Krooninen sairaus

tiivistelmä

BRAF

-onkogeeni mutatoitunut 15% satunnaisia ​​peräsuolen syöpiä. Noin puolet näistä

BRAF

mutantti syövät osoittavat usein lukukehysmutaatioita kutsutaan mikrosatelliittien epävakaus (MSI), mutta ovat diploidinen ja kromosomiin vakaa.

BRAF

villin tyypin syövät ovat tyypillisesti microsatellite stabiileja (MSS) ja sen sijaan hankkia kromosomi epävakaus (CIN). Näiden syöpien, CIN liittyy huono tulos.

BRAF

mutantti syöpiä, jotka ovat MSS, tyypillisesti läsnä on edennyt pitkälle ja on erityisen huono ennuste. Olemme aiemmin osoittaneet kliinisiä ja molekyylitason yhtäläisyyksiä MSS syövät tai ilman

BRAF

mutaatio, ja siksi oletettu, että CIN voi myös olla yleisiä

BRAF

mutantti /MSS syöpiä.

BRAF

mutantti /MSS (n = 60), ja

BRAF

villityypin /MSS CRC (n = 90) tutkittiin CIN avulla Heterotsygotian menetys analyysin yli kahdentoista loci kattavat kromosomialueita 5q , 8p, 17p ja 18q. CIN oli yleisempää

BRAF

mutantti /MSS syöpiä (41/57, 72%), mikä oli verrattavissa korko löytyy

BRAF

villityypin /MSS syöpiä (74/90, 82 %). Suurin menetys

BRAF

mutantti /MSS syövät tapahtui 8p (26/44, 59%), ja ainakin 5q (19/49, 39%). CIN in

BRAF

mutantti /MSS syövistä korreloi pitkälle (AJCC III /IV: 15/17, 88%; p = 0,02); osoittivat korkeat yhteistyössä esiintyminen kanssa CpG Island Methylator Fenotyyppikuvaus (17/23, 74%); ja CIN at 18q ja 8p liittyy elinajan (p = 0,02, p 0,05). Tämä tutkimus osoittaa, että CIN esiintyy yleisesti kehittyneen

BRAF

mutantti /MSS kolorektaalisyövissä jossa se voi edistää huonompi selviytymisen, ja korostaa entisestään molekyylitason yhtäläisyyksiä esiintyy näiden ja

BRAF

villityypin syöpiä.

Citation: Bond CE, Umapathy A, Buttenshaw RL, Wockner L, Leggett BA, Whitehall VLJ (2012) kromosomaalinen epävakaus

BRAF

Mutant mikrosatelliittimarkkereita Stable paksusuolen ja peräsuolen syöpiä. PLoS ONE 7 (10): e47483. doi: 10,1371 /journal.pone.0047483

Editor: William B. Coleman, University of North Carolina School of Medicine, Yhdysvallat

vastaanotettu: 18 kesäkuu 2012; Hyväksytty: 12 syyskuu 2012; Julkaistu: 22 lokakuu 2012

Copyright: © Bond et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä tutkimus tukivat National Health ja Medical Research Council avustus (NHMRC 442965); Pathology Queensland, Clinical and Statewide Services, Queensland, Australia; ja Australian jatko palkinto (APA). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

Yksittäisiä peräsuolen syöpä (CRC) on monipuolinen sairaus, joka johtuu etenemistä eri tyyppisiä esiaste vaurioita, jotka ovat molekulaarisesti ja morfologisesti erilliset. Nämä vauriot hankkia geneettisiä muutoksia liittämällä yhteen vähintään kaksi tunnustettua molekyyli johtavia reittejä kasvaimien syntyyn. ”Perinteiset polku” on kaikkein hyvin tunnettu ja liittyy etenemisen tavanomaista tyyppiä adenooma, jotka voivat hankkia mutaatio tai menetys

APC

mutaatio

KRAS

ja

p53

, ja kromosomaalinen epävakaus ennen muodostumista karsinooma [1], joka on tyypillisesti

BRAF

villityypin. Mitä enemmän viime aikoina kuvattu ”sahalaitainen” reittiin kuuluu etenemistä hammastetun vaurion syöpään [2], [3], [4], [5]. Tähän liittyy varhaisessa mutaatiosta

BRAF

onkogeeni [6], [7], ja hankkiminen CpG Island Methylator Fenotyyppikuvaus (CIMP), johon liittyy laajaa promoottori hypermetylaation ja myöhemmin hiljentäminen keskeisten tuumorisuppressorigeeneille [ ,,,0],8], [9].

BRAF

on olennainen osa mitogeeniaktivoidut proteiinikinaasi (MAPK) signalointiryöpyn joka edistää solujen lisääntymistä ja antiapoptooppinen vaikutuksia [10].

BRAF

mutaatio pidetään merkkiaine sahalaitaiset reitin ja löytyy noin 10-15% CRC [11], mukaan lukien suurin osa osoittaa CIMP. Noin puolet näistä syövistä on hypermetylaation ja hiljentäminen DNA mismatch korjaus geeni,

MLH1

johtuen CIMP [8], [12]. Tämä johtaa useita mutaatioita DNA toista kirjoitusten, kutsutaan mikrosatelliittien epävakaus (MSI) [13]. Nämä MSI,

BRAF

mutatoitunut syövistä on aiemmin hyvin kuvattu diploidi [14], [15], [16], lisää yleisesti esiintyviä vanhempien naisilla ja proksimaalinen paksusuolen, usein musiinituoton tuottavat ja huonosti eriytetty [ ,,,0],2], [15], [17], [18]. Loput puolet

BRAF

mutantti vauriot sahalaitaiset polku, joka ei ole metyloinnin

MLH1

, ovat mikrosatelliitti stabiileja (MSS) [19], [20]. Toisin kuin MSI syövät, nämä eivät ole hyvin tunnettu.

Mielenkiintoista, kaksi

BRAF

mutantti alaryhmiä, jotka eroavat microsatellite epävakaus asema, antavat huomattavasti vastakkaisia ​​ennusteet. Vaikka

BRAF

mutantti /MSI syövistä korreloi erinomaisen potilaiden hoitotuloksiin,

BRAF

mutantti /MSS syövistä liittyy erittäin huono tulos, joka on jopa pahempi kuin

BRAF

villityypin /MSS syövät johtuvat kautta ”perinteinen polku” [20], [21], [22]. Molekyylimekanismeja taustalla tätä eroa ei tiedetä.

Kaksi erillistä muotoja perimän epävakaisuuden tiedetään esiintyvän CRC: MSI ja kromosomi epävakaus (CIN) [23], [24]. MSI vaikuttaa genomista eheys DNA-tasolla ja kehittyy polyyppi /karsinooma siirtymistä

BRAF

mutantti sahalaitaiset polyypit joka hiljaisuus

MLH1

DNA metylaatio kautta CIMP fenotyyppi [13], [25] . Vaihtoehtoisesti CIN joka vaikuttaa noin 70% CRC [18], toimii laajemmalla genomista mittakaavassa kuin siinä viitataan tappioita ja /tai voitot kokonaan tai osittain kromosomialueita, ja on liittynyt huonompi selviytyminen [16], [26] , [27], [28]. CIN kehittyy tavanomaisissa adenoomien jotka ovat

BRAF

villityypin sekä edistymistä pahanlaatuisen kautta ”perinteinen polku”. Heterotsygoottisuuden menetys (LOH), joka kuvaa joko menetys tai vähentäminen toinen vanhempien alleeleja tietyssä sijainti kromosomissa, osoittaa läsnäolon CIN. Kromosomi-alueet 18q, 17p, 5q, ja 8p, jotka tarjoavat sataman keskeinen tuumorisuppressorigeeneille, on havaittu osoittaa laaja LOH CRC [1], [23].

On epäselvää,

BRAF

mutantti sahalaitaiset polyyppeja, jotka tulevat pahanlaatuisia mutta eivät metyloimaan

MLH1

ja eivät kehitä MSI, ilmeinen kromosomi epävakautta. Esimerkiksi jotkut viimeaikaiset tutkimukset ovat ehdottaneet, että CIMP ja CIN ovat toisensa poissulkevia [29], [30]. Vaikka tämä on yhtäpitävä diploidinen luonteen

BRAF

mutantti /MSI sahalaitaiset reitin syöpiä CIMP joka edetä kautta korkea mutaatiotapahtumaa nopeudella, se ei selitä, miten

BRAF

mutantti /MSS sahalaitaiset reitin syöpiä edistymistä ja erityisesti sitä, että niiden ennuste on erityisen huono [16], [29], [30], [31], [32].

Oletimme, että vaikka CIN voivat olla toisensa poissulkevia MSI, se ei ole toisiaan poissulkevia kanssa CIMP ja se voi olla yleinen

BRAF

mutantti /MSS syöpiä. MSI syöpiä on suljettu pois LOH-analyysi tämän ja aikaisempien tutkimusten takia dokumentoitu alhainen CIN aiemmin todettu, ja koska epävakauden mikrosatelliittimarkkerin hetkellä MSI syövissä ei mahdollista informatiivinen arvioida [26], [30] , [31], [32].

Materiaalit ja menetelmät

Ethics lausunto

Kirjallinen, tietoon perustuva suostumus saatiin kunkin potilaan mukana tässä tutkimuksessa. Tämä tutkimus hyväksyttiin Royal Brisbane ja naisten sairaala ja Bancroft Human Research eettisten toimikuntien.

Potilasnäytteet

1052 satunnaista CRC ja vastaaviin normaaleihin limakalvo näytteet saatiin, kun kirurginen Royal Brisbane ja naisten Hospital (RBWH), Queensland, Australia. Kliiniset tiedot, mukaan lukien potilaan ikä puhkeamista ja sukupuoli, anatominen sijainti, syöpä vaiheessa ja potilaiden hoitotuloksiin kerättiin mahdollisuuksien kuuluisi potilaan kaavioita, patologiaraporteista tai Queensland Death rekisterin. Anatominen sijainti määriteltiin joko proksimaalinen (proksimaalisesti pernan taipeet) tai distaalisen. Syöpä vaihe luokiteltu sekä amerikkalaisen sekakomitean Cancer (AJCC) ja kasvainten etäpesäkkeet (TNM) lavastus järjestelmiä [33].

MSI tila, CIMP, BRAF, KRAS ja p53-mutaation havaitsemiseen.

Näytteet oli aiemmin tutkittu MSI mukaan National Cancer Institute: n 5 merkki paneeli koostuu kahdesta mononukleotidi markkereita, BAT25, BAT26; ja kolme dinukleotidi markkereita, D5S346, D2S123 ja D17S250 [34]. MSI on luokiteltu, jos vähintään yksi mononukleotidi merkkejä ja vähintään yhden muun markkerin (joko mononukleotidi tai dinukleotidi) oli positiivinen [34], [35]. CIMP aikaisemmin selvitettiin MethyLightTM on viiden markkeripaneelin koostuu CACNA1G, IGF2, NEUROG1, RUNX3, SOCS1 [36], [37] _ENREF_35_ENREF_35. Syövät katsottiin CIMP positiivinen, jos 3 tai enemmän markkereita metyloitiin. Kaikki näytteet oli seuloa

BRAF

V600E (a1796t) mutaatio käyttäen alleelinen syrjintää määritystä, ja

KRAS

mutaatiot kodoneissa 12 ja 13 avulla Sequenom MassARRAY tekniikkaa [37]. Ilmaantuvuus

p53

mutaatio poikki eksonit 4-8 on aikaisemmin raportoitu kaikista syövistä mukana tässä tutkimuksessa [37].

Heterotsygotian menetys Analysis

Kromosomi epävakautta ( CIN) arvioitiin heterotsygotian menetys (LOH) analyysi yli yhteensä 12 loci kattaa 4 kromosomaalisia alueita, joiden tiedetään satama avain tuumorisuppressorigeeneille sekaantunut CRC. Nämä keskikeho 5q22.2 (joka sisältää

APC

geeni); 8p22 (liittyy CRC vaimennin alue); 17p13.1 (ulottuen

p53

locus), ja 18q (varten

Smad2

,

Smad4

ja

DCC

loci). Kolme merkkiä tutkittiin kullakin neljällä alueella (5q: D5S346, D5S1466, D5S489, 8p: D8S258, D8S254, D8S1121, 17p: 17S261, 17S578, D17S926, ja 18q: D18S55, D18S460, D18S487). Alukesekvenssit kunkin markkereita saatiin Ensembl verkkosivuilla (https://www.ensembl.org/index.html). (Lisätietoja LOH PCR-reaktioissa katso taulukko 1 Täydentävä data S1). Pariksi normaali ja syövän PCR-tuotteet ajettiin elektroforeesissa 5% polyakryyliamidigeelissä ja havaitaan radiologisesti.

LOH yksittäisten loci teki, jos yksi kahdesta alleelista syöpä näytteen, oli vähintään 40%: n vähennys voimakkuudessa verrattuna sen pariksi normaalissa näytteessä. Polymorfinen markkeri jossa kaksi vanhempien alleelien voitiin visualisoida pidettiin informatiivinen. Yleinen laajuus CIN havaittiin yli 12 loci, ja CIN positiivisuutta (CIN) on valittu, jos vähintään 1 informatiivinen markkeri havaittiin LOH. CIN negatiivisuus pisteytettiin, jos vähintään 40% (5 12) merkkiaineet olivat informatiivisia, ja mikään näistä osoitti LOH. Analyysiä CIN yksittäisten alueiden, 3 loci havaittiin ja pisteytettiin CIN jos ainakin yksi osoitti Loh, ja CIN negatiivinen, jos 2 3 lokuksille informatiivinen eikä osoittanut Loh.

murto alleeliset menetys (FAL) on aiemmin kuvattu [38]. Tämä lähestymistapa oli käytössä lisäanalyysiä läsnäolosta CIN, jossa kokonaismäärä alleelinen menetys tapahtumista jaettiin kokonaismäärä informatiivinen markkereita per näyte ja per kohortti. Käytimme tätä todentaa kokonaisesiintyvyys alleeliset menetys, ja korrelaatiot FAL ja vaiheessa esitys, syövän sijainti ja sukupuoli, ja molekyylitason ominaisuudet

p53

ja

KRAS

mutaatio, ja CIMP olivat määritetty.

tilastollinen analyysi

Merkittävät suhteet kategorisen datan arvioitiin käyttämällä Fisherin testiä (SPSS version 19; Graphpad ohjelmistot). Erot tietojen jatkuvan arvioitiin käyttäen t-testejä. Coxin suhteellisen vaaran malleja käytettiin tutkimaan vaikutuksia eri tekijöiden eloonjäämisaste jossa kuolema johtuu syövästä otettiin olevan tapahtuman kiinnostava. Log rank testillä arvioimaan vastaavuutta jakaumien soveltuvin osin. P-arvot ≤0.05 pidettiin merkittävinä.

Tulokset

BRAF Mutaatio MSS kolorektaalisyövissä

1052 syöpiä, 128 (12,2%) oli

BRAF

mutaatio. Näistä

BRAF

mutantteja, 60 (4,7%) oli MSS (

BRAF

mut /MSS) ja muodosti kokeellinen kohortissa. Tätä verrattiin satunnaisesti valittu ohjaus kohortin 90 MSS,

BRAF

villityypin syöpiä (

BRAF

paino /MSS).

BRAF

mut /MSS syöpiä pääasiassa sijaitsee proksimaalisessa paksusuolessa (33/48, 69%) verrattuna

BRAF

paino /MSS syöpiä (25/82, 30,5%) (p p = 0,01) ja oli ei-merkitsevä suuntaus ikä (68,6 vuotta proksimaalisen syöpiä vastaan 63,1 vuotta varten distaalinen syöpien; p = 0,1).

BRAF

mut /MSS syöpiä havaittu eroa nopeudella CIMP proksimaalisessa (17/27, 63,0%) verrattuna distaalisen suoliston (6/12, 50%), nopeudella

p53

mutaation proksimaalisen (14/31, 45,2%) tai distaalisen suolen (6/14, 42,9%), tai vaiheessa diagnoosi proksimaalisessa (10/21, 47,6%) verrattuna distaalisen suoliston (4/9, 44,4 %).

Kaiken BRAFmut /MSS kohortti eivät eronneet iän puhkeamista, sukupuolijakauma tai vaiheessa diagnoosin

BRAF

paino /MSS kohortti (taulukko 1). Molekyylirakennetta,

BRAF

mut /MSS syöpiä ei poikennut

BRAF

paino /MSS syöpiä laajuus

p53

mutaatio (21/57, 37% versus 42 /90, 47%), mutta ne olivat huomattavasti todennäköisempää osoittaa CIMP (27/47, 57% vs. 3/79, 4%) (p 0,0001) (taulukko 1).

BRAF

paino /MSS kohortti,

KRAS

mutaatio oli läsnä 41/90 (46%) syövistä (taulukko 1).

yleinen esiintyvyys Kromosomi Epävakaus (CIN) B

BRAF

mut /MSS ja

BRAF

paino /MSS syöpä ikäluokat näkyy erittäin informatiivinen merkkiaineita LOH 95% (57 60) ja 100% (90 90) vastaavasti.

Molemmat ikäluokat osoitti korkea CIN riippumatta

BRAF

mutaatiostatus, jossa 41/57 (72%)

BRAF

mutantti, ja 74/90 (82%)

BRAF

villityypin osoittaa CIN (taulukko 2). Murto alleelinen menetys (FAL) [38], joka kuvaa taajuuden alleelinen menetys tapahtumien joukossa kokonaismäärä informatiivisia tapahtumia, analysoitiin edelleen menetelmä määrällisesti kokonaismarkkinavoima CIN Kohortin.

BRAF

mut /MSS syöpien osoitti hieman alempi keskimääräinen FAL verrattuna

BRAF

paino /MSS syöpiä (132/428 = 0,308, versus 286/745 = 0,384), mutta tämä ero oli ei tilastollisesti merkitsevä (p = 0,1) (taulukko 3).

CIN at Yksittäiset kromosomialueita

BRAF

mut /MSS syövät osoitti CIN korkeimmalla taajuuden 8p geenivirhe (26 44, 59%), ja vähiten on 5q alue (19 49, 39%).

BRAF

paino /MSS syöpiä oli korkein taajuus CIN klo 17p (43 65, 66%), ja alhaisimpia CIN + at 5q (43 80, 54%) ja 8p (39 72, 54%) (taulukko 2).

BRAF

paino /MSS syöpien oli korkeampi taajuus CIN tapahtumia verrattuna

BRAF

mut /MSS syöpiä esiintyviä yksilötason kromosomaalisia alueita 5q, 17p ja 18q. Tämä suhde oli tilastollisesti merkitsevä 18q, 60% (50 83) on

BRAF

paino /MSS syövät osoittavat CIN, verrattuna 40% (19 48) on

BRAF

mut /MSS syöpiä CIN tässä loci (p = 0,03) (taulukko 2).

p53 mutaatioaste ja läsnäolo CIN

mutaatio

p53

korreloi poistamisen

p53

lokuksen (kromosomin 17p) (taulukko 2). Taajuus

p53

mutaatio suhteessa CIN syystä tutkittiin, lukuun ottamatta 17p tietojen välttämiseksi yliarviointi yhdistys, joka voidaan ajaa sisällyttämällä LOH positiivisia markkereita ympäröivä

p53

lokuksen. Perustuen kromosomissa 5q, 8p ja 18q loci;

BRAF

paino /MSS kohortti, 38/70 (54%) CIN syöpien oli samanaikainen

p53

mutaatio, verrattuna vain 4/20 (20%) ja CIN-negatiivinen syövät (p = 0,01).

BRAF

mutantti /MSS syöpien osoitettiin samanlainen, mutta ei-merkittävä suuntaus, jossa 16/37 (43%), CIN syöpiä, joilla on

p53

mutaation verrattuna vain 4/17 (24% ) CIN-negatiivinen syöpiä (taulukko 2). Sisällä

BRAF

paino /MSS kohortin LOH lainkaan yksittäisten kromosomialueita korreloi merkitsevästi korkeampi esiintyvyys

p53

mutaatio (taulukko 2). Keskimäärin FAL per kohortti osoitti korkeampaa tappio samaan aikaan

p53

mutaation verrattuna villityypin varten

p53

, merkittävästi niin

BRAF

paino /MSS syöpiä ( p = 0 0,001) (taulukko 3).

KRAS mutaatioaste ja läsnäolo CIN in BRAFwt /MSS Syövät

BRAF

ja

KRAS

mutaatiot varmistettiin olevan toisensa poissulkevia.

BRAF

paino /MSS syöpien oli 46% (41 90)

KRAS

mutaatioaste (taulukko 1). Ei ollut merkittävää yhdistyksen välillä

KRAS

mutaatio ja CIN näissä syövissä, joissa on

KRAS

mutaatio läsnä 43% (32 74) CIN syöpiä ja 56% (9 16) CIN-negatiivinen syöpiä (taulukko 2). Mielenkiintoista on CIN syöpien, keskimääräinen FAL oli merkitsevästi pienempi

KRAS

mutantti verrattuna

KRAS

villityypin syöpiä (p = 0,045) (taulukko 3).

CpG Island Methylator Fenotyyppikuvaus (CIMP) ja CIN in BRAFmut /MSS syövät

CIMP oli läsnä 57% (27 47)

BRAF

mut /MSS syöpiä, kun taas vain 4% (3 79 )

BRAF

paino /MSS syöpiä näytetään CIMP (taulukko 1). Mielenkiintoista, huomattava osa

BRAF

mut /MSS syöpiin osoitettu sekä CIMP ja CIN, jossa 72% CIMP korkea

BRAF

mut /MSS syöpiä osoitti CIN (taulukko 2).

CIN ja kliinis data

läsnäolo CIN ei vaikuttanut alkamisiällä ja sukupuolen jakaumat (taulukko 2 täydentävä data S1). Nopeus CIN eivät muuttuneet riippumatta siitä, onko syöpä peräisin proksimaalisesta tai distaalisen paksusuolen joko kohortin taajuuden alleelien menetys (FAL)

BRAF

mut /MSS syövät 0,33 ja 0,32; ja

BRAF

paino /MSS 0,33 ja 0,42 varten läheisten ja etäisten syöpiä (taulukko 3, taulukko 2 Täydentävä data S1).

BRAF

mut /MSS syöpiä, CIN merkitsevästi yhteydessä pitkälle, esiintyvät 15 17 (88%) vaiheen III /IV syövät verrattuna 6 13 (46%) vaiheen I /II syöpiä (p = 0,02) (taulukko 4). Keskimääräiset FAL tulokset olivat yhdenmukaisia ​​tämän toteamuksen, yhä FAL korreloivat etenee vaiheeseen

BRAF

mut /MSS CIN syöpiä (p = 0,03) (taulukko 3). Sen sijaan

BRAF

paino /MSS ryhmässä oli korkeita CIN niin myöhään ja alkuvaiheessa esityksen 27/33 (82%) vaiheen III /IV, ja 31/37 (84%) vaihe I /II CIN syöpiä (taulukko 4). Tämä osoitettiin myös samanlainen FAL hinnat löytyy

BRAF

paino /MSS myöhään verrattuna alkuvaiheen syöpien (taulukko 3).

Between ikäluokat, merkitsevästi pienempi useita

BRAF

mut /MSS CIN positiivinen syövät esitellään alkuvaiheessa I /II verrattuna

BRAF

paino /MSS syöpiä CIN. Tämä ilmeni yleinen (p = 0,02) ja yksittäisten alueiden 5q, 17p ja 18q (p = 0,02, p = 0,04, p = 0,01 vastaavasti). Nopeus CIN positiivisia syöpiä esitettävänään vaiheissa (III /IV) oli samanlainen molemmissa ikäluokat (taulukko 4).

kasvainten ilman imusolmuke osallistumista, 6/13 (46%)

BRAF

mut /MSS syöpien osoitti CIN verrattuna 36/42 (86%)

BRAF

paino /MSS syöpiä (p = 0,007) (taulukko 4).

BRAF

mut /MSS syöpien osoitti suuntaus Nousevien korkojen CIN samaan aikaan levisi ainakin yksi imusolmuke (p = 0,07). Vaikka ei ole merkittävä, nämä CIN syöpien oli myös korkeampi metastaasien 100% verrattuna määrä CIN syövät ilman metastaaseja 65%.

BRAF

paino /MSS syöpien osoitti samantasoista CIN tai ilman imusolmuke levitä tai etäpesäkkeitä (taulukko 4).

BRAF

mut /MSS syöpiä näytetään co-esiintymiseen CIMP ja CIN, suurempaa enemmistöä esitettiin myöhäisessä vaiheessa (III /IV) (10/16, 63%), verrattuna esitettävänään alkuvaiheessa (I /II) (4/13, 31%) , vaikka tämä ei saavuttanut merkitystä (taulukko 3 täydentävä data S1).

Coxin suhteellisen vaaran malleja tutkittaessa käytettiin yleistä syöpään erityisiä eloonjäämistä potilailla, joilla on CIN syöpiä. Ottaa huomioon mahdolliset vaikuttavat sekoittavat muuttujien

BRAF

tila (

BRAF

mut /MSS ja

BRAF

paino /MSS) ja vaihe (I /II ja III /IV ), yhdessä kaikkien tilastollisesti merkitsevä korkeammat vuorovaikutuksia, sisällytettiin malliin. Ei merkittäviä suhteita läsnäolon yleisestä CIN ja eloonjääminen osoitettiin joko kohortin (

BRAF

mut /MSS p = 0,81,

BRAF

paino /MSS p = 0,22). Kuitenkin analyysi yksittäisten loci paljasti

BRAF

mut /MSS syöpiä CIN at 18q ja 8p on merkittävästi huonompi selviytyminen kerran oikaistu vaiheessa (p = 0,02, p 0,05 vastaavasti) (taulukko 5).

BRAF

paino /MSS syöpiä havaittu eroa eloonjäämisluvuissa riippumatta CIN tilan yksittäisiä loci (taulukko 5).

Potilaat, joilla on

BRAF

mut /MSS syöpiä oli huonompi eloonjäämisluvut verrattuna niihin, joilla

BRAF

paino /MSS syövät kerran oikaistu vaiheessa riippumatta läsnä ollessa tai ilman CIN (HR = 3,4, 95% CI [1,65, 6,99], p = 0,001 ).

keskustelu

kolorektaalisyövissä johtuvat kautta sahalaitaiset neoplastiset reitin on tunnusomaista tiheä

BRAF

mutaatio, MSI ja CIMP. MSI syöpiä on tutkittu laajasti, ovat diploidinen ja antavat erinomaisen ennuste. Koska MSI,

BRAF

mutaatio korreloi erityisen huono potilaiden hoitotuloksiin. Tutkimus kertoo, että korkeatasoinen CIN näkyy

BRAF

mutantti /MSS syöpiä ja tämä osoittaa ainakin yksi mekanismi perimän epävakaisuuden jolla näiden syöpien muodostavat ja edistystä. CIN arvioitiin kanssa Heterotsygotian menetys (LOH) analyysin CIN määritetä, jos ainakin yksi kahdestatoista markkereita oli positiivinen LOH. Keskimääräinen suhteellinen alleelinen menetys (FAL) [38], joka katsoo määrän markkereita osoittaa LOH suhteessa määrä informatiivinen markkereita, laskettiin myös edelleen tarjota määrällisesti mitta määrä CIN. Molemmat menetelmät löytyi samalla korkeat taajuudet CIN esiintyvien MSS syövissä riippumatta

BRAF

mutaatiostatus. Monet CIN positiivisen

BRAF

mutantti /MSS syöpien osoitti CIMP ja näin ollen tämä tutkimus haastaa uskossa, että CIN ja CIMP ovat toisensa poissulkevia. Se antaa lisänäyttöä,

BRAF

mutantti /MSS syövät ovat pohjimmiltaan erilaisia ​​niiden MSI kollegansa vaikka molemmat mahdollisesti syntyvät

BRAF

mutantti sahalaitainen polyypit.

BRAF

mutantti /MSS syövät ovat tärkeä alaryhmä paksusuolisyövän koska niiden yhteydessä on erityisen huono potilaan ennustetta. Kuitenkin, johtuen niiden suhteellisen alhainen esiintyvyys on noin 5-7% kaikista paksusuolen syövän molekyylimekanismeja taustalla huono lopputulos ei ole hyvin tutkittu. Tunnistamalla 60

BRAF

mutantti /MSS syövät suuresta sarjasta 1052 potilasta, tarvittava voima oli saavutettu tutkia taajuus CIN suhteessa muihin kliinisiin ja molekyylitason muuttujia. Se on vakiintunut, että

BRAF

mutantti syöpien pääasiallisesti esiintyvät proksimaalisessa paksusuolessa [12], [18], [37]. Varmasti suurin osa

BRAF

mut /MSS syöpiä tässä tutkimuksessa olivat tältä alueelta (69%), mutta ei ollut eroa nopeudessa CIN löytyy proksimaalisesta verrattuna distaaliseen syöpiä (taulukko 3; Taulukko 2. Täydentävät tiedot S1).

Olemme aiemmin osoittaneet, että

BRAF

mutantti /MSS syövistä on vertailukelpoinen määrä

p53

mutaation

BRAF

villityypin /MSS syöpiä, ja tämä oli huomattavasti suurempi kuin

p53

mutaationopeutta löytyy

BRAF

mutantti /MSI syöpiä. Lisäksi kliinis dataa

BRAF

mutantti /MSS syöpien ja

BRAF

villityypin /MSS syöpiä, myös korreloi kannalta pitemmälle esityksen, verrattavissa iät puhkeamista, ja yhtäläinen sukupuolijakauma [37]. Laaja aste CIN löytyy

BRAF

villityypin /MSS syöpien on hyvin dokumentoitu. Kuten

BRAF

mutantti syöpiä arvellaan olevan peräisin sahalaitainen polyyppi, ja

BRAF

mutantti syöpiä, jotka ovat mikrosatelliittimerkkien epävakaita ovat diploidinen; se voidaan oletettu, että

BRAF

mutantti /MSS syöpiä olisi myös CIN-negatiivinen. Kuitenkin perustuvat aiempien toteamiseen useiden molekyyli- ja kliinisten yhtäläisyyksiä kaksi MSS alaryhmää [37], me arveltu, että kromosomi epävakaus edistäisi etenemisen huomattava osa

BRAF

mutantti /MSS syöpiä. Tässä esitetyt tiedot tukevat tätä olettamusta. Olemme edelleen hypoteesin, että

BRAF

mutanttisoluja, hankinta CIN on yhdenmukainen selviytymisen vain puuttuessa Mikrosatelliittimarkkerien epävakautta. Löytää niin samalla korkeat CIN esiintyviä suuren kohortin

BRAF

mutantti /MSS syövät tarjoaa lisätodisteita molekyylitasolla yhtäläisyyksiä esiintyy näiden kahden MSS alaryhmää vaikka voidaankin edetä sahalaitaiset polyypit, ja muut tavanomaisista adenoomia.

läsnäolo CIN tutkittiin yli kahdentoista markkereita ulottuen neljällä kromosomialueita yleisesti poistettu kolorektaalisyövässä (kromosomit 5q, 8p, 17p ja 18q). Vaikka yleinen määrä CIN oli korkea sekä

BRAF

mutantin ja villityypin ikäluokat, tutkiminen yksittäisten loci paljasti eroja ikäryhmien taajuusalueella CIN tapahtumaa loci.

BRAF

mutantti /MSS syöpiä oli suurimmassa määrin CIN on 8p kromosomi varsi, ja vähiten on 18q alueella. Sen sijaan

BRAF

villityypin /MSS syövät oli korkein taajuus epävakaudesta 17p käsivarteen, ja ainakin 8p ja 5q. Merkittävä ero määrä CIN ryhmien välillä voitiin todeta 18q kromosomialueen kanssa

BRAF

villityypin /MSS syöpiä, joilla on merkittävästi suurempi tappio klo 18q kromosomialueella. Kromosomi 18q21.1 suhtautuu tuumorisuppressorigeeneille

Smad4, Smad2

ja

poistaa peräsuolen

syöpä (

DCC

) geenejä.

Smad4 Twitter /

2

geeni kompleksi osallistuu signaalinvälitykseen TGF-beeta-reitin ja varsinkin alkuvaiheessa tuumorigeneesiä voi säätelemään kohdegeenien tuloksena pidätettiin kasvun ja apoptoosin [ ,,,0],39], [40]. Sisällä MAPK-kinaasireitin, poikkeavan aktivaation alavirran efektoreita

BRAF

on havaittu moduloivan TGF-beeta-välitteistä signalointia

Smad

s [39], [41], jossa

ERK

on liitetty estämällä

Smad

tumaansiirtymiseen [42]. Kuten

BRAF

mutantti /MSS syövistä on konstitutiivisesti aktiivinen MAPK-reitin menetys

Smad

loci saattaa olla turha ja voisi auttaa selittämään huomattavasti alhaisempi poisto osoitteessa 18q aluetta näiden verrattuna

BRAF

villityypin /MSS syöpiä.

DCC

edellyttää epigeneettiset äänenvaimennusjärjestelmän [43] ja se voidaan kohdistaa tämän mekanismin sijasta poiston

BRAF

mutantti syöpiä. Kaiken kaikkiaan erot määrä CIN osoitteessa yksittäisten alueiden, osoittavat, että tietyt lokuksen ensisijassa poistetaan inaktivoimiseksi asuville tuumorisuppressorigeeniä mukaan geneettisen taustan syöpä.

menetyksen sattuessa yksi alleeli on tyypillisesti edeltää tai seuraa mutaatiomuutoksilla tapauksessa toisen alleelin samalla alueella inaktivoimiseksi kohde tuumorisuppressorigeenin. Tämä näkyi esillä olevassa tutkimuksessa, jossa sekä

BRAF

mutantin ja villityypin syövät,

p53

mutaatio korreloi CIN klo 17p. Keskimäärin FAL pisteet laskettiin uudelleen perustuvat kromosomeissa 5q, 8p ja 18q poistamiseksi vaikutuksen 17p CIN on

p53

mutaatioaste. Mutaatio

p53

korreloi merkitsevästi korkeampi FAL pisteet CIN in

BRAF

villityypin syöpiä. Samanlainen, mutta ei-merkitsevä suuntaus oli nähtävissä

BRAF

mutantti syöpiä. Nämä tiedot tukevat hypoteesia, että

BRAF

mutantti syövät eivät ole täysin erilaisia ​​kuin kautta syntyvät perinteisen adenooma-karsinooma-reitin, mutta se voi jakaa useita molekyyli- ominaisuuksia, joita tarvitaan kasvaimen etenemistä.

Se on ollut olettaisi, että CIN ja CIMP ovat toisensa poissulkevia [29], [30]. Kiinnostavaa kyllä, tämä tutkimus osoittaa selvästi tiheä CIN ja CIMP yhteistyössä esiintyminen

BRAF

mutantti /MSS syöpiä (72%), mikä viittaa siihen, nämä muodot geneettiset ja epigeneettiset epävakaudet voivat toimia tässä molekyylitason mekanismeja. Nämä havainnot korostavat tarvetta ositus tunnistaa molekyyli- piirteitä tärkeitä syövän alaryhmien. Käänteinen suhde CIN ja CIMP on aikaisemmin havaittu pääasiallisesti

BRAF

villityypin syöpä kohortti, jossa vain 9

BRAF

mutantti /MSS syöpiä tutkittiin [29]. Alhainen CIN on löydetty CIMP positiivisia syöpiä käyttämällä genomin monenlaisia ​​lähestymistapa, mutta

BRAF

mutaatiostatuksesta riippumatta ei arvioitu [44]. Puute yhdistys raportoitu näissä tutkimuksissa todennäköisesti heijastaa alhainen taajuus CIMP in

BRAF

villityypin syöpiä. Esillä olevassa tutkimuksessa, CIMP esiintyi vain 4%

BRAF

villityypin syövät, esteenä merkittävää analyysia CIMP korreloivat CIN tässä alaryhmässä.

BRAF

mutantti /MSS syöpiä, huomattavasti lisääntyvää yleistä CIN löydettiin pitkälle edennyt esitys (taulukot 3 ja 4), mikä viittaa siihen, että CIN voivat edistää etenemistä tämän syöpätyyppi. Tämä malli havaittiin myös kromosomaalisen alueiden 18q ja 17p (taulukko 4). Huomattava määrä CIN klo 8p alueella esiintyvät sekä varhaisen ja myöhäisen vaiheen, voi selittää tätä aluetta osoittavat suurinta nopeutta CIN tämän syöpätyypin, ja lisäksi voi sotkea rooli menetyksen olevan 8p tuumorisuppressorigeenin aikaisin sairauksien kehittymisestä.

Sitä vastoin yleistä CIN ja kaikki yksittäiset kromosomialueita,

BRAF

villityypin /MSS syövät osoitti vertailukelpoisia hintoja CIN varhaisessa ja myöhäisessä vaiheessa, ja tämä viittaa siihen, että CIN on tärkeää aloittamisen tai aikaisin etenemistä tämän syövän alaryhmä. Korkeampi keskimääräinen suhteellinen alleelinen menetys (FAL) pisteet havaittiin

BRAF

villityypin versus mutantti MSS syöpiä voidaan heijastaa aikaisempaan alkamiseen CIN ja siksi suurempi kertyminen CIN tapahtumia (taulukko 3).