PLoS ONE: PSCA rs2294008 polymorfismin kanssa lisääntynyt syöpäriski
tiivistelmä
Background
Julkaistu tietoja yhdistyksen välillä
PSCA
rs2294008 polymorfismi ja syöpäriskin ovat sekaantuneet selkeitä tuloksia. Suhteen määrittämiseen ja tarkasti arvioida vaikutus koko arvio yhdistyksen, teimme meta-analyysi.
Methods
Haimme julkaistun kirjallisuuden EMBASE ja PubMed tietokantojen avulla hakutermejä ”
PSCA
”,” eturauhasen kantasoluantigeeni ”,” variantteja ”,” polymorfismi ”,” polymorfismit ”ja” syöpä ”. Kaikkiaan 21 tukikelpoisten artikkeleita haettiin, 27, 197 syöpätapausta ja 48, 237 säätimet.
Tulokset
Kokonaisuudessaan löysimme yhdistyksen välillä
PSCA
rs2294008 polymorfismi ja syövän riski oli tilastollisesti merkitsevä: TT vs CC: OR = 1,18, 95% CI, 1,10-1,27; TT + CT vs CC: OR = 1,08, 95% CI, 1,05-1,10; TT vs CT + CC: OR = 1,14, 95% CI, 1,07-1,21; T vs C: OR = 1,10, 95% CI, 1,06-1,14; CT vs CC: OR = 1,10, 95% CI, 1,06-1,13. Kerrostunut analyysit syöpätyypin ja etnisen osoittivat samanlaisia tuloksia.
Johtopäätökset
perusteella tilastollista näyttöä, voimme vetää johtopäätös, että rs2294008 polymorfismi PSCA-geenin on todennäköisesti tärkeä rooli syövän karsinogeneesin erityisesti mahasyövän ja virtsarakon syöpä.
Citation: Geng P, Li J, Wang N, Ou J, Xie G, Liu C, et al. (2015) PSCA rs2294008 polymorfismin kanssa lisääntynyt syöpäriski. PLoS ONE 10 (8): e0136269. doi: 10,1371 /journal.pone.0136269
Editor: Masaru Katoh, National Cancer Center, JAPAN
vastaanotettu 5 maaliskuuta 2014; Hyväksytty: 03 elokuu 2015; Julkaistu: 26 elokuu 2015
Copyright: © 2015 Geng et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään
Rahoitus: Tätä työtä tukivat by lupanumeroon 81272364 National Natural Science Foundation of China (ja HJL). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.
Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.
Johdanto
Genome-laajuinen yhdistys tutkimukset (GWAS) koskevat etiologia syövän ovat luoneet yli 150 alueisiin, jotka liittyvät erilaisiin tiettyjen syöpien. Löydöt onnistuneesti laajentaa nykyistä käsitystä syövän mekanismien [1]. Koska toiminnallinen merkitys geneettisten polymorfismien syövän taudin alkamisen ja etenemisen, se on erittäin tärkeää tutkia edelleen patofysiologia syöpään geenin tasolla. Geneettinen muutokset, kuten muutokset järjestyksessä ja poikkeava järjestöjen solun genomiin vaihtelevat yhden nukleotidin substituutioita brutto kromosomi, johtaa syöpään muodostumista biologisesti säätelemällä kourallinen molekyylitason toimintaa.
eturauhasen kantasoluantigeeni (
PSCA
), joka sijaitsee kromosomissa 8q24.2, on 123 aminohapon solukalvon glykoproteiini, joka kuuluu LY-6 /Thy-1-perheen solun pinnan antigeenejä.
PSCA
on raportoitu solunpintamarkkeria liikaa-express eturauhasen syöpäsolulinjoissa verrattuna normaaleissa kudoksissa [2]. Korkea ilmaus
PSCA
liittyy merkittävästi haitallisia ennustetekijöiden ominaisuuksia, kuten Gleason pisteet, rakkularauhanen invaasio ja Kapselipolysakkaridiantigeenin osallistuminen [3], sekä syövän vakavuudesta ja etäpesäkkeiden [4]. Lisäksi
PSCA
on säädelty useilla kiinteitä kasvaimia (haima, virtsarakko, munuaissolukarsinooma ja munasarjojen mucinous) [2,5], ja säädellä vähentävästi ruokatorven, mahasyövän ja sappirakon syöpä [ ,,,0],6-8]. Kuitenkaan ole ratkaisevia todisteita rooliin
PSCA
ilmentymistä syövän syövän synnyn paitsi ehdotus, että ilmaus
PSCA
vaihtelee riippuen solujen yhteydessä [5].
Kaksi viimeaikaista GWAS aiheiden perusteella eri etnistä alkuperää osoitti rs2294008 polymorfismi
PSCA
on merkittävä riskitekijä lisääntynyt mahasyövän alttius valkoihoinen väestö [9], kun taas deceases mahalaukun syövän riski Aasian väestöstä [10 ]. rs2294008 polymorfismi ensimmäisessä eksonissa
PSCA
geeni voi olla huomattava vaikutus vaihtelut transkriptionaalista aktiivisuutta ylävirran fragmentti
PSCA
[8]. Tähän mennessä vaikkakin kertyvät tiedot ovat dokumentoineet yhdistyksen välillä
PSCA
rs2294008 polymorfismi ja syövän riski, näyttöä rooli polymorfismi geenimerkkinä syövän riski on edelleen epäselvä [9-14]. Suurin osa tutkimuksista keskittyivät yhteen syöpätyyppi on suhteellisen pieni otoskoko. Tämän seurauksena vaikutukset
PSCA
rs2294008 polymorfia syöpäriskiin voidaan aliarvioida ja vähemmän luotettavia. Tässä työssä siksi, jonka tavoitteena on määritellä suhde
PSCA
rs2294008 polymorfismia syöpäriski ja tarkasti arvioida vaikutus koko arvio yhdistyksen, teimme meta-analyysi käyttäen kaikkia saatavilla julkaistua tietoa.
Materiaalit ja menetelmät
haku strategia
Tutkimuksissa yhdistyksen välillä
PSCA
rs2294008 polymorfismi ja syöpäriskin olivat kattavasti etsitään EMBASE ja PubMed käyttäen seuraavia aiheista termejä: ”
PSCA
”, ”eturauhasen kantasoluantigeeni”, ”variantteja”, ”polymorfismi”, ”polymorfismit”, ja ”syöpä” kahden riippumattoman tutkijat. Ei rajoituksia julkaisun kieltä tai vähintään useita aiheita määriteltiin tällä haulla. Muita julkaistut tiedot tunnistettiin tarkastelemalla kirjallisuusviitteet luetellaan kussakin haettuja artikkelissa.
ja poissulkukriteereitä
minimoimiseksi heterogeenisuus ja helpottaa sopivan tulosten tulkintaan, valitsimme tutkimuksissa oikeutettuja tähän meta-analyysi perustuu seuraaviin kriteereihin: (a) arvioi yhdistyksen välillä
PSCA
rs2294008 polymorfismi ja syöpäriskin käyttäen tapaus-verrokki suunnittelu; (B) säädetään käytettävissä taajuuden kunkin genotyypin (CC, CT, TT) molemmissa tapauksissa ja ohjaa laskea kertoimet suhde (syrjäisimmillä alueilla) ja vastaavat 95% luottamusvälit (CI). Siinä tapauksessa, että sama asia sarja käytettiin myöhemmin uusi artikkeli, me pidetään suurin yksi. Tutkimukset ulkopuolelle, jos ne olivat arvioita, pääkirjoitukset, kommentteja tai eläinkokeissa.
Data louhinta
Tiedot louhinta valmistui kahden riippumattoman tutkijat vastaavat kirjallisuudesta. Kerätyt tiedot muodossa kukin julkaisu seuraavasti: ensimmäinen tekijän nimi, julkaisuvuosi, tutkimus maa, etninen alkuperä mukana aiheista (valkoihoinen tai aasialainen), menetelmät suoritettiin genotyypin lähde hallintalaitteiden (sairaala- tai väestöpohjaisia), syöpätyyppi, Juttujen kokonaismäärät ja valvontaa, ja taajuus
PSCA
rs2294008 genotyyppien välillä tapausten ja verrokkien. Yksimielisyyteen uutettu eriä saavutettiin keskustelun välillä kaksi tutkijaa.
Tilastollinen
Jotta voitaisiin arvioida yhdistyksen välillä
PSCA
rs2294008 polymorfismi ja syövän riski, syrjäisimmät alueet ja vastaavat 95% CI tiivistetysti kunkin tutkimuksen TT vs CC, TT + CT vs CC, TT vs CT + CC, T vs C ja TT vs CC malleissa. Alaryhmäanalyysi suoritettiin etnisyyden ja syöpätyypin (mahasyöpä, virtsarakon syöpä ja muita, kun kyseessä alle kolmessa tutkimuksessa).
heterogeenisyys on aste vaihtelut kesken tulosten eri tutkimusten välillä sisältyvät samaan meta analyysi. Chi-square perustuva Q-testi tehtiin havaitsemiseksi heterogeenisuus tutkimusten meta-analyysi.
P
0,10 pidettiin tilastollisesti merkitsevä. Tällöin yhdistetyssä syrjäisimpien alueiden laskettiin mukaan sattumanvaraiset vaikutukset malli (Der Simonian ja Laird) [15]; Muutoin kiinteiden vaikutusten malli (Mantel-Haenszelin menetelmää) käytettiin [16].
Herkkyysanalyysi suoritettiin tunnistaa tutkimuksen vaikuttaneet tasalaatuisuus sisältyi tutkimuksia, kun merkittävä heterogeenisyys oli ilmoitettu. Hardy-Weinberg tasapaino (HWE) kontrolliryhmässä tarkistettiin chi-neliö testi. Julkaisu bias tutkittiin kaksi yleisesti käytetty analyysityökaluja: suppilo juoni ja Egger n lineaarisen regression testi [17].
Tilastolliset analyysit Tässä tutkimuksessa tehtiin käyttämällä Stata ohjelmistoa (versio 12.0, StataCorp LP, College Station , TX, USA). Kaikki testit olivat kaksipuolisia ja merkitsevyystasolla pidettiin
P
0,10.
Tulokset
Tutkimus valinta
Saimme 535 artikkeleita yhteensovitus alistaa käytetään termiä hakustrategia. Tutkittuaan niiden otsikot ja abstraktit, valitsimme 30 artikkelia Koko tekstin tukikelpoisuuden arviointia. Näistä 9 lopulta poistetaan eri syistä, kuten riittämättömät tiedot [18-22], katsaukset [23,24], jossa ei ole ohjaus väestöstä [25] ja tutkimuksen merkitystä parhaillaan tutkitaan polymorfismi [26]. Siksi 27, 197 syöpätapausta ja 48, 237 säätimet 21 artikkelit 24 tutkimukset kuuluivat tähän meta-analyysi [4,8-14,27-39] (kuvio 1).
ominaisuudet sisältyi tutkimuksia
perusominaisuuksia kaikki mukana tutkimuksissa, on lueteltu taulukossa 1. yhteensä kaksikymmentäneljä tutkimukset olivat oikeutettuja tähän meta-analyysissä, joista kahdeksan oli Kaukasian aiheita ja kuusitoista Aasian aiheista. Oli suuria eroja kirjallisuudessa on osallistujien lukumäärä kussakin tutkimuksessa vaihtelee 77-5, 303 tapauksessa ryhmässä ja 200-16, 567 hallinnassa väestöstä. Ainoastaan kahdessa poikennut p arvoista HWE [10,33].
PCR-RFLP: polymeraasiketjureaktio-restriktiofragmenttipituuspolymorfismin; PCR-LDR: PCR-ligaa- detektioreaktiossa; DHPLC: denaturointi suuren erotuskyvyn nestekromatografia; AS-PCR: alleeli-spesifinen PCR: llä; SNP: yhden emäksen monimuotoisuus, PB: väestöpohjainen tutkimukset; HB: sairaala perustuvat tutkimukset.
Quantitative synteesi
Kokoamalla kaikki voivat tutkimuksissa yhdeksi suureksi aineisto, löysimme yhdistyksen välillä
PSCA
rs2294008 polymorfismia ja syöpä riski oli tilastollisesti merkitsevä. Yhdistys esiintyi voimakkaampaa TT vs CC ja TT vs CT + CC: OR = 1,18, 95% CI, 1,10-1,27 (kuvio 2); OR = 1,14, 95% CI, 1,07-1,21, vastaavasti. Totesimme myös maltillista TT + CT vs CC (OR = 1,08, 95% CI, 1,05-1,10) (kuvio 3), T vs C (OR = 1,10, 95% CI, 1,06-1,14), ja CT vs CC (OR = 1,10, 95% CI, 1,06-1,13) (taulukko 2).
jokaisessa tutkimuksessa arvioiden OR ja sen 95%: n luottamusväli piirrettiin kanssa laatikko ja vaakasuora viiva. Symboli täynnä timantti viittaa yhdistettiin OR ja sen 95%: n luottamusväli. Satunnaisten vaikutusten meta-analyysi osoittaa merkittävää yhteyttä.
Jokaisessa tutkimuksessa arvioiden OR ja sen 95%: n luottamusväli piirrettiin kanssa laatikko ja vaakasuora viiva. Symboli täynnä timantti viittaa yhdistettiin OR ja sen 95%: n luottamusväli. Kiinteiden vaikutusten meta-analyysi osoittaa merkittävää yhteyttä.
P, p-arvo Q testi heterogeenisuus.
ositus analyysejä eri syöpätyypin osoittivat vastaavasti suurentunut maha- syöpä ja virtsarakon syöpä. Kun kerrostetaan väestön mukaan kansallisuus, sekä Aasian ja valkoihoinen väestö osoitti yleensä kasvu syöpäriskiä (taulukko 2).
heterogeenisuus ja herkkyysanalyysit
Koska merkittäviä heterogeenisuus tutkimukset (TT vs CC:
P
= 0,007; TT vs CT + CC:
P
= 0,029; T vs C:
P
= 0,007), herkkyys analyysi toistamalla meta-analyysi, kun jätetään pois kunkin tutkimuksen, yksi kerrallaan, tehtiin lähteen tunnistamiseen. Tulokset osoittivat Matsuo et ai. [27] tehdään merkittäviä osuuksia huomattava heterogeenisuus. Poissulkeminen Tämän tutkimuksen dramaattisesti vähentynyt heterogeenisyys (TT vs CC:
P
= 0,440; TT vs CT + CC:
P
= 0,710; T vs C:
P
= 0,245). Kuitenkin yhdistetyt tuloksia ei tilastollisesti vaikuttaneet sulkea kukin tutkimus, mukaan lukien tutkimus eri mieltä HWE. Nämä tiedot osoittivat, että tuloksemme ovat vakaita ja kestäviä.
Julkaisu bias
Begg n suppilo juoni ja Egger testi käytettiin määrittämään julkaisu bias tässä meta-analyysi. Ei ollut selvää epäsymmetria ilmoitettu tontteja. Egger testi myös tukevaa näyttöä ei ole merkittävää julkaisua bias meta-analyysi (Begg:
P
= 0,442; Egger:
P
= 0,316; malli: TT + CT vs CC) ( Kuva 4).
Jokainen piste edustaa yksittäisen tutkimuksen osoitetun -alueella.
keskustelu
PSCA
kuin eturauhasen antigeenin avainasemassa solun tarttumiseen, lisääntymistä, ja selviytyminen [40]. Seerumin taso oli suoraan tai epäsuorasti liittyy syövän etenemiseen.
PSCA
yli-ilmentyminen oli aluksi raportoitu eturauhassyövän [2], jota seurasi useita muita syöpiä, kuten haimasyöpä [41,42]. Tutkimukset yhdistyksen välillä
PSCA
rs2294008 polymorfismia syöpäriskiä on usein suoritettu joko pieni tai suuri väestö tunnistaa suhteen. Tällä hetkellä ei ole johdonmukaista todisteita tätä yhdistystä. Jotkut tutkimukset osoittivat rs2294008 polymorfismi
PSCA
geeni voi olla merkittävä rooli virtsarakon syövän synnyn ja se voisi toimia biomarkkeri geneettinen alttius tähän syöpään [37,38], vaikka tämä toteamus ristiriidassa seuraava replikointi tutkimus koskien mahasyövän japani väestön joissa pienempi riski mahalaukun syövän ehdotettiin [10]. Kaikkein Tuore tutkimus kuitenkin jo osoittanut mitään genotyyppiyhteyttä välillä
PSCA
rs2294008 polymorfismi ja paksusuolen syövän riskiä. Ottaen huomioon suhteellisen rajallinen otoskoko on toistaiseksi määrittää vakaa vaikutus koko
PSCA
rs2294008 polymorfismin suhteen syöpään.
Meta-analyysi on laajalti hyväksytty merkittävä väline analysoimaan kumulatiiviset tiedot tutkimuksista, joissa tulokset alhaisen tilastotehoa tuotettiin rajallisuuden vuoksi tutkittavien [43]. Esillä olevassa meta-analyysi, joka koostuu 27, 197 syöpätapausta ja 48, 237 säätimet 21 artikkelit 24 tutkimuksissa kattavasti tutkittu yhdistyksen välillä
PSCA
rs2294008 polymorfismi ja syöpäriskiä. Yhdistetty Tulokset viittasivat tilastollinen yhdessä yleisen syöpäriskiä. Vuonna kerrostunut analyysit mukaan syöpätyypin, kohonnut mahasyövän ja virtsarakon syövän näytettiin. Yhdenmukainen havaintojen entisessä analyysit, kerrostuneisuus analyysit etnisyyden osoitti myös
PSCA
rs2294008 polymorfismi liittyy lisääntynyt syöpäriskiä Aasian sekä valkoihoinen väestö.
Tämä on ensimmäinen tutkimuksessa käsitellään syöpäriski liittyy
PSCA
rs2294008 polymorfismi mennessä, vaikka useat meta-analyysit ovat tutkineet alttius vaikutukset
PSCA
rs2294008 polymorfismin vaikutus mahasyövän [6060 tapauksia ja 4824 tarkastuksia, 10717 tapauksia ja 9028 tarkastukset, 10836 tapauksia ja 9235 valvontaa tutkimuksessa Wang et al., Zhang et al. (Asian Pac J Cancer Edellinen), Zhang et al. (Exp Ther Med), vastaavasti] [44-46]. Kaikki nämä tutkimukset osoittivat PSCA rs2294008 polymorfismi on riskitekijä mahasyövän, havainto vastaa nykyistä työtä (55363 useamman osanottajan jopa verrattuna suurimpaan tutkimus), joka laajentaa kautta sisällyttämällä useiden jälkeen julkaistuja tutkimuksia. Viittaus lisääntynyt syöpäalttiutta merkitsee sitä, että vaihtelu rs2294008 polymorfismin johtaa epänormaalin ilmentymisen PSCA siten edistää syövän etenemisessä riippumatta syövän tyypistä tai etnisen alkuperän.
Tiedetään, että helikobakteeri-infektio edustaa pää- ja erityinen tarttuva aiheuttaa ihmisten syövän, mahasyövän erityisesti. Eri linjat todisteet ovat osoittaneet tärkeän roolin H. pylori pelaa mahasyövässä. Esimerkiksi Levi et al. raportoitu, että ei vain helikobakteeri-infektiota toimii itse alttius tekijä, mutta se voi olla lisäaineen vaikutuksia mahasyövän yhdistämällä muihin häiritsevien tekijöiden [47]. Lähes samaan aikaan, Wang et ai. lisätodisteita siitä, että pysyvät helikobakteeri-infektion ja infektion aiheuttama krooninen tulehdus voi lisätä todennäköisyyttä mahalaukun cardia syövän Kiinan [48]. Lisäksi, Lunet et ai. ilmoitti, että H. pylori on suuri vaikutus vaikutuksiin vaihteleva laajasti kaikkialla maantieteellisillä alueilla johtuen erillisten elämäntavat ja altistumista ympäristön syöpää aiheuttaville aineille [49]. Nämä raportit näyttävät tukevan havaintomme hieman pienempi riski syövän liittyvän rs2294008 genotyypit, verrattuna raportoitu aikaisemmassa yhdistys tutkimus helikobakteeri-infektion [36]. Tämä ero osoittaa, että rs2294008 polymorfismi suhteessa muihin syöpää kuten infektio helikobakteeri, vaikuttaa vähemmän osa syövän synnyn. Etiologia syöpä on monitekijäinen ja heterogeeninen, lisätutkimuksia tarvitaan tunnistamaan riskitekijät, mikä helpottaa varhaisen havaitsemisen ja ennaltaehkäisy.
On huomattava Tutkimusten välisten heterogeenisuus tässä meta-analyysi. Vaikka mitään merkittäviä muutoksia havaittiin yhdistettyjen tulosten poistettaessa Tutkimuksen lahjoittamalla heterogeenisyys, emme voi sulkea pois mahdollinen vaikutus ja nykyinen tulee hoitaa varoen. Lisäksi kannalta maltillisen otoskoko kerrostunut analyysejä, se on edelleen epämääräinen noin vakaa vaikutus koko
PSCA
rs2294008 polymorfismi yhteydessä syöpäriskiä. Lopuksi lähtö HWE havaittiin kahdessa tutkimuksessa. Vertaamalla tuloksia välillä mukaan lukien ja ilman niitä, havaitsimme vähäinen vuorottelun tuloksissa eivät pääse huomattavat. Kuitenkin, kun otetaan huomioon muutamia merkittäviä vaikutuksia seurauksena läsnäolosta heterogeenisyys ja lähtö muoto HWE, meidän havainnot ovat luotettavia perustuvat tilastotietoihin.
Yhteenvetona tämä meta-analyysi viittasi siihen, että
PSCA
rs2294008 polymorfismi oli merkitsevästi liittyy lisääntynyt riski sairastua syöpään. Kerrostunut analyysit syöpätyypin ja etnisen osoittivat samanlaisia tuloksia. On kuitenkin syytä toteuttaa suuria tutkimuksia tulevaisuudessa vahvistaa nykyisen havaintoja.
tukeminen Information
S1 PRISMA tarkistuslista.
doi: 10,1371 /journal.pone.0136269.s001
(DOC) B