Krooninen sairaus

tiivistelmä

tavoite

suoritetaan päivitetyn meta analyysi käyttäen kattavan logistinen regressio ja malli-vapaa lähestymistapa, arvioida tarkemmin roolin rs4444235 variantin lähellä luun morfogeneettinen proteiini-4 (

BMP4

) -geenin paksunsuolen syöpään altistava ( CRC).

Methods

yhteensä 19 tutkimusten 28770 tapauksia ja 28234 kontrollia sisällytettiin. Metagen järjestelmä logistinen regressio levitettiin valita todennäköisin geneettinen malli rs4444235. Yleistynyt kerroinsuhde (OR

G) metrinen käytettiin antamaan maailmanlaajuinen testi suhde rs4444235 ja CRC riskiä.

Tulokset

Metagen analyysi ehdotti rs4444235 sovitettu parasta lisäaineen malli . Arvioinnissa lisäaineen mallin heterogeenisuus havaittiin (

P

= 0,059,

I

2

= 36,1), ja yhdistetyt per-alleeli OR oli 1,08 (95% CI = 1,05 -1,11). Perustuvat malliin vapaa lähestymistapa, yhdistettiin OR

G oli 1,09 (95% CI = 1,05-1,14) alle satunnaista vaikutus malli. Kerrostunut analyysit ehdotti heterogeenisyys voi olla osittain selittää väestön etnisyys, tutkimuksen suunnittelu, lähteet valvonnan ja otoskoko. Herkkyysanalyysi kannatti lisäksi vankka vakautta nykyiset tulokset, näyttämällä samanlaisia ​​yhdistetyssä arvioiden ennen ja jälkeen peräkkäisen poiston jokaisen tutkimuksen.

Johtopäätökset

Tämä meta-analyysi antaa vankan arvio positiivisten assosiaatio rs4444235 ja CRC riskejä ja edelleen korostaa, että rs4444235 CRC riskin ennustaminen.

Citation: Liu L, Su Q, Li L, Lin X, Gan Y, Chen S (2014) yhteinen Variant rs4444235 lähellä

BMP4

annetaan geneettinen alttius paksusuolisyövän: Päivitetty meta-analyysi perustuu kattavaan Statistical strategiaa. PLoS ONE 9 (6): e100133. doi: 10,1371 /journal.pone.0100133

Editor: Xiaoping Miao, MOE Key laboratorio ympäristöä ja terveyttä, School of Public Health, Tongji Medical College, Huazhong tiede ja teknologia, Kiina

vastaanotettu: 25 tammikuu 2014; Hyväksytty: 21 toukokuu 2014; Julkaistu: 16 kesäkuu 2014

Copyright: © 2014 Liu et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä työ tukivat Ohjelma Guangdong Medical Research Foundation (Grant nro B2012176, https://www.gdwst.gov.cn/lixiang/), Foundation for Distinguished Young Talents in Higher Education Guangdongin (Grant nro 2012LYM_0082; http: //www.gdhed.edu.cn/main/index.html) ja National Natural Science Foundation of China (Grant nro 81302493; https://isisn.nsfc.gov.cn/egrantweb/). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

peräsuolen syöpä on merkittävä kansanterveydellinen ongelma kehittyneissä maissa ja on yhä yleisempää Aasiassa ja Afrikassa, yli 1,2 miljoonaa uutta tapausta maailmanlaajuisesti vuosittain [1]. Kuten muut monimutkaisia ​​sairauksia, peräsuolen syöpä on monimutkainen piirre ohjaa monipuolista etiologies liittyy useita ympäristö- ja geneettiset tekijät ja niiden vuorovaikutus [2]. Kaksi- ja familiaalinen perustuvat tutkimukset ovat antaneet selkeitä todisteita siitä, että noin 35% kaikista CRC tapauksissa olla geneettinen komponentti [2]. Kaikista CRC tapauksissa alle 5% voidaan osuus yhdistämällä joitakin ituradan mutaatioiden korkea penetrance, kun taas suurin osa ”satunnaisia” tapauksista johtuu paljon yhteistä variantteja yksilöllisesti pieniä vaikutuksia [3].

Äskettäin genomin laajuinen yhdistys tutkimukset (GWAS) ovat osallisina useita yhteisiä yhden emäksen monimuotoisuus (SNP) in perinnöllinen alttius CRC [4], [5]. SNP rs4444235 kromosomissa 14q22.2, kartoitetaan 9,4 kb ylävirtaan koodaavan geenin luun morfogeneettinen proteiini 4 (

BMP4) B, oli aluksi raportoitu, jonka meta-analyysi GWAS tietojen liittyvän CRC riski, joiden yhteenlaskettu OR 1,11 (95% CI = 1,08-1,15,

P

= 8,1 × 10

-10) [6]. BMP4 on tärkeä jäsen BMP signalointireitin, johon kuuluu CRC kehitystä sääntelyn paksusuolen kantasolujen erilaistumista [7]. Tämä SNP on ehdotettu toimia cis-säätelijä

BMP4

ja näin annettu CRC riski [6]. Kuitenkin seuraavat replikointi tutkimukset tuottivat ristiriitaisia ​​tuloksia, mikä johtuu osittain ”voittaja kirous”, kuten alkuperäisessä raportissa [8], ”Proteus ilmiö” lisääntymään data [9], heterogeeninen etninen väestö, ja riittämätön tilastollinen voima, muiden muassa.

Meta-analyysi, integroimalla julkaistut tiedot, voi olla tehokas keino selventää epäjohdonmukaisuudet poikki yksittäisten tutkimusten. Kaksi meta-analyysit on tehty arvioida rs4444235 CRC. Meta-analyysi Li et al. [10], mukaan lukien 19893 tapaukset ja 22106 valvontaa, arvioidaan useita geneettisiä malleja rs4444235, mikä johtaisi useita vertailuja tai virheellisten tilassa tietoja ilman ennalta biologisia todisteita. Toinen meta-analyysin Theodoratou et al. [11], mukaan lukien vähemmän näytteet (18607 tapausta ja 19576 valvonta), käytetään suurimman todennäköisyyden estimaattori tulkita uskottava malli rs4444235. Kuitenkin tässä meta-analyysissä ei havaittu alaryhmäanalyysi sitoutunut. Voittaa edellä mainitut puutteet edellisessä meta-analyysit, me integroitu julkaistu tietoja 28770 tapauksia ja 28234 valvontaa, ja suoritetaan päivitetyn meta-analyysi käyttämällä kattava tilastollinen strategiaa. Metodologia logistinen regressio sovellettiin arvioida todennäköisin geneettinen malli metagen järjestelmään [12]. Yleistetty kerroinsuhde, joka perustuu malliin vapaa lähestymistapa, käytettiin antamaan globaalin testin geneettisten yhdistyksen [13]. Kerrostunut analyysit suoritetaan edelleen tutkia potentiaalisia heterogeenisyys. Ydin tavoitteena meta-analyysi oli tarjota tarkempaa ja luotettavampaa arviointia varten roolia rs4444235 polymorfismi geneettinen alttius paksusuolen syövän.

Materiaalit ja menetelmät

Haku Strategia ja tunnistaminen Asiaa koskevat tutkimukset

Tämä meta-analyysi tehtiin mukaan Preferred Reporting Kohteiden-katsaukseen ja Meta-analyysit (PRISMA) lausunto (tarkistuslista S1) [14]. Geneettiset yhdistys tutkimukset koskien rs4444235 ja peräsuolen syöpä (CRC) riski etsittiin PubMed /MEDLINE ja EMBASE tietokantojen kautta 15 lokakuu 2013, käyttämällä yhdistelmiä avainsanat: ( ”BMP4” tai ”rs4444235” tai ”14q22.2” ) ja ( ”peräsuolen syöpä” tai ”peräsuolen neoplasmor” tai ”paksusuolensyöpä” tai ”peräsuolen syöpä”). Samanlainen hakutermejä myös käytettiin Wanfang DATA ja CNKI tietokantoja. Etsintä on täydennetty tarkastelu viiteluetteloiden kaikkien asiaa koskevat tutkimukset ja katsaus artikkeleita. Kaikki asiaankuuluvat raportit tunnistettu sisällytettiin ilman kielirajoituksia.

Seuraavat kriteereillä olisi täytettävä: (1) joko tapausverrokkitutkimuksista tai sisäkkäisiä tapausverrokkitutkimukset; (2) selkeä määrittely peräsuolen syöpätapausta; (3) tutkimukset arvioidaan suhde rs4444235 ja CRC riski; (4) antaa riittävät tiedot laskea uudelleen vaikutuksen mittareita, jotka oli määrä genotyyppien tapauksissa ja valvontaa. Kirjoittajat otettiin yhteyttä sähköpostitse palkkiokelpoisia artikkeleita raportoitu riittävästi tietoa. Jos he eivät kyenneet toimittamaan yksityiskohtaisia ​​tietoja, nämä artiklat jätettiin pois. Eläinkokeissa, selostuksia, konferenssi tiivistelmiä, pääkirjoitukset ja kirjeet ulkopuolelle. Jos useampi kuin yksi etnisen väestöstä oli yksi raportti, kukin populaatio tarkasteltiin erikseen. Tutkimukset päällekkäisyyksiä muiden tutkimusten olisi jätettävä, ja jolla on eniten valmis tieto oli mukana. Ensimmäinen tutkimus yhdistys rs4444235 mukaan Houlston et al. jätettiin [6], koska päällekkäinen tutkimuksesta Tomlinson et al. [5]. Jälkimmäinen valittiin, koska suurempien näytteestä.

Data Extraction

Data poimittiin itsenäisesti ja kahtena kappaleena 2 arviointia (L. Liu Q. Su). Seuraavat tiedot on poimittu kunkin artikkelin mukaan kiinteän protokolla: ensimmäinen kirjoittaja, julkaisuvuosi, tutkimuksen suunnittelu, maa, etnisyys, lähde valvonnan määrä tapauksia ja valvonnan, keski-ikä tapauksissa sukupuolen suhteen, site /tyyppi peräsuolen syövän, genotyypitysmenetelmää, vähäinen alleelin taajuus (MMM), ja taajuus genotyyppien tapauksissa ja valvontaa.

tilastollinen analyysi

Hardy-Weinberg tasapainon valvonnan uudelleen analysoitiin käyttämällä goodness- of-fit χ

2 testi (

P

0,05). Käänteisen varianssi menetelmää sovellettiin arvioitaessa yhdistettyä taajuutta Riskimuodon (C-alleelin) eri etnisiä populaatioissa. Geneettinen vaikutus rs4444235 CRC herkkyys arvioitiin käyttämällä lähestymistapoja kuvattu alla:

Metagen järjestelmä on tarjonnut yleiset puitteet tulkita uskottavin geneettistä mallia rs4444235 että käsitelty genotyypit riippumattomina muuttujia logistinen regressio alle sekä kiinteiden ja sattumanvaraiset vaikutukset malleja [12]. Määräaikainen vaikutus malli, kaksi tekijää,

θ

2 ja

θ

3 arvioitiin käyttämällä logistista regressiota: logit (

π

ij

) =

α

i

+

θ

2z

i2

+

θ

3z

i3

, jossa

α

i

oli indikaattori tutkimuksittain kiinteän vaikutus, OR

TC /TT = exp (

θ

2

) ja OR

CC /TT = exp (

θ

3

). Jotta huomioon lisäaineen osan heterogeenisyys, satunnainen-vaikutus logistinen regressio suoritettiin käyttäen GLLAMM moduuli STATA ohjelmiston kautta käyttöön tutkimuksittain satunnainen kerroin: logit (

π

ij

) =

α

i

+ (

θ

2 + ν

i2

)

z

i2

+ (

θ

3 + ν

i3) z

i3

. Uskottavin geneettinen malli määritettiin käyttäen seuraavaa menettelyä: jos

θ

2

=

θ

3

= 0, mitään merkittävää geneettistä-yhdistys ehdotettiin; jos

θ

2

= 0 ja

θ

3

0, väistyvä geneettinen malli ehdotettiin; jos

θ

2

=

θ

3

0, määräävä malli ehdotettiin; jos

θ

3

θ

2

0, co-hallitseva mallia ehdotettiin; jos 2

θ

2

=

θ

3

, lisäaineena malli oli todennäköistä. Tässä meta-analyysissä, geneettinen malli rs4444235 oli parhaiten varustettu lisäainetta mallia. Sitten per-alleelin tai C-alleelin (lisäaine malli), jossa vastaava 95%: n luottamusväli (95% CI) arvioitiin logistisen regressiomallin, nimeämällä tulokset 0, 1, ja 2 AA, AC ja CC genotyyppejä, vastaavasti. Tutkimusten välisten heterogeenisuus arvionsa Cochranin χ

2 perustuu

Q

testi ja

I

2

metristä. Jos kukaan ei heterogeenisuus (eli jos

Q

testi oli merkittävä [

P

0,1] tai

I

2

oli alle 25%) , kiinteän vaikutus mallia käytettiin yhdistämään arvion; muuten, satunnainen-vaikutus mallia sovellettiin. Tutkia lähteet heterogeenisyys, kerrostunut analyysit suoritettiin, jos mahdollista, mukaan väestön etnisen (aasialaiset, valkoihoiset, ja afrikkalaiset), lähteet valvonnan (väestöpohjainen ja sairaala-pohjainen), tutkimussuunnitelma (GWAS ja replikointi tutkimus), ja yhteensä otoskoko (≤2000 ja 2000).

lisäksi yleistetty OR (OR

G), joka perustuu geneettiseen malli-vapaa lähestymistapa otettiin käyttöön myös tähän meta-analyysi [13 ]. OR

G hyödyntää täydellinen genotyyppi jakelu antaa arvion yleisestä geenin-taudin suhteen, sillä mutaatiostatuksesta kuormitus käsiteltiin porrastettu altistumista. Heterogeenisyys myös arvioitiin OR

G metriset ja ositettu analyysi suoritettiin myös.

Herkkyysanalyysi suoritettiin arvioimaan vaikutuksen yhden tutkimuksen yhdistettiin arvioihin. Julkaisu bias testattiin Egger n regression testi ja Begg n suppilo juoni. Tilastolliset analyysit tehtiin ORGGASMA, METAN ja metagen moduulit STATA ohjelmistoversio 13.0.

P

arvo 0,05 pidettiin tilastollisesti merkitsevä, paitsi arvio Tutkimusten välisten heterogeenisuus, jos merkittävä määrä 0,10 sovellettiin.

Tulokset

Euroopan ominaisuus sisältyy Studies

Kuvio 1 esittää vuokaaviota tutkimuksen valintaprosessin. Kattava Haku tuotti 56 mahdollisesti liittyvät referenssit. 18 artikkelia määritettiin olevan aluksi oikeutettuja seulomalla otsikot ja tiivistelmät. Sen jälkeen kun vielä yksityiskohtainen arviointi, 7 kahdennettu artikkeleita [6], [15], [16], [17], [18], [19], [20] ja 3 artikkelit riittävästi tietoa [20], [21], [ ,,,0],22], [23] suljettiin pois. 1 artikkeli on suljettu johtuen pieni otoskoko (92 tapausta ja 96 valvonta) [24]. 1 tutkimus artikkelista Tomlinson et al. jätettiin pois koska poikkeama Hardy-Weinberg tasapainoon [5]. Lopuksi, yhteensä 7 artikkelit 19 tutkimusten 28770 tapauksia ja 28234 kontrollia sisällytettiin tähän meta-analyysi [5], [25], [26], [27], [28], [29], [30] . Ominaisuudet näistä tutkimuksista yhteenveto taulukossa 1. Niistä sisältyi tutkimuksia, 15 tutkimukset suoritettiin valkoihoisista, 3 tutkimukset aasialaisilla, ja 1 tutkimuksessa afrikkalaisia.

Yhdistetty taajuus Riskimuodon (C alleelityypitys) in Controls mukaan Alkuperä

merkittävää heterogeenisuus nähtiin sekä valkoihoisista ja aasialaiset. ja siten random-vaikutus mallia sovellettiin (kaikki

P

0,0001,

I

2

= 82.21 ja 92.40, vastaavasti). Yhdistetty taajuus C-alleelin oli 0,463 (95% CI = +0,452-+0,474) valkoihoisista, samanlainen kuin 0,477 (95% CI = +0,423-,532) aasialaisilla. Vain 1 Tutkimus suoritettiin afrikkalaisia, ja taajuus C-alleelin oli 0,334.

Kaiken Meta-analyysi rs4444235 ja peräsuolen syövän riski

Taulukossa 2 esitetään yhteenveto tuloksista yleistä meta- analyysi. Vuonna metagen analyysissä yhdistettiin OR

TC /TT ja TAI

CC /TT oli 1,08 (95% CI = 1,03-1,12) ja 1,18 (95% CI = 1,12-1,25), vastaavasti, mikä viittaa lisäaineen mallin todennäköisin geneettistä mallia. Sitten lisäaine malli rs4444235 arvioitiin käyttäen perinteisellä menetelmällä. Vuonna lisäaine mallissa heterogeenisuus havaittiin (

P

= 0,059,

I

2

= 36,1), ja siten random-vaikutus mallia sovellettiin. Variantti oli merkitsevästi yhteydessä lisääntyneeseen CRC riski, jossa on yhdistetty per-alleelin OR 1,08 (95% CI = 1,05-1,11; kuva 2). Perustuvat malliin vapaa lähestymistapa, heterogeenisyys havaittiin myös (

P

= 0,063,

I

2

= 35,6). Alle random-vaikutus malli, merkittävä tulos tuotettiin myös yhdistyksen rs4444235 ja CRC riski, jossa yhdistetyssä OR

G 1,09 (95% CI = 1,05-1,14).

ositus analyysi rs4444235 ja peräsuolen syövän riski

Kun suoritetaan ositettu analyysi väestön etnisyys, valkoihoisilla alaryhmässä 15 tutkimusten heterogeenisuus poistettiin, ja merkittävät assosiaatiosta rs4444235 yhä olemassa sekä lisäaine malli ja OR

G arviointi (taulukko 2). Kuitenkin aasialaiset 3 tutkimuksissa oli merkittävää heterogeenisyyttä (

P

= 0,040 ja 0,041 Lisäaineiden mallin ja OR

G, vastaavasti), eikä merkitsevää yhteyttä löytynyt.

mukaan lähteiden valvonnan, että väestöpohjainen alaryhmä 13, analyysit lisäaineen mallin ja OR

G molemmat osoittivat merkittävää yhdistys rs4444235 CRC ilman näyttöä heterogeenisyys, kun taas sairaalan johdolla alaryhmä 8 tutkimuksissa merkittävä heterogeenisyys havaittiin eikä merkittäviä yhdistys on raportoitu.

Mitä opiskelemaan suunnittelu oli 6 GWAS ja 13 replikointi tutkimuksia. Arvioitaessa lisäaine malli ja OR

G metrinen, sekä alaryhmiä osoitti positiivista geneettinen yhdessä CRC riski, ilman merkkejä heterogeenisyys. Mielenkiintoista, yhdistettiin Arvioiden GWAS (per-alleeli OR = 1,12; OR

G = 1,14) oli hieman suurempi kuin alaryhmässä replikointi tutkimusten (per-alleeli OR = 1,06; OR

G = 1,07 ).

kerrostunut analyysi suoritettiin myös mukaan yhteensä otoskoko (määrä molemmissa tapauksissa ja valvonta), otetaan 2 alaryhmää: suuri otoskoko alaryhmä (yhteensä otoksen koko 2000), jossa 22064 tapauksia ja 20876 säätimet ja pieni tai keskikokoiset alaryhmä (yhteensä näytekoko ≤2000) kanssa 6706 tapauksia ja 7358 tarkastuksia. Sekä lisäaine malli ja OR

G analyysejä, heterogeenisuus poistettiin alaryhmä on suuri otoskoko, kun taas pieni tai keskikokoiset alaryhmä, heterogeenisyys edelleen olemassa. Molemmat alaryhmät osoitti Merkitsevä yhteys rs4444235 ja CRC riskiä.

Herkkyysanalyysi ja julkaiseminen Bias arviointi

Koska Tutkimusten välisten heterogeenisuus havaittiin tässä meta-analyysissa suoritetaan edelleen herkkyysanalyysissä alla random-vaikutus malli. Jotta lisäaine malli, herkkyysanalyysissä, peräkkäin jättämällä kukin tutkimuksessa raportoitu sarja yhdistettiin OR 95%: n luottamusväli on yli 1,00, ja pooliin syrjäisimpien olivat samanlaisia ​​ennen ja jälkeen jättämällä pois jokaisen tutkimuksen (taulukko 3). Samanlaisia ​​tuloksia ehdotettu OR

G analyysi että yksikään tutkimus muuttivat merkittävästi yhdistettiin OR

G. Vuonna Begg n ja Egger testit, ei ollut näyttöä julkaisemisesta bias sekä apuaine mallin ja OR

G (kaikki

P

arvot Begg ja Egger testit 0,05).

keskustelu

tällä hetkellä perinteinen meta-analyysit geneettisen yhdistyksen tutkimuksia suoritetaan tavallisesti romahtamassa genotyyppejä kahteen ryhmään olettaen eri geneettisten mallien. Nämä erilaiset mallit eivät ole itsenäisiä, ja a priori biologinen perustelu valinnan tietystä mallista on harvoin saatavilla [31]. Lisäksi tulkinta näistä tuloksista on monimutkaista, koska joukko eri arvioiden ja merkitsevyystestit tarjotaan yleensä. Tässä nykyisessä meta-analyysi rs4444235 ja peräsuolen syövän riskiä, ​​voimme hyödyntää kokonaisvaltaisen strategian, mukaan lukien metagen analyysi perustuu logistinen regressio ja OR

G metrinen perustuu malliin vapaa lähestymistapa [12], [13], voittaa haitat perinteiseen meta-analyysi virheellinen malli toiveiden ja useita malli testit täytetyn tyypin I virheprosentti, ja tehdä tulkinta nykyiset tulokset helpompaa.

tässä meta-analyysi 19 tapausverrokkitutkimukset of 28770 tapauksia ja 28234 valvonta, metagen analyysi osoitti, että rs4444235 asennettu parasta lisäainetta malliin. Tieto Parhaiten sopivan mallin rs4444235 voi olla tärkeä käytön optimoimiseksi tämän SNP kolorektaalisyövässä (CRC) riski ennusteen. Arviointi lisäaineen malli osoitti, että CRC riski lisääntyi 8% per extra C-alleelin. Perustuen malli-vapaa lähestymistapa, yleistetty OR (OR

G) analyysi osoitti, että CRC tapauksissa korkeampi mutaatiostatuksesta kuormituksella kuin terveillä henkilöillä on 9% suurempi riski CRC alttius. Herkkyysanalyysi tukee lisäksi nykyiset tulokset, näyttämällä samanlaisia ​​syrjäisimpien alueiden ennen ja jälkeen peräkkäin jättämällä pois yksi tutkimus. Positiivinen assosiaatiosta rs4444235 CRC riski tunnistaa tällä meta-analyysi oli myös yhtäpitävä havaintojen kanssa aiempien meta-analyysit [10], [11].

rs4444235 on 9,4 kb transkription aloituskohdasta

BMP4

. BMP signalointi on elintärkeä toiminto ylläpitoon Wnt signaloinnin estävän kantasolun eriyttäminen lähellä peräsuolen krypta emäkset [7]. Kohonneen ilmentyminen BMP-reitin jäsenet hillitä Wnt signaloinnin myöhemmin aktivoi β-kateniinin ja nostaa solujen alttiutta kasvaimeen aiheuttavia mutaatioita, ja lopulta edistää peräsuolen syövän synnyn [7]. Kiehtovan, tuoreessa tutkimuksessa, lusiferaasireportterista määritys ehdotti elementti, johon rs4444235 karttoja toimii alleelispesifisen transkription tehostaja [23]. CRC solulinjoissa alleelin ekspressio analyysi osoitti merkittävän yhdistys lisääntynyt

BMP4

ilmaisun kanssa C-alleelin [23]. Nämä tiedot ovat vahvasti tukeneet toiminnallista roolia rs4444235 CRC kehittämiseen cis- vaikuttavan sääntelyn vaikutus

BMP4

ilme.

heterogeenisyys on laajalle levinnyt ja vaikea ongelma meta-analyysi geneettisen yhdistyksen opinnot. Ei ole yllättävää, heterogeenisyys olemassa tässä meta-analyysi, ja näin tulosten tulisi tulkita varoen. Kuitenkin ositettu analyysi etnisyys, heterogeenisyys poistettiin valkoihoisilla ja merkittävä yhdistyksen rs4444235 säilytetään. Tutkimuksen mukaan suunnitteluun sekä GWAS ja replikointi tutkimuksissa heterogeenisuus oli tosiasiallisesti vähentynyt, ja yhdistys oli myös olemassa. Mielenkiintoista, alaryhmä GWAS tuotti suurempia yhdistetyssä syrjäisimpien kuin lisääntymään data, joka ilmaisee ”voittaja kirous” oli olemassa rs4444235 in GWAS. Sen suhteen näyte koon, vain alaryhmä kanssa suuren otoksen kokoheterogenian poistettiin, mutta molemmat alaryhmät osoitti merkittäviä geneettisiä -alueella. Kun stratifioitu lähteiden valvonnan, heterogeenisuus poistettiin väestöpohjaisen alaryhmä. Nämä havainnot ehdottivat heterogeenisyys voi olla osittain selittyä eri luontoa väestön etnisen, ohjaus lähteet, tutkimuksen suunnittelu ja otoskoko poikki yksittäisten tutkimusten. Lisäksi yksikään tutkimus ollut merkittävä vaikutus yleiseen arvioita herkkyysanalyysin, eikä julkaisu bias havaittu tähän meta-analyysissä, mikä viittaa vankka vakautta nykyiset tulokset.

Huolimatta vahvuus tämän tutkimuksen hyödyntäen kattavat tilastotiedot strategia, joitakin rajoituksia ansaitsevat huolellisen tarkastelun. In kerrostunut analyysi etnisyys, suurimmassa osassa tutkimuksia tehtiin valkoihoisista, vain 3 tutkimuksia ja 1 tutkimuksessa arvioidaan rs4444235 aasialaisilla ja afrikkalaisilla, vastaavasti. Yhteyttä ei ole nähtiin aasialaiset ja afrikkalaiset johtuen mahdollisesti pienen otoksen koosta ja riittämätön teho. Suhdetta rs4444235 ja CRC riski ansaitsee enemmän tutkimuksia eri populaatioissa. Vain yksi polymorfismi arvioitiin tässä meta-analyysi, ja tämä meta-analyysi ei antanut yleiskuva geneettistä vaihtelua on

BMP4

CRC alttius. Lisäksi geeni-ympäristön vuorovaikutukset ei pelata tärkeämpi rooli peräsuolen syövän synnyn verrattuna geneettiset tekijät [32]. Kuitenkin vain yksi tutkimus on tähän mennessä Hutter et al. on tutkinut vuorovaikutus rs4444235 ja ympäristötekijöiden [33], ja siten vuorovaikutuksen ei voida arvioida tässä meta-analyysissä.

Yhteenvetona tämän päivitetyn meta-analyysi, hyödyntäen kokonaisvaltaista strategiaa, tukee edelleen merkittävä roolia rs4444235 vuonna geneettinen alttius paksusuolen syövän. Edelleen toiminnallinen polymorfismia perustuvat tutkimukset koko

BMP4

geeni perusteltua vahvistaa ja laajentaa nykyisten löydösten eri etnisiä populaatioissa.

tukeminen Information

tarkistuslista S1.

tarkistuslista Edullisten raportointi Kohteiden-katsaukseen ja Meta-analyysit selvitys.

doi: 10,1371 /journal.pone.0100133.s001

(DOC) B