Krooninen sairaus

tiivistelmä

Background

Vaikka alkuvaiheen ei-pienisoluinen keuhkosyöpä (NSCLC) pidetään potentiaalisesti parannettavissa tauti seuraava täydellinen resektio, potilailla on laaja kirjo selviytymisen mukaan vaiheessa (IB, II, III A). Kussakin vaiheessa geeniekspressioprofiilien voidaan tunnistaa potilaat, joilla on suurempi riski toistumisen. Oletimme, että muuttunutta mRNA ilmaisun yhdeksän geenit voivat auttaa ennustamaan sairauden lopputulokseen: Leikkauskorjauksessa rajat täydentävät 1 (ERCC1), myeloidinen sinkkisormipolypeptidiin 1 (MZF1) ja Twist1 (jotka säätelevät N-kadheriiniekspressiota), ribonukleotidireduktaasi alayksikkö M1 (RRM1 ), tioredoksiini-1 (TRX1), tyrosyyli-DNA fosfodiesteraasi (Tdp1), Nukleaaritekijä aktivoitujen T-solujen (NFAT), BRCA1 ja ihmisen homologi hiivan orastava voitettavinaan bentsimidatsoli (bubR1: tä).

Menetelmät ja Principal havainnot

Suoritimme reaaliaikainen kvantitatiivinen polymeraasiketjureaktio (RT-QPCR) pakastettuina keuhkosyöpä kudosnäytteiden 126 chemonaive NSCLC potilaat, joille oli tehty kirurginen resektio ja arvioi yhdistyksen välillä geeniekspressiotasot ja selviytymistä. Sillä validointi, käytimme parafinoidut yksilöitä 58 muista NSCLC potilaat. Vahva inter-geenin korrelaatiota ei havaittu ekspressiotasot kaikkien geenien, paitsi NFAT. Coxin suhteellisen vaarat malli osoitti, että yhdessä sairauden vaiheessa, BRCA1 mRNA ilmaisu korreloi merkitsevästi kokonaiselinaikaa (riskisuhde [HR], 1,98 [95%: n luottamusväli (CI), 1,11-6]; P = 0,02). Itsenäisessä kohortin 58 potilasta, BRCA1 mRNA ilmaisu myös merkittävästi korreloi elinaika (HR, 2,4 [95% CI, 1,01-5,92]; P = 0,04).

Johtopäätökset

yli-ilmentyminen BRCA1 mRNA vahvasti yhteydessä huonoon selviytymiseen NSCLC potilaiden ja validointi tämän havainnon itsenäisessä datasarjan vahvistaneet tätä -alueella. Koska BRCA1 mRNA ilmaisu on aiemmin kytketty erilaiseen herkkyyteen sisplatiinin ja antimikrotubulusaine huumeet, BRCA1 mRNA ilmaisu voi antaa lisätietoja muokkaamalla adjuvantti antimikrotubulusaine kemoterapian, varsinkin vaiheessa IB, jossa rooli adjuvanttihoitoa ei ole selvästi osoitettu.

Citation: Rosell R, Skrzypski M, Jassem E, Taron M, Bartolucci R, Sanchez JJ, et al. (2007) BRCA1 A Novel ennustetekijä resektoitiin Non-Small-Cell Lung Cancer. PLoS ONE 2 (11): E1129. doi: 10,1371 /journal.pone.0001129

Academic Editor: William Pao, Memorial Sloan-Kettering Cancer Center, Yhdysvallat

vastaanotettu: 20 kesäkuu 2007; Hyväksytty: 01 elokuu 2007; Julkaistu: 07 marraskuu 2007

Copyright © 2007 Rosell et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tutkimus tässä raportoidut rahoitti Espanjan Keuhkosyöpä ryhmän ja Medical University of Gdansk. Se oli osittain rahoittama Espanjan terveysministeriön myöntää FIS 05/1621. Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

vuonna 2006 Euroopassa oli arviolta 386300 keuhkosyöpää, jossa on huomattavasti korkeampi esiintyvyys miehillä kuin naisilla [1]. Joukossa täysin resektoitiin ei-pienisoluinen keuhkosyöpä (NSCLC) potilasta, 40% vaiheen I, 66% II vaiheen ja 75% vaiheessa IIIA potilaista kuolee viiden vuoden kuluessa resektio [2], ja hyöty adjuvanttihoitoa on ei ole osoitettu vaiheessa IB. Vuonna ANITA satunnaistetussa tutkimuksessa, 5-vuoden potilaiden elinaikaa vaiheessa IB tauti oli 62% kemoterapiassa ryhmässä ja 64% kontrolliryhmässä; vastaavat luvut olivat 52% ja 39% vaiheessa II potilaille ja 42% ja 26% vaiheessa IIIA [3]. Lisäksi taudin vaiheessa useat tutkimukset ovat tarkastelleet geeniekspressioprofiilien NSCLC, tunnistaa molekyyli alatyyppejä liittyvät potilaiden hoitotuloksiin [4], [5], [6], [7]. Geenien ilmentyminen allekirjoitukset vaihtelevat viidestä 64 geenit on tunnistettu [6], [7], ja tutkimusten välisten vertailujen ovat paljastaneet merkittäviä, vaikkakin epätäydellinen, sopimus malleja ennustamaan lopputuloksen [4]. Lisäksi kyky tulkita merkitys yksittäisten geenien allekirjoituksista on edelleen haaste [8]. Geenin ilmentyminen allekirjoitukset tunnistetaan geenit liittyvät lähinnä syövän etäpesäkkeiden [6], mutta ei kuvata osallistuvien geenien DNA: n korjaukseen polkuja.

Prekliiniset tutkimukset ovat osoittaneet, että puute tahansa yli 30 osallistuvien geenien nukleotidin Leikkauskorjauksessa (NER) koulutusjakson antaa tuotteelle merkitty yliherkkyys sisplatiinin [9]. Hypothesizing että kohonneita NER geenit voivat olla paitsi ennustava vaan myös ennustetekijöitä markkereita, päätimme tutkia seuraavien geeneistä, jotka perustuvat aiempien raporttien niiden ennustearvo: Leikkauskorjauksessa rajat täydentävät 1 (ERCC1) [10], BRCA1 [11 ], ihmisen homologi hiivan orastava voitettavinaan bentsimidatsoli (bubR1: tä) [12], [13], [14], myeloidinen sinkkisormipolypeptidiin 1 (MZF1) [15], [16], [17], ribonukleotidireduktaasi alayksikkö M1 (RRM1 ) [18], [19], [20], tioredoksiini-1 (TRX1) [21], [22], tyrosyyli-DNA fosfodiesteraasin (Tdp1) [23], [24], [25]. Lisäksi tutkimme Twist [26], [27] ja Nukleaaritekijä aktivoitujen T-solujen (NF-AT) [28], [29], jotka ovat mukana hyökkäys-etäpesäke prosessi. (Lisätietoja on yhdeksän geenit tutkitaan löytyy teksti S1.) B

Mikään näistä yhdeksästä geenit on tunnistettu geeniekspressioprofiilien liittyvät NSCLC potilaiden hoitotuloksiin [4], [5], [6] [7], lukuun ottamatta TRX1, joka tunnistettiin proteomiikka-analyysi ja liittyy huono selviytyminen [21]. Jotta valottaa ennusteen arvioinnissa näiden geenien, olemme tutkineet niiden ilmentyminen reaaliaikaisella kvantitatiivinen käänteistranskriptaasi-PCR (RT-PCR) 126 täysin resektoitiin NSCLC potilaat, jotka eivät saaneet adjuvanttihoitoa ja korreloivat tulosten kanssa selviytymisen.

Methods

potilaat

NSCLC näytettä otettiin 126 peräkkäistä potilasta, joille tehtiin parantava keuhkojen resektion Medical University of Gdansk (Gdansk, Puola) vuosien 2000 ja 2004 jälkeen saadakseen hyväksynnän Institutional Review board of Medical University of Gdansk ja potilaiden allekirjoittivat tietoon perustuva suostumus. Potilaat olivat 98 urosta ja 28 naarasta, jossa ikä diagnoosin vaihtelevat 37-77 vuotta (mediaani-ikä, 64 vuotta). Seitsemänkymmentäyksi potilaalla oli vaihe I sairaus, 33 vaiheessa II, ja 22 vaiheessa IIIA. Kaksikymmentäseitsemän potilaat olivat huonosti eriytetty, 74 kohtalaisen eriytetty, ja 9 hyvin erilaistunut NSCLC; loput 16 potilasta olivat määrittelemätön. Kahdeksankymmentä potilaat olivat tupakoitsijoita, 39 entiset tupakoitsijat, ja loput seitsemän koskaan tupakoineet. Sata ja kaksikymmentä kaksi potilaalle tehtiin virallista keuhko- lobectomy tai enemmän, systemaattinen ipsilateral välikarsinan imusolmukedissektiossa; neljä jäljellä potilaalle tehtiin segmentectomy heikon keuhkojen varaukseen. Vaiheet määritettiin jälkeen patologisen arvioinnin resektoitiin yksilöitä mukaan International System Välivarastointi Lung Cancer [30] (taulukko S1). Kukaan potilaista sai adjuvanttihoitoa.

validoitu BRCA1 ennusteen arvioinnissa 58 vaiheessa IB-IIB NSCLC potilaat, joille oli tehty kirurginen resektio klo Azienda Ospedaliera Santa Maria (Terni, Italia) välillä helmikuu 1997 ja joulukuussa 2003 saatuaan hyväksynnän Institutional Review board of Azienda Ospedaliera Santa Maria ja potilaiden allekirjoittivat tietoon perustuva suostumus. Potilaan ominaisuudet on esitetty taulukossa S1.

Geenien ilmentyminen analyysi

Tumor näytteet 126 potilasta saatiin kirurgian aikana, koska lohkojen 1cm3 ja pikajäädytettiin nestemäisessä typessä. Kudokset säilytettiin -80 ° C: ssa, kunnes kokonais-RNA uutettiin AllPrep sarjat (Qiagen, Valencia, CA). Vain kasvainnäytteestä jotka sisältävät yli 60% kasvainkudoksen mikroskooppisen jakso olivat oikeutettuja jatkokäsittelyä varten. Pitoisuus RNA arvioitiin Nano-drop ™ ja laatu saatu RNA testattiin agaroosigeelillä. Ensimmäisen juosteen cDNA syntetisoitiin 1 ug kokonais-RNA käyttäen High-Capacity cDNA Archive Kit (Applied Biosystems, Foster City, CA). Yhdeksän geenit tutkittiin on esitetty taulukossa 1. Kvantitatiivinen RT-PCR-reaktioissa kunkin geenin tehtiin ABI PRISM 7900 HT Sequence Detection System (Applied Biosystems).

Suhteellinen geenin ilmentymisen arvot laskettiin ΔΔCt menetelmä käyttäen Sequence Detection System (SDS) 2.1 -ohjelmisto (Applied Biosystems). ΔΔCt menetelmä antaa määrä kohdegeenin normalisoidaan endogeenistä viitegeenin (ribosomaalinen 18S RNA) ja suhteessa kalibraattori näyte (viite kaikilla näytteillä; kaupallisesti saatavilla Normaali keuhko ja maksa ihmisen RNA: ta (Stratagene, La Jolla, CA). Alukkeet yhdeksän geenit ovat taulukossa S2.

ERCC1, RRM1 ja BRCA1-geenin ilmentyminen arvioitiin formaliinilla kiinnitetyt, parafiiniin upotetut kirurginen yksilöitä 58 potilasta validoinnissa kohortissa. Käyttämällä laser talteenotto mikrodissektion tekniikkaa ( Palm Microlaser, Oberlensheim, Saksa) varmistetaan vähintään 80% kasvaimen kudoksessa. standardin kudosnäyte deparaffinization käyttäen ksyleeniä ja alkoholit, näytteet lyysattiin tris-kloridi, EDTA, natriumdodekyylisulfaatti (SDS) ja proteinaasi K, joka sisältää puskuria. RNA uutettiin sitten fenoli-kloroformi-isoamyylialkoholia seurasi saostaminen isopropanolilla läsnä glykogeenin ja natriumasetaattia. RNA suspendoitiin uudelleen DEPC: vedessä (Ambion Inc, Austin TX, USA) ja käsiteltiin DNaasi I: llä (Ambion Inc) ja välttää DNA saastuminen. cDNA syntetisoitiin käyttämällä M-MLV retrotranscriptase entsyymiä. Templaatti-cDNA lisättiin Taqman Universal Master Mix (Applied Biosystems) on 12,5 ul reaktio spesifisiä alukkeita ja koetinta kunkin geenin. Aluke ja koetin sarjat olivat samanlaiset kuin jäädytetty yksilöt; endogeeninen viittaus geeni oli β-aktiini. Kvantifiointi geenin ilmentyminen suoritettiin käyttäen ABI Prism 7900HT Sequence Detection System (Applied Biosystems).

Tilastolliset analyysit

Mediaaniarvot ja alueet olivat peräisin kvantitatiivisten muuttujien ja mRNA: n geenin ilmentymistä. Laadullinen muuttujia tiivistää avulla absoluuttisen taajuuksien ja prosenttiosuudet. Kruskal-Wallisin testiä käytettiin tarkistaa normaaliuden. Erot mediaani mRNA ekspressiotasot välillä histologisia tyyppejä arvioitiin U Mann-Whitneyn testi. Spearmanin rank-korrelaatiokerroin (rho) käytettiin mittaamaan korrelaatiot joukossa geeniekspressiotasot. Teimme

a priori

päätös luokitella mRNA geeni-ilmentymisen tasot korkea tai matala, käyttämällä pienintä P-arvo menetelmän modifioitu Lausen ja Schumacher [31]. Bonferronin menetelmää käytettiin korjauksen vaikutuksen monivertailuja, ja empiirinen P-arvot kullekin geeni vahvistettiin kautta 5000 permutaatio testejä. Kun mitään optimaalista rajakohta todettiin, käytimme näytteen mediaani analysoitaessa aikaa taudin uusiutumiseen ja selviytymistä. Aika taudin uusiutumiseen ja selviytymisen laskettiin käyttäen Kaplan-Meier ja eroja käyrien testattiin käyttäen log-rank-testi. Valita sopiva osajoukko geenien yhdistyksen mahdollisia kliinisiä muuttuja (histologia, vaihe ja laatu), teimme eteenpäin ja taaksepäin Coxin regressioanalyysiä. Kaikkien laskelmien perusteella tehtyihin kokeisiin olivat kaksipuolisia, merkitys asetettiin 5%, ja teho oli 80%. Analyysit suoritettiin käyttämällä Statistical Package for Social Sciences (SPSS) for Windows version 14 (SPSS Inc., Chicago, IL) ja S-Plus 6.1 for Windows.

Tulokset

mediaaniarvot kunkin geenin koko Näyteryhmä on esitetty taulukossa S3. Geenimonistus ei onnistunut vähemmistö näytteitä jokaista transkriptio analysoitu. Siellä oli merkittäviä eroja ilmaisun mukaan histologian kaikkien geenien paitsi NFAT, korkeasti havaittu okasolusyöpää kuin adenokarsinoomat (taulukko 2). Ei ollut eroja geenien ilmentyminen mukaan vaiheessa (taulukko S4). Voimakas korrelaatio havaittiin välillä ekspressiotasoja eri geenien, esimerkiksi tasojen välillä TRX ja RRM1 (rho = 0,52; P = 0,0003), ja välillä ERCC1 ja BRCA1 (rho = 0,62; P = 0,0001) (taulukko 3).

Kun seuranta-ajan mediaani 29,7 kuukautta (vaihteluväli, +1,7-+65,9kuukausi), yleinen tapahtuma-vapaa ja eloonjäämismediaani ei ole saavutettu. Kun tapahtuma-vapaa ja eloonjäämismediaani analysoitiin mukainen ekspressiotasoja yhdeksän geenien, TRX ja BRCA1 osoittivat merkittäviä eroja. Tapahtuma elinaika 21 potilaalla on matala TRX tasoa ei ole saavutettu, vaikka se oli 32 kuukautta (95% CI,) jäljellä 93 potilasta, joilla on korkea (P = 0,02). 77 potilasta, joilla on alhainen BRCA1, tapahtuma-elinaika ei ole saavutettu, vaikka se oli 22 kuukautta (95% CI, +14,9-29kuukausi) niille, joilla on korkea (P = 0,04) (taulukko S5, Fig. 1 ). Tapahtuma-elinaika käyrät mukaan ilmaus seitsemän muun geenit on esitetty kuvassa S1. Eloonjäämismediaani 24 potilaalla on matala TRX tasoa ei ole saavutettu, vaikka se oli 39 kuukautta jäljellä 101 potilasta, joilla on korkea (P = 0,03). 83 potilasta, joilla on alhainen BRCA1, mediaanielossaolosta ei ole päästy, kun se oli 29 kuukautta (95% CI, +22,2-+35,7kuukausi) niille, joilla on korkea (P = 0,04) (taulukko 4, kuvio. 1). Eloonjäämismediaani käyrät mukaisesti ilmentymisen muut seitsemän geenit on esitetty kuvassa S2. Kuitenkin, kun vain vaihe I potilasta tutkittiin, tapahtuma-elinaika oli merkittävästi erilainen mukaan ekspressiotasoja MZF1 ja BRCA1 (taulukko S6, kuvio. S3), ja mediaani elinaika oli merkittävästi erilainen mukaan ekspressiotasoja ERCC1, MZF1, Twist ja BRCA1 (taulukko S7, Fig. S4).

Event-vapaa (A, B) ja mediaani (C, D) eloonjääminen mukaan ilmaus TRX (A, C) ja BRCA1 (B, D) .

Coxin suhteellisten riskien mallia valittu patologinen vaiheessa IIIA ja BRCA1 ilmaisun itsenäisinä ennustavat tekijät hengissä. Riskisuhde (HR) oli 7,91 (95% CI, 2,27-27,54; p = 0,001) vaiheessa IIIA ja 1,98 (95% CI, 1,11-6); P = 0,02) ja BRCA1 lauseke (taulukko S8).

validointi BRCA1

seuranta-ajan mediaani on 58 potilasta validoinnissa kohortissa oli 40 kuukautta. Mukaan Coxin suhteellisten riskien mallia, HR potilaille, joilla on korkea BRCA1 oli 2,4 (95% CI, 1,01-5,92; p = 0,04). Ei ollut vaiheessa IIIA potilasta tässä kohortissa.

Keskustelu

Geenien ilmentyminen allekirjoitukset on osoitettu ennustaa lopputulos resektoidun vaiheessa I NSCLC [5], [6], kuitenkin käyttö mikrosirut on vähäistä tarvetta makean jäädytetyn kudoksen. RT-QPCR mukana pieni määrä geenejä tarjoaa käytännön vaihtoehto, joka mahdollistaa tarkan ja toistettavan kvantifiointi tulokset RNA saatuja pieniä määriä parafinoidut yksilöitä. Tulokset RT-QPCR suoritettiin viisi [7] ja kahdeksan [32] geenit korreloivat tulosten NSCLC [7] ja keuhkoadenokarsinooma [32] potilailla. Olemme tutkineet ilmaus ERCC1, BRCA1, bubR1: tä, MZF1, RRM1, TRX1 ja Tdp1, osallistuvat DNA: n korjaukseen polkuja, ja Twist ja NFAT, jotka liittyvät etäpesäkkeiden muodostumista. Monimuuttujakalibrointiin mallissa, vain BRCA1 ja vaihe IIIA tunnistettiin riippumattomina ennustetekijöiden muuttujia. Itsenäisessä validointi kohortin 58 vaiheessa IB-IIB pienisoluista keuhkosyöpää, BRCA1 vahvistettiin ainoana itsenäisenä ennustetekijöiden merkki.

Potilaat, joiden kasvaimet olivat korkealla BRCA1 ilme oli huomattavasti huonompi selviytyminen ja pitäisi olla ehdolla adjuvanttihoitoa.

In vitro

tutkimukset ovat osoittaneet, että BRCA1 voi säädellä ero herkkyyttä eri luokkiin kemoterapeuttisten aineiden [33]. Puuttuminen BRCA1 johtaa korkean herkkyyden sisplatiinia, kun taas sen läsnäolo lisää herkkyyttä antimikrotubulusaine aineet [33]. Siksi uskomme, että potilaat, joilla on korkein ekspressiotasot pitäisi saada antimikrotubulusaine, ei-platinapohjaisen kemoterapian. Olemme toteuttaneet pilottitutkimus räätälöityjä adjuvanttihoitoa perustuu BRCA1 mRNA tasoilla 88 täysin resektoidun vaiheen II-IIIA pienisoluista keuhkosyöpää, jossa ne, joilla on korkeimmat ekspressiotasot saanut adjuvanttia doketakselia ja muita hitaammin tasoilla saivat sisplatiinia kemoterapiaan. Väliaikainen analyysi osoittaa, että tapahtuma-elinaika on samanlainen molemmissa ryhmissä. Nämä havainnot tukevat aikaisempia havaintoja vaiheessa II-IIIA potilailla, jotka saivat neoadjuvant gemsitabiini /sisplatiini, jossa ne, joilla on korkein BRCA1 tasot oli synkkä selviytymisen 12 kuukauden [11].

Ei eroja ekspressiotasoja kaikista yhdeksän geenien havaittiin mukaisesti vaiheessa tai tuumorin koko ( 4 vs 4 cm). Kuitenkin kaikkien yhdeksän geenit tutkitaan vain BRCA1 osoitti suuntaus vaikuttaminen eloonjäämisen mukaan kasvaimen kokoa. I vaiheessa pienisoluista keuhkosyöpää, selviytyminen on korreloi käänteisesti kasvaimen kokoa [34]. Esillä olevassa tutkimuksessa yhden muuttujan selviytyminen analyysi osoitti, että sen lisäksi, BRCA1, ERCC1 ja MZF1 merkittävästi vaikuttanut selviytymistä I vaiheessa (taulukko S7, Fig. S4). Nämä havainnot korostavat mahdollista roolia ERCC1 ja MZF1, jotka korreloi voimakkaasti BRCA1, sillä vahva ennustetekijöitä merkkiaineet I vaiheessa NSCLC. Ei yllättäen, kuitenkin, ottaen huomioon korkea korrelaatio ekspressiotasot näiden kolmen geenin (taulukko 3), kun kaikki kolme geeniä yhdistettiin, ei enää parannus prognostinen arvo BRCA1 yksinään havaittiin.

Vaikka mekanismit, joilla jotkut yhdeksän geenit tutkitaan vaikuta potilaiden ennuste ei ole kovin selvä, yliekspressio ERCC1 ja RRM1 näyttää olevan onkogeenin perustuvia [35], [36], [37], [38], [39]. BRCA1 metylaatio ja kumoamisesta BRCA1 mRNA on löydetty satunnaisesti rintasyöpiä [40], mutta hyvin harvoin NSCLC [41]. Joissakin satunnaista rintasyöpiä, huono tulos liittyy BRCA1 metyloinnin ja alhainen ilmaisun voi selittyä MYC vahvistus [42].

Muut tutkimukset, käyttäen monoklonaalinen vasta-aine 8F1 [43] ovat raportoineet, että läsnäolo of ERCC1 proteiini on ennusteen merkki selviytymisen alussa NSCLC ja ennustaja lopputulokseen adjuvanttia sisplatiini-kemoterapian; Kuitenkin ennen tutkimuksessa mahasyövän [44], oli epäselvää, huono kliininen vaste potilailla, joiden kasvaimet olivat korkeat esikäsittely mRNA tasot ERCC1 johtui kasvainsolu vastustuskykyä sisplatiini kemoterapiaan tai aggressiivisempi tuumoribiologiassa. Lisäksi ERCC1-positiivisia ihmisen normaaleja fibroblasteja, ja soluja potilailla, joilla on perinnöllinen mutaatiot ERCC1, ERCC1 ei ole pääasiallinen antigeeni tunnustettu 8F1-vasta-aineella immunovärjäyksellä [45]. Lisäksi toisessa tutkimuksessa, ERCC1 proteiini tila ei korreloinut selviytymisen vaiheessa IV ei [46], kun taas oikeudenkäynti räätälöityjä sisplatiinin perustuu ERCC1 mRNA ilmaisun, vaste oli 39% ohjausvarsi ja 50% räätälöity arm (P = 0,02) [47].

Yhteenvetona Tutkimuksemme osoittaa, että ensinnäkin, BRCA1 on läheistä sukua ERCC1, RRM1 ja muita geenejä, kuten MZF1, mutta erottuu merkittävin ennustetekijöiden merkkiaine uusiutumisen . Oletamme, että potilailla, joilla on korkea BRCA1 tasot hyötyvät antimikrotubulusaine-pohjainen-muttei sisplatiini-pohjainen-kemoterapiaa. Toiseksi korkea näiden transkriptien koituu suurempi taudin uusiutumisen riski, toisin kuin on raportoitu muilla tutkijat, jossa korostetaan tarvetta tämän alan tutkimukseen valaista ennakoivaa roolia näiden NER liittyviä geenejä ja oikein muokata hoidon (Fig. S5). Vaikka väestö tutkimuksessamme oli vinossa ja tupakoivilla miehillä kanssa okasolusyöpä, tuloksemme takaa lisätutkimuksia vahvistamaan niiden soveltuvuus histologinen osajoukot NSCLC, Jotta irtoa lisävalaistusta näihin kysymyksiin, aiomme tutkia BRCA1, ERCC1 , MZF1 ja RRM1 ilmaisun 200 kasvain yksilöitä ANITA tutkimuksen [3] ja 620 potilasta sisältyvät Espanjan Keuhkosyöpä Group natch tutkimuksessa neoadjuvant vs adjuvanttihoitoa vs leikkaus yksin.

tukeminen Information

Kuva S1.

Event elinaika mukaan ilmaus ERCC1 (A), MZF1 (B), Twist (C), RRM1 (D), Tdp1 (E), NFAT (F), ja bubR1: tä (G) B doi: 10,1371 /journal.pone.0001129.s001

(0,09 MB TIF) B Kuva S2.

Eloonjäämismediaani mukaisesti ilmentymisen ERCC1 (A), MZF1 (B), Twist (C), RRM1 (D), Tdp1 (E), NFAT (F), ja bubR1: tä (G)

doi: 10,1371 /journal.pone.0001129.s002

(0,09 MB TIF) B Kuva S3.

Event-elinaika käyrät I vaiheen potilaille mukaan geeniekspressiotasot yhdeksästä geenien tutkittu

doi: 10,1371 /journal.pone.0001129.s003

(0,10 MB TIF) B Kuva S4.

mediaani eloonjäämiskäyriä vaiheen I potilaiden mukaan geenin ilmentymisen tasoa yhdeksän geenien tutkittiin

doi: 10,1371 /journal.pone.0001129.s004

(0,10 MB TIF)

Kuva S5.

Ristiriitaisia ​​havaintoja johtaa vastustavat strategiat räätälöintiä adjuvanttihoitoa. Olaussen et al (NEJM 2006; 355: 983-991) raportoivat, että puute ERCC1protein merkitsee suurempi taudin uusiutumisen riski ja suurempi herkkyys sisplatiini-kemoterapiaan. (Sisplatiini herkästi puute ERCC1 ilmaisun on osoitettu prekliinisissä ja kliinisissä tutkimuksissa.) Tutkimuksemme osoittavat, että suurempi taudin uusiutumisen riski liittyy korkeita useiden selostukset, kuten ERCC1. Nämä potilaat voivat olla resistenttejä sisplatiiniin ja herkkiä taksaanit tai muihin antimikrotubulusaine lääkkeiden

doi: 10,1371 /journal.pone.0001129.s005

(0,13 MB TIF) B Taulukko S1.

Potilaiden ominaisuudet tärkeimpien kohortin (N = 126) ja validointi kohortin (N = 58) B doi: 10,1371 /journal.pone.0001129.s006

(0,04 MB DOC) B Taulukko S2.

Alukkeet ja koettimet yhdeksän geenit tutkitaan

doi: 10,1371 /journal.pone.0001129.s007

(0,03 MB DOC) B Taulukko S3.

Suhteellinen geenien ilmentyminen arvot

doi: 10,1371 /journal.pone.0001129.s008

(0,03 MB DOC) B Taulukko S4.

Geenien ilmentyminen mukaan taudin vaiheeseen

doi: 10,1371 /journal.pone.0001129.s009

(0,04 MB DOC) B Taulukko S5.

Event-elinaika mukaan geeniekspressiotasot

doi: 10,1371 /journal.pone.0001129.s010

(0,06 MB DOC) B Taulukko S6.

Event-elinaika I vaiheessa potilaat mukaan geeniekspressiotasot

doi: 10,1371 /journal.pone.0001129.s011

(0,06 MB DOC) B Taulukko S7.

Eloonjäämismediaani I vaiheen potilaille mukaan geeniekspressiotasot

doi: 10,1371 /journal.pone.0001129.s012

(0,06 MB DOC) B Taulukko S8.

Monimuuttujatestaus Cox malli eloonjäämisestä osoittaa suurempi kuolemanriski potilailla, joilla on korkea BRCA1 ja niille, joilla on vaiheen III A tauti

doi: 10,1371 /journal.pone.0001129.s013

(0.03 MB DOC )

Text S1.

Lisätietoja yhdeksän geenit tutkitaan

doi: 10,1371 /journal.pone.0001129.s014

(0,09 MB DOC) B