Krooninen sairaus

tiivistelmä

Background

Asianmukainen potilasvalintaa tarvitaan kohdistettuja hoitoja, jotka ovat tehokkaita vain potilaille, joilla on erityisiä geneettisiä muutoksia. Meidän tavoitteena oli määritellä potilailla, joiden Hakijan geenien potilailla, joilla on ei-pienisoluinen keuhkosyöpä.

Methods

Potilaat, joilla on primaarinen keuhkosyöpä, joille tehtiin kliininen geenitestit Guangdong General Hospital otettiin . Kuljettajan geenejä havaittiin sekvensoimalla, korkean resoluution sulamisanalyysillä, qPCR tai useampia PCR ja RACE menetelmiä.

Tulokset

524 potilasta otettiin tähän tutkimukseen, ja erot kuljettaja geenissä muutoksiin keskuudessa alaryhmiä analysoitiin perustuvat histologian ja tupakoinnista. Alaryhmässä tupakoimattomien adenokarsinooma, EGFR oli yleisin muunneltu geeni, jossa on mutaatio osuus 49,8%, jonka jälkeen EML4-ALK (9,3%), PTEN (9,1%), PIK3CA (5,2%), c- Met (+4,8%), KRAS (4,5%), STK11 (2,7%), ja BRAF (1,9%). Kolme eniten muuttunut geenien alaryhmässä tupakoitsijoille adenokarsinooma oli EGFR (22,0%), STK11 (19,0%), ja KRAS (12,0%). Olemme vain löytyy EGFR (8,0%), c-Met (2,8%), ja PIK3CA (2,6%) muutoksia ei-tupakoitsijan kanssa levyepiteelisyöpä (SCC) alaryhmä. PTEN (16,1%), STK11 (8,3%), ja PIK3CA (7,2%) olivat kolme useimmin rikastettu geenien tupakoitsijoille SCC. DDR2 ja FGFR2 esitettiin vasta tupakoitsijoille SCC (4,4% ja 2,2%, tässä järjestyksessä). Näistä neljä alaryhmää, erot EGFR, KRAS ja PTEN mutaatiot olivat tilastollisesti merkitseviä.

Johtopäätös

Tunnusomaista kuljettajan geenin muutokset eri alaryhmiin perustuu histologian ja tupakoinnista olivat hyödyllisiä määrittelyssä potilaille tulevia kliinisiä kokeita, jotka kohdistuvat näistä geeneistä. Tämä tutkimus viittaa myös siihen, että voimme pitää potilaalla on harvoin korjauksilla kuljettajan geenejä, joilla on harvinaisia ​​tai orpojen tauteja, jotka tulee hoitaa erityisen molekyylirakennetta suunnattu hoitoja.

Citation: SJ, Chen ZH, Su J, Zhang XC , Zhong WZ, Yang JJ, et ai. (2012) tunnistaminen rikastetun Kuljettaja Gene Muutokset alaryhmiä ei-pienisoluinen keuhkosyöpä Potilaat Perustuu histologia ja tupakoinnista. PLoS ONE 7 (6): e40109. doi: 10,1371 /journal.pone.0040109

Toimittaja: Ming Sinä, Medical College of Wisconsin, Yhdysvallat

vastaanotettu 11 joulukuuta 2011; Hyväksytty: 1 kesäkuu 2012; Julkaistu: 29 kesäkuu 2012

Copyright: © 2012 An et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä työ tukivat avustuksia National Natural Science Foundation of China (nro. 30772531, 81071699, 30871126, 81172090, 81001031 ja 81101549), säätiö Guangdong Science and Technology osasto (2006B60101010 ja 2007A032000002), ja Kiinan Lung Cancer Research Foundation. Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

Keuhkosyöpä on johtava syy syövän kuolemaan sekä miehillä että naisilla Yhdysvalloissa ja kaikkialla maailmassa. Vaikka eri kemoterapeuttisten aineiden kehitettiin 1980-luvun lopulla ja 1990-luvun hoitoja kuten platinaa kaksinkertainen hoito näyttävät saavuttaneen terapeuttinen tasangolla, jossa objektiivinen hoitovaste on 30-40% ja keskimääräinen eloonjäämisaika noin 1 vuosi potilaille, joilla on vaiheen IIIB tai vaihe IV sairaus [1]. Parantaakseen edelleen hoitotuloksiin, uusia strategioita kohdistaminen molekyyli genomista poikkeavuudet ovat intensiivisen tutkimuksen.

Useat molekyyli muutoksia tiedetään esiintyvän geeneissä, jotka koodaavat viestintäproteiinit kriittinen solujen lisääntymistä ja selviytymistä. Nämä geenit on määritelty ”kuljettajan geenejä”. Keuhkojen adenokarsinooma, kuten kuljettajan geenejä ovat epidermaalisen kasvutekijän reseptori (EGFR), KRAS, BRAF, PIK3CA, ja EML4-ALK. Mutaatiot nämä geenit ovat vastuussa sekä aloitus ja ylläpito maligniteetin [2], [3]. Muut kuljettaja geenit on viime aikoina määritelty, mukaan lukien STL11 (tunnetaan myös nimellä LKB1), PTEN, DDR2, ja FGFR2 [4] – [8]. Ymmärtämällä toimintoja näiden kuljettajan geenejä, voi olla mahdollista kehittää erityisiä hoitomuotoja pahanlaatuisia kasvaimia, joiden tiedetään olevan kuljettajan geenimutaatioita.

tyrosiinikinaasiestäjät (TKI) kohdistaminen EGFR, kuten gefitinibi ja erlotinibi, on tullut standardi ensimmäinen linjan hoito potilailla, joilla on edennyt ei-pienisoluinen keuhkosyöpä (NSCLC), joka satama aktivoivia EGFR mutaatioita [9], [10]. Kuitenkin lähes kaikki potilaat lopulta kehittää vastustuskykyä EGFR TKI. Useat resistenssin lukien KRAS mutaatio, EGFR eksoni 20 T790M mutaatio, ja MET geenimonistuksen, on raportoitu. Niinpä kattava molekyyliprofiilin tarvitaan ymmärtämään sekä herkkyys ja kestävyys molekyylitason täsmähoitoihin keuhkosyöpään [11].

Kun otetaan huomioon biomarkkereiden valinta kohdennettuja syövän hoitomuotoja, ryhmämme aloitti Guangdong General Hospital Keuhkosyöpä mutaatio Project (GGHLCMP). Tavoitteena tässä projektissa on tutkia vaikutusta tupakan kulutukseen ja histologia tyypin esiintyvyys kuljettajan geenimutaatioita ja määritellä potilasalaryhmissä, joille Hakijan geenin muutoksia rikastetaan. Kirjoittajat raportoivat kirjo kuljettajan geenejä, kuten EGFR, KRAS, c-Met, PIK3CA, BRAF, STK11, PTEN, EML4-ALK fuusio geenin, DDR2, ja FGFR2 populaatiossa Kiinan primaarisessa keuhkosyöpä.

Methods

etiikka ja ohjausjärjestelmästä ja Potilasvalinta

yhteensä 1800 potilasta siirrettiin Guangdong General Hospital (GGH) genomisen tutkimusten välillä tammikuu 2007 ja joulukuun 2009 (kuva 1). Kelpoisuusvaatimukset sisälsi seuraavat: histologinen diagnoosi ensisijainen keuhkosyöpä; saatavuus demografiset tiedot, kuten ikä, sukupuoli, tupakointi, histologian ja taudin vaiheessa; saatavuus Eloonjääntitulokset; saatavuus kasvain näytteitä genomista analyysejä; ja tarjoaminen tietoon perustuvan suostumuksen. Keuhkosyöpä Diagnoosi vahvistettiin riippumaton patologi. Kliiniset tiedot kerättiin sairauskertomuksiin potilaiden sairaalassa. Tupakoimattomien määriteltiin siten, että potilas oli polttanut 100 savuketta elinaikanaan; tupakoitsijoita mukana entiset ja nykyiset tupakoitsijoita. Potilaat, joilla muiden pahanlaatuisten kasvainten tai hyvänlaatuisia keuhkojen kasvaimet pois. Tutkimuksen hyväksyi eettinen komitea Guangdongin General Hospital. Kaikki potilaat toimitti kirjallisen tietoisen suostumuksensa.

Gene muutostyöt Detection

Kasvaimen kudokset koepalat jäädytettiin nestemäisessä typessä ja säilytettiin -70 ° C: ssa analyysiin saakka. Arvioimme kudoksiin ennen geneettistä havaitseminen käyttäen HE värjäystä. Näytteet, joissa ≥50% kasvainsoluja otettiin tähän tutkimukseen. 357 näytettä otettiin kasvain näytteet toistoleikattiin ja 167 näytettä olivat ydin koepaloja. DNA ja RNA uutettiin Aqua-SPIN Tissue /Cell gDNA Isolation Mini Kit (Biowatson, Shanghai, Kiina) ja RNeasy Mini Kit (Qiagen, Valencia, CA), tässä järjestyksessä. Eheys ja määrän RNA ja DNA arvioitiin geelielektroforeesilla ja Thermo Manodrap 1000 (Thermo, MA, USA) analyysi. cDNA syntetisoitiin käyttäen ABI High-Capacity cDNA Reverse Transcription Kit RNaasi Inhibitor (ABI, CA, USA). Mutaatiot EGFR ja KRAS havaittiin PCR-pohjainen sekvensointi [12]. PIK3CA ja BRAF mutaatioita havaittiin korkean resoluution DNA sulamisanalyysikokeita [13]. EML4-ALK mutaatiot analysoitiin useita PCR ja RACE cDNA: [14]. c-Met: n monistaminen määritettiin qPCR DNA [15]. PTEN (cDNA), STK11 (cDNA), DDR2, ja FGFR2 (DNA) mutaatiot havaittiin PCR-pohjainen sekvensointi (taulukko S1). Kaikki tutkimuksesta aiemmin kuvattuja viittauksia.

Tilastollinen analyysi

muutostyöt eri alaryhmien ositettu histologian ja tupakointi analysoitiin Chi-square ja Fisherin testejä tarvittaessa. Survival-analyysi suoritettiin Kaplan-Meier-analyysi, jossa log-rank-testi. Monimuuttuja analyysit tehtiin käyttämällä Coxin suhteellisten riskien mallia (Forward: Wald; P = 0,05, merkintä; P = 0,10, poisto). Kaikki p-arvot olivat kaksipuolisia, ja P 0,05 oletettiin olevan merkittävä.

Tulokset

Potilastiedot

Kaikkiaan 524 tukikelpoisten Potilaita oli; Potilaan ominaisuudet on koottu taulukkoon 1. miesten ja naisten suhde oli 2.2:1. Keskimääräinen potilaan ikä oli 59,3 vuotta vanha, jotka vaihtelevat 23-88 vuotta vanhoja. Kaikkiaan 292 potilasta oli koskaan tupakoineet (55,7%) oli enemmän potilailla, joilla adenokarsinooma (67,6%) kuin okasolusyöpä (27,5%). Alkuvaiheen kokoisen keuhkosyöpä osuus oli 41% tutkimuksen väestöstä. Survival tulos data katkesi 1. elokuuta 2011 ja yhteensä 138 kuolemaan tapahtumia.

ilmaantuvuus Kuljettajan Genes

Mutaatiot eksonien 18-21 EGFR, eksonit 9 ja 20 PIK3CA, eksonit 11 ja 15 BRAF, eksonit 1-9 PTENin Kodonit 12, 13, 59, ja 60 KRAS, eksonit 6, 9,14, 16, ja 18 DDR2, eksonit 6, 7 ja 14 FGFR2, eksonit 1-5 ja STK11, ja muunnelmia EML4-ALK fuusio havaittiin (edustaja kaaviot on merkitty kuvioissa S1, S2, S3, S4 ja S5). Cut-off-piste c-Met korkean tason monistuksissa määriteltiin keskiarvo + 5SD kontrolliryhmän kuten aiemmin on kuvattu [15].

Koska yli 23 testit tehtiin geenit tässä tutkimuksessa jotkut yksilöt eivät riittävä saatavuus kaikille testit suoritetaan. Yksityiskohdat kunkin geenin jokaista alaryhmässä löytyy taulukosta taajuuden kuljettajan geenin muutoksia. Muutos hinnat geenien alaryhmiin laskettiin positiivinen /havaittu näytteissä. Mutaatio määrä EGFR NSCLC oli 28,4% (147/517), PTEN oli 9,5% (21/220), STK11 oli 7,9% (8/101), EML4-ALK oli 6,3% (15/239), KRAS oli 5,4% (27/498), c-Met oli 4,5% (20/448), PIK3CA oli 4,4% (20/452), BRAF oli 1,5% (7/452), DDR2 oli 1,2% (2/166), ja FGFR2 oli 0,6% (1/165), vastaavasti. Mutaatio ominaisuudet nämä geenit esitetään taulukossa 2. Löysimme 5 potilaalla on samanaikaisia ​​EGFR eksonin 21 L858R ja eksonin 20 mutaatio, ja 3 potilaalla on samanaikaisia ​​EGFR eksonin 21 L858R ja eksonin 19 deleetio (kuva 2).

eksoni 20 + 21, mutaatiot eksonin 20 ja eksonin 21 samanaikaisesti esitetään samassa potilaille; Exon19 + 21, mutaatiot eksonin 19 ja eksoni 21 samanaikaisesti esitetty samoilla potilailla.

määrä potilaita havaittiin useita kuljettajan geenin muutokset (taulukko 3). Kaikkiaan 23 potilasta, joilla EGFR mutaatioita oli c-MET lisäyksiä tai mutaatioita STK11, PIK3CA, BRAF tai PTEN. Erityisen kiinnostavia, yksi potilas, jolla EML4-ALK fuusio oli aktivoiva EGFR-mutaatio, ja toinen potilas oli PTEN mutaatio. Muita yleisiä dual mutaatioita esiintyi potilailla, joilla oli BRAF ja KRAS tai BRAF ja PIK3CA mutaatioita. Vain yksi potilas oli kolminkertainen mutaatio EGFR, PIK3CA, ja BRAF. EGFR ja KRAS, PTEN ja KRAS, PIK3CA ja PTEN ovat toisensa poissulkevia tässä tutkimuksessa.

Tupakointi tila liittyy Kuljettaja Gene muutostyöt

Analysoimme suhteita kuljettajan geenien ja tupakoinnista (Taulukko 4). EGFR-mutaatio hinnat olivat huomattavasti korkeammat tupakoimattomilla kuin tupakoitsijoilla [40,9% (119/291) vs. 12,4% (28/226),

X

2

= 50,791,

P

0,0005, khiin neliö testi, 2-puolinen]. KRAS-mutaatio olivat merkitsevästi alhaisemmat tupakoimattomilla kuin tupakoitsijoilla [3,6% (10/279) vs. 7,8% (17/219),

X

2

= 4,177,

P

= 0,041]. STK11 ja PTEN mutaatiot tupakoimattomilla oli pienempi kuin tupakoitsijoilla, mutta ero oli toisarvoinen merkitys [2,1% (1/48) ja 6,3% (7/112) vs. 13,2% (7/53) ja 13,0% ( 14/108),

X

2

= 4,274 ja 2,87,

P

= 0,062 ja 0,09, vastaavasti]. DDR2 ja FGFR2 mutaatioita todettiin olevan läsnä vain tupakoitsijoita, mutta ei havaittu merkittäviä eroja. c-Met, PIK3CA, BRAF, ja ALK mutaatioita ei todettu liittyvän tupakoinnista.

Eri Histologia tyypit liittyvät eri Kuljettajan Genes

Analysoimme eroja kuljettaja geenimutaatioita eri histologisia alatyyppejä (taulukko 4). Mutaatio hinnat EGFR adenokarsinooma (AC), levyepiteelisyöpä (SCC), ja suuri karsinooma (LCC) oli 40,3% (140/347), 4,4% (6/144) ja 3,8% (1/26) , vastaavasti (

X

2

= 73,595,

P

0,0005, Chi-square test, 2-puolinen). KRAS mutaationopeudet AC, SCC, ja LCC oli 7,1% (24/340), 1,5% (2/132) ja 3,8% (1/26), vastaavasti (

X

2

= 6.124,

P

= 0,039, Fisherin testiä,). PTEN mutaationopeudet AC, SCC, ja LCC oli 7,0% (8/115), 10,6% (10/94), ja 27,3% (3/11), vastaavasti (

X

2

= 4,642,

P

= 0,084, Fisherin tarkka testi). BRAF mutaatiot havaittiin vain AC; DDR2 ja FGFR2 mutaatiot vain esitetty SCC, mutta ei havaittu merkittäviä eroja. Erot c-Met korkean tason monistuksia, PIK3CA ja STK11 mutaatioita, ja EML4-ALK fuusioita potilailla, joilla on eri histologisia tyyppejä ei ollut tilastollisesti merkitsevä. Päällekkäisyyksiä näiden muutosten pääosin esitetty potilaalla on AC, ja vain 2 potilaalla on SCC ja 2 potilaalla on LCC.

Erilliset sairaudet jaotellaan kuljettajan geenejä perustuen histologia yhdistettynä tupakoinnista.

suoritetaan edelleen kerrostuminen analyysit perustuvat histologisia tyyppejä (AC ja SCC) ja tupakoinnista yhdessä. Potilaat luokiteltiin neljään alaryhmään (kuvio 3, taulukko 4). AC tupakoi alaryhmä, EGFR oli yleisin muuttunut geeni (49,8%, 114/229), ja sen jälkeen EML4-ALK fuusio (9,3%, 8/86), sitten PTEN mutaatio (9,1%, 7/77) , PIK3CA mutaatio (5,2%, 11/210), c-Met-monistus (4,8%, 10/207), KRAS mutaatio (4,5%, 10/223), STK11 mutaatio (2,7%, 1/37), BRAF mutaatio ( 1,9%, 4/210), DDR2 mutaatio (0%, 0/71), ja FGFR2-mutaatio (0%, 0/70). AC tupakoitsija alaryhmä, kaikkein rikastettu geeni oli EGFR-mutaatio (22,0%, 26/118), jonka jälkeen STK11 mutaatio (19,0%, 4/21), sitten KRAS mutaatio (12,0%, 14/117), EML4- ALK fuusio (4,5%, 2/44), c-Met-monistus (4,0%, 4/101), BRAF mutaatio (3,1%, 3/97), PTEN mutaatio (2,6%, 1/38), ja PIK3CA (2,1 %, 2/97). Olemme vain löytyy EGFR (8,0%, 4/50), c-Met (2,8%, 1/36), ja PIK3CA (2,6%, 1/38) muutoksia ei-tupakoitsijan kanssa SCC alaryhmä. Tupakoitsijan kanssa SCC ryhmän, useimmiten rikastettu geenejä PTEN mutaatioita (16,1%, 10/62), jota seurasi STK11 mutaatio (8,3%, 2/24), sitten PIK3CA mutaatio (7,2%, 6/83), EML4 alk fuusio (6,5%, 4/62), c-Met-monistus (6,3%, 5/80), DDR2 mutaatio (4,4%, 2/45), KRAS mutaatio (2,3%, 2/88), FRFR2 mutaatio ( 2,2%, 1/45), EGFR-mutaatio (2,1%, 2/94), ja BRAF (0%, 0/94). Näistä neljä alaryhmää, erot EGFR, KRAS ja PTEN mutaatiot olivat tilastollisesti merkitseviä (X

2 = 92,991, 11,951, 8,628. P = 0,0005, 0,005, ja 0,023, vastaavasti, khiin neliö -testi tai Fisherin testiä tarvittaessa). DDR2 ja FGFR2 mutaatiot vain esitetty SCC tupakoitsija alaryhmä. Tuntematon vaihtelu nopeudella potilaista tupakoimattomien SCC alaryhmä oli noin 86,6, mikä oli korkein näistä neljästä alaryhmien. Survival analyysi perustuu neljään alaryhmään ei havaittu eroja alaryhmien (kuva 3).

(a), eloonjääminen analyysi alaryhmien (b) Valuuttojen kuljettajan geeni muunnelmia alaryhmien. NS AC: potilailla, joilla adenokarsinooma tupakoimattomilla, S AC: potilailla, joilla adenokarsinooma tupakoitsijoilla, NS SCC: potilailla, joilla on levyepiteelisyövän tupakoimattomilla, S SCC: potilailla, joilla on levyepiteelikarsinooma tupakoitsijoilla.

Survival analyysi potilaat, joilla on erilaiset Kuljettaja Gene Ominaisuudet

Perustuu EGFR mutaatioita, me luokitellaan potilaat kahteen alaryhmään hengissä analyysia; EGFR-mutaatio positiiviset ja negatiiviset ryhmä. Eroa elinaika todettiin kahden alaryhmiä koko EGFR-mutaatio havaittiin potilasryhmässä (

X

2

= 0,957,

P

= 0,328. Kuva 4). Monimuuttujalähettimet analyysi Cox Regression kuten EGFR-mutaatio, vaihe, histologia, sukupuoli, tupakointi, ja iän mukaan vain siinä vaiheessa oli riippumaton ennustetekijä potilaista (

X

2

= 16,607,

P

0,0005, Forward: Wald;

P

= 0,05, merkintä;

P

= 0,10, poisto). Me tehdään edelleen kerrostuminen analyysi perustuu kliinisissä vaiheissa potilaista. Vaiheen 1 potilaiden, potilaiden EGFR-mutaatio positiivinen ollut pidempi elinaika kuin potilailla, joilla on EGFR negatiivinen (

X

2

= 3,947,

P

= 0,047, kuva 4).

(a), Survival analyysi kaikista EGFR havaittujen potilaita; (B), Survival analyysi vaiheen I potilaille. NR: ei saavutettu.

Keskustelu

Tietääksemme tämä on ensimmäinen tutkimus tutkia koko profiilin sekä tunnetuimpia sekä uudenlaiset kuljettaja geenejä, kuten PTEN , DDR2, ja FGFR2, NSCLC potilaat, ottaen samalla huomioon eri histologisen tyypit ja tupakointi Kiinan keuhkosyöpäpotilaita. Eri tutkimukset kuljettaja geenit voivat saada erilaisia ​​tuloksia, koska etnisen tai kliinisiä tietoja potilaista [16] – [22]. Suuri otoskoko ja monimutkainen meikki meidän potilasryhmässä pystyimme vertailemaan eroja potilasalaryhmissä. Suurin osa aiemmin julkaistu joissa tutkitaan kuljettajan geenejä vain keskitytään tiettyyn potilaiden alaryhmässä AC tai tupakoimattomien [3], [15], [21]. Lung Cancer Mutation Consortium sponsoroi NCI on myös kiinnostunut potilailla, joilla adenokarsinooma [23]. Johto NSCLC parhaillaan siirtymässä mukaisen hoidon perusta vaiheessa ja suorituskykyä asema yksilöllisempiä hoitoja perustuu kliinisiin, histologisen, ja molekyylitason tekijöitä [24]. Vastaavasti meidän tutkimus on ensimmäinen selkeä kuva siitä, miten kuljettajan geenien NSCLC väestö voi vaihdella kasvainhistologiaa ja tupakoinnista ja etsii potilasalaryhmissä, joille muutoksiin näissä kandidaattigeenit eniten rikastunut; nämä geenit voivat siksi kohdentaa yksilöllisten hoitoja. Lisäksi olemme analysoineet vaikutuksia kuljettajan geenin muutokset yleisestä potilaiden selviytymiseen.

erityispiirteet kuljettajan geenejä, jotka liittyvät kuhunkin alaryhmä viittaavat siihen, että nämä alaryhmien saattavat itse asiassa olla eri sairauksien, jotka tulevaisuudessa vaativat eri kohdistettuja hoitomuotoja. Epidemiologisia, molekyyli- ja kliinisen patologisia piirteitä ovat osoittaneet, että NSCLC tupakoimattomia on erillinen yksikkö [25]. Meidän alaryhmäanalyysissä NSCLC perustuu histologian ja tupakointi osoitti, että histologian ja tupakointi voisi merkittävästi vaikuttaa korjauksilla kuljettajan geenejä, erityisesti EGFR, KRAS, STK11 ja PTEN. EGFR mutaatioita rikastuneet tupakoimattomien potilaiden AC, KRAS tupakoitsijoilla AC, ja STK11 ja PTEN tupakoitsijoilla. Vaikka alatyyppi tupakoi potilaalla on AC on tutkittu intensiivisesti, koska niiden herkkyys EGFR-TKI, alatyypeistä tupakoitsija potilaiden AC harvoin tutkittu. Tutkimuksemme osoitti, että mutaatiot KRAS ja BRAF in tupakoitsija AC potilaat olivat korkeimmat näistä alatyypeistä. Tämä tutkimus osoittaa myös, että tupakoi potilaalla on SCC oli korkein tuntematon muutokset joukossa neljä alaryhmää. Ei korjauksilla KRAS, BRAF, PTEN, ALK, DDR2, ja FGFR2 löydettiin tupakoimattomien potilaiden SCC alaryhmä. Muutos hinnat EGFR, c-Met, ja PIK3CA olivat hieman alhaisemmat Näistä alatyypeistä. Tämä osoittaa, että tupakoi potilaalla on SCC voivat olla patogeenisiä mekanismeja, jotka poikkeavat tiedossa kuljettaja geenistä muutoksia. Tutkimus paljasti myös, että alatyyppi tupakoitsijat SCC oli erityispiirteitä DDR2 ja FGFR2 vain esitetään tässä alaryhmässä. Lukuun ottamatta BRAF, joka esitetty vain AC, kaikkien muiden geenien löytyy alatyypin tupakoitsijoilla SCC. PIK3CA mutaatiot ja c-Met vahvistus hinnat tupakoitsijoilla SCC alatyypin olivat kaikkein korkeimmat tämän alatyypin. Vaikka LCC otoskoko oli pieni, huomasimme, että PTEN mutaatiovauhtia (27,3%) vuonna LCC oli korkein kaikkien alatyyppejä. Kehittyvät data osoittaa, että kasvainhistologiaa voivat koskea edut erityisten kemoterapian tai kohdennettuja terapiaohjelmlssa [24]. Tällaiset suhteet voivat olla myös osittain liittyy kuljettajan geenin eroja. Make-up näiden geenien eri alatyyppeihin voi siis olla hyödyllistä määritellä erityisiä muunnelmia kuljettajan geenejä, jotka voivat huomattavasti tarkentaa hoito NSCLC [26].

tulokset osoittavat, että kaikki muut geenit harvoin muuttunut ( 10%) Kiinan pienisoluista keuhkosyöpää, paitsi EGFR mutaatioita (28,4%). Kuljettajan mutaatioita esiintyy geeneissä, jotka koodaavat signalointi proteiineja, jotka ovat kriittisiä solujen lisääntymistä ja selviytymisen [1]. Yhdessä havainnot, tämä merkitsee sitä, että uusi luokitus menetelmä pienisoluista keuhkosyöpää voidaan ehdottaa perustuu molekyylien biomarkkereita. Potilaat, joilla on harvoin korjauksilla kuljettajan geenejä voitaisiin katsoa olevan harvinaisia ​​tai orpo sairauksia ja tulisi harkita erilaisia, mistä tutkimus ja yksilöllinen hoito näkökulmasta ja tulevaisuudessa. Alaryhmäanalyysi Näiden kuljettajan geenien tutkimuksessamme oli erittäin hyödyllinen määriteltäessä potilaille, joilla on eri kuljettajan geenin muutokset edelleen kliinisissä tutkimuksissa.

muuttamista jotkut kuljettaja geeneistä on pieni ero julkaistuista tutkimuksista, jotka voivat johtua eri väestön tutkittu [20], [21]. Tutkimus kertoi, että mutaatiot EGFR ja KRAS todettiin 7 (7%) ja 36 (38%) potilaista, vastaavasti [22]. Toiset kertoivat, että KRAS mutaatioita havaittiin 75 395 (19%) ja 40 233 (17%) potilasta NSCLC, vastaavasti [16], [17]. Mielenkiintoista, vaikka KRAS-mutaatio korko on erilainen, mutta etusija potilaiden on sama, joka on mutaatio näyttää olevan useammin tupakoitsijoilla ja AC, nykyisiä tai entisiä tupakoitsijoita oli suurempi taajuus KRAS mutaatioita kuin koskaan tupakoitsijoita [18], [19].

päällekkäisyys mutaatioita kuljettajan geenien paljasti monimutkaisuus yksilöllisen hoidon keuhkosyövän tulevaisuudessa. EGFR ja KRAS olivat kaksi tärkeintä geenien tutkittu monet tutkijat. Tutkimuksemme löytyi EGFR-mutaatio voisi päällekkäisiä muiden havaittujen geenien paitsi KRAS, DDR2 ja FGFR2. RAS ja useat sen loppupään -efektiboksejamme lukien BRAF, on sittemmin osoitettu olevan yleisesti mutatoitunut laaja ihmisen syövissä ja biologiset tutkimukset ovat vahvistaneet, että RAS-reitin aktivaatio edistää kasvaimen aloittamista, etenemistä ja metastaattinen leviäminen monissa yhteyksissä [28]. Vaikka tutkimuksessamme BRAF mutaationopeutta NSCLC on harvoin 1,5% (7/452), 2 7 potilaista tunsivat samanaikaista EGFR ja BRAF mutaatioita. Tämä eroaa raportoitu, että BRAF mutaatiot ovat toisensa poissulkevia EGFR ja KRAS mutaatiot [29], [30]. ALK havaittiin 1 potilaalla AC olla samanaikaisia ​​esittelyyn EGFR-mutaatio. Se on eri edelliseen tulokseen, että EML4-ALK-fuusioiden olivat sulkevat toisensa pois mutaatioita EGFR geeni [31], [32]. Uskomme, että yhä useammat päällekkäisyyksiä kuljettajan geenejä raportoidaan tulevaisuudessa, joten kliininen käytäntö ei vain tarvitse harkita herkkä mutaatio, mutta myös mietittävä mutaatio samassa potilailla saman tavoitteen hoito tai yhdistettynä terapia.

päällekkäisyys mutaatioita kuljettajan geenien paljasti monimutkaisuus yksilöllisen hoidon keuhkosyövän tulevaisuudessa. EGFR ja KRAS olivat kaksi tärkeintä geenien tutkittu monet tutkijat. Tutkimuksemme löytyi EGFR-mutaatio voisi päällekkäisiä muiden havaittujen geenien paitsi KRAS, DDR2 ja FGFR2. RAS ja useat sen loppupään -efektiboksejamme lukien BRAF, on sittemmin osoitettu olevan yleisesti mutatoitunut laaja ihmisen syövissä ja biologiset tutkimukset ovat vahvistaneet, että RAS-reitin aktivaatio edistää kasvaimen aloittamista, etenemistä ja metastaattinen leviäminen monissa yhteyksissä [27]. Vaikka tutkimuksessamme BRAF mutaationopeutta NSCLC on harvoin 1,5% (7/452), 2 7 potilaista tunsivat samanaikaista EGFR ja BRAF mutaatioita. Tämä eroaa raportoitu, että BRAF mutaatiot ovat toisensa poissulkevia EGFR ja KRAS mutaatiot [28], [29]. ALK havaittiin 1 potilaalla AC olla samanaikaisia ​​esittelyyn EGFR-mutaatio. Se on eri edelliseen tulokseen, että EML4-ALK-fuusioiden olivat sulkevat toisensa pois mutaatioita EGFR geeni [30], [31]. Uskomme, että yhä useammat päällekkäisyyksiä kuljettajan geenejä raportoidaan tulevaisuudessa, joten kliininen käytäntö ei vain tarvitse harkita herkkä mutaatio, mutta myös mietittävä mutaatio samassa potilailla saman tavoitteen hoito tai yhdistettynä terapia.

Analysoimme ennustetekijöiden merkitystä näiden alaryhmien ja kuljettajan geenin muutoksia. Emme löytäneet mitään eroja kokonaiselossaoloaikaa näistä alaryhmiin perustuu histologian ja tupakoinnista. Tutkimuksemme ja muut Tutkimus osoitti, että EGFR-mutaatio I vaiheessa potilaat saattavat olla suotuisa ennustetekijöiden biomarkkereiden [32]. Nämä kuljettaja geenit voidaan siksi käyttää ennakoivaa biomarkkereita jos erityinen yhdisteiden kohdistaa näitä geenejä löytyy.

tulokset voivat olla hieman vinossa johtuen erittäin alhainen vaihtelu nopeudella useimpien geenien tutki, pieni otoskoko joissakin alaryhmiä, erilaiset havaitsemismenetelmät, erilaiset otoskoot erilaisten geenien ja toistuva analysointi saman yksilöiden eri geenejä. Kuten kaikki potilasnäytteiden ovat todella arvokkaita, korkean suoritustehon menetelmä havaitsemiseksi kuljettajan geeni muutoksia luotava mahdollisimman pian.

Yhteenvetona Tutkimuksemme osoittaa, että alatyyppejä NSCLC määritelty histologian ja tupakoinnista näkyvät olla erillisiä patologinen yhteisöihin tietyn kuljettajan geenin muutokset ja voitaisiin harkita eri sairauksia. Potilaat, joilla on harvoin korjauksilla kuljettajan geenejä hiljaista, että nämä ovat harvinaisia ​​tai orpojen sairauksiin, jotka olisi käsiteltävä toisesta näkökulmasta tulevaisuudessa. Ominaisuudet tunnettu alaryhmien voi auttaa valitsemaan potilaille, joilla on erityinen kuljettaja geenin muutokset tulevia kliinisiä kokeita ja yksilöllisen Tutkimuksia.

tukeminen Information

Kuva S1.

edustaja mutaatio kuvaajat BRAF ja PIK3CA.

doi: 10,1371 /journal.pone.0040109.s001

(TIF) B Kuva S2.

edustaja mutaatio kuvaajat EGFR.

doi: 10,1371 /journal.pone.0040109.s002

(TIF) B Kuva S3.

edustaja mutaatio kuvaajia KRAS ja FGFR2.

doi: 10,1371 /journal.pone.0040109.s003

(TIF) B Kuva S4.

edustaja mutaatio kuvaajat DDR2.

doi: 10,1371 /journal.pone.0040109.s004

(TIF) B Kuva S5.

edustaja mutaatio kuvaajia STK11 ja PTEN.

doi: 10,1371 /journal.pone.0040109.s005

(TIF) B Taulukko S1.

Primer jota käytettiin tutkimuksessa.

doi: 10,1371 /journal.pone.0040109.s006

(DOC) B

Kiitokset

Haluamme kiittää Drs. Hong Yan Tang, Hong-Sui Wu, Wei-Bang Guo ja Shi-Liang Chen niiden apua näytteiden keräämistä ja DNA: n ja RNA.