Krooninen sairaus

tiivistelmä

tavoite

TP53BP1 geeni voi olla mukana kehittämässä syöpä häiritsevät DNA: n korjaukseen. Kuitenkin tutkimukset tutkivat suhdetta TP53BP1 Glu353Asp (rs560191) polymorfismi ja syövän saatu ristiriitaisia ​​ja tuloksettomia tuloksia. Toteuttaakseen nämä epäselvä havaintojen meta-analyysi suoritettiin arvioimaan assosiaatiota TP53BP1 Glu353Asp (rs560191) polymorfismi ja alttiutta syöpään.

Methods

Suoritimme haun kaikista Englanti raportoi tutkimuksia varten assosiaatiota TP53BP1 Asp353Glu (rs560191) polymorfismi ja alttiutta syöpään käyttäen Medline, Cochrane Library, EMBASE, Web of Science, Google (tutkija), ja kaikki kiinalaiset raportit tunnistettiin käsin ja on-line käyttämällä CBMDisc , Chongqing VIP-tietokanta, ja CNKI tietokanta. Tiukat valintakriteerit ja poissulkemisperusteet määritettiin, ja kertoimet suhdeluvut (syrjäisimmät alueet), jossa 95%: n luottamusväli (CI) arviointiin käytettiin vahvuus yhdistysten. Kiinteä tai satunnainen vaikutus malli valittiin perustuen heterogeenisyys testi keskuudessa tutkimuksia. Julkaisu bias arvioitiin käyttäen suppilon tontteja ja Egger n testausalusta.

Tulokset

yhteensä seitsemän tutkimuksissa otettiin mukaan meta-analyysin mukaan lukien 3213 tapaukset ja 3849 tarkastuksia. Tulokset osoittivat, että Glu353Asp (rs560191) polymorfismin TP53BP1 geeni ei ollut yhdessä syöpäriski kaikki geneettiset malleissa. Alaryhmässä analyysi, tulokset ehdotti, että Glu353Asp polymorfismi ei liittynyt syöpäriskiä mukaan etnisyys, syövän tyypistä, genotyypitysmenetelmää oikaistuna tai ei, HWE ja laatupisteet.

Johtopäätökset

Tämä meta-analyysi ehdotti, että Glu353Asp (rs560191) polymorfismin TP53BP1 geeni ei liittynyt syöpäriskiä.

Citation: Liu L, Jiao J, Wang Y, Zhang D, Wu J, Huang D (2014) puuttuminen yhdistyksen TP53BP1 Glu353Asp polymorfismi kanssa syöpäriskiä: järjestelmällinen katsaus ja meta-analyysi. PLoS ONE 9 (3): e90931. doi: 10,1371 /journal.pone.0090931

Editor: William B. Coleman, University of North Carolina School of Medicine, Yhdysvallat

vastaanotettu: 27 joulukuu 2013; Hyväksytty 4 helmikuuta 2014; Julkaistu: 06 maaliskuu 2014

Copyright: © 2014 Liu et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Kirjoittajat ei ole tukea tai rahoitusta raportoida.

kilpailevat edut: kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

kerrottiin, että oli noin 12,7 miljoonaa uutta syöpätapausta ja 7,6 miljoonaa syöpäkuolemista kautta maailman vuonna 2008 [1]. Kuitenkin etiologia syöpä on edelleen tuntematon ja sairauden kulkuun hoidot ovat rajalliset. Lisäksi, koska osallistuminen sytokiinien syövän arveltu, oli monia kandidaattigeenit lähestyy suunnittelussa tapaus-verrokki yhdistys tutkimus yhden nukleotidin polymorfismien (SNP: t), mukaan lukien p53-sitova proteiini 1 (TP53BP1).

TP53BP1 geeni on ollut tärkeä rooli sekä DNA: n korjaukseen ja solusyklin ohjaus ja myös välittää DNA-vaurioita tarkistuspisteen kautta yhteistyössä vaurioita anturit ja signaalimuuntajia [2]. TP53BP1 sisältää kaksi BRCA1 C-terminaalinen (BRCT) domeenit, jotka ovat välttämättömiä kasvaimia estävä toimintojen [3]. SNP on TP53BP1 geeni voi olla tärkeä rooli etiologiassa syövän, koska suora rooli TP53BP1 solu vasteena DNA-vauriolle. Aiemmat tutkimukset ovat osoittaneet, että ei yhdistyksen välillä TP53BP1 Asp353Glu (rs560191) SNP ja syövän riskiä [4] – [9], mutta Kiyohara et al. raportoitu, että Glu /Glu genotyyppi TP53BP1 Asp353Glu liittyi alentunut riski sairastua keuhkosyöpään [10]. Joten tutkimustulokset koskevat yhdistyksen välillä Asp353Glu (rs560191) polymorfismin TP53BP1 geenin ja syöpäriskiä ovat ristiriitaisia.

Kun otetaan huomioon yksi tutkimus voi puuttua valtuudet tarjota luotettavaa johtopäätös, suoritimme meta-analyysi nämä voivat osoittavien tarkkaa suhdetta TP53BP1 Asp353Glu (rs560191) polymorfismi ja alttiutta syöpään, joka olisi paljon suurempi mahdollisuus saavuttaa kohtuullisen vahvoja johtopäätöksiä.

Methods

valinta tukikelpoiset Studies

Haimme Medline (US National Library of Medicine, Bethesda, MD), EMBASE, Cochrane Library, kiinalainen Biological Medicine, China National Knowledge Infrastructure, Wang Fang Data ja Chongqingin VIP-tietokanta (viimeksi haku päivitettiin joulukuussa 20, 2013) käyttäen termejä ”p53-sitovan proteiinin 1 tai TP53BP1 tai 53BP1”, ”Asp353Glu tai rs560191 tai D353E”, ”syöpä tai tunor tai syöpä” ja ”polymorfismi, variantin tai mutaatio”. Valinta tehtiin ilman rajoituksia kieli, mutta mukana vain julkaissut artikkeleita kirjoitettu Englanti tai Kiinan. Käytimme PubMed vaihtoehto ”liittyviä artikkeleita” tutkimusta varten hakea lisää mahdollisesti merkitystä artikkeleita. Viiteluetteloihin tarkastettiin ja tutkijat otettiin yhteyttä ylimääräisiä kirjallisuutta.

Valintaperusteet

Tutkimukset valittiin jos ne täyttävät seuraavat kriteerit: (1) yhdistys tutkimus, jossa tapaus-verrokki tai kohortti suunnittelu; (2) Tutkimuksessa selvitettiin yhdistyksen välillä TP53BP1 (rs560191) polymorfismi ja syöpäriskiä; (3) jos kyseessä on useita julkaisuja samasta tutkimusryhmä, täydellisin ja viimeaikaiset tulokset käytettiin.

poisjättökriteerit

Poissulkukriteerit määritettiin: 1) tiivistelmät, selostuksia ja eläinkokeista; 2) hyödytön raportoituihin tietoihin, genotyyppi lukumäärä tai ei sisälly; ja 3) tutkimuksen ilman riittäviä tietoja meta-analyysi. Jos useampi kuin yksi tutkimus julkaistiin samojen tekijöiden käyttäen samaa tapauksessa sarja, vain viimeisin tutkimuksessa tai tutkimuksessa suurin koko Näytteiden mukana meidän meta-analyysi.

Data Extraction

Kaksi arvioijaa (Lei Liu ja Jinghua Jiao) itsenäisesti tutkitaan tutkimuksia assosiaatiot TP53BP1 Asp353Glu (rs560191) polymorfismi ja syöpäriskiä. Kun poikkeamia esiintyi, tutkijoille rekrytoitiin tietojen arviointi. Seuraavat tiedot kerättiin: Ensimmäisen tekijän, julkaisuvuosi, sijainti, etnisyys, otoskoot potilaiden ja verrokkien, tutkimuksen suunnittelu ja genotyypin numeroita.

arvioijat kehittänyt laadun arviointiasteikolla (taulukko 1), jota muutettiin aiemmista tutkimuksista [11] – [13], laadun arvioimiseksi tukikelpoisten tutkimuksissa.

tarkastelu ja analysointi opastettiin suorittamaan Prisma lausuman ensisijainen raportointi systemaattinen tarkastelu ja meta-analyysi [14].

tilastollinen analyysi

kertoimet suhdeluvut (syrjäisimmät alueet), jossa 95%: n luottamusväli (CI) ja genotyyppien ja alleelien arviointiin käytettiin vahvuus yhdistyksen välillä TP53BP1 Asp353Glu (rs560191) polymorfismi ja syöpäriskiä. Syrjäisimmillä alueilla tehtiin alleeli kontrasteja, lisäaine geneettinen malli, sekä väistyvä geneettistä mallia ja hallitseva geneettinen malli, tässä järjestyksessä. Heterogeenisyys tutkittiin

I

2

tilastollinen tulkita osuus koko vaihtelun myötävaikuttanut Tutkimusten välisten vaihtelua. Olemme myös mitattava vaikutus heterogeenisyys käyttämällä kvantitatiivista toimenpidettä,

I

2

= 100% x (Q-d f) /Q. Jos oli tilastollinen ero kannalta heterogeenisuus (P 0,10,

I

2 50%

), satunnainen vaikutusten mallia voitaisiin käyttää arvioitaessa yhdistettyä syrjäisimpien alueiden [15], [16] . Muussa tapauksessa yhdistetyt syrjäisimpien alueiden arvioitiin kiinteiden vaikutusten malli [17]. Herkkyysanalyysi suoritettiin poistamalla yhden tutkimuksen aina vaikutuksen tutkimiseksi yksittäisten tietojen asetettu yhdistettyjen syrjäisimmille alueille. Mahdollisia julkaisu bias arvioitiin kanssa suppilo tontteja ja Egger testi. Epäsymmetrinen juoni ehdottaa mahdollista julkaisu bias ja P-arvo on Egger testissä pienempi kuin 0,05 katsottiin edustavan tilastollisesti merkitsevä julkaisun bias [18]. Kaikki tilastolliset testit suoritettiin RevMan versio 5.0 (Review Manager, Kööpenhamina: Pohjoismainen Cochrane-keskuksen, Cochrane, 2010) ja kattava meta-analyysi ohjelmistoversio 2.0 (Biostat, Englewood Cliffs, I.N.J., USA).

P

arvo on pienempi kuin 0,05 mistään testiä pidettiin tilastollisesti merkitsevä.

Tulokset

Tutkimus osallisuutta ja ominaisuudet

Kuten osoitti kuvassa 1 yhteensä seitsemän tutkimusta kuuluivat tähän meta-analyysin mukaan lukien 3213 tapaukset ja 3849 tarkastuksia [4] – [10]. Tutkimukset tunnistettu ja pääpiirteistä oli yhteenvetona taulukossa 1 ja taulukossa 2. genotyyppi jakelu kuusi tutkimusten polymorfismin ei poikennut Hardy-Weinberg tasapainossa vuonna kontrolliryhmissä (kaikki olivat suurempia kuin 0,05, taulukko 3).

Quantitative Data Synthesis

Kuten osoitti taulukossa 4, meta-analyysi koko tutkimukset osoittivat, ettei yhdistyksen välillä Asp353Glu (rs560191) polymorfismi ja syöpäriskiä kaikissa viisi geneettinen malleja potilailla (OR = 0,98, 95% CI = 0,86-1,11 G vs. A; OR = 0,95, 95% CI = +0,71-+1,28 GG vs. AA; OR = 0,99, 95% CI = 0,86-1,13 GG vs. AG OR = 0,97, 95% CI = +0,77-+1,23 varten väistyvä mallin OR = 0,96; 95% CI = 0,87-1,07 varten hallitseva malli) (Kuva 2 ja kuva 3). Vuonna alaryhmäanalyysissä mukaan etnisyys, syöpätyypin oikaistuna tai ei, genotyypitysmenetelmiä, HWE ja laatu pisteet, tulokset ehdottivat, että Asp353Glu (rs560191) polymorfismi eivät liittyneet syöpäriskiä. Ei ollut merkittävää julkaisua bias mukaan Begg ja Egger testit (Begg, p = 0,21; Egger, p = 0,64) ja suppilo juoni (kuva 4).

Kuva 2.B. Forest juoni yhdistyksen välillä syöpä ja Glu353Asp (rs560191) mutaatio potilailla (GG vs AA). Kuva 2.C Forest juoni yhdistyksen välillä syöpä ja Glu353Asp (rs560191) mutaatio potilailla (GG vs AG).

Kuva 3.B. Forest juoni yhdistyksen välillä syöpä ja Glu353Asp (rs560191) mutaatio potilailla (GG + AG vs AA).

Herkkyysanalyysi

mukaan herkkyysanalyysi, tulokset osoittivat meille, että ei ollut huomattavia muutoksia meidän arvioiden jälkeen kuulua myös yksittäisten tutkimusten, mikä osoittaa, että tulokset olivat vakaita (tuloksia ei ole esitetty).

keskustelu

on hyvin tiedetään, että SNP voi edistää yksilön herkkyys syöpään ja TP53BP1 on keskeinen osa soluvasteen DNA vaurioita [19]. Therfore, SNP on TP53BP1 voi olla tärkeä rooli etiologiassa syöpä. Johtopäätös että TP53BP1 geeni oli tärkeä rooli DNA: n korjaukseen on hyvin tutkittu, mutta toiminnallinen merkitystä TP53BP1 geenin polymorfismin ei ole raportoitu. On mahdollista, että sekvenssimuuntelun promoottorin ja koodaavan alueen TP53BP1 saattaa vaikuttaa sen transkription ja loppupään biologinen toiminta [4], [5].

parhaan tietomme mukaan joitakin tutkimuksia, jotka tähtäävät roolia Asp353Glu (rs560191) polymorfismi syöpäriski on tehty, mutta tulokset ovat ristiriitaisia. Sen arvioimiseksi järjestön välisestä Asp353Glu (rs560191) polymorfismi ja syövän riskiä, ​​suoritimme tämä meta-analyysi.

Emme ole löytäneet sinificant yhdistyksen välillä TP53BP1 Asp353Glu (rs560191) polymorfismi ja syöpäriskin yleistä väestö, mutta eri etnisyys, tutkimuksen suunnittelu, genotyypitysmenetelmiä ja syöpätyypin olisivat vastuussa negtive johtopäätöksiä. Me perfomed alaryhmäanalyysissä perustuu näihin tekijöihin. Kuitenkin resluts osoitti meille, että Asp353Glu (rs560191) polymorfismi eivät liittyneet syöpäriskiä mukaan etnisyys, syövän tyyppi, tutkimus vastaavia tai ei, genotyypitysmenetelmiä, HWE ja tutkimus pisteet. Se voi johtua siitä ainoastaan ​​yhden tutkimuksen [10] ilmoitti, että Asp353Glu polymorfismi liittyi syöpäriskiä. Siksi tarvitaan lisätutkimuksia vahvistamiseksi tuloksemme.

Joidenkin tutkimusten mukaan TP53BP1 on voinut suojaavia vaikutuksia levyepiteelisyövän pään ja kaulan (SCCHN) induktiohoitoon riskiä, ​​mutta tällaisia ​​vaikutuksia rajoittuivat TP53 Arg72Pro variantin alleelin /haplotyypin kantajia [5], [8]. Koska syy muutaman tutkimuksia perfomed ja oli monia meta-analyysejä on TP53 Arg72Pro polymorfismi ja syövän riskiä [20], [21], emme voineet käyttää meta-analyysi analysoida suhdetta TP53BP1 Asp353Glu (rs560191) polymorfismi yhteenlaskettu jossa TP53-geenin polymorfia ja syöpä. Lisäksi, Rudd et ai. [22] ja Truong et al. [23] mukaan Asp353Glu (rs560191) polymorfismi oli yhteydessä keuhkosyövän riskiä, ​​mutta tämä yhdistys ei todettu tutkimuksessa [24] Brooks JD et al. Lisäksi, koska riittämätön tiedot näistä kolmesta tutkimuksesta, emme voisi sisällyttää näitä tutkimuksia tähän meta-analyysiin. Tämä voi olla toinen syy negtive päätelmä tässä meta-analyysissä.

Meta-analyysi Timofeeva et al. [25] eivät osoittaneet merkittävää yhdistyksen välillä rs560191 polymorfismin ja keuhkosyövän riskiä. Se tuli samaan johtopäätökseen meidän tutkimus. Kuitenkin se oli huolissaan vain keuhkosyövän riskiä. Meidän meta-analyysissä, yhdistyksen välillä rs560191 polymorfismin ja muita syöpätyyppejä, mukaan lukien kohdunkaulan syöpä, rintasyöpä ja levyepiteelisyövän pään ja kaulan analysoitiin myös.

On olemassa useita rajoituksia tämän meta-analyysi, joka tulee harkita. Ensinnäkin, syöpä on monitekijäinen sairaus, mukaan lukien monimutkaiset vuorovaikutukset ympäristön altistumisesta geenin tekijöihin. Tässä meta-analyysissä, meillä oli riittävästi tietoa suorittaa arviointi tällaista vuorovaikutusta varten itsenäinen rooli TP53BP1 Asp353Glu (rs560191) polymorfismi syövän kehittymisessä. Toiseksi, vain seitsemän tutkimukset kuuluivat tähän meta-analyysiin. Niinpä lisää tutkimuksia tarvitaan tunnistamaan tämä yhdistys kattavammin. Kolmanneksi tutkimuksessa Naidu et al. [4] osoittaa genotyyppi jakaumat vertailupopulaatiossa jotka eivät olleet HWE sisällytettiin tähän meta-analyysiin. Forth, emme pitäneet julkaistut tutkimukset muilla kielillä kuin Englanti /Kiina tai esitetyt tiedot abstracted muodossa; Näin, julkaisu ja mahdollisten kieli harhojen voi esiintyä.

Kaiken kaikkiaan tämä meta-analyysi ehdotti, että polymorfismi TP53BP1 Asp353Glu (rs560191) -geeni ei voida pitää geneettinen riskitekijä syöpään. Samaan aikaan tämä tulos on tulkittava varovasti. Voit tarkistaa tämän seurauksena laajamittainen tapausverrokkitutkimukset yksityiskohtaisia ​​yksittäisiä tietoja tarvitaan.

tukeminen Information

tarkistuslista S1.

PRISMA 2009 tarkistuslista.

doi: 10,1371 /journal.pone.0090931.s001

(DOC) B

Kiitokset

Kiitos Jingpu Shi, FT, professori Department of Clinical Epidemiology ja Evidence Medicine ensimmäisessä Affiliated sairaala China Medical University. Kiitos toimitukselle ja nimetön arvostelijoita.