Fragmentti kirjasto lääkkeiden kehittämisen Otavan
fragmentti perustuen lääkeaineen suunnittelu tunnistaa matalan molekyylien, jotka tekevät avain vuorovaikutusta tavoitteensa sitoutumiskohtaan. Tämä korkea atomi hyötysuhde osumia käytetään optimoimaan osaksi arvokkaammaksi ja monimutkaisempia lyijy-yhdisteitä. Mieltymys fragmentti-pohjainen suunnittelu verrattuna muihin menetelmiin, kuten tehoseulonnan, lepää pitkälti parannetun seulonnan enemmän vaikuttava konformatio- tilaa pienemmällä lähtö- useita yhdisteitä. Siten fragmentti pohjainen lääkesuunnittelu tehokkaasti kasvattaa estäjiä monimuotoisuuden tilaa. Ensimmäinen askel fragmentti perustuen lääkeaineen suunnittelu on saada hyvä fragmentti library.OTAVA on oma erityisesti suunniteltu Fragment Library tarjoamaan kemiallisen fragmentit, jotka voidaan lähtökohtia huumeiden discovery.This fragmentti kirjaston rakentaminen suoritettiin käyttäen tiukkoja rakenteellisia, substructural ja erityinen lääkeainekemian suodattimia. Tämä OTAVA 抯 Fragment Library, joka käsittää noin 6514 yhdisteitä, on suunniteltu perustuu yleisesti hyväksytty sääntö-of-kolme. Yhdisteet suodatetaan molekyylipainon (MW -5) (korkea vesiliukoisuus on olennaista käytännön syistä aikana seulonta etenkin HCS). Rakenteelliset suodatusta käytettiin syrjäytymistä fragmentti kirjastosta yhdisteistä, jotka sisältävät toimintoja, jotka voivat aiheuttaa ei-toivottuja vaikutuksia, kuten syöpää, myrkyllisyys, ADME ongelmat ja vääriä positiivisia. Myös fragmentti kirjastosta poistettiin yhdisteitä, joissa on reaktiivisia funktionaalisia ryhmiä, joissa on vaara, kovalenttisen sitoutumisen kohdeproteiinin ja yhdisteitä, jotka eivät sisällä ainakin yhden alifaattisen tai aromaattisen renkaan tai sisältävät minkä tahansa atomin erilainen O, N, C, H, Br, I, Cl, F, S, tai P.The OTAVAN fragmentti kirjasto päivitetään säännöllisesti uusia fragmentteja. Viimeinen versio kirjaston kuvaus on saatavilla sivustollamme osoitteessa fragmentti kirjastossa sivulla. Fragmentti kirjasto ja muut yhdiste kirjastot OTAVA on saatavilla pyynnöstä kuten MDL rakenne-tiedostoja (SDfiles) tai ISIS Database (db) tiedostoja. Kaikki yhdisteet OTAVA katkelma kirjastosta varastossa, määrinä vähintään 20 mg. Fragment kirjasto yhdisteitä voidaan yksilöllisesti valita perustuen asiakkaan 抯 kriteereihin. Otavan Fragment Library on kehitetty vastaamaan asiakkaiden tarpeisiin, jotka etsivät ennalta valittujen fragmentti tuotteita lääkekehityksen.