Krooninen sairaus

tiivistelmä

Background

välinen yhteys polymorfismien päälle 15q25.1 ja keuhkosyöpä on laajalti arvioitu; kuitenkin tutkimukset ovat tuottaneet ristiriitaisia ​​tuloksia. Olemme pyrkineet tutkimaan tätä epäjohdonmukaisuutta suorittamalla kattavan meta-analyysi kahden polymorfismien (

CHRNA3

geeni: rs1051730 ja

AGPHD1

geeni: rs8034191) on 15q25.1.

menetelmät

Data poimittiin 15 ja 14 tutkimuksia polymorfismien rs1051730 ja rs8034191 joihin 12301/14000 ja 14075/12873 keuhkosyöpää /valvontaa, vastaavasti. Satunnaisen-vaikutukset mallia sovellettiin puuttumalla heterogeenisyys ja julkaisu bias.

Tulokset

Kaksi polymorfismien seurasi Hardy-Weinberg tasapainon kaikkien muiden tutkimusten (

P

0,05) . Sillä rs1051730-G /A, kantajia alleelin oli 36% suurempi riski saada keuhkosyöpä (95% luottamusväli [CI]: 1,27-1,46;

P

0,0005), ilman heterogeenisuus (

P

= 0,258) tai julkaisun bias (

P

Egger

= 0,462). Sillä rs8034191-T /C, alleelinen kontrasti osoitti, että C-alleeli koitui 23% lisääntynyt riski keuhkosyöpä (95% CI: 1,08-1,4;

P

= 0,002), joilla on merkittävää heterogeenisyyttä (

P

0,0005) ei julkaista bias (

P

Egger

= 0,682). Alaryhmien analyysissä todettiin, että Tutkimusten välisten heterogeenisuus oli peräisin etnisyys, tutkimuksen suunnittelu, Hyväksytty tietoa, ja keuhkosyöpä alatyyppejä. Esimerkiksi yhdistys polymorfismien rs1051730 ja rs8034191 keuhkosyöpä oli heterogeeninen välillä valkoihoisten (OR = 1,32 ja 1,22; 95% CI: 1,25-1,44 ja 1,05-1,42;

P

0,0005 ja 0,008, tässä järjestyksessä ) ja Itäaasialaiset (OR = 1,51 ja 1,03; 95% CI: 0,76-3 ja 0,47-2,27;

P

= 0,237 ja 0,934, vastaavasti) alle alleelinen malli, ja tämä yhdistys suhteellisen vahvistui alla hallitseva malli. Ei ollut havaittavissa julkaisu bias molemmille polymorfismien.

Johtopäätökset

havainnot osoittivat, että

CHRNA3

geeni rs1051730-alleelin ja

AGPHD1

geeni rs8034191- T-alleelin saattaa olla riski antavia tekijöitä kehittämiseksi keuhkosyövän valkoihoisista, mutta ei Itä-aasialaiset.

Citation: Gu M, Dong X, Zhang X, Wang X, Qi Y, Yu J, et ai. (2012) vahvan yhteyden Kaksi polymorfismit on 15q25.1 ja Lung Cancer Risk: meta-analyysi. PLoS ONE 7 (6): e37970. doi: 10,1371 /journal.pone.0037970

Editor: Yan Gong, College of Pharmacy, University of Florida, Yhdysvallat

vastaanotettu: 19 tammikuu 2012; Hyväksytty: 27 huhtikuu 2012; Julkaistu: 06 kesäkuu 2012

Copyright: © 2012 Gu et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä työ tukivat Shanghai Rising Star Program (11QA1405500) ja National Science Foundation nuorten tutkijoiden of China (30900808). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat lukenut lehden politiikan ja ovat seuraavat ristiriitoja: Xuezhi Zhang on työntekijä Kiina petrokemian Corporation. Ei ole olemassa patentteja, tuotteiden kehittämiseen tai kaupan tuotteiden julistaa. Tämä ei muuta tekijöiden noudattaminen kaikki PLoS ONE politiikan tietojen jakamista ja materiaaleja.

Johdanto

Keuhkosyöpä on yleisin maligniteetti ja ensimmäinen johtava syy syövän kuolleisuus, joiden arvioitu 1,3 miljoonaa uutta tapausta diagnosoidaan vuosittain maailmassa [1], [2]. Tunnettu riskitekijöitä keuhkosyöpä kuuluvat tupakointi ja altistuminen ionisoivalle säteilylle (esim radon, lääketieteellinen kuvantaminen). Kertyvät tutkimusten mukaan geneettiset tekijät voivat vaikuttaa vaihtelun alttiutta keuhkosyöpään. On yleisesti hyväksytty, että keuhkosyöpä on monimutkainen monitekijäinen sairaus, johtuvan vuorovaikutuksen geneettisten tekijöiden ympäristötekijöihin [3], [4]. Huolimatta intensiivisesti omistettu tutkivat geneettiset tekijät keuhkosyövän, ajo geenit ja geneettiset variantit, jotka määrittävät kehittäminen keuhkosyöpään ovat epäselviä.

kromosomin 15q25.1 alue on tunnistettu hotspot keuhkosyöpä herkkyys viimeaikaiset genomin laajuinen yhdistys (GWA) tutkimukset [5], [6], [7], [8]. Tulokset geneettisen yhdistyksen tutkimusten nikotiiniriippuvuus, nikotiiniriippuvuus ja tupakointiin liittyviin sairauksiin ovat lähentyneet syytöstä kromosomiin 15q25.1 alueella. Suhde polymorfismien rs1051730 in

CHRNA3

geeni ja rs8034191

AGPHD1

geeni ja keuhkosyövän riskiä tai liittyvät fenotyypit on laajalti tutkittu. Kuten McClellan ja kuningas, monet elleivät useimmat geneettisten polymorfismien, joista ilmoitetaan liittyvän yhteisten häiriöitä GWA tutkimuksissa ovat tosiasiallisesti vääriä yhdistysten aiheuttamat hienoisia eroja syntyperä asukkaiden välisiä tutkitaan (tunnetaan nimellä ”arvoituksellisesti väestö kerrostuneisuus” ) [9]. Lisäksi perustuu siihen, että yksittäisten tutkimusten riittämätön otoskoot ole riittävää tilastollista voima havaita yhteisen variantit pieniä vaikutuksia keuhkojen Karsinogeneesin tulokset eivät ole toistettavissa. Johtamiseksi tarkemman arvion ja tutkimaan epäjohdonmukaisuus, arvioimme vaikutus kaksi polymorfismien rs1051730 ja rs8034191 sen keuhkosyövän riskiä, ​​käsitellään heterogeenisyys ja julkaisu bias.

Methods

Me tehdään tässä analyysi suuntaviivojen mukaisesti Edullisen Reporting Kohteiden-katsaukseen ja Meta-analyysit (PRISMA) selvitys [10] (ks vuokaavio S1 ja tarkistuslista S1).

Hae strategia tunnistaminen Studies

Haimme PubMed ja EMBASE tietokantoja julkaistuja artikkeleita ennen tammikuuta 2012 käyttäen Boolen yhdistelmiä asiasanoja (CHRNA3 OR AGPHD1 OR LOC123688) jA (keuhkosyöpä OR syöpä tai kasvain) jA (geeni tai polymorfismi tai alleeli tai perimän tai variantti OR mutaatio). Artikkelit rajattiin Englanti-kielen ja ihmisen tutkimukset. Teksti kokonaisuudessaan noudetun esineiden oli tutkittava, jotta voitaisiin päättää, onko tietoa aihe kiinnostaa oli mukana. Viiteluettelot näistä noudetaan artikkeleita ja järjestelmällisiä arvioita tarkistettiin myös lainaukset artikkeleita ei alun perin tunnistettu. Artikkeleita liittyy useampi kuin yksi maantieteellinen tai etnisen heterogeeninen ryhmä, kukin ryhmä käsiteltiin erikseen. Kun genotyyppi taajuus ei ilmoiteta, otimme yhteyttä kirjoittajat saada tarvittavat tiedot.

Inclusion /poisjättökriteerit

Artikkelit kuuluivat tähän meta-analyysissä, jos he 1) tutki hypoteesi, että

CHRNA3

geeni rs1051730 polymorfismi ja /tai

AGPHD1

geeni rs8034191 polymorfismi liittyivät keuhkosyövän riskiä; 2) seurasi sisäkkäisen tapaus-verrokki tai tapaus-verrokki tai poikkipinta-tutkimuksen suunnittelu; ja 3) toimittanut riittävästi tietoja genotyyppi /alleeli laskee tapausten ja kontrollien välillä arvioida kerroinsuhde (OR) ja vastaavat 95%: n luottamusväli (95% CI). Suhteellisen täydellinen ja viimeaikaiset tulokset poimittiin kun oli useita artikkeleita, jotka koskevat samaa väestöstä.

Extracted Information

Seuraavat tiedot uutettiin itsenäisesti ja aloittanut erilliset tietokannat kaksi tekijää (MG ja WN ) kustakin pätevien tutkimuksesta: ensin tekijän sukunimi, julkaisupäivämäärä, väestö etnisyys, tutkimuksen suunnittelu, lähtötilanteen ominaisuudet tutkimusväestöstä kuten ikä, etnisyys, sukupuoli, tupakointi, ja genotyyppi laskee tapauksissa ja valvontaa. Jokainen kohtasi ristiriita oli ratkaisi jonka keskustelu kunnes päästiin.

Laatupisteet Assessment

Tutkimus laatu arvioitiin käyttämällä laadun arviointi pisteet kehitetty geneettisiä yhdistys tutkimukset Thakkinstian et al [ ,,,0],11]. Yhteensä tulokset vaihtelivat 0 (huonoin) 12 (paras). Kriteerit laadun arviointi geneettisen yhdistyksen kahden tutkittu polymorfismien ja keuhkosyöpä on kuvattu taulukossa S1.

Tilastollinen analyysi

Tiedonhallinta ja tilastolliset analyysit tehtiin käyttäen STATA ohjelmistoa (StataCorp, Texas , USA, versio 11.0 for Windows). Poikkeaminen Hardy-Weinberg tasapaino testattiin χ

2 tai Fisherin testi kontrolliryhmissä. Riippumatta Tutkimusten välisten heterogeenisuus, satunnainen vaikutusten mallia käyttäen Dersimonian ja Laird menetelmä toteutettiin tuoda yksittäinen vaikutus-kokoarvioita yhteen, ja arvio heterogeenisuus otettiin Mantel-Haenszel malli [12]. Mukauttamaton OR ja 95%: n luottamusväli käytettiin vertaamaan alleeliset ja hallitseva kontrasti tapausten ja kontrollien välillä.

Between-tutkimus heterogeenisuus arvioitiin epäjohdonmukaisuus index

I

2 tilastoa (vaihdellen 0-100%), joka oli dokumentoitu prosenttiosuus havaittu-tutkimus vaihtelu johtuu heterogeenisyys sijaan sattumalta, korkeammat arvot viittaa olemassaolon heterogeenisyys [13], [14]. Kun kyseessä on Tutkimusten välisten heterogeenisuus, selvitimme tutkimuksen ominaisuudet, jotka voivat osittaa tutkimukset alaryhmiin homogeenisen vaikutuksia. Arvioida, missä määrin yksi tai useampi covariates selitetty heterogeenisyys, käytimme meta-regression, jatkeena random-vaikutusten meta-analyysi.

Kumulatiivinen meta-analyysi suoritettiin tunnistaa vaikutus ensimmäisen julkaistu tutkimus myöhemmin julkaisuista, ja kehitys yhdistetyn arvioiden ajan mukaan nousevaan julkaisupäivää. Potentiaalisesti vaikutusvaltainen tutkimuksia, suoritimme vaikutusvaltainen analyysi (tunnetaan myös herkkyysanalyysissä) poistamalla yksittäinen tutkimus aina tarkistaa, onko jokin näistä arvioista puolueellinen kokonaisarvio.

suppilo juoni ja Egger testi sovellettiin arvioida julkaisu bias [15]. Egger testi voi havaita suppilo juoni epäsymmetria määrittämällä, leikkauspiste poikkeaa merkittävästi nollaksi regressio standardoitua vaikutuksen estimaatteja niiden tarkkuus. Trim ja täytä menetelmää käytettiin myös arvioida, paljonko ja tuloksia mahdollisesti puuttuu tutkimuksista johtuva julkaisu bias. Todennäköisyys 0,05 katsottiin merkitseväksi lukuunottamatta

I

2 ja Egger n tilastotieto, joille merkittävyystasolla määriteltiin 0,1.

Tulokset

haku of Studies

Perustuu hakustrategia, ensisijainen seulonta tuotti 40 mahdollisesti merkitystä artikkeleita, joista 12 täytti kriteereillä yritetään arvioida yhdistys

CHRNA3

geeni rs1051730 ja /tai

AGPHD1

geeni rs8034191 polymorfismien keuhkosyöpä riski [5], [16], [17], [18], [19], [20], [21], [22], [23 ], [24], [25], [26]. Vuokaavio kaavamaisesti valintaprosessiin ja ilman artikkelit erityisiä syitä (kuvio 1). 12 pätevä artikkelia vuodesta 2008 vuoteen 2011, johon 16 tutkimuksissa 9 valkoihoisista, 4 Itäaasialaiset, 2 in Afrikkalainen-amerikkalaiset ja 1 mixed (valkoihoinen, Afrikkalainen Amerikan ja Hispanic) populaatioissa. Laatu pisteet tutkimuksissa vaihteli 7-10 (keskiarvo: 8,5) ulos maksimaalinen pistemäärä 12. Yksityiskohtaisesti oli 11 (15) ja 10 (14) esineiden (tutkimukset) ja rs1051730 ja rs8034191 polymorfismit joihin 12301/14000 ja 14075/12873 keuhkosyöpää /valvontaa, vastaavasti.

tutkimus ominaisuudet

ominaisuudet lähtötilanteessa kaikki päteviä tutkimuksia on koottu taulukkoon 1. genotyyppi jakaumia kaksi polymorfismien olivat Hardy -Weinberg tasapainon kaikissa tutkimuksissa (

P

0,05). Kymmenen 16 pätevien tutkimuksia Hyväksytty ikää tai sukupuolta tai tupakointi tapausten ja kontrollien välillä [16], [18], [19], [21], [22], [24], [25], [26]. Viisi tutkimukset olivat sairaalan johdolla [16], [19], [23], [26], ja loput väestöpohjainen. Kolme tutkimusta mukana ei-pienisoluinen keuhkosyöpä kuin päätepiste, ja yhdessä tutkimuksessa mukana okasolusyöpä keuhkosyöpä päätepisteenä. Taajuudet on

CHRNA3

geeni rs1051730-alleelin vaihteli suuresti välillä valkoihoisten ja Itäaasialaiset kanssa Afrikkalainen-amerikkalaiset välillä. Esimerkiksi Kontrolliryhmiin rs1051730-alleelin vaihteli 29,45%: sta 37,14% valkoihoisista, välillä 1,39%: sta 3,3% Itäaasialaiset, ja 16.15%: sta 19,85%: in Afrikkalainen-amerikkalaiset. Havainto oli samanlainen

AGPHD1

geeni rs8034191-C-alleelin, jossa taajuudet vaihtelevat 23,04%: sta 39,47%: in valkoihoinen tarkastuksia, 1,82%: sta 3,72%: Itä-Aasian valvontaa, ja 16.15%: sta 31,44 vuonna Afrikkalainen -American valvontaa.

Overall Analysis

Koska harvalukuisuuden mutanttialleelit molempien tutkittu polymorfismien Itäaasialaiset ja maksimoida tilastollinen voima havaita yhdistys, me pidetään riski vaikuttaa kaksi polymorfismien alle sekä alleeliset ja hallitseva malleja.

yleinen vertailu

CHRNA3

geeni rs1051730-alleelin tuotti hämmästyttävän lisääntynyt riski keuhkosyöpä (OR = 1,33; 95% CI : 1,24-1,44;

P

0,0005) suhteessa rs1051730-G-alleelin; oli kuitenkin kohtalainen näyttöä Tutkimusten välisten heterogeenisuus (

I

2 = 57,8%;

P

= 0,003). Riski suuruus oli hieman voimisti alla hallitseva malli (OR = 1,36; 95% CI: 1,27-1,46;

P

0,0005), mutta heterogeenisuus oli poissa (

I

2 = 18,4%;

P

= 0,258) (taulukko 2). Samoin varten

AGPHD1

geeni rs8034191-T /C polymorfismi, verrattuna T-alleelin, C-alleelin koitui merkittävästi 23% suurempi riski saada keuhkosyöpä (95% CI: 1,08-1,4;

P

= 0,002) ja heterogeenisuus (

I

2 = 87,2%;

P

0,0005). Riski suuruus oli hieman heikentynyt alle hallitseva malli (OR = 1,2; 95% CI: 1,02-1,42;

P

= 0,03;

I

2 = 85,2%;

P

0,0005) (taulukko 3).

sekä polymorfismien, mikä heijastuu visuaalinen suppilon juoni tarkastus (Kuva 2-A ja 2-C) ja Egger n regressio epäsymmetria tilastotieto, oli alhainen todennäköisyys julkaisun bias (

P

= 0,742 ja 0,682 varten rs1051730 ja rs8034191, vastaavasti). Lisänäyttöä valikoiva julkaisu ehdotti, että ei ollut puuttuvia tutkimuksia tarvitaan, jotta suppilo juoni symmetrinen molemmille polymorfismien (kuva 3-B ja 3-D).

Jokaisessa tutkimuksessa TAI näkyy keskellä sininen kiinteä ympyrä, jonka ylempi ja alempi ääripäitä edustavat vastaavan 95%: n luottamusväli. OR-arvot laskettiin nykyiselle tupakoitsijoiden vastaan ​​tupakoimattomien (myös entiset tupakoitsijat tiedot) tai ex-tupakoitsijoita vastaan ​​koskaan tupakoitsijoita toisin. Vihreä katkoviiva on piirretty sovittamalla OR ja tupakointi prosenttia tapauksissa mukana tutkimuksiin.

Kumulatiivinen ja vaikuttaja Analyysit

kumulatiivinen meta-analyysissä, kaikissa geneettiset mallit me ei löytänyt näyttöä siitä, että ensimmäinen julkaistu tutkimus, joka ilmoitti mahdollisesti merkittävä tulos käynnistettiin sitten seuraavaan julkaisuun lisääntymään. Vaikutusvaltainen analyysi osoitti, että yksikään tutkimuksessa vaikuttaneet kokonaistulokset merkittävästi sekä polymorfismien (tuloksia ei ole esitetty).

alaryhmäanalyysi

Koska merkittävä heterogeenisyys ja hakea sen mahdollisia lähteitä, me suoritetaan paneeli alaryhmäanalyyseissa etnisyyteen, Hyväksytty tietoa, tutkimuksen suunnittelu, ja taudin tyyppi.

ryhmittely tutkimuksista laskeutuminen väestön osoitti, että kertoimet sairastua keuhkosyöpään oli merkittävästi vahvistunut Afrikkalainen-amerikkalaiset molemmille polymorfismien, ja oli ei-merkitsevä tai huomattavasti alentaa Itäaasialaiset varten

CHRNA3

geeni rs1051730 polymorfismi (alleelinen malli: OR = 1,51; 95% CI: 0,76-3,0;

P

= 0,237; ja hallitseva malli: OR = 1,22; 95% CI: 0.59-2,52;

P

= 0,592) (taulukko 2), ja

AGPHD1

geeni rs8034191 polymorfismi (alleelinen malli: OR = 1,03; 95% CI: 0,47-2,27;

P

= 0,934, ja hallitseva malli: OR = 0,72; 95% CI: ,52-+0,99;

P

= 0,043) (taulukko 3). Sen sijaan ei ollut olennaisia ​​muutoksia riskiarvioita valkoihoisilla molemmille polymorfismien. Kun jaottelu sovitetun tiedot iästä tai sukupuolesta tai tupakoinnin asemasta tapausten ja kontrollien välillä, riski-arviot suhteellisen heikentynyt Hyväksytty tutkimuksissa sekä polymorfismien alle sekä alleeliset ja hallitseva malleissa (taulukot 2 ja 3), ja laatu heterogeenisyys ei ollut parantunut.

alaryhmäanalyysi tutkimuksen suunnittelu, yhdistys sekä tutkittu polymorfismien keuhkosyöpä voimistivat sairaalassa perustuvat tutkimukset alle alleelinen malli (rs1051730: OR = 1,56, 95% CI: 1,1-2,21,

P

= 0,012, ja rs8034191: OR = 1,31, 95% CI: 0,96-1,79,

P

= 0,092), kun taas alle hallitseva malli, tämä yhdistys tehostua väestön perustuvat tutkimukset (rs1051730 : OR = 1,39, 95% CI: 1,31-1,48,

P

0,0005 ja rs8034191: OR = 1,25, 95% CI: 1,03-1,51,

P

= 0,021). Rajoittaminen analyysi ei-pienisoluinen keuhkosyöpä havaittu mitään todisteita heterogeenisyys, ja totesi, että riski suuruus oli merkittävä mutta suhteellisen heikentynyt alle alleelinen malli (rs1051730: OR = 1,24, 95% CI: 1,1-1,38,

P

0,0005 ja rs8034191: OR = 1,21, 95% CI: 1,08-1,36,

P

= 0,001), kun taas tämän suuruusluokan vahvistui merkittävästi alle hallitseva malli (rs1051730: OR = 1,38, 95 % CI: 1,18-1,61,

P

0,0005 ja rs8034191: OR = 1,35, 95% CI: 1,16-1,58,

P

0,0005).

Meta-regressioanalyysiä

tunnistamaan muita lähteitä heterogeenisyys Sitouduimme meta-regressioanalyysi ikä (keskiarvo tai mediaaniarvo), sukupuoli (mies prosenttia), ja tupakointi korko (prosentteina nykyisten ja entiset tupakoitsijat) . Näistä muuttujista, yhdistys

CHRNA3

geeni rs1051730 (korrelaatiokerroin: 0,48,

P

= 0,069) ja

AGPHD1

geeni rs8034191 (korrelaatiokerroin: 0,57,

P

= 0,043) polymorfismit keuhkosyöpä riski havaittiin tapauksissa, joissa on korkea tupakointimäärään alle alleelinen malli (kuva 3).

keskustelu

Via kattavan meta-analyysi , arvioimme yhdistys kaksi yhteistä polymorfismien päälle 15q25.1 kanssa keuhkosyövän riskiä. Kaiken kaikkiaan tulokset osoittivat, että

CHRNA3

geeni rs1051730-alleelin ja

AGPHD1

geeni rs8034191-T-alleelin saattaa olla riski antavia tekijöitä kehittämiseksi keuhkosyövän valkoihoisista, mutta ei Itä-aasialaiset . Vaikka potentiaalisia heterogeenisuus ei olisi helppo poistaa, tässä tutkimuksessa, tietojemme mukaan on ensimmäinen meta-analyysi mennessä käsittelevät yhdistyksen näiden kahden polymorfismien keuhkosyöpää herkkyys.

Havaitsimme etnisyyden mahdollisena Tutkimusten välisten heterogeenisyyteen alaryhmäanalyysi. Geneettinen heterogeenisyys on väistämätöntä sairaus tunnistamisen strategiaan [27]. Huomasimme, että yhdistys rs1051730 ja rs8034191 polymorfismien keuhkosyöpä riski oli heterogeeninen välillä valkoihoisten ja Itäaasialaiset. Merkitys havaittiin vain entinen, joka koostui tuloksiin GWA tutkimusten Länsi populaatiot. Olemme myös huomanneet merkittäviä eroja

CHRNA3

geeni rs1051730-alleelin ja

AGPHD1

geeni rs8034191-C-alleelin välillä valkoihoisten ja Itäaasialaiset, joten sitä on erittäin vaikea havaita heikko yhdistys aasialaisilla ellei tutkii erittäin suuri väestö. Tämä viittaa siihen, että erilaiset geneettiset taustat voivat aiheuttaa tämän eron tai eri populaatioissa voi olla erilaisia ​​kytkentäepätasapaino- kuvioita. Tutkitut polymorfismit voivat olla sidos toisen syy muunnos yhdessä etninen väestö, mutta ei toisessa [28]. Esimerkiksi rs1051730 polymorfismi on täydellisessä kytkentäepätasapainossa kanssa mahdollisesti patogeenisten alleelin rs16969968 (D398N)

CHRNA5

geeni [17], [29]. Siksi spekuloida, että polymorfismi rs1051730 voi olla pleiotrooppinen vaikutus etiologiassa keuhkojen syövän synnyn eri etnisten ryhmien. Ottaen huomioon erilaiset geneettiset taustat, on välttämätöntä rakentaa tietokanta polymorfismien liittyvien keuhkosyöpään jokaisessa etninen /rodullinen ryhmä.

Lisäksi häiritsevä vaikutus etnisyyden yleiseen arvioon, mahdolliset arvio tulee hoitaa varovaisuutta tutkimuksia ositettu tutkimuksen suunnittelu. Tässä meta-analyysissä, molempien polymorfismien riski arvioita sairaalassa perustuvat tutkimukset olivat vahvempia kuin väestön perustuvat tutkimukset. Lisäksi suhteellisen pieni otoskoko, haittoja sairaalan perustuvat tutkimukset ei pitäisi jättää huomiotta, koska väestö kerrostuneisuus on edelleen tärkeä kysymys [30]. Kahdessa tutkimuksessa oli palvelukseen aiheita vain yhdestä sairaalasta, ja näin saattaa olla kapea sosioekonomiset profiilin molemmissa tapauksissa ja valvontaa. Lisäksi huono vertailtavuus tapausten ja kontrollien välillä sairaalassa perustuvat tutkimukset saattavat käyttää hämmentävä vaikutus tosi yhdistys valossa alueellisen erikoisuus tautiin ja ero sairaalahoitoon tapausten ja kontrollien välillä [31]. Sen sijaan koehenkilöt peräisin yhteisön tai väestössä voisi olla edustava otos, jolloin tulokset väestön perustuvat tutkimukset vakuuttavampi. Ottaen huomioon laajempi luottamusvälit arvioiden lisää tutkimuksia tarvitaan määrällisesti vaikutusta koko luotettavasti.

Lisäksi meidän meta-regressioanalyysi Yhdistyksen kahden tutkittu polymorfismien keuhkosyöpä riski potilailla, joilla on korkeampi tupakointimäärään . Me määritelty tupakointimäärään perustuva prosenttiosuus nykyisten ja entisten tupakoitsijoiden jos käytettävissä. Tämä määritelmä ei todennäköisesti heikentää havaintomme, koska sulkeminen yhä tupakoinnin voisi johtaa aliarvioimiseen riskiä keuhkosyöpään. Lisäksi meidän tiedot tupakoinnin ja muiden sekoittavien tekijöiden poimittiin äskettäisissä julkaisuissa (vuoden 2008 jälkeen) ammatti syöpään lehdissä heijastuu korkea laatu pisteet. Lisäksi tupakointi on ylivoimaisesti merkittävä tekijä keuhkosyöpää, noin 90% keuhkosyöpä esiintyvyys [32]. Aiemmat tutkimukset osoittivat, että polymorfismit

CHRNA3

geeni liittyy lisääntynyt riski tupakoinnin aloittamisesta, mikä viittaa mahdolliseen genotyyppi-fenotyyppi vuorovaikutus [33].

vahvuuksia Tutkimuksen sisältävät suhteellisen suuri otoskoko, ei poikkeama Hardy-Weinberg tasapaino, ja korkea laatu päteviä tutkimuksia. Kuitenkin nykyinen tutkimus olisi tulkittava useita teknisiä rajoituksia ajatellen. Ensinnäkin suurin osa tutkimuksista tämän meta-analyysissä olivat tapausverrokkitutkimukset, jotka ovat alttiita valikoitumisharhalle sisällyttämällä vain fataali tapauksissa. Toiseksi koska vain julkaistujen tutkimusten in Englanti haettiin ja ”harmaa” kirjallisuutta (artikkelit muilla kielillä kuin Englanti) ei ollut mukana, julkaiseminen bias voisi olla mahdollista, vaikka meidän suppilo tonttien ja tilastolliset testit eivät näytä sitä. Kuitenkin epäsymmetria suppiloon juoni, on joko visuaalisesti tulkita tai tilastollisesti testattuja, voi johtua olennainen ero pienten ja suurempien tutkimukset että syntyy luontainen Tutkimusten välisten heterogeenisuus [34]. Koska tällä hetkellä meillä ei ole kultaista standardia vertailla tuloksia suppilon juoni testien [34], Egger testi ja tavallista suppilo juoni on asetettu kyseenalaiseksi. Emme voi täysin sulkea pois pieni todennäköisyys, että pienet negatiiviset tutkimukset puuttuvat juoni. Kuitenkin leikata ja täytä ehdotettua menetelmää ei puutu tutkimuksia tarvitaan, jotta suppilo juoni symmetrinen molemmille polymorfismien. Kolmanneksi yksi lokus-alaista meta-analyysin poissuljettu mahdollisuus geeni-geeni ja geeni-ympäristön vuorovaikutukset sekä haplotyyppi-pohjainen vaikutuksia, mikä viittaa siihen, että lisätutkimuksia arvioitaessa nämä näkökohdat ovat tarpeen. Neljänneksi keskitytty vain kaksi polymorfismien päälle 15q25.1 ja eivät pitäneet muita kandidaattigeenejä tai polymorfismit. On todennäköistä, että tutkittu polymorfismit itsessään ole sen pääasiallinen syy riski ennustuksen keuhkosyöpäpotilaita, mutta ovatko nämä kaksi polymorfismien integroituna muita riskitekijöitä parantaa ennustuksen vaatii lisätutkimuksia.

Yhdessä me ovat laajentaneet aiemmin yksittäisissä tutkimuksissa antamalla vakuuttavia todisteita siitä, että

CHRNA3

geeni rs1051730-alleelin ja

AGPHD1

geeni rs8034191-T-alleelin saattaa olla riski antavia tekijöitä kehittämiseksi keuhkosyövän valkoihoisilla , mutta ei Itä-aasialaiset. Olemme vahvistaneet aiempia havaintoja yhdistyksen korkean tupakointimäärään lisääntynyt keuhkosyövän riskiä. Jatkotutkimukset tulisi tutkia markkereita ja vieressä 15q25.1 selvittämään, onko nykyinen yhdistys on kausaalinen tai johtuu kytkentäepätasapaino-.

tukeminen Information

Taulukko S1.

kriteerit laadun arviointiin geneettisen yhdistyksen

CHRNA3

geeni rs1051730 polymorfismi ja

AGPHD1

geeni rs8034191 polymorfismi keuhkosyöpää.

doi: 10,1371 /journal.pone.0037970.s001

(DOC)

Vuokaavio S1.

PRISMA vuokaavio.

doi: 10,1371 /journal.pone.0037970.s002

(PDF)

tarkistuslista S1.

PRISMA tarkistuslista.

doi: 10,1371 /journal.pone.0037970.s003

(DOC) B