Krooninen sairaus

tiivistelmä

Tausta ja tavoite

Ruokatorven syöpä on yksi yleisimmistä ja tappavin syöpiä maailmanlaajuisesti. Meidän edellinen väestöpohjainen tutkimus raportoitu hyvin yleisiä ruokatorven syövän Chaoshan, Guangdong, Kiina. Esi Chaoshan väestön siirtyessä Taihang Mountain alueella Pohjois-Keski-Kiinassa, joka on toinen korkean esiintyvyyden alue ruokatorven syöpään. Tarkoituksena Tämän tutkimuksen tarkoituksena oli saada näyttöä perinnöllinen alttius ruokatorven syövän Chaoshan väestön viitaten Taihang Mountain väestö, ja niiden lopullisena tavoitteena molekyylitunnistus taudin geenien.

Methods

Teimme familiaalinen korrelaatio, sekoittumista, ja monimutkainen erottelu analyysit 224 perhettä Chaoshan väestöstä ja 403 perheitä Taihang väestöstä käyttäen FPMM ohjelman SAGE versio 5.3.0. Toinen analyysi keskittyneet tiettyihin perheitä, joilla on suuri määrä vaikuttaa yksilöiden tai aikaisin alkanut tauti.

Tulokset

väestössä, kohtalainen sukulaisparia sib korrelaatio havaittiin ruokatorven syöpään. Lisäksi veli-veli korrelaatio oli jopa korkeampi. Sekoittamisen analyysit osoittivat, että kolmen komponentin jakelu malli parhaiten tilit vaihtelua alkamisiällä ruokatorven syöpään, ja että monitekijäinen malli tarjoaa parhaiten väestössä tiedot. Autosomaalinen hallitseva tila ja hallitseva tai resessiivinen suuria geeni polygeenisiä perintö havaittiin olevan paras malleja perinnöllinen alttius ruokatorvisyöpään joissakin suurperheille.

Johtopäätökset

Nykyinen Tulosten perusteella periytyviä herkkyys ruokatorven syöpään tietyissä riskiryhmiin Kiinassa, ja tukee pyrkimyksiä tunnistaa alttiusgeenit.

Citation: Guohong Z, Min S, DuenMei W, Songnian H Min L, Jinsong L, et ai. (2010) Genetic heterogeenisyys ruokatorvisyöpäriskit korkean esiintyvyyden alueilta ja pohjoisen Kiinassa. PLoS ONE 5 (3): e9668. doi: 10,1371 /journal.pone.0009668

Editor: Irene Oi Lin Ng, The University of Hong Kong, Hongkong

vastaanotettu: 01 heinäkuu 2008; Hyväksytty: 12 helmikuu 2010; Julkaistu: 15 maaliskuu 2010

Copyright: © 2010 Guohong et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä tutkimus rahoittivat avustukset nro 30210103904 päässä Natural Science Foundation of China ja nro A1080203 päässä Key Natural Science Foundation of Kiinan Guangdongin. Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

ilmaantuvuus ruokatorvisyöpää vaihtelee yli 300-kertaisesti maailmanlaajuisesti, jossa korkeimmat tallennettu tietyillä alueilla Kiinassa ja Keski-Aasiassa. [1], [2], [3] useimmissa Kiinan väestön, valtaosa ruokatorven syöpiä ovat levyepiteelikarsinoomia. [1], [4], [5] pohjois-Keski-Kiinassa, korkean esiintyvyyden sijaitsevat pääosin pitkin pohjoislaitamilla kolmesta maakunnasta-Hebei, Henan, ja Shanxi -abutting eteläisen kylkeen Taihang Vuoria. Kuolleisuus voi olla jopa 1100/100000, kuten tapahtuu Linxian, Henanin maakunnassa, ja vuonna Yangcheng, Shanxi. [6], [7], [8] Kahden viime vuosikymmenen aikana Wu ja hänen kollegansa [9 ] on pyritty epidemiologisia todisteita geneettinen alttius kehittämiseen ruokatorven syövän sekä tehokkaita keinoja yksilöiden seulomiseksi, jotka ovat erittäin herkkiä tauti. Familiaalinen yhdistäminen Ruokatorven syöpä havaittiin tämän korkean esiintyvyyden alueella. [10] Lisäksi tulokset erottelun tutkimusten Wu et al. [7], [11] 221 korkean riskin ydinvoiman perheiden Linxian, kaikki jälkeläiset ≥ 40 vuotias, ja 225 korkean riskin perheille kerätty Yangquan kaupunki ehdotti peittyvästi periytymistapa ruokatorvisyövälle näiden kahden korkean riskin kohteista.

Etelä-Kiinassa, että Chaoshan littoral alueen kaksituhatta kilometrin päässä Taihang Vuoria, on olemassa toinen korkean esiintyvyyden alue ruokatorven syöpään, erityisesti Nanao Island. [4] mukaan edellisessä tutkimuksessa Ikävakioitu ilmaantuvuus ruokatorven syöpään miehillä ja naisilla olivat 72-150 /100,000 ja 26-64 /100000, vastaavasti, 1995-2004 Nanao Island. Ruokatorven syöpä ja sydämen syöpä oli yleisin pahanlaatuinen kasvain, joka käsittää 52% koko pahanlaatuinen kasvain tapauksissa ja ruokatorven syöpä lisääntymässä. [12]

Huolimatta maantieteellistä erittelyä, meillä voi olla yhteinen etiologia ruokatorven syöpä näillä kahdella alalla? Historialliset tiedot, tukevat viimeaikaiset geneettisten tietojen muodossa polymorfismien sekä Y-kromosomi ja mtDNA, osoittavat, että esi Chaoshan ihmiset siirtynyt siitä Taihang Mountain alueella. Analyysi mtDNA haplogroups osoitti, että yhteinen äidin geneettinen tausta liittyy riskiryhmien näiden kahden alueen. [13]

Epidemiologiset tutkimukset ovat osoittaneet, että tietyt ympäristö- riskitekijät liittyvät myös ruokatorven syövän Chaoshan alueella, mukaan lukien käynyttä kalakastike, ruokailutottumuksiin, alkoholin kulutus, tupakoinnin ja juominen Kongfu teetä. [ ,,,0],6], [14], [15], [16], [17], [18], [19], [20], [21], [22] Siitä huolimatta, familiaalinen klusterointi ruokatorvisyöpää on dokumentoitu Chaoshan korkean esiintyvyyden väestö, joka tarjoaa tärkeän vihjeen geneettinen etiologia. [23] Lisäksi on olemassa kaksi riskiryhmien-Chaoshan ja Taihang-kahdessa ilmeisesti eri ympäristöissä, mutta jotka liittyvät yhteisten esivanhempien, osoittaa, että geneettinen alttius voi olla tärkeä rooli riski sairastua ruokatorven syöpään. Siksi on tärkeää tutkia, geneettiset tekijät ovat todellakin mukana etiologiassa ruokatorven syövän Chaoshan korkean ilmaantuvuuden alueella.

tavoitteena Tämän tutkimuksen tarkoituksena oli saada näyttöä tietyn mallin perinnöllisten alttius ruokatorvisyöpään että Chaoshan ja Taihang Mountain riskiryhmien joka tukisi lisätutkimuksia paikallistaa alttiusgeenit familiaalisen ruokatorven syöpään. Kaikkiaan 224 väestöpohjaisen sukutaulujen päässä Chaoshan alueella ja 403 sairaala-pohjainen sukutaulujen päässä Taihang Mountain alueella kerättiin ja tutkittiin familiaalinen korrelaatio, sekoittumista, ja monimutkainen erottelu käyttämällä ohjelmaa Tilastollinen analyysi Genetic Epidemiology (SAGE).

Materiaalit ja menetelmät

Tutkittavat ja tiedonkeruu

Oppiaineet kahden populaation tutkittiin: väestöpohjaisia ​​aiheista Chaoshan Etelä-Kiinassa, ja sairaala-pohjainen aiheista Taihang Mountain alue Pohjois-Kiinassa. Chaoshan alue, jossa asuu noin 10 miljoonaa, on ranta- alue itäosassa Guangdong. Sen Suurimmat kaupungit ovat Shantou, Chaozhou ja Jieyang. Suoraan itään on Fujianin maakunnassa ja etelään on Etelä-Kiinan merellä. Chaoshan asukkaat ovat verrattain eristyksissä väestö ja ovat pitäneet vanhan kiinan kielen (Chaoshan murre) ja perinteisiä tapoja. Nanao Island, jossa asuu noin 70000, on läänin kiinnitetty Shantou vastapäätä Taiwan. Asukkaat Nanao Island ovat osallistujia pitkäaikainen tutkimus ruokatorven syöpä, ja syöpä rekisterin Nanao Island on toiminut yhteistyössä Patologian osasto, Shantou University Medical College ja terveysministeriön Bureau of Nanao Island vuodesta 1995. järjestelmä on suuri väestö-pohjainen verkko kattaa kylä klinikat sekä kaupungin ja maakunnan sairaaloissa. Tallennetut tiedot sisältävät potilaan demografiset ja natiivi alkuperä, puhkeamisikä, röntgen- ja patologinen vahvistus diagnoosi, ja sairauden vaiheesta kussakin tapauksessa ruokatorven ja sydämen syöpä. Ohjaavat kirjanpito ja saatuaan tietoon perustuvan suostumuksen, haastattelimme kaikki uudet kohteille kotinsa mukana henkilöstön hallituksen terveysministeriön Nanao Island. Strukturoitu kyselylomake annettiin potilaille, jotka pyydettiin antamaan suullinen vastauksia. Me tallennettuja tietoja, kuten elämäntapojen (esim tupakoinnin ja alkoholin juominen) ja ruokavalio, sekä suvussa neljä perättäistä sukupolvea. Aina kun proband oli epävarma vastaus, haastattelimme muita perheenjäseniä tai vanhempi naapureita varmistamaan tietojen paikkansapitävyyden. Koska nielemisvaikeuksia on tärkeä kliininen oire, sitä käytettiin taudinmääritys; ennen 1980, kun huono lääketieteellistä vallitsivat, vanhempi ruokatorven syöpä potilaat, jotka olivat diagnosoitiin kylä lääkärit tai epäillään kuoli EY oli todettu tällä menetelmällä. Tästä väestö, yhteensä 224 ruokatorven syövän ja sydämen syöpä sukutauluihin otettiin rekisterin kerättyjä 2003 – 2005.

Taihang Mountain alueella on korkein ilmaantuvuus ruokatorven syövän Pohjois-Kiinassa. Tätä aluetta valitsimme poikkileikkaus tutkimus sairaalan perustuvan väestöstä. Olemme tutkineet potilaskertomus kaikilla potilailla, joilla ruokatorven syöpä, joka esiteltiin neljässä sairaalassa-Linzhou (Linxian) kasvainten Hospital, Linzhou People sairaala, Helsinki Centre sairaala, ja Anyang Kasvaimen sairaala-kesä-elokuussa 2005. Saatuaan suostumusta potilaiden ja niiden lääkärit, haastattelimme potilaille. Perheet todenneessa läpi yhden probands, että viimeisin vaikuttaa perheenjäsenen ollessa valittu proband. Familiaalinen esiintyminen ruokatorvisyöpää tutkittiin face-to-face haastattelut. Date at diagnoosi kirjattiin proband ja kaikkien sitä sukulaisia. Kaikkiaan 7379 yksilöiden 403 perheiden varmistettu kautta probands otettiin tutkimukseen.

tutkia heterogeenisyys ikä puhkeamista käytimme seuraavat valintakriteerit suurten sukutaulujen: ruokatorven syöpäpotilaille kolmessa peräkkäisessä sukupolvea, ja alkamisiällä jatkuvasti vähentynyt sukupolvelta toiselle. Lopulta saimme kaksi varhain alkanut perheitä 224 sukutauluja Chaoshan, ja neljä varhain alkanut perheiden ja yhden laajennetun sukutaulu (kuusi sukupolvea syvä) ja 32 293 yksilöiden vaikuttaa ruokatorven syövän Taihang Vuoria.

Tietoon-suostumus asiakirjat allekirjoitti jokaiselle osallistujalle ennen projektin. Tutkimus hyväksyi eettisen komitean Shantou University.

familiaalinen korrelaatio ja tilastollinen analyysi

familiaalinen korrelaatio analyysi suoritettiin käyttäen FCOR; versio 5.3.0 on S.A.G.E. FCOR käytettiin arvioitaessa korrelaatiot piirre arvojen paria sukulaisten. Täällä, ruokatorven syöpä asema oli tietty piirre; Pari korrelaatioita arvioitiin ja keskityttiin seuraaviin suhteellinen tyypit: vanhemmat ja jälkeläiset, sisarukset, hyväntahtoinen, ja serkut. Lisäksi Chi-square tilastoja ja P-arvot laskettiin testata tasalaatuisuus korrelaatiota alatyypeistä kussakin pääasiallisin.

sekoittamisen analyysi

kovarianssi rakenne analysoitiin käyttämällä sekoittumisesta erottelu ohjelma, versio 5.3.0 SAGE. Asetettaessa parametrien yksi-, kaksi- ja kolmen komponentin jakaumat arvioitiin erikseen. Kunkin jakelu, ei tiedonsiirtoa oli määritelty. Muut parametrit kunkin komponentin keskiarvo arvioitiin suurimman uskottavuuden menetelmää, jossa kaikki numeerisia menetelmiä alkaa määrätylle alkuarvot tuntemattomien parametrien, ja sitten alkaa liikkumisesta todennäköisyys pinnalla, kunnes raja täyttyy, paikallinen maksimi on todettu, tai numeerinen vaikeuksia kohdataan.

Complex eriytyminen analyysi

Teimme monimutkainen eriytyminen analyysi perheiden mallintaa geneettinen alttius ja ikä puhkeamista ruokatorvisyöpää käyttämällä luokan rajallinen polygeenisiä yhdistettyä mallia (FPMM), joka on ainoa vaihtoehto tällä hetkellä saatavilla binary ominaisuuksia vaihtelevalla alkamisiällä alle Linux 3.0 käyttöjärjestelmä, versio 5.3.0 SAGE

Tämä malli johtaa todennäköistä, että voi olla lasketaan tehokkaita algoritmeja kehitetty oligogeeninen malleissa. Profiilit FPMM olivat lähimpänä profiileja tavallista sekoitettu malli tarkat laskelmat. [24], [25], [26] teoriaa monimutkaisia ​​eriytyminen analyysi on, että osajoukko yksilöiden populaation oletetaan olevan alttiita ruokatorvisyöpään ja siksi saada alkamisiällä ruokatorven syöpään, kunhan ne elää tarpeeksi kauan, kun taas jakelun alkamisiällä saattaa riippua mahdollisista eriytyvällä geenejä. Jos Mendelin lähetys on olemassa, sen oletetaan olevan kautta yhden autosomaalinen lokuksen kahden alleelin, A ja B, A: n ollessa oletettu taudin alleeli. Taajuudet alleelin A ja B on merkitty q

A ja (1- q

A), tässä järjestyksessä. Erottelu mahdollisen suuren lokus sallitaan antamalla yhden tai useamman parametrin riippuvat huomaamaton (piilevä) laadullinen tekijä u = AA, AB tai BB. Me kutsumme u yksilön tyyppi. Tässä yhteydessä, tyyppi parhaiten määritellään odotettavissa jakelu yksilön jälkeläisiä. Niinpä käytämme termiä tyyppi mahdollistaa monenlaisia ​​erillisiä siirto, onko Mendelin vai ei. Jakauma tyyppien väestön oletetaan olevan Hardy-Weinberg tasapaino. Yksilöt kunkin oletetaan lähettämään alleelin A jälkeläisilleen lähetyksen todennäköisyyksillä τ

AA, τ

AB, ja τ

BB. Letting β olla perustason parametri n ja ai ikä kerroin.

Tässä tutkimuksessa iän, ruokatorven syövän tilan ja sukupuolen sisällytettiin parantamiseksi mallin sovitus; syöpä tila pidettiin ensisijainen binary, toisin sanoen 0 ei ruokatorvisyöpään ja 1 syövän, ja sukupuoli-koodi oli sovitettu kovarianssina ensisijaiseen piirre, eli 0 miesten ja 1 naisten. Alle FPMM erottelua analyysi, neljä suurta Mendelin geenin malleja (hallitseva, resessiivinen, codominant, laskeva), polygenetic mallit (puhdas polygenetic, suuria geeni ja polygenetic) ja kolme ei-geneettisten mallien (ei suuria tyyppi, puhdas ympäristö, ja yleinen) ovat toteutettu tietojen arvioida, mikä malli on parhaiten yhteen havaitun datan. On yhdeksän hypoteesit malleja seuraavasti:

Mendelin mallit: Mendelin siirto suuren geeni oletetaan tässä mallissa (τ

AA = 1, τ

AB = 0,5, τ

BB = 0).

hallitseva

malli, genotyyppi AA vastaa genotyyppi AB, kuten heijastuu lähtötilanteen muuttujat β

AA = β

AB.

peittyvästi

malli, genotyyppi BB on sama kuin genotyyppi AB, kuten heijastuu lähtötilanteen muuttujat β

BB = β

AB.

codominant

malli, genotyyppi AB on väliaineena genotyyppien AA ja BB, jota kuvastaa perustason parametrit β

AB = 1/2 (β

AA + β

BB).

laskeva

malli, genotyyppi β

AA≥β

AB≥β

BB.

Nongenetic malleissa: ympäristön malli on myös luvallinen sisältää pääasiallisten vaikutus, joka ei tartu vanhemmilta jälkeläisille A nontransmitted ympäristövaikutus malli, jossa kukin lähetys todennäköisyydet on toteutettu olla yhtä suuri taajuus alleelin A, eli τAA = τAB = τBB = qA. Muissa ympäristön malli, joka mahdollistaa mahdollisen heterogeenisyyden altistumistasoja sukupolvien välillä, siirto todennäköisyydet jonka on oltava, ts τAA = τAB = τBB; Ei suuria tyyppi mallin, ei tiedonsiirtoa eikä suuria geeni ja ympäristö-tyypin vaikutukset; General (monitekijäinen) malli, täydellinen malli mielivaltainen siirto todennäköisyyksiä, jossa kaikki parametrit olivat vapaan ja annettiin sopivaksi data.

Polygenetic tai suuria geeni ja polygenetic malleja: valinnan mukaan alkamisiällä tai alttius on polygeenisiä komponentti määritelty alla FPMM lohko. Ohjelmassa tyyppi taajuudet, perustason parametrit (β), ja siirto todennäköisyydet arvioitiin. Malli on alhaisin Akaike tiedot kriteerit (AIC) arvo pidettiin paras malli, jota tukee todennäköisyys osamäärätesti.

etsintään toteamiseen bias ja yhden tai monipistekytkentälaite toteamista, malli vapaa todennäköisyyttä kunkin sukutaulu oli perustu proband iän puhkeamisvaiheessa ja arvioitu. Sekoittamisen eriytyminen analyysi ohjelma voidaan sovittaa kahden tai kolmen normaalijakauman samanaikaisesti soveltamalla teho muutos tietojen ja myös mahdollistaa sekä toteamiseen ja jäljellä familiaalinen korrelaatioita. [27]

verrata tulokset entisen tutkimuksen alla D-luokan malli, me syntyy seuraavia kovariaatit edustavat jäljellä familiaalinen vaikutuksia kuvanneet Carter et al. [11] Lyhyesti, nämä ovat F1 (vaikuttaa isä vaikutus), M1 (vaikutti äiti vaikutus), S1 ( määrä vaikuttaa ikääntyneiden sibs); F1, M1 ja S1 koodattiin 1 jos isä, äiti tai sibs vaikutti vastaavasti ja 0, jos ei koske tai puuttuvat.

Tulokset

Chaoshan, on 7224 yksilöiden 224 sukutauluissa, 374 (5,18%) (sisältäen probands) oli ruokatorven syöpä (taulukko 1). Vuonna Taihang, on 7379 yksilöiden 402 sukutauluja, 738 (10,0%) oli ruokatorven syöpä. Sukutauluista in Chaoshan perusteella väestötietoja, taipumus olla suuria ja monen sukupolven ( 3 sukupolvea), kun taas varmistanut sairaalan johdolla tietojen Taihang mukana monissa ydinperhettä kahden tai kolmen sukupolven vain. Nämä erot sukupuu rakenne voi selittää ilmeinen kaksijakoinen eron määrä ruokatorvisyöpää välillä tutkimusryhmissä.

Tarkempi ominaisuuksien sukutauluja on esitetty taulukossa 1. Enemmän miehillä kuin naisilla vaikutti molemmissa populaatioissa. Osuus sukutaulujen useita (≥2) vaikutti jäseniä oli samankaltainen kahden populaation (40.18% vuonna Chaoshan, 43.42% vuonna Taihang,

P

0,05). Keski-ikä puhkeamista (at diagnoosi) Ruokatorven syövän Taihang (61,65 vuotta) oli hieman suurempi kuin vuonna Chaoshan (60,75 vuotta,

P

0,05).

familiaalinen korrelaatioita

familiaalinen korrelaatio analyysi suoritettiin käyttäen FCOR (SAGE versio 5.3) arvioida korrelaatiot piirre arvojen paria sukulaisten kuvatulla Materiaalit ja menetelmät. Olemme havainneet, että kaikki korrelaatiokerroin arvot Chaoshan väestön suhteellinen paria olivat samanlaisia ​​kuin Taihang väestöstä (taulukko 2). Kaiken kaikkiaan suurempi sisarus-sisarus kuin vanhempien jälkeläisiä yhteyttä ei havaittu, mikä viittaa siihen, familiaalinen klusterointi geenien, jossa jokainen sukupolvi on mahdollisesti erilaiseen ympäristöön. Valikoima Sisarusten korrelaatioita oli +0,079-,149 vuonna Chaoshan ja ,102-+0,171 in Taihang, jossa veli-veli korrelaatiokerroin on suhteellisen korkea verrattuna muihin sukulaisparien sib korrelaatioita. Nämä tulokset osoittavat osallistumista geneettiset vaikutukset etiologiassa ruokatorven syövän väestössä.

suurperheet, kaikki korrelaatiokerroin arvot olivat korkeampia kuin väestössä yleensä. Korkeimmat korrelaatiokertoimet olivat veli-veli (0,488) ja sisko-sisko (0,416) paria, mikä osoittaa vahvan geneettinen vaikutus alttiuteen ruokatorvisyöpään suurten perheiden sekä Chanshan ja Taihang alueet (taulukko 2).

sekoittamisen analyysi

sekoittamisen analyysi suoritettiin käyttäen sekoittumista erottelua ohjelman SAGE (Versio 5.3.0) arvioimaan, onko jakauma keski-ikä puhkeamista ruokatorven syövän perheiden voisi olla parempi selittää seoksena kahden tai useamman jakaumat eikä samalla jakelun ja määrittämään tiettyjä keinoja sopivaksi että eriytyminen analyysi (katso alla). Tulokset sekoittamisen analyysin on esitetty kuviossa. 1.

Paneeli A: väestössä yleensä Chaoshan, paneeli B: väestössä Taihang. Histogrammit osoittavat on sekoitus jakaumat kahdessa populaatioissa.

seoksen kahdesta jakaumien sopii huomattavasti paremmin kuin yksi jakelu (Chaoshan: χ

2 = 30,09,

P

0,001, Taihang: χ

2 = 48,15,

P

0,001). Seosta, jossa on kolme jakelua kolme mielivaltaista on suurin todennäköisyys ja sopii hieman paremmin kuin kahden jakelumalli in Chaoshan (väestössä χ

2 = 4,1,

P

= 0,04288) ja ilmeisesti paremmin Taihang (χ

2 = 19,54,

P

0,001). Siten sekoittumista jakaumat kahden populaation paremmin selittää sekoitettu jakeluun kuin ainuttakaan ja ovat yhteensopivia mahdollisen suuren geenin vaikutus (kuva 1).

segregaatio analyysi

Segregation väestössä.

Voit selvittää mahdollisen periytymistapa me asentaa yhdeksän mallia, joista neljä Mendelin mallia, joka on polygeenisiä malli, polygeenisiä plus Mendelin malli, ympäristön malli, ei suuria tyyppi, ja täydellinen malli mielivaltaisen lähetyksen todennäköisyys (yleinen), kuten on kuvattu Materiaalit ja menetelmät. Arvioidut parametrit ja vastaavia malleja käytetään monimutkaisia ​​erottelun analyysejä ruokatorven syövän sekä yleisiä populaatioissa olivat samat, ja tulokset on esitetty taulukoissa 3 ja 4. molemmissa ryhmissä, kaikki

P

-arvot olivat vähemmän kuin 0,05, ja AIC arvot olivat alhaisimpia yleisiä malleja (3870,98 in Chaoshan ja 7562,54 in Taihang Mountain). Ilman yleinen malli, huomasimme, että codominant malli (4036,51) on Chaoshan väestön ja puhtaan polygenetic malli (7896,56) on Taihang väestöstä oli pienin AIC arvoja. Tulokset sekä yleisiä väestön tukea monitekijäinen mallia paras malli.

eriytyminen suuri ja laajennettu sukutauluja.

Suuressa sukutauluista molemmista alueilla Mendelin lähetys malleissa oli pienin AIC tulokset; Chi-neliö ja vastaava

P

-arvoja esitetään taulukoissa 5 ja 6. Nämä tulokset viittaavat siihen, että suuri geeni mallin taustalla etiologia ruokatorven syöpä näissä perheissä. Kahden suuren sukupuu Chaoshan, malleissa pienin AIC arvot olivat: peittyvästi, hallitseva, ja hallitseva kanssa polygeenisiä periytymistapa (taulukko 5). Neljän suuren sukutaulut Taihang, resessiiviset kanssa polygeenisiä tilassa antoi pienimmän AIC-arvon ja pidetään parhaiten sopivan malli niille suurille perheille (taulukko 6). Laajennetussa sukutauluista alkaen Taihang Vuori, Mendelin hallitseva malleissa (taulukko 7).

Keskustelu

Monikertomavarianssianalyysi periytymistapa on paras malli alttius ruokatorvisyöpään kahden yleisen väestön

tulokset FCOR analyysi vahvisti, että ruokatorven syöpä on kohtalaisen korreloi keskuudessa perheenjäseniä, ja tukevat osallistumista geneettinen komponentti varten ruokatorven syövän alttiuden kahden yleisen väestön. Kohtalainen sisar-sisko korrelaatio löytyy tässä tutkimuksessa osoittaa, että jälkeläiset olivat vaikutusvaltainen vaikutukset vanhemmiltaan. Tuloksemme ovat yhdenmukaisia ​​aiempien tutkimusten osoittavat familiaalinen korrelaatio ja yhteen ruokatorven syövän perheitä kahdessa populaatiossa. [10], [23]

tyydyttävin malli päässä sekoittamisen analyysi kaksi yleistä väestön koostuu seoksesta, kolme jakelua, mikä osoittaa, että enemmän kuin yksi komponentti on tarpeen selittää jakelua ruokatorven syöpä. Tuloksemme ovat yhdenmukaisia ​​aiempien familiaalinen korrelaatio ja sekoittumista tutkimuksia, joka osoitti, että geneettinen riskitekijä (t) saattaa olla erittäin tärkeää korkean esiintyvyyden alueilla Kiinassa. [9] Havainto useita jakaumat on yhteensopiva merkittävä geeni hypoteesi; kuitenkin sekoittumista voi myös syntyä muista syistä. Siten eriytyminen analyysiä käytetään määrittämään, onko nämä suuret vaikutukset erillisiä perheissä mukaan Mendelin odotusten.

kehittyneiden menetelmien segregaation analyysin ja tutkimalla lisänäytteitä muista korkean riskin alueet voivat olla apua ymmärtämään paremmin etiologia ruokatorven syöpä. [7] Taihang Vuori alueella, aikaisemman eriytyminen analyysi suoritettiin käyttäen REGTL ohjelman mukaiseen D-luokan regressiivinen malli, ja peittyvästi suuria geeni ehdotettiin [7]. Kuitenkin vasta nyt, samanlainen muodollinen erottelu analyysiä ei ollut suoritetaan Chaoshan väestöstä. Esillä olevassa tutkimuksessa olemme suoritetaan monimutkainen erottelun analyysi käyttäen SEGREG ohjelman mukaisesti FPMM malli. Viimeaikaiset parannukset SEGREG antaa sille merkittäviä etuja ohjelmista REGC, Regd ja REGTL edellisen S.A.G.E. versioilla ja FPMM, joka on ainoa vaihtoehto tällä hetkellä saatavilla binary ominaisuuksia vaihtelevalla alkamisiällä, on tehokkaampaa kuin luokan A regressiivinen malli tietojen ruokatorven sairaus pääasiallisena piirre ja alkamisiällä kuin sensuroitu piirre. [28]

Kun me mallinnettu puhkeamisikä, kaikki Mendelin malleja, puhdasta polygene malli, ja puhtaan ympäristön malli hylättiin, kun taas yleinen malli hyväksyttiin väestötason kahden suuren esiintyvyyden alueilta . Vaikka emme löytäneet todisteita osallistuminen suuren geenin etiologiassa ruokatorven syövän joko väestöjen, meidän tulokset monitekijäinen perintö mukaan erilaisia ​​polygenes ja ympäristötekijät edistävät taudin. Lisäksi väestössä, ympäristön malli oli alhaisin AIC-arvon vieressä yleinen malli, mikä viittaa on tärkeä rooli ympäristötekijöitä kehittämisessä ruokatorven syöpään.

Tuloksemme ovat yhdenmukaisia ​​ja tuki lausunnon Garavello ym. [7], [29], että suvussa syövän yhdistettynä tupakointi ja juominen lisäävät riskiä ruokatorven syöpään. Muita geneettisiä malleja on harkittava, mukaan lukien vuorovaikutus alttiusgeeniyhdistelmiä ja ympäristöön liittyvien riskitekijöiden väestötasolla.

Erottelu analyysi on tyypillisesti herkkä toteamiseen bias, ja vääriä oletuksia toteamista voitaisiin mitätöidä arviot saatu erottelu analyysi. Toteaminen korjausta sovellettiin ilmastointi todennäköisyyttä on probands in Taihang väestöstä.

Merkittävä Mendelin komponentti antaa herkkyys ruokatorven syövän suurperheiden

Tutkittuaan kaksi yleistä väestön, meidän toinen lähestymistapa oli keskittyä perheitä, jotka on aikaisemmin ollut ruokatorven syöpään, kuten perheet suuri määrä vaikuttaa yksilöiden tai aikaisin alkamisiällä. Vuodesta Taihang arvioimme sukua 293 yksilöiden 32 asianosaisille sekä neljä muuta suurta polveutumisten; Chaoshan tutkittiin kahden suuren sukutaulujen joiden keski-ikä on alkamisesta oli 49,25 vuotta.

familiaalinen korrelaatio ja sekoittumista analyysit osoittivat, että useampi kuin yksi komponentti tarvitaan selittämään jakaumia, joka tukee geneettinen komponentti. Erityisesti korkea sukulaisparia sib korrelaatioita (r = 0,2610 ja 0,2982) löytyy suurperheisiin osoittaa tärkeä rooli vanhempien merkitys toimien jälkeläiset ”piirteitä.

monimutkainen eriytyminen analyysi yhden suuren sukutaulu Taihang ja kaksi suurta sukutaulujen Chaoshan, sekä puhtaan ympäristön ja puhtaan polygenic mallien hylättiin; autosomaalinen hallitseva ja hallitseva polygenic mallit olivat parhaiten sopiva kuvioita. Muille neljälle sukutauluista Taihang, peittyvästi jossa polygeenisiä malli oli paras malli.

Tulokset tukevat olemassa suuri herkkyys lokuksen kanssa Mendelin perinnöllisyys joissakin suurperheille.

Geneettinen heterogeenisyys ruokatorven syövän kaksi korkean esiintyvyyden alueilta

Kun tutkimuksessa Wu et ai, [7] tutkia heterogeenisuus ikä puhkeamista ruokatorven syöpä, kirjoittajat erottaa perheitä kahteen ryhmään, joista toisessa probands joiden ikä puhkeamista oli 60 vuotta ja toinen probands joiden ikä puhkeamista oli 60 vuotta; he eivät löytäneet mitään todisteita merkittävistä heterogeenisyys näiden kahden alasarjan välisessä. Tunnistaminen subsets perheiden eri todennäköinen geneettinen etiologialtaan varten oesophogeal syöpä pidetään osoitettu geneettinen heterogeenisyys. Tässä tutkimuksessa ei vain ikä aiheiden lisäksi myös vaikuttaa numerot yksilöitä, sukupolvien kärsivän yksilön, ja ikä varianssi otettiin huomioon chosing osajoukot analysoitavaksi. Tuloksemme osoittavat ei-Mendelin periytymistapa väestössä ja näennäinen hallitseva periytymistapa tietyissä suurperheille. Nämä havainnot viittaavat siihen, että ruokatorven syöpä on merkittävä geneettinen heterogeenisyys, erityisesti monitekijäinen perintö kokonaisväestössä ja autosomaalinen hallitseva perintö joissakin alaryhmissä väestöstä. Lisäksi tulokset aiempien tutkimusten ehdotti osallistumista merkittävä resessiivinen geenin ruokatorvisyöpäriskit Yangquan, Shanxi ja Linxian, Henanin maakunnassa. [7], [11] On myös näyttöä familiaalinen ruokatorven syöpäalttiusgeeniksi alue kromosomissa 13q. [30], [31], [32], [33] Lisäksi kasvaimet potilailta, joilla on positiivinen suvussa näyttelytila ​​useammin heterotsygotian menetys (LOH) tätä kromosomi kuin lapset potilailta, joilla on suvussa. [34]

Kuten muiden syöpien, määräävä periytymistapa of oesoaphageal syövän nähtävissä muutaman erittäin suuren perheitä ehdottaa osallistumista yhteisten altistavia geenejä. Muissa familiaalinen tapauksissa ruokatorven syöpään ja satunnaisissa tapauksissa polygeenisiä /monitekijäinen etiologia voidaan oletetut jakamalla alleelien monien loci, kukin osaltaan pientä kasvua syöpäriskiä. [35] Esimerkiksi vain osa familiaalinen rintojen syöpä on selvästi perinnöllinen, mikä johtuu pääasiassa mutaatioita yhden geenin. Tietoa geneettinen heterogeenisyys ruokatorven syöpä on tärkeää pystyä tunnistamaan eri alaryhmiin ja lopulta paljastaa taudin loci.

Lisätutkimuksia geneettisen kytkennän ja alttius geenin sijainti

Yhdistetty molekyyli- geneettinen analyysi ja geneettisen epidemiologian voi paljastaa taustalla perusteella geneettinen alttius ruokatorven syöpään.