Krooninen sairaus

tiivistelmä

tavoite

Kuoleman-Associated Protein Kinase 1 (

DAPK1

) geeni on usein tutkittu kohdunkaulan syövän (CC). Tavoitteena tässä tutkimuksessa oli suorittaa järjestelmällinen katsaus ja meta-analyysi, jotta voidaan arvioida

DAPK1

promoottori Metylointia epigeneettisestä merkkiaineena CC riskin.

Methods

systemaattinen kirjallisuushaku suoritettiin. Cochrane ohjelmistopaketti Review Manager 5.2 käytettiin. Kiinteän vaikutuksia tai random-vaikutus malleja, mukaan heterogeenisuus tutkimuksissa käytettiin laskettaessa kertoimet suhde (syrjäisimmillä alueilla) ja 95% luottamusväli (CI). Lisäksi alaryhmäanalyyseissa suoritti histologinen tyyppi, määrityksiä käytetään arvioitaessa

DAPK1

promoottorin metylaation, ja kontrollinäyte lähde.

Tulokset

Yhteensä 20 papereita, julkaistu välillä 2001 ja 2014 on 1929 näytettä, otettiin mukaan meta-analyysi.

DAPK1

promoottori metylaatio liittyy suurentunut CC riski perustuu sattumanvaraiset vaikutukset malli (OR: 21.20; 95% CI = 11,14-40,35). Jättäen pois kaikkein heterogeeninen tutkimuksessa välinen tutkimus heterogeenisyys vähentynyt ja yhdistyksen lisääntynyt (OR: 24.13; 95% CI = 15,83-36,78). Yhdistys vahvistettiin myös kaikissa alaryhmissä analyysit.

Johtopäätökset

Merkittävä vahvan yhteyden

DAPK1

promoottori metylaatio ja CC osoitettiin ja vahvistettiin itsenäisesti histologinen kasvain tyyppi, käytetystä metodista metyloinnin ja lähde kontrollinäytteiden. Metylointi markkereita voi olla arvoa aikainen havaitseminen CC esiasteleesioita, lisää laitteen vakuutteluista turvallisuuden naisia, jotka ovat ehdolla harvemmin näyttöjä, ja ennustaa tuloksia tartunnan saaneiden naisten ihmisen papilloomavirus.

Citation: Agodi A, Barchitta M, Quattrocchi A, Maugeri A Vinciguerra M (2015)

DAPK1

Promoottori metylointi ja kohdunkaulan syövän riski: järjestelmällinen katsaus ja meta-analyysi. PLoS ONE 10 (8): e0135078. doi: 10,1371 /journal.pone.0135078

Editor: Raffaele A. Calogero, University of Torino, Italia

vastaanotettu: 26 helmikuu 2015; Hyväksytty: 17 heinäkuu 2015; Julkaistu: 12 elokuu 2015

Copyright: © 2015 Agodi et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään

Data Saatavuus: kaikki asiaankuuluvat tiedot kuuluvat paperin ja sen tukeminen Information tiedostoja.

rahoitus: kirjoittajat eivät tuki ja rahoitus raportoida.

kilpailevat edut: kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä olemassa.

Johdanto

Kohdunkaulan syöpä (CC) on toiseksi yleisin syöpä naisilla maailmanlaajuisesti [1, 2]. Tunnistaminen ja naisten hoito kohdunkaulan intraepiteliaalisten neoplasia (CIN) tai karsinooma

in situ

(CIS), edeltäjä vauriot invasiivisen CC, ovat tärkeä osa ehkäisyn CC [3]. CC syntyy selvästi havaittavia morfologisia muutoksia normaalista epiteelin ja etenee carcinoma läpi sarjan hyvin määritelty ennalta invasiivisia vaurioita. Histologisesti, CC esittelee joko okasolusyöpä (SCC) tai adenokarsinooma (AC) [4], jossa SCC on vallitseva. Pysyvyys ihmisen papilloomaviruksen (HPV) on tärkein etiologinen tekijä kehittämiseen CC ja esiasteleesioita [5, 6]. Kuitenkin vain pieni osa HPV-tartunnan CIN vaurioita edetä kohdunkaulan syöpä, siten, muiden isäntä tekijät osansa kohdunkaulan syövän synnyn [2, 7].

Niistä otaksuttu molekyylitason muutoksia mukana neoplastisten prosessissa , poikkeava metylaatio saattaa olla ratkaiseva tapahtuma oncogenesis [8]. Tuore meta-analyysi vahvisti, että maailmanlaajuinen DNA metylaatiotasoilla, kudoksissa useiden syöpien, olivat merkittävästi alhaisemmat syöpäpotilailla kuin terveillä verrokeilla [9]. Noin 60% kaikista ihmisen promoottorien liittyy CpG saaria. Genomissa transformoimattomien solujen, ~ 90% kaikista promoottorit ovat metyloimattomia [10]. Sitä vastoin syöpä, metyloinnin CpG alueiden geenin promoottori liittyy sopimatonta transkription repression ja geenin toiminnan lopettamisesta. Merkittävästi monet inaktivoidun geenit ovat tuumorisuppressorigeenit [11,12] ja estämällä näiden geenien metylointi on osallisena syövän aloittamista, kehitys, ja etenemiseen [13]. Vaikka on vaikea määrittää, ovatko tällaiset epigeneettisellä muutokset ovat aiheuttajaa tai välillisistä syövän, on näyttöä siitä, että ne voivat esiintyä aikaisin neoplastisia prosessi [14]. Äskettäin rooli epigeneettiset mekanismit geenin toiminnan lopettamisesta on tutkittu kohdunkaulan oncogenesis [13,15-19].

joukossa mukana geenit, Death-Associated Protein Kinase 1 (

DAPK1

) geeni on usein tutkittu CC. DAPK1 on uusi 160 kd kalmoduliinista riippuvaa seriini /treoniini-kinaasi, joka toimii positiivisen välittäjänä apoptoosin, kun taas apoptoosi linkkejä kehittämiseen, etenemisen ja etäpesäkkeiden ihmisen syövän [20]. DAPK1 C-terminaalista seriini-rikas hännän peptidi, joka säilyy kuolemaan-domain sisältävät proteiinit, näyttelee negatiivinen säätelevä rooli inhibitioon DAPK1, kun taas poistaminen tämän alueen lisää tappaminen toimintaa [21]. Hypermetylaatiota

DAPK1

on usein raportoitu erilaisten syöpien tyypit, mukaan lukien paksusuolen [22], pään ja kaulan [23], virtsarakon [24], keuhkosyöpä [25-27], B-solujen lymfooma [28] ja munasarja [29]. Lisäksi se on liittynyt edennyt pitkälle kasvaimen kehitystä [30] ja huonon ennusteen ei-pienisoluinen keuhkosyöpä [31]. Koska DAPK1 on positiivinen välittäjänä apoptoosin, vaiennettaisi

DAPK1

poistanut DAPK välittämän apoptoosin ja ehkä sitten nopea etäpesäke syöpäsoluissa [32]. Lisäksi soluja, joista puuttuu

DAPK1

ilmentymisen kautta promoottorin metylaation tuli invasiivinen ja metastaattinen [33].

lisäksi toiminnallisen vaikutukset geenin inaktivaatio kasvainten kehittymiseen, geenejä, jotka ovat usein poikkeuksellisesti metyloitu tiettyjä kasvaimia on käytetty molekyylikohteista havaitsemiseksi neoplastisten solujen kehon nesteiden tarjoamalla lisätavoitteita ei-invasiivisia varhainen diagnoosi ja syövän seuranta [34-36]. Siten kehittää paneeli metylaation markkereita voi olla arvoa aikainen havaitseminen CC esiasteleesioita, lisää laitteen vakuutteluista turvallisuuden naisia, jotka ovat ehdolla harvemmin näyttöjä, ja ennustaa tuloksia tartunnan saaneiden naisten HPV [34].

tavoitteena tämän tutkimuksen tarkoituksena oli suorittaa systemaattinen tarkastelu ja meta-analyysiin, jotta voidaan tiivistää nykyiset julkaistut tutkimukset ja arvioida

DAPK1

promoottori Metylointia epigeneettisestä merkkiaineena CC riski.

Methods

haku strategiaa ja valintakriteerit

Ensinnäkin systemaattisen kirjallisuudesta toimialalla Medline tietokannan avulla PubMed, suoritettiin epidemiologisissa tutkimuksissa, jotka on julkaistu ennen heinäkuuta 2014 tutkii assosiaatio-geenin promoottorin metylaation ja CC riski. Kirjallisuudesta suoritettiin itsenäisesti kaksi Tekijät käyttämällä avainsanoja ”promoottori metylaatio” ja ”kohdun neoplasiaa”. Etsintöjen rajoittuivat tutkimusten kirjoitettu Englanti; tiivistelmiä ja julkaisemattomia tutkimuksia ei ole mukana. Lisäksi viiteluetteloihin valikoiduista artikkeleista tarkastettiin etsimään uusia asiaa koskevat tutkimukset. Tavoitteena Ensimmäisen valinta oli tunnistaa tutkimuksia, selvitettiin yhdistyksen välillä promoottorin metylaation tahansa geenin ja CC riski; Tutkimuksia ei ole sulkea pois heikkous suunnittelun tai datan laatua. Niinpä artikkelia valittiin vain jos ne täyttivät seuraavat kriteerit: i) tapausverrokkitutkimuksista tai kohorttitutkimuksen malleja, ja ii) tutkimukset, jotka arvioitiin yhdistys geenin promoottorin metylaation ja CC. Myöhemmin koska

DAPK1

geeni on tunnistettu yleisimmät analysoitu ja tutkittu geeni, meta-analyysi artikkeleita raportointi assosiaatiota

DAPK1

promoottori metylaatio ja CC riskin suoritettiin. Niinpä sisällytettäväksi kvantitatiivisen analyysin, tutkimukset oli täytettävä seuraavat kriteerit: i) tutkimukset, jotka arvioitiin yhdistyksen välillä

DAPK1

metylaatio ja CC ja ii) edellyttäen tietoa taajuus

DAPK1

metylaatio syövän ja kontrolliryhmissä. Lisäksi poissulkemisperusteet olivat seuraavat: i) tutkimuksiin, jotka eivät käytä kuorinnan soluja, kohdunkaulan biopsiat tai virtsoissa näytteitä ja ii) jotka ohjaavat tai syöpä ryhmien mukana yksilöiden erilaisia ​​syövän esiasteita. Edullinen raportointi eriä järjestelmälliseen arvostelut ja meta-analyysi (PRISMA) koskevia ohjeita noudatettiin [37] (S1 ja S2-tiedostot).

Data louhinta ja laadun arviointiin

Kaksi Tekijät itsenäisesti uudelleen kaikki tukikelpoiset tutkimukset ja otetun seuraavat tiedot vakiomuodossa: ensin tekijän sukunimi, julkaisuvuosi, maan, jossa tutkimus tehtiin, näytetyyppi, kokeellisia menetelmiä arvioida

DAPK1

metylaatio ja tapausten määrä ja ohjaa aiheista.

tilastollinen analyysi

Kaikki tiedot analysoitiin käyttämällä Review Manager 5.2 ohjelmisto tarjoaa Cochrane Collaboration (https://ims.cochrane.org/revman).

Puun käyrät laadittiin havainnollistamaan tutkimuksittain vaikutus koot yhdessä 95%: n luottamusväli. Kiinteän vaikutuksia tai random-vaikutus malleja, mukaan heterogeenisuus tutkimuksissa käytettiin laskettaessa syrjäisimmille alueille ja 95% CI voidakseen arvioida yhdistyksen välillä

DAPK1

promoottori metylaatio ja CC riski. Jos arvo on nolla määrän promoottorin metylaation tapahtumien aiheuttamia ongelmia laskenta syrjäisimpien alueiden yksittäisten tutkimusten Review Manager 5.2 ohjelmisto tarjotaan lisätä arvoa 0,5 kaikkiin soluihin liittyvien ristiintaulukointikysely [38].

heterogeenisuus tutkimuksissa mitattiin käyttäen Q-testi perustuu χ2 tilastotieto, kun otetaan huomioon merkittävät tilastollinen heterogeenisyys p 0,1. Koska Cochranin testi osoittaa vain läsnäolon heterogeenisyys eikä sen suuruutta, myös raportoitu I

2 tilastotieto, joka arvioi prosenttiosuus tuloksen vaihtelua, joka voidaan katsoa heterogeenisuus tutkimuksiin. I

2 arvo 0% tarkoittaa ei havaittu heterogeenisyys, kun taas 25% on ” alhainen ”, 50% on ” kohtalainen” ja 75% on ” korkea ”heterogeenisyys [39]. Olemme myös arvioi Tutkimusten välisten varianssi käyttämällä tau-squared (t) tilastotieto [40].

Lisäksi alaryhmä-analyysit suoritettiin histologinen tyyppi (SCC ja AC), jonka määrityksiä käytetään arvioitaessa

DAPK1

promoottori metylaatio (metylaatiospesifisen PCR-MSP ja reaaliaikainen kvantitatiivinen MSP-qMSP), ja kontrollinäyte lähteestä (normaali kohdunkaulan kudoksissa-NT ja hyvänlaatuinen kohdunkaulan kudosten-BCT). Herkkyysanalyysi suoritettiin löytää suhteellisen huonolaatuisen tutkimusten mukaan laiminlyönti yhden tutkimuksen kerrallaan ja nähdä, onko tietty puute saattaa vaikuttaa yleiseen OR arvon ja heterogeenisyys eri tutkimuksissa.

määrittämiseksi läsnäolo julkaisu bias, symmetriaa suppilon tonttien jossa syrjäisimpien piirrettiin niiden vastaavat keskivirheet arvioitiin.

tulokset

Hakutulokset ja tietojen ominaisuudet

yksityiskohtaiset vaiheet järjestelmällinen katsaus ja meta-analyysi prosessin annetaan PRISMA vuokaavio (kuva 1). Kaikkiaan 519 artikkelia haetaan tietokannasta. Sen jälkeen poissulkeminen tutkimuksia, jotka eivät täyttäneet kriteereillä,

DAPK1

johti yleisin analysoitu geeni. Myöhemmin yksi artikkeli lisättiin manuaalisella etsimistä viitaten lista ja siten 27 papereita, joka julkaistiin vuosina 2001 ja 2014, sisällytettiin systemaattinen tarkastelu ja yhteenveto taulukossa 1. Yhteensä 13 tutkimukset olivat Aasian maista (48%) [13 , 17, 36, 41-50], 6 Euroopan maista (22%) [3, 16, 51-54], 5 USA (19%) [55-59] ja 3 Afrikasta (11%) [60 -62]. Kaikki tutkimukset arvioitiin

DAPK1

promoottori metylaation SCC ja 12 tutkimuksessa (44,4%) myös AC. Mitä tulee menetelmän promoottorin metylaation arvioinnin ”kultainen standardi menetelmä”, jota käytetään useimmissa tutkimuksissa (67%), oli MSP, jonka jälkeen qMSP (26%), sekvensointi (3,5%) ja metylointi erityiset-multiplex ligaatio-riippuvainen koettimen monistamisen (MS-MLPA) (3,5%).

Meta-analyysi

Niistä 27 valittujen artikkeleita, 4 tutkimuksiin ilman kontrolliryhmä, 2 kokeissa, jotka ovat precancerous vaurioita hallinnassa tai jos ryhmissä ja 1 tutkimus, joka on raportoitu riittävästi tietoa, suljettiin pois meta-analyysi. Siten 20 tutkimukset (74%) arvioidaan

DAPK1

promoottorin metylaation sekä kasvaimen ja terveillä verrokkinäytteet sisällyttää esillä meta-analyysi. Kaiken kaikkiaan tutkimuksissa raportoidut tulokset on saatu 1929 näytteistä: 1092 syöpäpotilaista ja 837 vertailuryhmästä. Mitä lähde kontrollinäytteiden 10 tutkimuksissa arvioitiin

DAPK1

promoottori metylaation BCT potilailta, joilla on gynekologisia sairauksia, kuten kohdun myoomaan, adenomyoma, ja kohdun esiinluiskahdus, 8 tutkimukset NT terveistä ihmisistä ja 2 tutkimukset normaaleissa kohdunkaulan kudokset vieressä kasvain.

DAPK1

promoottori metylaatio liittyy suurentunut CC riski kanssa yhdistetty OR 19.97 (95% CI = 13,57-29,38), joka perustuu kiinteiden vaikutusten mallia. Kuitenkin, johtuen merkittävän heterogeenisuus (I

2 = 49%; p = 0,007), joka on yhdistetty OR 21.20 (95% CI = 11,14-40,35), joka perustuu sattumanvaraiset vaikutukset malli, saatiin (kuvio 2) . Alaryhmä analyysit tehtiin histologiset tyypit, menetelmiä metylointianalyysi ja lähteitä kontrollinäytteiden. Yhdistyksen välillä

DAPK1

promoottori metylaatio ja CC vahvistettiin kunkin alaryhmän (S1 taulukko).

Lisäksi herkkyysanalyysissä löysi tutkimuksen Yang et al. (2010) [54], koska suhteellisen huonolaatuista tutkimus. Kun tässä tutkimuksessa [54] oli pois, välillä tutkimuksen heterogeenisyys laskenut I

2 = 39% (p = 0,04), ja yhdistyksen välillä

DAPK1

promoottori metylaatio ja CC riski lisääntynyt (OR: 24.13 ; 95% CI = 15,83-36,78) (S1 kuvio) B

Alaryhmien analyysissä jättämällä heterogeeninen tutkimuksen [54] tehtiin. Alaryhmäanalyysi histologisia tyyppejä osoitti, että heterogeenisyys kokonaan kadonnut AC alaryhmän (I

2 = 0%; p = 0,93) ja yhdistyksen vahvistettiin sekä SCC (OR = 33.84; 95% CI = 15,61-73,37; pohjainen satunnaisen vaikutuksista malli) (kuvio 3A) ja AC (OR = 21,89; 95% CI = 8,64-55,48, joka perustuu kiinteiden vaikutusten malli) (kuvio 3B) alaryhmiin. Lisäksi Alaryhmäanalyysissa perustuvat analyysit menetelmiä käytetään arvioimaan

DAPK1

promoottori metylaatio suoritettiin myös kaksi yhteistä tekniikkaa, MSP ja qMSP. Syrjäisimmät alueet olivat 23,45 (95% CI = 10,56-52,09), joka perustuu sattumanvaraiset vaikutukset malli, MSP alaryhmä, ja 34,25 (95% CI = 12,34-95,04), joka perustuu kiinteiden vaikutusten malli, qMSP alaryhmä, kun taas I

2 oli 51% ja 0%, tässä järjestyksessä (kuvio 4A ja 4B). Alaryhmä analyysi lähde kontrollinäyte, ja erityisesti välillä NT ja BCT, kertoi, että syrjäisimmät alueet olivat 16,99 NT (95% CI = 9,09-31,76) ja 22.00 varten BCT (95% CI = 11,95-40,51), tässä järjestyksessä. Heterogeenisyys NT ja BCT alaryhmät olivat pieniä I

2 = 48% ja I

2 = 14%, tässä järjestyksessä (kuvio 5).

(A) Okasolusyöpä (SCC) alaryhmäanalyysi , joka perustuu satunnaisen vaikutuksista mallia. (B) adenokarsinooma (AC) Alaryhmäanalyysissa, joka perustuu kiinteiden vaikutusten mallia.

(A) metylaatiospesifistä PCR (MSP) Alaryhmäanalyysissa, joka perustuu satunnaisen vaikutuksista mallia. (B) Quantitative reaaliaikainen MSP (qMSP) Alaryhmäanalyysissa, joka perustuu kiinteiden vaikutusten mallia.

NT: Normaali kohdunkaulan Tissue; BCT: Hyvänlaatuinen Kohdunkaulan Tissue.

suppilo juoni yhdistetty analyysi (kuvio 6), mikä on varsin symmetrinen, ei osoita merkittävää harhaa joukossa mukana tutkimuksissa, mutta muodot alaryhmien analyysien (S2 , S3 ja S4 kuvissa) osoittavat pieniä tai kohtalaisia ​​epäsymmetrian vuoksi julkaisu bias ei voida täysin sulkea pois kertoimella vaikutus nykyiseen meta-analyysi.

keskustelu

tuumorisuppressorigeeneille kuuluvat eri reittejä, kuten soluadheesiota, DNA korjaus, solusyklin Checkpoint ohjaus ja tumareseptorit, on havaittu olevan hypermetyloitunut CIN ja CC [41, 55, 60].

edellinen tarkastelu [63] tiivisti tulokset 51 julkaistut tutkimukset metylointianalyysi suoritettu kohdunkaulan kudosten ja solujen ja ehdotti, että yhdistelmä

DAPK1

,

CADM1

, ja

WR

geenit näyttävät lupaavin metyloidut geenin paneeli saada kohtuullinen suorituskyky CC seulontaan.

viime meta-analyysi Xiong et al. [64], joista 15 tutkimukset, ehdotti vahvan yhteyden

DAPK1

promoottori metylaatio ja CC (yhdistetty OR = 19,66; 95% CI = 8,72-44,31), mikä osoittaa, että

DAPK1

promoottori metylaatio voi olla biomarkkereiden aikana kohdunkaulan syövän syntymistä.

tutkimusraportit tulokset kattavamman meta-analyysi ja, ottaen huomioon, että promoottori metylaatio saattaa olla kudosspesifisiä tapahtuma [65, 66], tarjoaa alaryhmäanalyysi histologinen kasvain tyyppi. Esillä meta-analyysi koski 20 ainutlaatuinen artikkeleita ja puolesta yhteensä 1092 syöpäpotilaista ja 837 kontrollinäytteiden, raportoi merkittävä yhdistetyssä OR 21,20. Koska kohtalainen heterogeenisyys välillä tutkimuksia, herkkyysanalyysi ja alaryhmäanalyyseissa histologiset kasvaintyypit, lähteet vertailunäytteet sekä määrityksiä käytetään arvioimaan

DAPK1

promoottori metylointi tehtiin. Mielenkiintoista, poistamalla mitä erilaisimmista tutkimuksen [54], yhdistyksen välillä

DAPK1

promoottori metylaatio ja CC riski lisääntynyt (OR: 24.13) ja vahvistettiin SCC ja AC alaryhmien kanssa heterogeenisyys välillä tutkimus I

2 = 48% ja I

2 = 0%, tässä järjestyksessä.

kultakanta menetelmä promoottorin metylaation arviointi oli MSP, jossa PCR-tuotteet ajettiin geelillä, ja tulokset raportoidaan metyloituja tai metyloitumattomia on DNA-sekvenssin. Näin ollen tämä menetelmä ei salli tunnistaa osittaisen tasojen metylaation, ominaisuus, joka on erittäin tärkeä sekä biologisesti ja kliinisesti. Siten qMSP on kehitetty viime vuosina voittaa tämä rajoitus tavanomaisten MSP. Itse qMSP on raportoitu olevan tarkempi ja herkempi kuin perinteiset MSP ja mahdollistaa suuren läpimenon analyysi, joten se sopii paremmin seulontatyökaluna [67-69]. Esillä olevassa meta-analyysissä, että näitä kahta osoitusmenetelmät, sekä alaryhmiä raportoitu Merkitsevä yhteys

DAPK1

promoottori metylaatio ja CC. Vaikka heterogeenisyys välillä tutkimuksissa oli kohtalaisen suuri MSP alaryhmässä (I

2 = 51%), heterogeenisyys qMSP alaryhmä laski I

2 = 0%.

Lopuksi alaryhmäanalyysi lähde kontrollinäytteen paljasti huomattavan yhdistys molemmissa alaryhmissä; heterogeenisyys NT ja BCT alaryhmien oli kohtalaisen alhainen (I

2 = 48% ja I

2 = 14%, tässä järjestyksessä).

Tämä tutkimus on joitakin rajoituksia. Tutkimusten lukumäärä mukana meta-analyysissä on vaatimaton (n = 20). Lisäksi kaikilla tutkimuksiin osallistui oli tapaus-verrokki suunnittelua, se ei ole mahdollista selvittää, onko

DAPK1

promoottori metylaatio on varhainen syöpää aiheuttavia poikkeavuus tai vaikutus syövän. Näin ollen mahdollisuudet DNA: n metylaation mittausten vaatii validointi retrospektiivinen tutkimuksissa, mutta lopulta suurissa mahdollisille kliinisissä tutkimuksissa [70].

Lisäksi, vaikka herkkyysanalyysi ja alaryhmäanalyyseissa tehtiin, yhdistetyistä arvioita olisi tulkittava varovaisuutta, koska kohtalainen heterogeenisuus tutkimuksissa. Lopuksi pieni tai kohtalainen epäsymmetria suppiloon tontteja, viittaa siihen, että julkaiseminen bias ei voida kokonaan sulkea pois.

käyttökelpoisuus

DAPK1

tuumorisuppressorigeeniä hypermetylaation kuin epigenetic merkki on erityisen tutkimuksen kohteena monia erilaisia ​​syöpiä, mukaan lukien CC ja sen esiasteleesioita ja nykyisen meta-analyysi tarjoaa tieteellistä todisteita tähän keskusteluun, osoittaa merkittävää vahvan yhteyden

DAPK1

promoottori metylaatio ja CC. Tämä tulos vahvistettiin itsenäisesti histologinen kasvaintyypistä, käytetystä metodista metyloinnin ja lähde kontrollinäytteiden.

tukeminen Information

S1 Kuva. Herkkyysanalyysi 20 tutkimusten kanssa kiinteiden vaikutusten mallia.

Doi: 10,1371 /journal.pone.0135078.s001

(TIF)

S2 Kuva. Suppilo juoni alaryhmiin perustuvan analyysin histologinen syöpätyypin, jättämällä yksi heterogeeninen tutkimuksessa [54].

SCC: Okasolusyöpä; AC: Adenokarsinooma.

Doi: 10,1371 /journal.pone.0135078.s002

(TIF)

S3 Fig. Suppilo juoni alaryhmiin analyysi perustuu menetelmään, jättämällä yksi heterogeeninen tutkimuksessa [54].

MSP: metylaatiospesifistä PCR; qMSP: kvantitatiivinen reaaliaikainen MSP.

doi: 10,1371 /journal.pone.0135078.s003

(TIF)

S4 Fig. Suppilo juoni alaryhmiin perustuvan analyysin lähde kontrollinäytteestä, jättämällä yksi heterogeeninen tutkimuksessa [54].

NT: Normaali kohdunkaulan Tissue; BCT: Hyvänlaatuinen kohdunkaulan Tissue.

Doi: 10,1371 /journal.pone.0135078.s004

(TIF) B S1 tiedosto. PRISMA tarkistuslista.

Doi: 10,1371 /journal.pone.0135078.s005

(PDF)

S2 tiedosto. Meta-analyysi Genetic Association Studies muistilista.

Doi: 10,1371 /journal.pone.0135078.s006

(PDF) B S1 Taulukko. Alaryhmät analyysit perustuvat histologinen syöpätyypin, menetelmä ja lähde kontrollinäyte.

SCC: Okasolusyöpä; AC: Adenokarsinooma; MSP: metylaatiospesifistä PCR; qMSP: kvantitatiivinen reaaliaikainen MSP; M +: useita aiheita /näytteiden metylointi; M: useita aiheita /näytteet ilman metylointi; NT: Normaali kohdunkaulan Tissue; BCT: Hyvänlaatuinen kohdunkaulan Tissue.

Doi: 10,1371 /journal.pone.0135078.s007

(TIF) B

Kiitokset

Tekijät kiittää Bench Srl, University of Catania , teknistä tukea.