Krooninen sairaus

tiivistelmä

tavoite

Ruokatorven syöpä oli viidenneksi yleisin diagnosoitu syöpä ja neljänneksi suurin syy syöpään liittyvien kuolemaan Kiinassa vuonna 2009. Geneettiset tekijät voisi olla tärkeä rooli ruokatorven okasolusyöpä (ESCC) syövän syntymistä.

mallit ja menetelmät

vaikutuksen arvioimiseksi

p21

,

p53

,

TP53BP1

ja

p73

yhden emäksen monimuotoisuus (SNP) riskistä ESCC teimme sairaaloiden tapauskontrollitutkimuksessa. Kaikkiaan 629 ESCC tapauksissa ja 686 verrokkia palvelukseen. Heidän genotyypit määritettiin käyttäen ligaa- detektioreaktiossa (LDR) menetelmällä.

Tulokset

Kun

p21

rs3176352 GG homozygoottisia genotyyppi käytettiin vertailuryhmään, CC-genotyyppi liittyi merkitsevästi suurentunut ESCC. Kun

p73

rs1801173 CC homozygoottisia genotyyppi käytettiin vertailuryhmään, CT genotyyppi liittyi merkitsevästi suurentunut ESCC. Sen jälkeen Bonferroni korjauksen, sillä

p21

rs3176352 G C,

p

oikeassa edelleen huomattavaa. Muiden kuuden SNP, kaikissa verrattuna malleissa, ei assosiaatio polymorfismien ja ESCC riski havaittiin.

Johtopäätökset

p21

rs3176352 G C ja

P73

rs1801173 C T SNP liittyy suurentunut ESCC. Vahvista nykyisen havaintojen lisäksi, suurempia tutkimuksia ja kudosspesifisiä biologisia ominaisuuksia tarvitaan.

Citation: Zheng L, Tang W, Shi Y, Chen S, Wang X, Wang L, et al. (2014)

p21

rs3176352 G C ja

p73

rs1801173 C T polymorfismit liittyy lisääntynyt riski ruokatorven syöpään kiinalaisessa väestöstä. PLoS ONE 9 (5): e96958. doi: 10,1371 /journal.pone.0096958

Editor: Ralf Krahe, University of Texas MD Anderson Cancer Center, Yhdysvallat

vastaanotettu: 13 tammikuu 2014; Hyväksytty: 12 huhtikuu 2014; Julkaistu: toukokuu 12, 2014

Copyright: © 2014 Zheng et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä tutkimus tuettiin osittain National Natural Science Foundation of China (81370001, 81371927, 81101889, 81000028), Jiangsu Natural Science Foundation (BK2010333, BK2011481), Social Development Foundation Zhenjiang (SH2010017) ja Changzhou Young Talents ja Science-Technology Foundation of Health Bureau (QN201102) ja Affiliated kansan sairaalan Jiangsu yliopiston rahasto (Y200913). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

Koska neljänneksi yleisin syy syöpäkuolemista ja viidenneksi yleisin diagnosoitu syöpä Kiinassa vuonna 2009 [1], 5-vuoden eloonjäämisaste ruokatorven syöpä on erittäin huono ja tilien vain 12,3% 23 Euroopan maissa [2]. Yli 90% ruokatorven syöpiä ovat ruokatorven okasolusyöpä (ESCC). Lisäksi ympäristön riskitekijät kuten tupakointi ja runsaan alkoholinkäytön, yhden emäksen monimuotoisuus (SNP) myös geneettiset tekijät voisi olla tärkeä rooli ESCC karsinogeneesissä [3].

tuumorisuppressoriproteiinia p53 usein mutatoitunut monentyyppisiä syöpien ja on sekaantunut solujen lisääntymisen ja syövän etenemistä [4].

p53

geeni on kromosomissa 17p13.1. Hyvin tutkittu

p53

polymorfismi, Arg72Pro (rs1042522 C /G; R /P) on raportoitu olevan toiminnallinen merkitys [5], [6]. Verrattuna Arg villityypin proteiinia, Pro variantti alleeli koodaama proteiini on tehokkaampaa indusoinnissa tuman DNA korjaavien geenien ilmentymistä [7]. Polymorfismi

p53

rs1042522 G C on liitetty riski lukuisia erilaisia ​​syöpiä [8].

P21 (Waf1 /CIP1 /CDKN1A), ei-spesifinen cdk-inhibiittorin ja avaimen välittäjänä G0-G1 solusyklin pysähtymiseen määrä lisääntyy villityypin p53. p21 toiminnot aikana geenin korjaus- ja angiogeneesissä [9]. Solusyklin pysähtymisen G1-S-vaiheessa rajoitus piste välittyy p21 ylössäätöä aiheuttama p53, ja siihen liittyvä G1 sykliinit-cdk2 kompleksit esto [10]. P53-vajaiden solujen, p21 vuorovaikutuksessa proliferating solun tuma-antigeenin (PCNA) ja aiheuttaa sekä G1 ja G2 solukierron pysähtymisen [11]. Estämällä PCNA-riippuvaisena DNA-replikaatiota, p21 ilmaus voi estää kasvaimen kasvua ja epäsuhta korjaus in vitro [12].

p21

koodaa 21 kDa: n proteiini, joka sijaitsee kromosomissa 6p21.2 ja kolme eksonia ja kaksi intronia [13].

Tumor proteiinia 53-sitova proteiini 1 (TP53BP1) vuorovaikuttaa nimenomaan

p53

ja osallistuu sekä DNA: n korjaukseen ja solusyklin kontrolli. Tekemällä yhteistyötä vaurioita anturit ja signaalimuuntajia, TP53BP1 auttaa välittävät DNA-vaurioita tarkastuspiste [14].

P73

osakkeita rakenteellisia ja toiminnallisia samankaltaisuuksia

p53

.

p73

sijaitsee 1p36.33, kartoitus alueelle, joka on usein poistettu syövissä [15]. p73 aktivoi transkription p21- ja p53: een reagoiva geenejä, jotka osallistuvat solusyklin kontrolli, DNA: n korjaukseen, apoptoosia ja estää solujen kasvua in p53-tavoin aiheuttamalla apoptoosin tai G1 solusyklin pysähtymisen [16], [17]. Tämä viittaa siihen, että p73 on kasvaimen vaimennin toimintoja. Muussa tapauksessa

p73

geeni on joitakin merkittäviä eroja p53. Toisin kuin p53-hiirillä, joilta puuttuu

p73

osoita mitään lisääntynyt alttius spontaani kasvaimien syntyyn [18].

Genetic vaihtelut p53-reitin geenit, kuten

p21

,

p53

,

TP53BP1

ja

p73

, voi edistää ja ESCC. Sairaalassa perustuva tapauskontrollitutkimuksessa teimme genotyypitys analyysit kahdeksan toiminnallista

p21

,

p53

,

TP53BP1

ja

p73

SNP 629 ESCC tapauksissa ja 686 kontrollit Kiinan väestön.

Materiaalit ja menetelmät

Eettinen hyväksyntä tutkimussuunnitelman

tiedot on talletettu tukeminen Information tiedostoja. Eettisten tutkimuksen suorittamisessa ihmiseen kohdistuvan ja /tai eläimiä, me noudatetaan Maailman lääkäriliiton Helsingin julistus. Tarkastelu hallitus Jiangsu University (Zhenjiang, Kiina) hyväksyi sairaala-pohjainen tapauskontrollitutkimuksessa. Kirjallinen suostumus saatiin kaikkien aineiden tutkimuksessa.

Potilaille ja valvonta

välisenä lokakuussa 2008 ja joulukuun 2010 alkaen Affiliated Kansan sairaalan Jiangsu yliopiston ja Affiliated sairaala Jiangsu University (Zhenjiang , Kiina), 629 potilaalla on ruokatorven syöpä rekrytoitiin peräkkäin. Patologiset keinoin, kaikissa tapauksissa ruokatorven syöpään diagnosoitiin ESCC. Hylkäämisperusteet olivat: potilaat, jotka aikaisemmin ollut syöpä; mitään etäpesäkkeitä syöpä ja sädehoito tai kemoterapia. 686 potilasta ilman syövän oli sovitettu tapauksiin iän suhteen (± 5 vuotta) ja sukupuoli, kuten valvontaa. Tarkastukset rekrytoitiin edellä mainitut kaksi sairaaloissa samaan aikaan. Useimmat tarkastukset hoidettiin trauma (mukaan lukien 612 traumapotilailla, 45 infektiotauti potilasta ja 29 sairastaneista potilaista).

Käyttämällä esitestattuja kyselylomake, koulutettu haastattelijat kyseenalaistettu kunkin aihe henkilökohtaisesti ja sai väestötietoja tietoa ( esimerkiksi ikä, sukupuoli) ja siihen liittyvät riskitekijät (kuten tupakoinnin ja alkoholin kulutus). Laskimoverinäytteet (2 ml) kerättiin haastattelun jälkeen kustakin aiheesta. Määritelmä ”tupakoitsijat” oli yhden savukkeen polttamisesta päivässä 1 vuoden ajan. Määritelmä ”alkoholi juovat” oli kulutus ≥3 alkoholijuomia viikossa 6 kuukautta.

DNA: n eristäminen, SNP valinta ja genotyypitys ligaatiolla detektioreaktiossa (LDR) B

Vuodesta koko veri, genominen DNA eristettiin [19]. 8 SNP valinta perustui aiempien julkaistuja artikkeleita, joissa on funktionaalisia huomioon [20], [21], [22], [23]. Teknistä tukea Shanghai Biowing Applied Biotechnology Company, näytteet genotyyppi käyttäen LDR menetelmää [24]. 160 (12,17%) satunnaisesti valitut näytteet korkea DNA laatu, toistuvat analyysit tehtiin laadunvalvontaan.

Tilastolliset analyysit

Käyttäen

χ

2 testiä välillä tapausten ja kontrollien, jakaumat demografisten ominaisuuksien, valittujen muuttujien ja genotyypit

p21

,

p53

,

TP53BP1

ja

p73

muunnokset erot arvioitiin. Logistisella regressioanalyysillä, yhdistysten välillä kahdeksan SNP ja riski ESCC arvioitiin raakaöljyn syrjäisimmille alueille ja säätää syrjäisimpien säädettäessä ikä, sukupuoli, tupakointi ja juominen tila. Koska vertailujen lukumäärä, Bonferronin korjausta menettelyä sovellettiin. Jonka hyvyys fit

χ

2 testissä Hardy-Weinberg tasapaino (HWE) testattiin vertaamaan havaittu genotyypin taajuudet odotettu niitä joukossa verrokkien. SAS 9.1.3 (SAS Institute, Cary, NC, USA), kaikki tilastolliset analyysit suoritettiin.

Tulokset

Ominaisuudet tutkimuspopulaation

Kotelot ja valvonta ” ominaisuudet on esitetty yhteenvetona taulukossa 1.

χ

2 testiä, tapaukset ja valvonta ovat riittävän Hyväksytty iän ja sukupuolen. Välillä tapauksissa ja valvontaa, merkittävä ero havaittiin tupakointi ja juominen tila, joka on esitetty taulukossa 1. Ensisijainen tieto kahdeksan genotyyppi SNP oli taulukossa 2. Konkordanssi luokallejääminen analyysit olivat 100% paitsi

p21

rs3176352 G C (158/160, 98,75%). Kaikille SNP, pienet alleelin taajuus (MAF) meidän valvonta oli samanlainen MAF Kiinan tietokantaan. Kontrolleissa, näiden kahdeksan polymorfismien, havaitut genotyyppi taajuudet olivat kaikki HWE (taulukko 2).

Yhdistykset välillä p21, p53, TP53BP1 ja p73 polymorfismit ja riski ESCC ja genotyyppi yhdistelmä analyysi

Kun

p21

rs3176352 GG homozygoottisia genotyyppi käytettiin vertailuryhmään, GC genotyyppi ei liittynyt riski ESCC; CC-genotyyppi liittyi merkitsevästi lisääntynyt riski ESCC (CC vs. GG: säätää OR = 1,61, 95% CI = 1,18-2,20,

p

= 0,0030). Vuonna hallitseva mallissa

p21

rs3176352 GC /CC variantit eivät liittyneet riskiä ESCC verrattuna

p21

rs3176352 GG-genotyyppi. Vuonna väistyvä mallissa, kun

p21

rs3176352 GG /GC genotyypit käytettiin vertailuryhmään, CC homotsygoottinen genotyyppi liittyi 63% suurempi riski ESCC (CC vs. GG /GC: säätää OR = 1,63, 95% CI = 1,23-2,15,

p

= 0,0006) (taulukko 3).

Kun

p73

rs1801173 CC homozygoottisia genotyyppi käytettiin kuten vertailuryhmään, CT genotyyppi liittyi merkitsevästi lisääntynyt riski ESCC (CT vs. CC: säätää OR = 1,39, 95% CI = 1,10-1,76,

p

= 0,006); TT genotyyppi ei liittynyt vaaraa ESCC. Vuonna hallitseva mallissa

p73

rs1801173 CT /TT-variantit liittyi merkitsevästi lisääntynyt riski ESCC (CT /TT vs. CC: säätää OR = 1,37, 95% CI = 1,10-1,72,

p

= 0,006), verrattuna

p73

rs1801173 CC-genotyyppi. Vuonna väistyvä mallissa, kun

p73

rs1801173 CC /TT-genotyyppien käytettiin vertailuryhmään, TT homotsygoottinen genotyyppi ei liittynyt vaaraa ESCC (taulukko 3).

Kun

p21

rs1801270 CC homozygoottisia genotyyppi käytettiin vertailuryhmään, AA genotyyppi liittyi merkittävästi vähentynyt riski ESCC. Kun

TP53BP1

rs560191 GG /GC genotyypit käytettiin vertailuryhmään, CC genotyyppi liittyi merkittävästi vähentynyt riski ESCC (taulukko 3). Logistinen regressio analyysit paljastivat, että

p21

rs2395655 G A,

p21

rs1059234 C T,

p21

rs762623 C A ja

p53

rs1042522 G C polymorfiat eivät liittyneet riskiä ESCC (taulukko 2). Kun Bonferroni korjauksen (lukumäärä mutiple testi = 32), ja

p21

rs3176352 G C, soviteltu

p

= 0,096 CC vs. GG, säädettiin

p

= 0,0192 SK vs. GG /GC. Sillä

p73

rs1801173 C T,

p

oikea = 0,202 CT vs. CC jälkeen ikä- et al.,

p

oikea = 0,195 CT /TT vs. CC. Muilta 6 SNP, kaikissa verrattuna malleissa,

p

0,05.

Kun

p21

rs3176352 CC genotyyppi ja

p73

rs1801173 CT /TT genotyypit pidetään riski variantti genotyypit. Kun ole vaaraa variantti genotyyppi kantaja ryhmää käytettiin vertailukohtana ryhmä, joko yhden riskin variantti genotyyppi operaattorin ryhmä (oikaistu OR = 1,42, 95% CI = 1,12-1,80,

p

= 0,0035) ja molemmat riski variantti genotyyppien operaattorin ryhmä (oikaistu OR = 2,47, 95% CI = 1,60-3,82,

p

0,0001) liittyi merkittävästi lisääntynyt riski ESCC.

Jaottelu analyysejä p21 rs3176352 G C ja p73 rs1801173 C T polymorfismin ja riski ESCC

vaikutusten arvioimiseksi

p21

rs3176352 G C genotyypit on ESCC riskin mukaan eri ikä, sukupuoli, tupakointi ja alkoholin juominen asema; suoritimme osituksen analyysit. Merkitsevästi lisääntynyt riski ESCC liittyvä

p21

rs3176352 G C polymorfismin näkyi kaikkien alaryhmien paitsi naispotilaiden jälkeen ositus (taulukko S1). Merkitsevästi vähentynyt riski ESCC liittyvä

p73

rs1801173 C T polymorfismin näkyi ikääntyneiden potilaiden, naisten ja potilailla, jotka eivät koskaan juominen tai tupakointi (taulukko S2).

Keskustelu

tässä sairaalan johdolla tapauskontrollitutkimuksessa of ESCC, huomasimme, että

p21

rs3176352 CC ja

p73

rs1801173 CT /TT genotyypit liittyy suurentunut ESCC; myönteisiä tuloksia havaittiin myös genotyypin yhdistelmänä analyysiin. Parhaan tietomme mukaan tämä on ensimmäinen positiivinen yhdistys

p21

rs3176352 G /C ja

p73

rs1801173 C /T polymorfismien kanssa ESCC riski.

P21 on sykliinistä riippuvainen kinaasi-inhibiittori. On havaittu, että monia erilaisia ​​syöpiä, p21 ilmentyminen on muuttunut. Tällä G1 vaiheessa p21-proteiini häiritsee solusyklin etenemisen [25], [26]. Sitoutuminen tuumorisuppressoriproteiinia p53 p21-promoottorin indusoimiseksi p21 ilmentymistä [27].

P21

rs3176352 G /C (IVS2 + 16 G C) sijaitsee intronin 2

p21

, 16 emäsparia alavirtaan liittämiseen sivustosta. Tämä C-to-G siirtymisen ennustetaan vaikuttavan

p21

lähetti-RNA silmukointi [28]. Choi

et al.

Osoitti, että

p21

rs3176352 G /C polymorfismin näytti olevan kytkentäepätasapainossa kanssa Ser31Arg on Korean väestöstä. Analyysi tämän haplotyypin keuhkosyöpään alttius osoitti suojaava vaikutus, joka oli riippuvainen määrästä variantin alleeleja. Aiemmassa tutkimuksessa, johon osallistui 80 ruokatorven syöpäpotilaille ja 200 syöpää vapaa säätimet Ningxia alueen Kiina,

p21

rs3176352 G /C polymorfismi ei liittynyt ruokatorven syöpäriski [29]. A case-control tutkimus Northeastern Iranista, 126 tapausta ja 100 kontrollia, tehtiin havaitsemiseksi yhteenliittymien

p21

polymorfismien (rs1801270 ja rs1059234) kanssa ESCC riski [30]. Tiedot ehdotti, että nämä kaksi

p21

polymorfismien, sekä yksinään että yhdistelmänä, ei ESCC geneettinen alttius biomarkkereita, joka suostuu meidän tuloksia.

P73, p53 homologi, on joitakin p53- kuten toimintaa ja tärkeä rooli moduloimaan solusyklin, apoptoosin ja DNA: n korjaukseen. Vuonna yleisyydestä alueella Kiinassa,

p73

polymorfiat eivät liittyneet ESCC alttiuteen [31]. Kuitenkin meidän tulokset ovat luotettavampia, koska korkeammat numerot tapausten ja valvontaa.

p73

rs1801173 C /T polymorfismin pohdittava vielä toiminnallinen tutkimus valottaa etiologia tämän SNP ja ESCC.

taajuudet geneettisten polymorfismien vaihtelevat usein etnisten ryhmien välillä. Esillä Kiinan tutkimuksessa alleelin taajuus

p21

rs3176352 C oli 0.410 686 verrokeilla, mikä on sopusoinnussa arvojen raportoidaan SNP tietokantaan Kiinan Han (0,422) ja Japani populaatiot (0,455) korkeampi kuin Saharan eteläpuolisen Afrikkalainen (0,233) väestö ja Afrikkalainen Amerikan väestöstä (0.250), ja kuitenkin alhaisempi kuin Euroopan väestöstä (0,758). Alleeli taajuus

p73

rs1801173 T oli 0,230 vuonna 686 verrokeilla, mikä on sopusoinnussa arvojen raportoidaan SNP tietokantaan CHB + JPT (Chinese Han + japani) populaatiot (0,267), suurempi kuin että Saharan eteläpuolisen Afrikkalainen (0,102) väestö ja Euroopan väestöstä (0,150).

Tämä tapauskontrollitutkimuksessa oli useita rajoituksia. Ensinnäkin, koska potilaiden ja verrokkien otettiin sairaaloista, luontainen bias voivat aiheuttaa vääriä päätelmiä. Toiseksi polymorfismit tutkittiin saa tarjota kattava kuva

p21

,

p53

,

TP53BP1

ja

p73

geneettinen vaihtelu. Fine-kartoitus tutkimukset tarpeellisia. Kolmanneksi, koska kohtalainen otoskoko ja ilman validointi kohortin tilastollinen teho oli rajoitettu. Lopuksi virusinfektiot ja immuunijärjestelmän parametrit tietoja ei ollut saatavilla, mikä voima analyysien rajoitettiin.

Yhteenvetona Tutkimuksemme tarjoaa vahvaa näyttöä siitä, että

p21

rs3176352 G /C ja

P73

rs1801173 C /T polymorfismit voivat myötävaikuttaa ESCC riskiä. Kudosspesifisiä biologisia ominaisuuksia ja replikointi tutkimukset suurempien väestö on vahvistettava havaintomme.

tukeminen Information

Taulukko S1.

Ositettu analyysit välillä

p21

rs3176352 G C polymorfismia ESCC riski sukupuolen, iän, tupakoinnista ja alkoholin kulutusta.

doi: 10,1371 /journal.pone.0096958.s001

( DOCX) B Taulukko S2.

Ositettu analyysit välillä

p73

rs1801173 C T polymorfismin ja ESCC riski sukupuolen, iän, tupakoinnista ja alkoholin kulutusta.

doi: 10,1371 /journal.pone.0096958.s002

( DOC)

Data S1.

Tiedot p21, p53, TP53BP1 ja p73 polymorfismien.

doi: 10,1371 /journal.pone.0096958.s003

(SAV) B

Kiitokset

Olemme kiitollisia kaikesta potilaalla, jotka osallistuivat tähän tutkimukseen. Haluamme kiittää tohtori Yiqun Chen (Biowing Applied Biotechnology Company, Shanghai, Kiina) teknistä tukea.