Krooninen sairaus

tiivistelmä

Background

MikroRNA (miRNA) osallistuu solujen eri prosesseja, kuten solun kasvua, erilaistumista, solukuolemaa ja niillä on tärkeä rooli erilaisissa sairauksissa, erityisesti syöpää. Viime aikoina useat tutkimukset ovat tutkineet yhdistyksen välillä yhden nukleotidin polymorfismien (SNP) on HSA-miR-149 rs2292832 ja alttiutta syöpään; Kuitenkin tulokset ovat edelleen epäselviä.

Menetelmät /Principal Havainnot

suorittaa meta-analyysi 12 tutkimuksesta, joihin sisältyi 5937 tapauksissa ja 6081 säätimet PubMed arvioimaan assosiaatiota HSA-miR -149 rs2292832 ja syövän riskiä yhdistettiin kertoimet suhdeluvut (syrjäisimmillä alueilla) ja 95%: n luottamusvälit (CI). Kuitenkin meidän tulokset osoittivat, että genotyyppi jakautuminen HSA-miR-149 rs2292832 ei liittynyt syöpäriskiä kaikissa geneettisten mallien. Alaryhmäanalyysi syöpätyypin, etnisen alkuperän tai tutkimuksen suunnittelu ei ilmennyt merkitsevää yhteyttä myöskään.

Johtopäätös

tulokset tämän meta-analyysi viittaavat siihen, että HSA-miR-149 rs2292832 polymorfismi ei liity syöpään vaara huolimatta mahdollisesti suojaava rooli C-alleelin maksasolukarsinoomassa ja miehen mahasyövässä.

Citation: Xu L, Zhou X, Qiu MT, Yin R, Wu YQ, Xu L (2013) puuttuminen Association välillä Hsa-miR-149 rs2292832 polymorfismi ja syöpäriski: Meta-analyysi 12 Studies. PLoS ONE 8 (9): e73762. doi: 10,1371 /journal.pone.0073762

Editor: Roberto Amendola, ENEA, Italia

vastaanotettu: 03 toukokuu 2013; Hyväksytty: 22 heinäkuu 2013; Julkaistu: 05 syyskuu 2013

Copyright: © 2013 Xu et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä työ tukivat Natural Science Foundation of Jiangsun maakunnassa (BK2010589, BK2011857), Kiina. Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistelu Käsikirjoitus.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

MikroRNA (miRNA) ovat runsas luokka pienet ei-koodaavat RNA: t, jotka negatiivisesti säädellä geeniekspressiota emäspariutumisen kanssa 3′-alueella kohde- mRNA: iden, jolloin joko mRNA pilkkominen tai translaation tukahduttaminen [1 , 2]. Monet tutkimukset ovat osoittaneet, että miRNA osallistuvat säännellään erilaisissa biologisissa prosesseissa, kuten solujen erilaistuminen, proliferaatio, angiogeneesi, aineenvaihduntaa ja syövän kehityksen [3-7]. Koska tärkeä osa kasvaimen muodostumisen, huolto-, ja etäpesäkkeitä, säädeltyyn miRNA, joko tuumorisuppressorien tai onkogeenien, voi olla tärkeä rooli syövän [8].

Yhden nukleotidin polymorfismien (SNP: t), joka sijaitsee miRNA geenejä voi liittyä muutoksiin miRNA käsittely, mikä johtaa toiminnallisia muutoksia miRNA vaikuttamalla vuorovaikutusta miRNA ja niiden kohde-mRNA: [9,10]. Monet tutkimukset ovat tutkineet yhdistyksen välillä SNP miRNA ja herkkyys eri syöpiä. HSA-miR-499 rs3746444 polymorfismi voisi lisätä rintasyövän riskiä [11]. Wang et ai. osoittivat, että miR-146a rs2910164 polymorfismi oli merkitsevästi liittyy riski papillaarisen kilpirauhaskarsinoomaa, ensisijainen maksasyövän ja kohdunkaulan syövän sekä miR-196a2 rs11614913 polymorfismi oli yhteydessä rintasyöpä, keuhkosyöpä, paksusuolen ja peräsuolen syöpä [12].

Viime aikoina monet tutkimukset ovat tutkineet yhdistyksen välillä HSA-miR-149 rs2292832 polymorfismi ja syöpäriskiä. Mutta tulokset eivät olleet vakuuttavia ja johdonmukainen. Ottaen huomioon rajat yksittäisessä tutkimuksessa, suoritimme tämä meta-analyysi 12 julkaistuja tutkimuksia johtamiseksi tehokkaampi arvio yhdistyksen välillä HSA-miR-149 rs2292832 polymorfismi ja syöpäriskiä.

Methods

Julkaisut ja kriteereillä

Medical alaotsikko (Mesh) termejä: ”microRNA”, ”syöpä” ja ”polymorfismi” käytettiin etsiä PubMed tukikelpoisten tutkimuksia (viimeinen etsiä: 28 huhtikuu 2013) . Viittaukset artikkeleita ja arvosteluja tutkittiin tutkia mahdollisesti lisätutkimuksia. Tutkimukset olivat sopivia, jos ne täyttävät seuraavat kriteerit: (a) tapausverrokkitutkimukset; (B) tutkivat yhdistyksen välillä HSA-miR-149 rs2292832 polymorfismi ja syövän riskiä; (C) yksityiskohtaiset genotyyppitietoja arviointiin of kerroinsuhde (OR) ja 95%: n luottamusväli (CI); (D) kokotekstiartikkeleita Englanti. Jos useita tutkimuksia ollut päällekkäisyyttä ja moninkertaisia ​​tietoja, vain ne, joilla täydelliset tiedot tai tuoreet tutkimukset olivat mukana.

Data louhinta

Data arvioitiin ja uutetaan tukikelpoisten tutkimuksista kaksi tutkijaa (Xu ja Zhou ) itsenäisesti. Seuraavat erät kustakin Tutkimuksen kirjattiin: ensin tekijän nimi, julkaisuvuosi, maan tai alueen alkuperää, etnisyyden, syöpä tyyppi, lähde hallintalaitteiden, genotyypitysmenetelmää, kaikista tapauksista ja valvonta, genotyyppi jakaumat tapauksissa ja valvontaa, ja Hardy-Winberg tasapaino (HWE), tässä järjestyksessä. Jos ristiriitaisuuksia välillä kaksi tutkijaa, toinen tutkija (Qiu) kutsuttiin keskustelemaan ja tarkistaa tiedot ennen kuin päästiin.

Tilastollinen

HWE arvioitiin valvonnasta kussakin tekemä tutkimus chi-neliö testi ja p 0,05 katsottiin lähtö HWE. Kertoimet suhde (syrjäisimmät alueet), jossa 95%: n luottamusväli (CI) arviointiin käytettiin vahvuus yhdistyksen välillä HSA-miR-149 rs2292832 polymorfismi ja syöpäriskiä. Yhdistettiin syrjäisimmillä alueilla tehtiin alleelinen vertailu (T vs. C), resessiivinen malli (TT vs. CT /CC), hallitseva malli (TT /TT vs. CC), homotsygoottinen vertailu (TT vs. CC), ja heterotsygoottinen vertailu (CT vs. CC), tässä järjestyksessä. Tilastollinen merkitys yhdistettyä syrjäisimpien alueiden määritettiin Z-testi ja p 0,05 pidettiin tilastollisesti merkitsevä. Chi-neliö perustuva Q-testiä käytettiin tarkistaa heterogeenisuus tutkimuksissa. A s 0,10 Q-testi ehdotti merkittäviä heterogeenisuus tutkimuksia, ja random-vaikutusten malli (Dersimonian-Laird menetelmä) suoritettiin laskemaan yhdistettyä syrjäisimpien alueiden [13]; Muussa tapauksessa kiinteiden vaikutusten malli (Mantel-Haenszelin menetelmää) käytettiin [14]. Alaryhmäanalyysien suoritettiin myös testaamaan vaikutukset etnisyyden, syövän tyyppi ja lähde valvontaa. Herkkyysanalyysi suoritettiin tunnistamiseksi vaikutus tietojen kustakin tutkimuksen yhdistettiin syrjäisimmille alueille. Begg n suppilo juoni ja Egger n lineaarisen regression testi tehtiin arvioimaan julkaisemisen suuntautunutta kirjallisuuksien ja p 0,05 katsottiin merkitseväksi [15]. Trim ja täytä menetelmää käytettiin arvioi mahdollisten epäsymmetriaa suppiloon juoni. Kaikki tilastolliset testit laskettiin STATA ohjelmistoversio 12,0 (STATA Corporation, College Station, TX, USA).

Tulokset

Tutkimus ominaisuudet

yhteensä 11 artikkelia haettiin PubMed mukaan mukaanottokriteereihin [16-26]. Kuvassa 1 esitetään yksityiskohtainen seulontaprosessiin. Tutkimus Zhang et al. [21] esitetään erillisessä OR eri syöpätyyppejä (mahasyövän ja peräsuolen syöpä) ja jokainen niistä pidettiin erikseen tähän meta-analyysiin. Siten yhteensä 12 tutkimuksissa, joissa 5937 tapauksissa ja 6081 valvonta analysoitiin myös meta-analyysi. Kuten on esitetty taulukossa 1, 3 12 tutkimukset olivat valkoisilla ja toinen 9 tutkimukset olivat aasialaisista. Lähes kaikissa tapauksissa todettiin histologisesti tai patologisesti. High Resolution sulaminen (HRM), TaqMan genotyypitysmääritys ja polymeraasiketjureaktio-restriktiofragmenttipituuspolymorfismin (PCR-RFLP) käytettiin genotyypitysmenetelmiä 2, 1 ja 9 tutkimukset vastaavasti. Kaikki tutkimukset käytetään verinäytteen genotyypitykseen. Ikä ja sukupuoli on jaksotettu vastaamaan valvonnasta lähes kaikissa tutkimuksissa, joista 7 oli sairaalan johdolla ja 5 väestötason. Jakautuminen genotyyppien kontrolleissa oli yhteisymmärryksessä HWE paitsi tutkimus Chu et al. [17].

* 11 artikkelia haettiin ja kaksi erillistä tutkimuksessa todettiin yhdellä artikkelissa, joten 12 tutkimukset olivat oikeutettuja.

Tekijän

Year

Maa

Alkuperä

Cancer tyyppi

Tutkimusasetelma

Genotyping method

P

hwe

Cases

Controls

Cases

Controls

TT

CT

CC

TT

CT

CC

Vinci[16]2013ItalyCaucasianCRCHBHRM0.91160178235879177586Chu[17]2012TaiwanAsianOSCCHBTaqMan 0.00148042534588473158426Kim[18]2012KoreaAsianHCCHBPCR–RFLP0.34159201816414839721Zhang[19]2012ChinaAsianBCPBPCR–RFLP0.21245229120102239211324Min[20]2012KoreaAsianCRCHBPCR–RFLP0.954465022211774823221951Zhang[21]2012ChinaAsianCRCPBPCR–RFLP0.584354431872024620319050Zhang[21]2012ChinaAsianGCPBPCR–RFLP0.702742691321014111412035Vinci[22]2011ItalyCaucasianLCHBHRM0.97101129164144115365Liu[23]2010USACaucasianHNSCCHBPCR–RFLP0.27110911308844158099445586Tian[24]2009ChinaAsianLCPBPCR–RFLP0.8610581035463472123470453112Hu[25]2009ChinaAsianBCPBPCR–RFLP0.161009109399460450108503482Ahn[26]2012KoreaAsianGCHBPCR–RFLP0.984614472411764422018740Table 1. Ominaisuudet voivat tutkimuksissa.

CRC: kolorektaalisyövän; OSCC: suun okasolusyöpä; HCC: maksasyövän; BC: rintasyöpä; GC: mahasyöpä; LC: keuhkosyöpä; HNSCC: levyepiteelisyövän pään ja kaulan PB: väestöpohjainen; HB: sairaala-pohjainen. P

HWE: Hardy-Winberg tasapainoon CSV Lataa CSV

Meta-analyysin tulokset

tärkeimmät tulokset meta-analyysi on esitetty taulukossa 2. Emme löytäneet Merkitsevä yhteys HSA -miR-149 rs2292832 polymorfismi ja syöpäriskin kaikki geneettiset mallit (T versus C: OR = 1,01, 95% CI 0,95-1,06, p

heterogeenisyys = 0,286; TT vs. CC: OR = 0,98, 95% CI 0,86 -1,11, p

heterogeenisyys = 0,451; CT vs. CC: OR = 0,96, 95% CI 0,86-1,05, p

heterogeenisyys = 0,851; TT /CT vs. CC: OR = 0,97, 95% CI 0,88 -1,06, p

heterogeenisyys = 0,858; TT vs. CT /CC: OR = 1,05, 95% CI 0,96-1,14, p

heterogeenisyys = 0,118) (katso kuva S1 kuvaan S5 File S1). Vastaavasti mitään merkittävää yhdistyksen välillä HSA-miR-149 rs2292832 polymorfismi ja syövän riskiä löydettiin meidän alaryhmäanalyysi etnisyys (Aasian ja valkoihoinen), tutkimuksen suunnittelu (sairaala-pohjainen ja väestöpohjaiset) tai syöpä tyyppiä (levyepiteelikarsinooma syöpä, rinta- syöpä, peräsuolen syöpä, keuhkosyöpä ja mahasyöpä).

N

tapauksessa /ohjaus

T vs. C

TT vs. CC

CT vs. CC

TT /CT vs. CC

TT vs. CT/CC

OR

Ph

OR

Ph

OR

Ph

OR

Ph

OR

P

h

Total125937/60811.01(0.95,1.06)0.2860.98(0.86,1.11)0.4510.95(0.86,1.05)0.8510.97(0.88,1.06)0.8581.05(0.96,1.14)0.118Cancer typeSC21589/15550.93(0.83,1.05)0.2180.8(0.62,1.04)0.1910.82(0.49,1.37)0.070.81(0.51,1.3)0.0660.89(0.73,1.1)0.978BC21254/13221.08(0.86,1.35)0.1211.04(0.79,1.37)0.3610.98(0.82,1.16)0.9070.99(0.84,1.17)0.6561.17(0.82,1.27)0.123CRC31041/11231.02(0.9,1.16)0.6691.07(0.81,1.43)0.6210.94(0.73,1.22)0.5480.99(0.77,1.26)0.8891.05(0.88,1.25)0.186LC21159/11641.09(0.76,1.56)0.0731.26(0.55,2.9)0.0580.99(0.76,1.27)0.5620.99(0.78,1.27)0.2381.23(0.6,2.54)0.071GC2735/7161.07(0.92,1.25)0.8760.99(0.7,1.4)0.9830.79(0.56,1.12)0.6280.89(0.64,1.24)0.7871.18(0.96,1.45)0.608Study designPB53021/30690.99(0.92,1.07)0.4020.98(0.82,1.16)0.8420.97(0.84,1.11)0.7550.97(0.85,1.11)0.9241.01(0.9,1.13)0.147HB72916/30121.02(0.94,1.11)0.1820.98(0.82,1.18)0.1470.94(0.82,1.07)0.6310.96(0.85,1.09)0.5051.1(0.97,1.24)0.172EthnicityAsian94567/46441.01(0.94,1.07)0.260.96(0.83,1.1)0.6480.93(0.82,1.05)0.7420.95(0.84,1.06)0.7861.05(0.96,1.14)0.166Caucasian31370/14371.01(0.9,1.14)0.221.05(0.81,1.38)0.1020.99(0.85,1.16)0.6881(0.86,1.16)0.5671.29(0.76,2.17)0.082Table 2. Meta-analyysin tulokset.

N: tutkimusten lukumäärä mukana; TAI: riskisuhde; P

h: p-arvo heterogeenisyys; SC: okasolusyöpä CRC, peräsuolen syöpä; BC: rintasyöpä; GC: mahasyöpä; LC: keuhkosyöpä; PB: väestöpohjainen; HB: sairaala-pohjainen CSV Lataa CSV

Herkkyystarkastelu

Yksi ainoa tutkimus poistetaan joka kerta yhdistetyistä tuloksista vaikutusten tutkimiseksi yksittäisten tutkimus yhdistettiin syrjäisimmille alueille. Tuloksemme osoittivat, että yhdistetyssä syrjäisimpien ei muuttunut, jossa ehdotettiin, että mikään yksittäinen tutkimus vaikuttanut merkittävästi yhdistetyistä tuloksista.

Julkaisu bias

Käytimme Begg n suppilo juoni ja Egger n lineaarisen regression testi arvioida julkaisun bias . Julkaisu bias havaittiin (T vs. C: P = 0,047 varten Begg testi ja P = 0,025 varten Egger testi; TT vs. CC: P = 0,011 varten Begg testi ja P = 0,028 varten Egger testi; TT vs. CT /CC: P = 0,024 varten Begg testi ja P = 0,007 varten Egger testi). Siten leikata ja täytä menetelmää käytettiin ja yhdistettiin syrjäisimpien laskettiin uudelleen kanssa hypoteettisesti julkaisemattomia arvioida epäsymmetria suppiloon juoni (kuva 2). Uudelleen laskettu syrjäisimmillä alueilla ei muuttunut merkittävästi (T vs. C: OR = 0,981, 95% CI = 0,914-1,053; TT vs. CC: OR = 0,912, 95% CI = 0,814-1,022; TT vs. CT /CC: OR = 1,031, 95% CI = 0,917-1,16), osoittaa tulosten pysyvyyden.

ympyrät: mukana tutkimuksissa. Diamonds: oletettu puuttuvat tutkimukset.

Keskustelu

miRNA olla tärkeä rooli solujen eri prosesseja ja osallistuvat moniin sairauksiin kuten erilaisia ​​syöpiä [2,27,28]. Geneettiset variaatiot, jotka syntyvät miRNA geenejä, mukaan lukien niiden yksi- ja ennalta miRNA alueilla, saattaa vaikuttaa käsittelyn ja ilmaus miRNA kuten tapahtuu säätelyä alaspäin kypsän let-7e, jonka G Mutaatio 19nt alavirtaan ennalta anna -7e [29]. Viime aikoina monet tutkimukset ovat osoittaneet yhdistyksen välillä SNP miRNA-geenin ja syöpäriskiä. MIR-27a polymorfismi (rs11671784) saattaa vähentää ilmentymistä kypsän miR-27a ja vähentää alttiutta syöpään [30]. Merkitsevästi lisääntynyt paksusuolisyövän riskin havaittiin MIR-196a2 (rs11614913) CT /CC-genotyyppi verrattuna TT genotyyppi [31].

Koska tuumorisuppressorigeeniä, miR-149 saattaa estää proliferaatiota ja indusoi solusyklin pysähtymisen kohdistamalla ZBTB2 mahasyövän [32]. Pan et al. osoittivat, että miR-149 saattaa olla mukana leviämisen ja invaasion glioomasoluihin eston kautta AKT1 signalointi [33]. Täten muutokset miR-149-geeni voi myötävaikuttaa syövän riskiä. Välinen assosiaatio HSA-miR-149 rs2292832 polymorfismi ja syövän riski on tutkittu joissakin tutkimuksissa. Kim et ai. osoittaneet, että riski HCC oli merkittävästi pienempi potilailla, joilla on miR-149 CT: a tai CT /CC genotyyppien [18]. Potentiaalisesti suojaava rooli C-alleelin HSA-miR-149 havaittiin uros- mahasyövässä [21,26]. Mutta mitään merkittävää yhdistyksen välillä HSA-miR-149 rs2292832 polymorfismi ja syövän riski havaittiin muun tutkimuksissa. Mitä ristiriitaisia ​​tuloksia yksittäisistä tutkimuksista kaikenlaisille syövät, tämä meta-analyysi mukaan lukien 12 tutkimuksissa 5937 tapauksia ja 6081 tarkastuksia yhteensä rakennettiin arvioimaan -alueella. Kuitenkin meidän tulokset osoittivat, että merkittävää yhdistyksen välillä HSA-miR-149 rs2292832 polymorfismi ja alttiutta syöpään. Vastaavasti alaryhmäanalyyseissa syövän tyypin, tutkimuksen suunnittelu tai etnisen alkuperän ei viitannut merkittävästi erilaisen tuloksen. Kun poistetaan Chu tutkimuksessa [17] sopeutumattomuus ja HWE kontrolliryhmässä herkkyysanalyysiin, yhdistetyissä tuloksissa ei muuttunut merkittävästi. Kuten julkaisu bias havaittiin, hyväksyimme leikata ja täytä tapa laskea mukautetun syrjäisimpien alueiden ja ei löytänyt erilaiseen lopputulokseen, mikä viittaa vakautta tilastollinen analyysi.

Useat rajoituksista meta-analyysin tulisi harkita. Ensinnäkin tutkimukset haetuin PubMed olivat täynnä tekstiä Englanti. Tämä voi olla osittain vastuussa havaitusta julkaisun bias, vaikka ne eivät muuta tuloksia käyttäen leikata ja täytä menetelmällä. Toiseksi useita tutkimuksia varten alaryhmäanalyysi oli pieni, että vain yksi osatyössä tutkittiin suun okasolusyöpä [17], levyepiteelisyöpä pään ja kaulan [23] ja maksasyövän [18] vastaavasti, josta Kim tutkimus [18] paljasti biologinen merkitys. Enemmän tutkimukset homogeeninen syöpäpotilaiden ja valvonta tarvittiin tulosten varmistamiseksi. Jotkut covariates kuten sukupuoli, ikä ja asuinpaikka-alue oli myös eivät ole saatavilla kaikissa tutkimuksissa säädetty syrjäisimpiä alueita, jotka täytyy käsitellä tarkemmin, koska löysimme mahdollisesti suojaava rooli C-alleelin miesväestöstä mahasyövän.

Lopuksi yhdistetyistä tulokset meta-analyysi ehdotti, että HSA-miR-149 rs2292832 polymorfismi eivät lisäisi herkkyyttä kaikentyyppisten syöpien huolimatta mahdollisesti suojaava rooli C-alleelin maksasolukarsinoomassa ja miehen mahasyövän. Kuitenkin meidän tuloksia tulee pitää varoen, koska havaittujen julkaisun bias ja rajoituksia yllä. Edelleen tulosten vahvistamiseksi, suuren mittakaavan tapausverrokkitutkimukset eri etnisten ryhmien ja useita syöpätyyppejä tarvitaan.

tukeminen Information

Tiedosto S1.

metsäviljelmien yhdistyksen välillä HSA-miR-149 rs2292832 polymorfismi ja syöpäriskiä.

doi: 10,1371 /journal.pone.0073762.s001

(DOCX) B Taulukko S1.

PRISMA tarkistuslista.

doi: 10,1371 /journal.pone.0073762.s002

(DOC) B