet valitun tutkimuksista: ensimmäisen tekijän nimi, julkaisuvuosi, lähde julkaisu, etnisyyden, tapausten määrä ja valvonta sekä käytettävissä alleeli ja genotyyppi taajuudet tietoa. Jos alkuperäiset tiedot olivat käytettävissä esineissä, pyyntö alkuperäisen datan lähetettiin vastaavan tekijän.

Tilastollinen

Vahvuus assosiaation SULT1A1 R213H polymorfismin ja CRC avattiin laskemalla kertoimet (OR), jossa 95%: n luottamusväli (CI). Arvioimme alleelin kontrasti (H vs. R), The codominant malli (HH vs. RR, HR vs. RR), hallitseva malli (HR + HH vs. RR) ja resessiivinen malli (TT vs. RR + HR), tässä järjestyksessä. Heterogeenisuus tutkimusten välistä arvioitiin Chi square-testi perustuu Q-tilaston [26]. Merkittävä Q-tilastoa (

P

0,10) osoitti heterogeenisuus tutkimuksissa. Olemme myös mitattava vaikutus heterogeenisyys muun toimenpiteen

I

2

= 100% x (Q-df) /Q [27]. Yhdistetty OR laskettiin kiinteä vaikutus malli (käyttäen Mantel-Haenszel menetelmä) tai satunnainen vaikutus malli (käyttäen Dersimonian-Laird menetelmä) mukaisesti heterogeenisuus tutkimuksissa [28], [29]. Mahdollista julkaisu harhaa arvioitiin käyttämällä Egger n lineaarisen regression testi silmämääräinen tarkastus Funnel juoni [30]. Lisäksi Chi square-testiä käytetään määrittämään, onko havaittu taajuus genotyypin hallita väestön sopeutui Hardy-Weinberg tasapaino (HWE) odotuksia. Analyysit suoritettiin käyttäen ohjelmistoa Review Manager 4.2 (Cochrane Collaboration, https://www.cc-ims.net/RevMan/relnotes.htm/) ja Stata versio 10 (StataCorp LP, College Station, Texas, USA).

P

arvo alle 0,05 pidettiin tilastollisesti merkitsevä, ja kaikki

P

arvot olivat kaksipuolisia.

Tulokset

Ominaisuudet voivat tutkimusten

Ominaisuudet sisältyvät tutkimukset nykyisessä meta-analyysi on esitetty taulukossa 1 [11] – [22]. Oli 2619 paperit merkitystä tutkiva ehdot (PubMed: 139; Elsevier Science Direct: 2220; EMBASE: 230; CBM: 30). Tutkimus valintaprosessi on esitetty kuvassa 1. Kaikkiaan 14 Tutkimuksissa tarkasteltiin assosiaatiota SULT1A1 R213H polymorfismi ja CRC [11] – [24]. Näistä 2 jätettiin pois (data 1 Tutkimus oli poissa, 1 oli kaksoiskappale raportti) [23], [24]. Siten 12 tutkimuksessa oli mukana nykyisessä meta-analyysi [11] – [22].

12 tutkimukset koostui 10 valkoihoinen, 1 Aasian ja 1 Brasilian. Alleeli ja genotyyppi taajuudet SULT1A1 R213H polymorfismi poimittiin 11 tutkimuksista. Mutta vain alleelifrekvensseiltään uutettiin tutkimuksen Gaustadnes et al. [14]. Siksi tutkimalla kontrastia HH vs. RR, HR vs. RR, HR + HH vs. RR, ja HH vs. RR + HR, meta-analyysi suoritettiin 11 tutkimuksia yleistä, ja 9 tutkimukset valkoihoinen. Tutkitaan kontrastia H alleelin vs. R alleeli, meta-analyysi suoritettiin 12 tutkimuksia yleistä, ja 10 tutkimukset valkoihoinen.

tulokset HWE testi jakelun genotyyppi hallitsee väestöstä on esitetty taulukossa 1 . Kahdessa tutkimuksessa eivät olleet HWE tukikelpoisiin tutkimuksissa [16], [17]. Se oli poissa käytöstä yhdessä tutkimuksessa suorittaa HWE testi [14].

Meta-analyysi

tärkeimmät tulokset meta-analyysi ja heterogeenisyys koe on esitetty taulukossa 2.

Analysis koko väestöstä

assosiaatio SULT1A1 R213H polymorfismin ja CRC tutkittiin 12 tutkimuksissa yhteensä 3549 tapausta ja 5610 tarkastuksia. Olemme havainneet merkittäviä Tutkimusten välisten heterogeenisyys kontrastit H vs. R, HH vs. RR + HR, ja HH vs. RR. Emme löytäneet yhdistyksen välillä SULT1A1 R213H polymorfismi ja CRC potilailla (H vs. R: OR = 1,04, 95% CI = 0,94-1,16,

P

= 0,46; HR + HH versus RR: OR = 1,01 , 95% CI = +0,92-+1,11,

P

= 0,81; HH versus RR + HR: OR = 1,01, 95% CI = 0,74-1,38,

P

= 0,95; HH versus RR : OR = 1,00, 95% CI = 0,77-1,31,

P

= 0,98; HR versus RR: OR = 1,01, 95% CI = ,92-+1,11,

P

= 0,86).

Analysis HWE väestön

Meta-analyysi suoritettiin näissä tutkimuksissa täyttää HWE. Meta-analyysiin sisältyi 9 tutkimukset (2858 tapausta ja 4550 tarkastukset). Q-testi heterogeenisuus oli merkittävä kontrastit H vs. R, HH vs. RR + HR, ja HH vs. RR. Emme havainneet yhdistys on SULT1A1 R213H polymorfismi ja CRC HWE väestöstä (H vs. R: OR = 1,06, 95% CI = 0,95-1,19,

P

= 0,31; HR + HH versus RR: OR = 1,03, 95% CI = 0,93-1,13,

P

= 0,56; HH versus RR + HR: OR = 1,10, 95% CI = 0,78-1,56,

P

= 0,57; HH versus RR: OR = 1,09, 95% CI = 0,83-1,44,

P

= 0,53; HR versus RR: OR = 1,02, 95% CI = 0,92-1,13,

P

= 0,75 ).

Analysis valkoihoinen väestö

meta-analyysiin sisältyi 10 tutkimukset (3367 tapausta ja 5167 tarkastukset) valkoihoisilla väestöstä. Q-testi heterogeenisuus oli merkittävä kontrastit H vs. R, HH vs. RR + HR, ja HH vs. RR. Tilastollisesti merkittävää yhdistys perustettiin varten SULT1A1 R213H polymorfismi valkoihoinen väestö (H vs. R: OR = 1,02, 95% CI = 0,92-1,15,

P

= 0,68; HR + HH versus RR: OR = 0,99 , 95% CI = 0,91-1,09,

P

= 0,90; HH versus RR + HR: OR = 1,01, 95% CI = 0,73-1,39,

P

= 0,97; HH versus RR : OR = 0,99, 95% CI = +0,75-+1,31,

P

= 0,94; HR versus RR: OR = 0,99, 95% CI = +0,90-+1,09,

P

= 0,85).

arviointi julkaisun bias

muodot suppilo tontteja ei ilmennyt näyttöä ilmeinen epäsymmetrian (suppilo tontit ei esitetty). Samalla olemme arvioi suppilo juoni epäsymmetria menetelmällä Egger n lineaarisen regression testi. Leikkauspisteen

antaa mitan epäsymmetria, ja sitä suurempi sen poikkeama nollasta selvempiä epäsymmetria. Tulokset Egger n lineaarisen regression testi on esitetty taulukossa 3. On osoitettu, että ei julkaistu bias kaikille vertailuissa.

Keskustelu

Useita riviä todisteet tukevat tärkeä rooli for genetiikan määritettäessä syöpäriskiä, ​​ja yhdistys tutkimukset ovat asianmukaisia ​​etsimiseen altistavia geenejä osallisina syövän [31]. Kuitenkin pieni näyte kokoinen assosiaatiotutkimuksiin puuttuu tilastollinen voima ja ovat johtaneet ilmeisesti ristiriidassa havaintojen [32]. Meta-analyysi on keino lisätä otoskoko tutkittavana koottava yhteen tietoja yksittäisistä yhdistys tutkimuksista, mikä parantaa tilastollinen voima analyysin estimointijärjestelmässä geneettisiä vaikutuksia [25]. Nykyisessä meta-analyysi, joka perustuu 12 tapausverrokkitutkimukset tarjoavat tietoa SULT1A1 R213H polymorfismi ja CRC mukana 3549 tapauksia ja 5610 tarkastuksia, emme löytäneet Merkitsevä yhteys SULT1A1 R213H polymorfismi ja CRC keskuudessa yleistä ja valkoihoinen populaatiot. Lisäksi tuloksia ole merkittävästi muuttuneet sen jälkeen, kun tutkimukset, jotka eivät täyttäneet HWE suljettiin pois. Meidän meta-analyysi osoittaa, että SULT1A1 R213H polymorfismi ei ole liitetty CRC kehitystä. Sikäli kuin tiedämme, tämä on ensimmäinen meta-analyysi suoritettiin tähän asti pyrittiin selvittämään assosiointi SULT1A1 R213H polymorfismin kanssa CRC.

SULT1A1 liittyvät vieroitus ja aktivointi eri karsinogeeneja, ja sääntelyä monien hormonien [7], [8]. On havaittu, että G: stä A siirtymistä nukleotidin 638 on SULT1A1 geeni aiheuttaa Arg His korvaaminen liittyy alhainen entsyymiaktiivisuus [10]. Viime aikoina tutkimukset ovat viitanneet siihen, että SULT1A1 HH genotyyppi liittyy kohonnut riski joidenkin syöpien kehitystä, kuten ruokatorven, rinta, ja keuhkosyöpä [33] – [35]. Nämä tulokset näyttävät tukevan että alhainen aktiivisuus SULT1A1 * H allozyme puuttuu suoja ravinnon ja /tai ympäristökemikaalien mukana karsinogeneesissä syövän. Kuitenkin myös meta-analyysi viittaa siihen, että SULT1A1 R213H polymorfismi ei ole liitetty CRC riski. Tutkimuksen mukaan Raftogianis et al. [10] viittaavat siihen, että tämä polymorfismi liittyy alhainen entsyymiaktiivisuus. Entsyymiaktiivisuus mitattiin verihiutaleiden valmisteita tässä tutkimuksessa. Kuitenkin käyttö verihiutaleiden aktiivisuuden määrittämiseksi tietyn entsyymin voidaan tulkita väärin johtuu siitä, ettei menetelmän erottaa joka entsyymi on vastuussa aktiivisuuden havaittu [21]. Lisäksi alustava mallinnus tutkimukset osoittavat, että tämä polymorfismi ei näytä suoraan vaikuttaa sitoutumiskohta alustan tai universaalin sulfonaatti- luovuttaja 3’phosphoadenosine-5′-fosfosulfaattia (PAPS) [36]. Samaan aikaan tekemää tutkimusta Ozawa et al. [37], vaikka yhdistelmä-entsyymiä käytettiin, erot sulfonoimalla kyvyt olivat vain vähäisiä, mikä voi selittyä kompromissin lämpöstabiilisuudessa aminohappo muutos aiheuttaa. Lisäksi, evdiences viittaavat siihen, että SULT1A1 R213H polymorfismi on kytkentäepätasapainossa SULT1A2 N235T [38], [39]. Näin ollen, on mahdollista, että aktiivisuus mitattiin niiden tutkimus johtuu SULT1A2 ja SULT1A1. Lisätutkimukset toiminnallisen vaikutuksia tällä polymorfismin tarvitaan edelleen tulevaisuudessa.

Useat yksityiskohtia kannattaisi tutkia nykyisen meta-analyysi. Ensinnäkin, viime meta-analyysi osoitti, että SULT1A1 R213H polymorfismi ei ollut tarkka vaikutus lisätä riskiä sairastua rintasyöpään, mutta se ei lisää rintasyövän riskiä postmenopausaalisilla naisilla [40]. Siksi tämä polymorfismi voi vain olla rooli yhdessä ympäristöaltisteiden. Tarkempi analyysi ositettu ympäristöaltisteiden voitaisiin suorittaa, jos yksittäiset tiedot olivat saatavilla. Toiseksi on syytä mainita, että vain 2 12 tutkimukset tehtiin ei-Cauasian meillä väestön meta-analyysi. Näin ollen tulokset myös meta-analyysi osoittaa, että ei ole assosiaatiota SULT1A1 R213H polymorfismi ja CRC, pääasiassa Cauasian väestöstä. Kolmanneksi merkittäviä Tutkimusten välisten heterogeenisuus havaittiin joitakin vertailuja, ja voidaan vääristää meta-analyysi. Fouthly vain julkaistujen tutkimusten kuuluivat tähän meta-analyysiin, ja julkaisu bias saattaa esiintyä. Viidenneksi meidän tutkimustuloksia on tulkittava varoen, koska esiintyvyys SULT1A1 R213H polymorfismi voi olla erilainen eri alatyyppejä CRC. Analyysi stratifioitu eri alatyyppien CRC voi antaa tarkemman tuloksen. Lopuksi, vaikka minimoitu todennäköisyyttä bias kehittämällä yksityiskohtainen protokolla ennen aloittamista tutkimuksen meta-analyysi on edelleen takautuva tutkimus, joka edellyttää menetelmien puutteet mukana tutkimuksissa.

Johtopäätöksenä meidän meta-analyysi osoittaa, että ei ole assosiaatiota SULT1A1 R213H polymorfismi ja CRC, pääasiassa Cauasian väestöstä. Päästäkseen lopullisen päätelmän edelleen geeni-geeni ja geeni-ympäristön vuorovaikutukset perustuvat tutkimukset suurempia otoskoko tarvitaan edelleen, erityisesti haja-Cauasian väestöstä.

tukeminen Information

tarkistuslista S1.

doi: 10,1371 /journal.pone.0019127.s001

(DOC) B

Kiitokset

Kiitämme kaikkia, jotka auttoivat tässä tutkimuksessa.