Krooninen sairaus

tiivistelmä

Background

Aikaisemmat tutkimukset assosiaatiosta röntgen korjaus rajat täydentävät ryhmä 1 (XRCC1) Arg194Trp, Arg399Gln, ja Arg280His polymorfismien kanssa pään ja kaulan alueen syöpä (HNC) ovat tuottaneet ristiriitaisia ​​tuloksia. Tavoitteena tässä tutkimuksessa oli arvioida vaikutuksia näiden kolmen polymorfisia variantteja on HNC riskiä.

Methods

PubMed ja EMBASE tietokannoista etsittiin geneettinen yhdistyksen tutkimuksia XRCC1 Arg194Trp, Arg399Gln ja Arg280His polymorfismit ja HNC riski. (Edellisessä haussa suoritettiin 20. elokuuta, 2013.) Kaksikymmentäkuusi tutkimuksia tunnistettiin ja meta-analyysi suoritettiin arvioimaan assosiaatio polymorfismin ja HNC laskemalla yhdistetty kertoimet suhdeluvut ja 95%: n luottamusväli.

tulokset

Ei merkittävää yhteyttä löytynyt alla alleelista, homotsygoottinen, heterotsygootti, ja hallitseva geneettinen malleja kokonaisvertailussa. Lisäksi mitään merkittävää assosiaatio XRCC1 Arg399Gln ja Arg280His polymorfismien ja HNC riski havaittiin alle neljä geneettinen mallia alaryhmäanalyyseissa etnisin perustein, syöpämuodon, ja onko tutkimuksia oikaistiin tupakointi ja alkoholin. Kuitenkin kerrostunut analyysit perustuvat syöpämuodon merkittävä assosiaatio välillä havaittiin XRCC1 Arg194Trp polymorfismi ja suusyövän alla alleelista, heterotsygootti, ja hallitseva malleja. XRCC1 Arg194Trp polymorfismi merkitsevästi yhteydessä HNC riskin tutkimuksissa, jotka oikaistiin tupakointi ja alkoholin alle homotsygoottinen ja heterozygoottiset malleja.

Johtopäätös

Meta-analyysin tulokset osoittavat, että XRCC1 Arg399Gln ja Arg280His polymorfismit luultavasti ei liity vaaraa HNC, mutta XRCC1 Arg194Trp polymorfismi liittyi suurentunut HNC alaryhmässä analyysin tutkimusten oikaistuna tupakointi ja alkoholin sekä lisääntynyt riski suun syövän kerrostunut analyysit perustuvat syöpämuodon . Lisätutkimukset suurempia näytteitä tarvitaan vahvistaa näitä havaintoja.

Citation: Wu W, Liu L, Yin Z, Guan P, Li X, Zhou B (2014) Association of X-Ray Repair Cross-täydennykseksi Group 1 Arg194Trp, Arg399Gln ja Arg280His polymorfismit Head and Neck Cancer Herkkyys: meta-analyysi. PLoS ONE 9 (1): e86798. doi: 10,1371 /journal.pone.0086798

Editor: Xifeng Wu, MD Anderson Cancer Center, Yhdysvallat

vastaanotettu: 30 elokuu 2013; Hyväksytty: 13 joulukuu 2013; Julkaistu: 30 tammikuu 2014

Copyright: © 2014 Wu et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä tutkimus tukivat apurahan no. 81272293 National Natural Science Foundation of China, myönnä. 81102194 National Natural Science Foundation of China. Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

Pään ja kaulan alueen syöpä (HNC), mukaan lukien syövät suuontelon, nielun (muut kuin nenänielun), ja kurkunpään, on kuudes yleisin syöpä maailmassa [1]. Noin 540000 uutta tapausta ja 271000 kuolemantapausta raportoidaan vuosittain maailmanlaajuisesti, mikä osoittaa kuolleisuus on noin 50% [2]. HNC pidetään monimutkainen sairaus, koska sekä geneettisiä ja ympäristöön liittyvien riskitekijöiden osaltaan sen etiologiassa [3]. Pääasiallinen riskitekijöitä HNC sisältävät tupakan ja alkoholin käyttö sekä altistuminen ihmisen papilloomaviruksen (HPV), joka yhdessä edistää vähintään 90% okasolusyöpä pään ja kaulan asioissa [1]. Lisäksi monet viimeaikaiset tutkimukset ovat osoittaneet, että geneettiset tekijät, kuten suvussa [4] ja polymorfismit geenit [5] – [8] tärkeitä rooleja kehittämisessä HNC.

Viimeaikaiset todisteet osoittavat, että DNA: n korjaukseen geeneissä voi määrittää yksilöllinen herkkyytensä HNC [9], [10]. Polymorfismien korjaavien geenien, jotka koodaavat entsyymejä voivat lisätä tai vähentää DNA korjaus kapasiteetti. DNA korjaukseen liittyvän reitin liittyy suoraan kääntyminen koulutusjakson, elimen irrottamisesta korjaukseen liittyvän reitin, ja post-replikointi /ohitus kautta. Elimen irrottamisesta korjaukseen liittyvä reitti sisältää pohjan Leikkauskorjauksessa (BER), nukleotidi leikkaaminen korjaus, ja epäsuhta korjaus [11]. X-ray korjaus rajat täydentävät ryhmä 1 (XRCC1) on tärkeä DNA: n korjaukseen proteiinia BER koulutusjakson [12]. In vitro ja in vivo tutkimukset ovat osoittaneet, että XRCC1 on rooli joko suoraan korjauksen aikana yhden säikeen katkoksia tai epäsuorasti aikana BER. Menetys XRCC1 aktiivisuuden alensivat geneettinen pysyvyys, mukaan lukien useammin spontaani ja /tai indusoi kromosomi translokaatioita ja poistot [13] – [16]. Vaikka yli 200 yhden nukleotidin polymorfismien (SNP: t) on havaittu XRCC1, vain kolme yhteistä SNP on laajalti tutkittu syövän riskiä. Ne ovat Arg194Trp (rs1799782), Arg280His (rs25489), ja Arg399Gln (rs25487), joka sijaitsee eksonit 6, 9, ja 10, vastaavasti, XRCC1 geenin [3]. In HapMap (https://snp.cshl.org/cgi-perl/gbrowse/hapmap24_B36/), vähäinen alleelin taajuus (MAF) on Arg194Trp on 0,09 valkoihoiset ja 0,26 Aasialaisille; MAF on Arg399Gln on 0,37 valkoihoiset ja 0,26 Aasialaisille; ja MAF on Arg280His on 0,04 valkoihoiset ja 0,09 aasialaiset. Joissakin tutkimuksissa raportoitu assosiointi Arg194Trp [8], [17], Arg280His [17], [18], ja Arg399Gln [19], [20] polymorfismien kanssa riskiä erilaisiin syöpiin.

aikoina, eli Monissa tutkimuksissa on raportoitu yhdistyksen välillä XRCC1 polymorfismien ja HNC riski, mutta tulokset ovat ristiriitaisia. Tea et al. [9] ja Ramachandran et al. [10] totesi, että Arg194Trp polymorfismi voisi lisätä HNC riskiä, ​​kun taas Matullo et al. [21] raportoitu päinvastainen havainto. Funktio Arg280His polymorfismin ei vieläkään täysin ymmärretä. Chuang et al. [22], joilla yhdistetyn analyysin ja totesi, että harvinaiset XRCC1 Arg280His homozygoottien liittyivät HNC riski oikaistu tupakointi ja alkoholin kulutus, kun taas muissa tutkimuksissa ei tällaista havaittu yhteyttä [9], [23] – [25] . Sillä Arg399Gln polymorfismi, tulokset ovat vielä kiistanalaisia ​​[10], [11], [24]. Siksi teimme meta-analyysi arvioida assosiaatiota XRCC1 Arg194Trp, Arg280His ja Arg399Gln polymorfismien ja HNC riskiä.

Materiaalit ja menetelmät

Haku Strategia

Haimme PubMed ja EMBASE tietokantoja kaikki geneettiset yhdistyksen tutkimuksia XRCC1 ja HNC riski. (Edellisessä haussa tehtiin 20 elokuu 2013). Erilaisia ​​yhdistelmiä seuraavia termejä käytettiin hakusanalla ”pään ja kaulan alueen syöpä”, ”suun syöpä”, ”suun ja nielun syöpä”, ”kurkunpään syöpä”, ”nielun syöpä”, ”XRCC1”, ”X-ray rajat täydentävät ryhmä 1 ”,” base Leikkauskorjauksessa ”,” BER ”,” SNP ”,” yhden nukleotidin polymorfismi ”,” polymorfismi ”ja” variantti ”. Vain Englanti kieli paperit olivat mukana hakuun. Siteeratut viitteet alkuperäisessä tutkimuksessa tai tarkastelu artikkeleita aiheiden haettiin mahdollisesti laajentaa etsintää osuvilla julkaisuihin.

ja poissulkukriteereitä

Seuraavia kriteereitä käytetään valitsemaan artikkeleita meta-analyysi: (a) tapauskontrollitutkimuksessa tai kohorttitutkimuksessa menetelmää käytettiin; (B) yhdistys HNC kanssa XRCC1 Arg194Trp tai Arg399Gln tai Arg280His polymorfismien tutkittiin; ja (c) riittävät tiedot genotyyppien esittelyyn arvioitu kertoimet suhdeluvut (syrjäisimmillä alueilla) ja 95%: n luottamusvälit (CI) oli saatavilla. Poissulkukriteerit käytettiin: (a) vertailupopulaatiossa mukana pahanlaatuinen kasvain potilasta tai tutkimuksessa ei ollut valvontaa; (B) riittävästi tietoa saatavilla noin genotyyppi taajuus tai numero; (C) päällekkäisiä julkaisuja tai julkaisuja, jotka sisälsivät päällekkäisiä tietoja.

Data Extraction

Tiedot eristettiin kaikista hyväksyttävistä julkaisuista huolellisesti ja itsenäisesti kaksi tutkijaa (Wei Wu ja Lu Liu) käyttäen standardia protokollaa ja data-kerätä lomakkeelle, jonka kriteerit. Alkuperäinen purkamisdata tarkastettiin toinen tutkija (Zhihua Yin), ja erimielisyydet ratkaistiin keskustelua joukossa kolme tutkijat. Seuraavat tiedot poimittiin: nimi ensimmäinen kirjoittaja, julkaisuvuosi, etnistä tutkituissa populaatioissa, sivusto syövän, genotyypitysmenetelmää, lähde hallintalaitteiden, yhteensovitus kriteerit, säätää muuttujia, ja tapausten ja kontrollien kanssa eri genotyyppiä.

tilastollinen analyysi

Hardy-Weinberg tasapaino (HWE) testi [26] tehtiin valvontaa ryhmiä arvioimaan geneettistä tasapaino jokaisen tutkimuksen. P-arvo 0,05 otettiin osoittamaan merkittävää epätasapainoa. Välttämiseksi sisällyttämistä tuntemattoman erilaisuuteen, tutkimuksia, joissa jakelun genotyypit XRCC1 geenipolymorfismien kontrolliryhmässä ryhmissä ole yhdenmukainen HWE jätettiin seuraavassa analyysissä. MAF laskettiin kontrolliryhmissä. MAF on arvio taajuudella, jolla vähemmän yleisen alleelin esiintyy tietyssä populaatiossa. Vahvuus yhdistyksen välillä XRCC1 polymorfismin ja HNC riski arvioitiin yhdistettiin kertoimet suhdeluvut (syrjäisimmät alueet), jossa 95%: n luottamusväli (CI). Merkitys yhdistetyn syrjäisimpien alueiden määritettiin Z testi ja kaksipuolinen P arvojen 0,05 pidettiin merkittävinä. Chi-neliö-pohjainen Q tilastollinen testi käytettiin heterogeenisyys analyysiin [27]. Tässä tutkimuksessa P arvot 0,05 vietiin viittaavat merkittävään heterogeenisuus tutkimuksia. Satunnaisen vaikutusten mallia käytettiin, kun heterogeenisuus oli merkittävä [28]; muuten kiinteiden vaikutusten mallia käytettiin [29]. Heterogeenisuus tutkimuksissa havaittiin käyttäen I

2 testiä. I

2 arvot 25% katsottiin alhainen, I

2 arvoja 25%: sta 75% katsottiin kohtalainen, ja I

2 arvot 75% katsottiin korkea [30]. Laskimme OR käyttäen neljää eri geneettistä mallia: alleelinen malli (B vs. A), homotsygoottinen malli (BB vs. AA), heterotsygoottinen malli (AB vs. AA), ja hallitseva malli (BB + AB vs. AA), jossa A edustaa pääalleelille ja B edustaa pieniä alleeli. Kerrostunut analyysit Jokaisen tutkimuksen etnisyys, syöpämuodon, ja ovatko tiedot oikaistiin tupakointi ja alkoholin suoritettiin myös käyttäen neljää geneettistä mallia, tunnistaa suhde XRCC1 polymorfismin ja HNC riski. Aina kun mahdollista, oikaistu syrjäisimpien logistisen mallia käytettiin laskemaan yhdistetyn OR ja 95%: n luottamusväli tutkimuksiin oikaistuna tupakoinnin ja alkoholin. Lisäksi herkkyys analyysit tehtiin vahvistamaan vakautta ja luotettavuutta tulokset [31]. Silmämääräinen tarkastus Begg n suppilo juoni ja Egger testi käytettiin arvioimaan julkaisun bias meta-analyysi ja P-arvot 0,05 katsottiin tilastollisesti merkitsevä [32], [33]. Kaikki tilastolliset testit suoritettiin ohjelmiston Stata versio 12.0 (Stata Corporation, College Station, TX, USA).

Tulokset

Tutkimus Ominaisuudet

Yhteensä 168 voi tarvita tutkimuksia haettiin kun kattava etsimään PubMed ja EMBASE tietokantoja (kuva 1), ja 125 näistä tutkimuksista ulkopuolelle ole merkityksellinen HNC tai XRCC1 Arg194Trp, Arg280His, ja Arg399Gln polymorfismit. Lisäksi 17 tutkimusta suljettiin pois lukien kolme tarkastelua, kolme meta-analyysit, seitsemän tutkimuksissa puuttuvia tietoja yhdessä tutkimuksessa ilman valvontaa, ja kolmessa tutkimuksessa merkityksellisiä solulinjoja. Näin ollen 26 tutkimukset [9] – [11], [21], [23] – [25], [34] – [52] yhdistyksen on XRCC1 Arg194Trp, Arg280His, ja Arg399Gln polymorfismien kanssa riski HNC oli mukana meta-analyysissä. Kaksikymmentä yksi tutkimuksista oli noin XRCC1 Arg194Trp, 25 oli noin XRCC1 Arg399Gln, ja yhdeksän oli noin XRCC1 Arg280His (kuva 1).

ominaisuudet 26 voivat selvitykset, myös julkaisuvuosi, etnistä tutkituissa populaatioissa, sivusto syövän, menetelmän genotyypityksen, lähde hallintalaitteiden, yhteensovitus kriteerit, oikaistu muuttujia, tapausten ja kontrollien eri genotyyppejä, HWE kontrolleissa ja MAF vuonna säätimet XRCC1 Arg194Trp, Arg399Gln, ja Arg280His polymorfismit luetellaan taulukoissa 1-3 vastaavasti. Kaikki tutkimukset julkaistiin vuosina 1999 ja 2013. Yleisimmin käytetty genotyypitysmenetelmää oli polymeraasiketjureaktio (PCR) -restriction fragmentti pituus polymorfismi. Jakelu genotyypit XRCC1 Arg194Trp, Arg280His, ja Arg399Gln polymorfismien kontrolliryhmissä oli yhdenmukainen HWE, lukuun ottamatta kolmen tutkimuksen. Kaksi näistä tutkimuksista liittyivät Arg194Trp polymorfismin [37], [43], ja yksi liittyi Arg399Gln polymorfismin [51]. Nämä tutkimukset jätettiin myöhemmin analyysit. Lopuksi analysoida yhdistys kolmen XRCC1 polymorfismien kanssa riski HNC, 19 tutkimukset valittiin Arg194Trp, 24 tutkimukset valittiin Arg399Gln, ja yhdeksässä tutkimuksessa valittiin Arg280His.

Quantitative Data Synthesis

XRCC1 Arg194Trp: Kun yleinen vertailun vuoksi Arg194Trp polymorfismi ei merkittävästi liittynyt HNC riskin varalta neljä eri geneettisten mallit (kuva 2). Edelleen alaryhmäanalyyseissa etnisin perustein, The Arg194Trp polymorfismi havaittiin olevan riskitekijä aasialaiset kun se oli suojaava tekijä valkoihoisista kaikissa geneettinen mallit; kuitenkin, assosiointi Arg194Trp polymorfismin kanssa HNC riski aasialaisilla ja valkoihoisilla ei ollut merkittävä (taulukko 4). Vuonna kerrostunut analyysit perustuvat syövän sivustosta, Arg194Trp polymorfismi merkitsevästi yhteydessä suusyövän käyttäen alleelista, heterotsygootti, ja hallitseva mallit (alleelinen malli: OR = 1,35, 95% CI = 1,00-1,82, I

2 = 63,5 %,

P

heterogeenisyys

= 0,02; heterotsygoottianalyysiin malli: OR = 1,40, 95% CI = 1,13-1,73, I

2 = 28,5%,

P

heterogeenisyys

= 0,22, hallitseva malli: OR = 1,40, 95% CI = 1,14-1,72, I

2 = 53,1%,

P

heterogeenisyys

= 0,06), mutta ei merkittävästi liittynyt suusyövän käyttäen homotsygoottinen mallia. Arg194Trp polymorfismi ei ole merkittävästi yhteydessä kurkunpään syövän kaikkien neljän geneettisissä malleissa (taulukko 4). Kun analyysit tutkimuksista oikaistuna tupakoinnin ja alkoholialan Arg194Trp polymorfismi merkitsevästi yhteydessä HNC riskin varalta homotsygoottinen ja heterozygoottiset mallit (homotsygoottinen malli: OR = 2,21, 95% CI = 1,44-3,38, I

2 = 0,0% , P

heterogeenisyys = 0,50; heterotsygoottianalyysiin malli: OR = 1,65, 95% CI = 1,15-2,38, I

2 = 50,0%, P

heterogeenisyys = 0,01), mutta yhdistys ei ollut merkittävää alla hallitseva malli. Kun tutkimuksia ei oikaistu tupakointia ja alkoholialan Arg194Trp polymorfismi ei merkittävästi liittynyt HNC riski jollakin neljästä geneettisten mallien (taulukko 4).

metsäviljelmien varten: Trp vs. Arg; b: TrpTrp vs. ArgArg; c: ArgTrp vs. ArgArg; d: TrpTrp + ArgTrp vs. ArgArg. Random-tehosteet malleja käytettiin a, c, ja d; kiinteän vaikutukset mallia käytettiin b. Ruudut ja vaakasuorat viivat edustavat tutkimuksittain OR ja 95%: n luottamusväli vastaavasti; timantti osoittaa yhteenvedon OR ja 95%: n luottamusväli.

XRCC1 Arg399Gln: Kun yleinen Vertailun vuoksi Arg399Gln polymorfismi ei merkittävästi liittynyt HNC riskin varalta neljä eri geneettisten mallia (kuva 3) . Edelleen alaryhmäanalyyseissa etnisin perustein, The Arg399Gln polymorfismi ei merkittävästi liittynyt HNC riski aasialaisilla tai valkoihoisilla (taulukko 4). Vuonna kerrostunut analyysit perustuvat syövän sivustosta, Arg399Gln polymorfismi ei merkittävästi liittynyt suusyövän tai kurkunpään syöpä (taulukko 4). Kun tutkimukset joko säätää tai korjaamattomissakin tupakoinnin ja alkoholin oli analysoitu, Arg399Gln polymorfismi ei merkittävästi liittynyt HNC riski (taulukko 4).

metsäviljelmien varten: Gln vs. Arg; b: GlnGln vs. ArgArg; c: ArgGln vs. ArgArg; d: GlnGln + ArgGln vs. ArgArg. Random-tehosteet malleja käytettiin c ja d; kiinteiden vaikutusten malleissa käytettiin a ja b. Ruudut ja vaakasuorat viivat edustavat tutkimuksittain OR ja 95%: n luottamusväli vastaavasti; timantti osoittaa yhteenvedon OR ja 95%: n luottamusväli.

XRCC1 Arg280His: Kun yleinen Vertailun vuoksi Arg280His polymorfismi ei merkittävästi liittynyt HNC riskin varalta neljä eri geneettisten mallia (kuva 4). Edelleen alaryhmäanalyyseissa etnisin perustein, The Arg280His polymorfismi ei merkittävästi liittynyt HNC riski aasialaisilla tai valkoihoisilla (taulukko 4). Vuonna kerrostunut analyysit perustuvat syövän sivustosta, Arg280His polymorfismi ei merkittävästi liittynyt suusyövän (taulukko 4). Kun tutkimukset joko säätää tai korjaamattomissakin tupakoinnin ja alkoholin oli analysoitu, Arg280His polymorfismi ei merkittävästi liittynyt HNC riski (taulukko 4).

metsäviljelmien varten: His vs. Arg; b: HisHis vs. ArgArg; c: ArgHis vs. ArgArg; d: HisHis + ArgHis vs. ArgArg. Kiinteiden vaikutusten malleissa käytettiin a, b, c, ja d. Ruudut ja vaakasuorat viivat edustavat tutkimuksittain OR ja 95%: n luottamusväli vastaavasti; timantti osoittaa yhteenvedon OR ja 95%: n luottamusväli.

heterogeenisuus Analysis

Todiste heterogeenisyys välillä tutkimusten meta-analyysissä havaittiin varten XRCC1 Arg194Trp, ja Arg399Gln, mutta syyt heterogeenisyys olivat epäselviä. Vuonna alaryhmäanalyyseissa merkittävää heterogeenisyyttä löytyi tutkimuksissa käytetty aasialaisilla, mutta ei tutkimuksissa käytetty valkoihoisilla, mikä osoittaa, että julkaisuista käytetty aasialaiset olivat luultavasti päälähde heterogeenisyys tutkimuksessamme. Lisäksi merkittävä heterogeenisyys havaittiin tutkimuksissa keskuudessa suusyöpä mutta ei kurkunpään syöpiä, mikä osoittaa, että julkaisuista joka keskittyi suusyöpä olivat toinen todennäköinen lähde heterogeenisyys. HNC sisältää syövät eri paikoissa ja riskitekijöitä näiden syöpien ovat erilaiset. Siksi lisätutkimukset kanssa suurempi otoskoko ja erilaiset tuumorikohdat tarvitaan tutkia mahdolliset lähteet heterogeenisyys.

Herkkyysanalyysi

Herkkyysanalyysit tehtiin arvioimaan vaikutuksen yksittäisten tutkimuksia yhdistetyt syrjäisimmät alueet jättämällä kunkin tutkimuksen vuorollaan. Kaikkien kolmen polymorfismien kaikkien neljän geneettinen mallia merkitys yhdistetyn syrjäisimpien ei olennaisesti muuttunut miltään henkilökohtaisen opintosuunnitelman (tuloksia ei ole esitetty). Tämä tulos osoitti, että tulokset olivat tilastollisesti varmana. Kuvassa S1 esittää herkkyysanalyysissä XRCC1 Arg194Trp mukaisesti saatuja alleelinen malli poistamalla yhtä tutkimusta kerrallaan.

Julkaisu Bias

Begg n suppilo juoni ja Egger testi käytettiin arvioida julkaisun bias kirjallisuudessa. Kaikki kolme polymorfismien, muodot Begg n suppilon koealojen kaikkien neljän geneettisissä malleissa ei havaittu selvää epäsymmetria. Kuvassa S2 esitetään muodon Begg n suppilo kuvaaja XRCC1 Arg399Gln alla hallitseva malli. Egger testi myös ei paljastanut merkittäviä todisteita julkaisun bias kolmen polymorfismien kaikissa neljässä geneettiset mallit (tuloksia ei esitetty); yksi poikkeus oli XRCC1 Arg280His alle heterozygoottiset malli (t = -2,56, p = 0,037). Olemme kuitenkin löytäneet mitään merkittävää eroa korjataan OR ja korjaamatta tai leikata ja täytä analyysi, joka tuki luotettavuutta havaintomme.

Keskustelu

Kun yleinen Vertailun meta- analyysi ei havaittu merkitsevää yhteyttä välillä XRCC1 Arg194Trp, Arg399Gln ja Arg280His polymorfismit ja HNC riski kaikissa neljässä geneettinen mallia. Edelleen alaryhmäanalyyseissa etnisin perustein, syöpämuodon, ja onko säätää tai korjaamattomissakin tupakoinnin ja alkoholin, mitään merkittävää yhdistyksen välillä havaittiin XRCC1 Arg399Gln, ja Arg280His polymorfismit ja HNC riskin varalta neljä geneettinen mallia. Kuitenkin kerrostunut analyysit perustuvat syöpämuodon, merkittävää yhteyttä välillä havaittiin XRCC1 Arg194Trp polymorfismi ja suusyövän alla alleelista, heterotsygootti, ja hallitseva malleja. Kun tutkimukset oikaistu tupakointi ja alkoholin analysoitiin, merkittävää yhteyttä välillä havaittiin XRCC1 Arg194Trp polymorfismi ja HNC riskin varalta homotsygoottinen ja heterotsygootti malleja. Tuloksemme osoittivat, että vaikka XRCC1 Arg399Gln ja Arg280His polymorfismit ei saa lisätä tai vähentää riskiä HNC, kun tupakointi ja alkoholin kulutus on otettu huomioon, XRCC1 Arg194Trp polymorfismi liittyi suurentunut HNC ja saattaa myös moduloida geneettinen alttius suun syöpä.

XRCC1Arg194Trp polymorfismi sijaitsee alueella proteiini, joka erottaa DNA-polymeraasi-b ja poly (ADP-riboosi) polymeraasi-vuorovaikutuksessa aloilla. Tae et ai. raportoitu erittäin merkitsevä yhteys alla hallitseva geneettinen malli XRCC1 Arg194Trp suurentunut riski okasolusyöpä pään ja kaulan keskuudessa Korean potilaiden ja normaalit kontrollit [9]. Kuitenkin useimmat muut tutkimukset ovat löytäneet yhdistys XRCC1 Arg194Trp kanssa HNC riski [11], [24], [25], [34], [35], [40], [46], [48]. Esillä olevassa tutkimuksessa, kiehtova havainto oli, että Arg194Trp polymorfismi oli riskitekijä aasialaisilla ja suojaavana tekijänä valkoihoisilla kaikissa neljässä geneettinen mallia; kuitenkin, nämä yhdistykset eivät olleet tilastollisesti merkitseviä. Tämä havainto on saattanut sattumaa, tai saattanut aiheuttaa eri geenistä taajuuksia eri populaatioissa; MAF on XRCC1 Arg194Trp on 0,26 Aasialaisille mutta vain 0,09 valkoihoisilla. Useat tutkimukset ovat raportoineet yhdistyksen välinen XRCC1 Arg194Trp polymorfismi ja suun syöpäriski [10], [39], [41], [43], [44], [51]. On raportoitu, että XRCC1 Arg194Trp polymorfismi voi johtaa alentuneeseen korjaus tehokkuutta DNA-vaurioita, ja korjaus vaje voi lopulta lisätä yksilön herkkyys suusyövän [53], [54]. Meidän alaryhmä meta-analyysi, me myös havainneet yhdistys XRCC1 Arg194Trp suun kautta syöpäriskiä. Olemme havainneet, että alla alleelinen mallia. Trp alleelin kantajia oli suurempi riski suusyövästä kuin Arg alleelin kantajia. Huomasimme myös, että yksilöiden Arg /Trp genotyyppi oli suurempi riski sairastua suun syöpä alle heterozygoottiset mallia; mutta tämä yhdistys ei havaittu alle homotsygoottinen mallia. Me spekuloida, että tärkein syy tähän havainto saattaa olla alhainen esiintyminen Trp /Trp genotyypin tutkimuksessa väestö; todellakin, useissa tutkimuksissa, määrä Trp /Trp-genotyyppi oli raportoitu olevan nolla. Alhainen esiintyminen Trp /Trp genotyyppi johtaa huonoon tilastollinen voima. Alle hallitseva malli, kun Trp /Trp ja Arg /Trp genotyypit analysoitiin yhdessä, yhdistys Arg /Trp genotyypin kanssa suusyövän oli edelleen tilastollisesti merkitsevä. Tämä havainto on sopusoinnussa meidän spekuloidaan, että heterozygoottiset ja homozygoottisia mallit antoivat erilaisia ​​tuloksia koska alhainen esiintyminen Trp /Trp genotyypin tutkimuksessa väestöstä. Tämä hypoteesi on testattava suurempi otoskoko tulevissa tutkimuksissa.

XRCC1 Arg399Gln polymorfismi sijaitsee sinkkisormen domain-alue (PARP sitomiskohta) proteiinin, joka havaitsee DNA katkeamisen [55] . Kantajia Tämän variantin osoitettiin olevan korkeampi DNA additiotuotteiden [56] ja tupakkaan liittyvien DNA-vaurioita [46], [57] – [59]. XRCC1 Arg399Gln on raportoitu merkittävästi liittyvät riskit mahalaukun [60], keuhko [61], ja peräsuolen [20] syöpiä. Ramachandran et al. havaitsivat, että XRCC1 Arg399Gln polymorfismi liittyi suurentunut suun syövän Intian väestöstä [10], kun taas Kostrzewska-Poczekaj et al. todettiin, että XRCC1 Arg399Gln oli suojaavana tekijänä okasolusyöpään pään ja kaulan nuorilla aikuisilla [52]. Useimmat muut tutkimukset ovat osoittaneet mitään merkittävää yhdistyksen XRCC1 Arg399Gln kanssa HNC riski [9], [25], [34],. Tässä tutkimuksessa olemme myös löytäneet yhdistyksen välillä XRCC1 Arg399Gln ja HNC riski kaikissa neljässä geneettinen mallia.

XRCC1 Arg280His polymorfismi sijaitsee lisääntyvän solun tuma-antigeenin sitova alue [62] in apurinic /apyrimidinic endonukleaasi (APE) sitovan kohdan domeeni [54], [63]. Arg280His polymorfismi voisi mahdollisesti muuttaa rakennetta XRCC1 ja vaikuttaa sen kyky olla vuorovaikutuksessa APE [54], [64]. Toiminnalliseen tutkimuksessa XRCC1 proteiinin kuljettavat His 280 ei pelastaa yksittäisen juosteen murtuman korjautumisessa puutos mutanttien solujen silloin kun ihmisen XRCC1 muunnosproteiineihin tuotu XRCC1 mutantti kiinanhamsterin munasarjasolut [65]. Vaikka toiminnallinen tutkimukset paljastivat mahdollinen mekanismi assosiointi XRCC1 Arg280His polymorfismi syöpäriskiä, ​​meidän meta-analyysi ei havainnut merkittävää yhdistyksen välillä XRCC1 Arg280His ja HNC riski. Tämä null tulos voi johtua rajallinen määrä tutkimuksia, jotka olivat mukana analyysimme. On selvää, suurempi otoskoko tarvitaan selventämään assosiaatiosta XRCC1 Arg280His polymorfismi kanssa HNC riski.

Vaikka teimme kattava analyysi, tutkimuksemme on useita rajoituksia. Ensinnäkin, vain rajoitettu määrä tukikelpoisia tutkimuksia löydetty ja niin otoskoko oli suhteellisen pieni. Siksi varsinkin kerrostunut analyysit, yhdistys havaittu tutkimuksessamme saattanut tapahtua sattumalta. Toiseksi, koska lähes kaikki tutkimukset, jotka valittiin meta-analyysissä oli tapaus-verrokki tutkimuksessa potilaat olivat syövän sairastaneet potilaat, jotka eivät selvinneet eivät sisälly. Tämän seurauksena valinta /selviytyminen bias ei voitu välttää.

Yhteenvetona meta-analyysissä ei havaittu assosiaatio XRCC1 Arg399Gln ja Arg280His polymorfismit ja riski HNC. Kuitenkin alaryhmäanalyyseissa tutkimusten oikaistuna tupakoinnin ja alkoholialan XRCC1 Arg194Trp polymorfismi liittyi suurentunut HNC, ja kerrostunut analyysit perustuvat syöpämuodon, XRCC1 Arg194Trp liittyi suurentunut suun syöpä. Lisätutkimukset suurempia näytteitä tarvitaan arvioida tarkemmin yhdistyksen välillä XRCC1 polymorfismien ja HNC riskiä.

tukeminen Information

Kuva S1.

herkkyysanalyysi XRCC1 Arg194Trp käyttäen alleeliset mallia.

doi: 10,1371 /journal.pone.0086798.s001

(DOC) B Kuva S2.

Begg n suppilo juoni Julkaisun bias testi XRCC1 Arg399Gln käyttäen hallitseva mallia.

doi: 10,1371 /journal.pone.0086798.s002

(DOC)

täydennysosa S1.

PRISMA tarkistuslista.

doi: 10,1371 /journal.pone.0086798.s003

(DOC)

täydennysosa S2.

PRISMA Vuokaavio.

doi: 10,1371 /journal.pone.0086798.s004

(DOC) B