Krooninen sairaus

tiivistelmä

Background

TNFAIP2

on ratkaiseva geeni mukana apoptoosin. Yhden emäksen monimuotoisuus (SNP) sen miRNA sitoutumiskohdista pystyi mukauttamaan toimintoja miRNA-kohdegeeneissä ja siten riski syöpiä. Tässä tutkimuksessa selvitettiin assosiaatioita potentiaalisesti toiminnallinen SNP miRNA sitoutumiskohdat 3’UTR

TNFAIP2

ja mahalaukun syövän riski on Yhdysvaltain väestöstä.

Methods

Teimme tapauskontrollitutkimuksessa 301 mahasyöpäpotilaista ja 313 syöpää vapaa valvonta taajuus-iän, sukupuolen ja etnisen alkuperän. Me genotyyppi neljä valittu

TNFAIP2

SNP (rs8126 T C, rs710100 G A, rs1052912 G A ja rs1052823 G T) ja käytti regressioanalyysimme arvioida näiden yhteenliittymät SNP syöpäriskiä.

tulokset

rs8126 CC genotyyppi liittyi merkittävästi kohonnut mahalaukun syövän riski (oikaistu OR = 2,00, 95% CI = 1,09-3,64 ja

P

= 0,024) verrattuna yhdistetyn rs8126 TT + TC genotyyppejä, erityisesti nykyisessä juovat. Kuitenkaan mikään muu

TNFAIP2

SNP liittyi mahasyöpäriski.

Johtopäätökset

tiedot osoittivat, että

TNFAIP2

miRNA sitoutumiskohta rs8126 T C SNP voi olla markkeri alttiutta mahasyövän, ja tämä havainto vaatii lisävalidointia suurempien tutkimuksissa.

Citation: Xu Y, Ma H, Yu H, Liu Z, Wang LE, Tan D, et ai. (2013) miR-184 Binding-Site rs8126 T C polymorfismi

TNFAIP2

liittyy mahasyöpäriski. PLoS ONE 8 (5): e64973. doi: 10,1371 /journal.pone.0064973

Editor: Nathan A. Ellis, University of Illinois at Chicago, Yhdysvallat

vastaanotettu: 23 heinäkuu 2012; Hyväksytty 23. huhtikuuta 2013 Julkaistu: toukokuu 28, 2013

Copyright: © 2013 Xu et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä työ tukivat National Institute of Health myöntää R01 CA131274 ja R01 ES011740 (Q. Wei), ja P30 CA016672 (University of Texas MD Anderson Cancer Center). Sen sisältö ovat yksin vastuussa kirjoittajien eivätkä välttämättä edusta näkemyksiä National Institutes of Health. Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: prof Qingyi Wei alkaen M. D. Anderson Houston, Texas, on editori PLoS ONE. Tämä ei muuta tekijöiden noudattaminen kaikki PLoS ONE politiikan tietojen jakamista ja materiaaleja.

Johdanto

Mahalaukun syöpä on yksi suurimmista syistä syöpään liittyvistä kuolemantapauksista maailmassa, vaikka sekä sen ilmaantuvuus ja kuolleisuus on laskenut viimeisimmän vuosikymmenen aikana [1]. Vuonna 2010 oli noin 21.000 äskettäin diagnosoitu potilailla ja 10570 kuolemista tähän sairauteen Yhdysvalloissa [2]. Epidemiologiset tutkimukset ovat osoittaneet, että ympäristötekijät, kuten ruokavalion korkea suolattu ja nitrattuja elintarvikkeet, tupakointi, alkoholijuomat kulutusta ja etenkin

Helicobacter pylori

(

H. Pylori

) infektio, ovat tärkeitä tekijöitä varten etiologiassa mahasyövän [3]. Kuitenkin vain murto-osa ihmisten käyttöön samanlaisia ​​elämäntapojen tai altistuneet samalle ympäristö- riskitekijät lopulta kehittyi mahasyövän, mikä viittaa siihen, että isäntä tai geneettiset tekijät voivat myös olla rooli taudin etiologiaa [4].

kaikista patofysiologisia aiheuttamia muutoksia eri etiologic liittyvät tekijät syöpien, induktio oksidatiivisen DNA-vaurioita epiteelisolujen vatsan on osoitettu olevan vahva yhteys syövän synnyn [5], [6]. Estämiseksi hallitsemattomasti solun kasvua johtuvat tällaisesta DNA-vaurioita, jotkut solusyklin valvontamekanismit on aloitettava estämiseksi mutaatioiden tai aloittaa apoptoosin Solujen ylivoimainen vahinkoa DNA.

MikroRNA ( miRNA), luokka endogeenisen ja pienten ei-koodaavan sääntelyyn RNA, negatiivisesti säädellä geeniekspressiota at transkription jälkeisellä tasolla hybridisaatio täydentävien sekvenssien 3’alue (3’UTR) kohde- RNA: iden (mRNA: t) [ ,,,0],7], [8], [9], [10]. Viimeaikaiset tutkimukset ovat osoittaneet merkittäviä vaikutuksia miRNA eri biologisissa prosesseissa, kuten solujen erilaistuminen, proliferaatio, solusyklin etenemisen sekä apoptoosin. Altered ilmauksia miRNA sekä niiden mahdolliset toiminnot tuumorisuppressoreilla ja oncogenes on osoitettu useiden syöpätyyppien, kuten mahasyövän [11], [12]. Samaan aikaan useat suhteellisen yleistä geneettisiä variantteja, kuten yhden emäksen monimuotoisuus (SNP), on tunnistettu biomarkkereita geneettinen alttius syövän molekyylien epidemiologiset tutkimukset. Johtuen niiden mahdolliset vaikutukset miRNA ilmaisun ja myöhemmät vaikutukset mRNA transkriptio miRNA SNP tai miRNA liittyviä SNP, kuten sijaitsevat miRNA sitova sivustoja 3’alue (UTR) niiden kohdegeenien, ovat sekaantuneet niin ratkaisevia geneettiset tekijät alttius eri syöpiä. Koska niiden roolista syövässä etiologiassa on epäselvä, on tärkeää ymmärtää toiminnallisia ja kehittyvä merkitystä näiden miRNA liittyvien SNP läpi niiden vaikutuksia syöpäriskiin ja niiden vuorovaikutus ympäristön riskitekijöiden etiologiassa mahasyövän [13].

kuuluminen SEC6 perhe, tuumorinekroositekijä α-indusoidun proteiinin 2 (TNFAIP2, joka tunnetaan myös nimellä B94 tai EXOC3L3), joka on yksi sellainen pro-apoptoottisen proteiinin, tunnistettiin alun perin geeni, jonka ilmentyminen voidaan indusoida jonka tuumorinekroositekijä-alfa (TNFa) on napalaskimon endoteelisoluissa [14].

TNFAIP2

sijaitsee kromosomissa 14q32, ja koodaa proteiinia, joka on 654 aminohappotähdettä, jonka näennäinen molekyylipaino oli 73 kDa. Joka koostuu 11 eksonista ja 10 intronia,

TNFAIP2

ulottuu noin 13,45 kb genomista DNA: ta [15]. Vuonna dbSNP tietokanta (https://egp.gs.washington.edu/), tämä geeni on raportoitu olevan 180 SNP: iden, joista 15 SNP 3’UTR

TNFAIP2

sijaitsevat ennustettu miRNA sitoutumiskohtia, mutta vain neljä näistä miRNA liittyvän SNP: t ovat yleisiä [eli vähäinen alleelin taajuus (MMM) 0,05]. Nämä neljä SNP: t ovat rs8126 T C (sijaittava sitoutumiskohta miR-184), rs710100 G A (vajaan miR-155), rs1052912 G A (vajaan miR-105) ja rs1052823 G T (vajaan asennuspalveli- 550) (https://compbio.uthsc.edu/miRSNP) [Fig. 1A].

(A) Neljä validoitu SNP ja niiden tarkat sijainnit sisällä

TNFAIP2

3′-UTR. (B) Kytkentäepätasapaino (LD) kartta valittujen SNP

TNFAIP2

geeni. Se osoitti, että rs1052912 ja rs1052823 ovat LD kanssa D ’= 0,87.

Viimeaikaiset tutkimukset ovat osoittaneet, että nämä SNP miRNA sitoutumiskohdat saattavat liittyä ihmisen syöpäriski [15], [ ,,,0],16]. Siksi me arveltu, että

TNFAIP2

SNP liittyvät alttiuteen mahasyöpä. Tämän hypoteesin testaamiseksi teimme tapauskontrollitutkimuksessa arvioida yhdistyksen näiden neljän

TNFAIP2

SNP miRNA sitoutumiskohtiin ja mahalaukun syövän riski on USA ei-latinalaisamerikkalainen valkoisen väestön.

Materiaalit ja menetelmät

tutkimus aiheet

Tutkittavat olivat joilla on vasta diagnosoitu ja histologisesti varmennettu mahasyövän The University of Texas MD Anderson Cancer Center (Houston TX) välillä maaliskuussa 2002 ja helmikuussa 2011 jotka rekrytoitiin jatkuva tapauskontrollitutkimuksessa mahasyövän. Samaan aikaan, syöpä-vapaa verrokeilla rekrytoitiin käyttämällä taajuutta matching iän (± 5 vuotta), sukupuoli, ja etnisyys (ei-latinalaisamerikkalainen valkoiset vs. muut) meneillään olevasta molekyyliepidemiologia tutkimus pään ja kaulan alueen syöpä vuosina 2002 ja 2011 [17]. Nämä syövän vapaa verrokeilla ei ollut sairaalassa potilasta, jotka etsivät terveydenhuolto, eikä geneettisesti liity tapauksiin. Lisätietoja riskitekijöitä, kuten tupakointi ja alkoholin käyttö, kerättiin kustakin hyväksymiskelpoisiksi jotka olivat antaneet tietoon perustuvan suostumuksen. Tutkimuksen protokolla hyväksyi Teksasin yliopiston MD Anderson Cancer Center Institutional Review Board.

genotyypin

Perimän DNA uutettiin buffy coat osa kustakin verinäytteestä käyttämällä Veri Mini Kit (Qiagen, Valencia, CA) valmistajan ohjeiden mukaisesti. DNA puhtaus ja pitoisuudet määritettiin spektrofotometrisesti absorbanssin mittaus 260 ja 280 nm: ssä UV-spektrofotometrillä.

valinnut kaksi

TNFAIP2

SNP rs710100 ja rs1052912, genotyypitettiin käyttäen TaqMan menetelmää 384-kuoppalevyille ja lukea kanssa Sequence Detection Ohjelmiston ABI-Prism 7900 väline, mukaan valmistajan ohjeiden, Applied Biosystems (Foster City, CA), joka toimitti myös alukkeita ja koettimia. Jokainen levy sisälsi neljä negatiiviset kontrollit, monistaa positiiviset kontrollit ja kahdeksan toistuvaa näytteitä. Olosuhteet vahvistus olivat seuraavat: 50 ° C 2 min, 95 ° C: ssa 10 min, mitä seurasi 40 sykliä 95 ° C 15 sekuntia, ja 60 ° C 1 min.

Koska TaqMan määritys ei sovellu kahden muun SNP: eli rs8126 ja rs1052823, ne genotyypitettiin PCR-restriktiofragmenttipituuspolymorfismin menetelmä, jossa alukkeet suunniteltiin luomaan uusia restriktiokohtia ja käytettiin monistamaan fragmentteja, jotka sisältävät polymorfismit molemmille kaksi SNP:. [18] alukkeiden sekvenssit, joita käytetään genotyypin määrityksissä olivat 5′-GGGGCCGGCTCTCTTGGGCC-3 ’ja 5′-CACACGTACAAAGACCTTGGGCATCC-3′ varten rs8126, ja 5’-CCTTCGGACTCAGGCATGACTC-3 ’ja 5’-GTAAGGCAGTACCTGGGAAAAGGGTA -3 ”varten rs1052823. PCR-profiili koostui ensimmäisen sulatusvaihe 95 ° C: ssa 5 minuutin ajan, 35 sykliä 95 ° C 30 s, 60 ° C: ssa 45 s ja 72 ° C 1 min ja lopullinen jatkamisvaihe 72 ° C: ssa 10 min. PCR-tuotteet rs8126 C-alleelin 105 emäsparia (bp) on pilkottu

Apa

I entsyymiä (New England Biolabs, Beverly, MA) ja kaksi fragmenttia, 85 bp ja 20 bp, kun taas rs1052823 G-alleelin 108 emäsparin pilkottiin

Rsa

I (New England Biolabs) kolmeen fragmentteja 83 bp, 15 bp ja 10 bp. Määritys onnistumisprosentti kaikkien genotyyppien oli 99%, ja toistuvien määrityksiä 10% näytteistä oli 100 yhtäpitävä.

Tilastollinen analyysi

χ

2 testiä suoritettiin vertaamaan jakelua demografiset muuttujat ja valittujen riskitekijöitä, kuten tupakointi ja alkoholijuomien kulutusta, tapausten ja kontrollien välillä. Hardyn-Weinberg tasapaino testattiin jonka hyvyys fit χ

2 testiä verrata havaittu genotyypin taajuuksia odotettavissa olevista syöpää vapaa valvontaa. Yhteenliittymille genotyyppien

TNFAIP2

SNP kanssa mahalaukun syövän riski arvioitiin laskemalla kertoimet suhdeluvut (OR) ja niiden 95% luottamusväli (CI) sekä univiariate ja monimuuttuja logistinen regressio mallien tapaus-verrokki analyysit , jonka jälkeen jaottelu analyysi iän (≤59 vs. 59 vuotta), sukupuoli, kansallisuus (valkoinen vs. ei-valkoinen), tupakointi ja juominen tila. Kaikki nämä analyysit suoritettiin tai ilman säätö demografiset muuttujat ja valittujen riskitekijöitä. Proc haplotyypin SAS /Genetics ohjelmiston odotusarvo-max-imization (EM) algoritmia tehtiin tuottaa suurimman uskottavuuden haplotyyppifrekvenssien. Haplotypes taajuuksilla alle 5% yhdistettiin yhdeksi ryhmäksi. Kaikki testit olivat kaksipuolisia, ja

P

0,05 pidettiin cutoff tilastollisiin merkitys. Kaikki tilastolliset analyysit suoritettiin Tilastollinen analyysi System ohjelmisto (versio 9.2; SAS Institute, Cary, NC).

Tulokset

demografisia ominaisuuksia ja riskitekijät mahasyövän

Tähän tutkimukseen osallistui 301 mahasyöpäpotilaista ja 313 syöpää vapaa valvontaa. Taulukossa 1 esitetään yhteenveto jakelu demografisten ominaisuuksien ja valitun riskitekijät mahasyövän. Koska taajuus matching käytetty meidän tutkimuksen suunnittelu ei ollut merkittävää eroa jakaumat iän (mediaani-ikä 59 vuotta), sukupuolen ja etnisen alkuperän. Ilmeisesti ei ollut eroa tupakointi ja juominen tilan tapausten ja kontrollien välillä. Nämä muuttujat olivat edelleen mukautettu edelleen multivariate logistisen regression malleja kontrolloida muiden mahdollisten jäljellä sekoittavia tärkeimmistä vaikutus valittujen SNP.

TNFAIP2

genotyypit ja mahalaukun syövän riski

genotyyppi jakaumat valittujen neljän

TNFAIP2

SNP välillä tapausten ja kontrollien on lueteltu taulukossa 2. havaittu genotyyppi taajuudet näistä SNP olivat kaikki yhtäpitäviä odottama Hardy- Weinberg tasapainon aiheista (

P

= 0,234 varten rs1052823 G T,

P

= 0,698 varten rs710100 G A ja

P

= 0,125 rs1052912 G ), lukuun ottamatta rs8126 T C (

P

= 0,013) tapauksissa. Jakaumat genotyyppien varten

TNFAIP2

rs8126 T C olivat 56,48% TT, 32.56% CT ja 10,96% CC samoissa tapauksissa merkittävästi eroavat kontrolleissa, mikä oli 52,72% TT , 41.53 CT ja 5,75 SK. Tämä ero oli tilastollisesti merkitsevä (

P

= 0,019) alle resessiivinen malli (rs8126 T C CC /TT + CT). (Taulukko 2)

Lisäksi

TNFAIP2

SNP rs8126 T C, ainoa neljästä valittujen

TNFAIP2

SNP miRNA sitoutumiskohtia, havaittiin tilastollisesti merkitsevä yhteys edelleen regressioanalyysimme. Tarkemmin sanottuna rs8126 homotsygoottinen CC genotyyppi vain rajatapaus liittyy lisääntynyt mahalaukun syövän riski (oikaistu OR = 1,76, 95% CI = 0,96-3,27 ja

P

= 0,072), verrattuna TT genotyyppi, mutta tämä riski kasvoi (säädetty OR = 2,00, 95% CI = 1,09-3,64 ja

P

= 0,024), verrattuna yhdistettyyn rs8126 T variantti genotyyppien (taulukko 2). Kuitenkin seuraavassa kerrostunut analyysin iän, sukupuolen, etnisen alkuperän, tupakointi ja juominen tila, vain alaryhmään nykyisen tupakoitsijoita, mutta eivät juovat, ei kohonnut riski jäädä tilastollisesti merkittäviä suuremmalla vaihtelua arvioissa (oikaistu OR = 4,04 , 95% CI = 1,08-15,08 ja

P

= 0,038) (taulukko 3), vaikka alaryhmä oli rajallinen havaintoja. Mitään muuta merkittävää yhteyttä todettiin analyysissä yhteisten vaikutusten kaikkien neljän

TNFAIP2

SNP miRNA sitoutumiskohdista.

TNFAIP2

Haplotyypit ja maha- syöpä

haplotypes tutki myös, onko mitään erityistä haplotyyppi voi liittyä mahalaukun syövän riski. Kuten on esitetty kuviossa. 1B,

TNFAIP2

rs1052823 ja rs1052912 ovat suuren kytkentäepätasapainossa (LD) (r

2 = 0,87); Näin ollen, rs1052912 ei sisälly haplotyyppianalyysi. Neljä haplotypes osoitettiin olevan taajuuksia 5% kaikista tapauksista, kun taas muut harvinaisempaa haplotyyppien (taajuudet 5%) yhdistettiin yhdeksi ryhmäksi analyysissa. Neljä yhteistä haplotyyppien (rs8126 /rs1052823 /rs710100: T-G-G, C-G-A, T-G-A ja C-T-A) osuus 90,53% ja 94,72% kromosomien tapauksista ja valvontaa, vastaavasti. Kuitenkin frekvenssijakautuman haplotypes ei ollut tilastollisesti erilainen tapausten ja kontrollien välillä, ja niiden yhteenliittymien kanssa mahalaukun syövän riski ei ollut merkittäviä samoin. Muissa analyysi toisaalta harvinaista haplotypes, haplotyyppi rs8126 /rs1052823 /rs710100: CGG tilastollisesti merkitsevä assosiaatio syöpäriskiä (oikaistu OR = 2,60, 95% CI = 1,39-4,85 ja

P

= 0,003) , verrattuna yhteiseen haplotyyppi TGG. (Taulukko 4)

Keskustelu

Tässä sairaalan johdolla tapauskontrollitutkimuksessa, huomasimme, että

TNFAIP2

miR-184 sitoutumiskohta variantti rs8126 CC-genotyyppi merkitsevästi liittyy kohonnut riski sairastua mahalaukun syövän väistyvä geneettinen malli. Kerrostuneisuus analyysi, tällainen vaikutus oli ilmeisempi alaryhmässä nykyisen juovat, jotka voivat olla sattumalöydös. Kuitenkin, ei ollut tilastollista näyttöä yhdessä riski taudin variantti genotyyppejä muiden valittujen SNP, kuten rs1052823 G T, rs710100 G A ja rs1052912 G A, joko yleinen analyyseissä tai kerrostunut analyysit iän, sukupuoli, etnisyys, tupakointi tai juominen tila. Lisäksi haplotyyppianalyysissä ei havaittu ylimääräistä osaryhmään yhteistä taajuutta suuri riski.

Äskettäin kaksi genomin laajuinen yhdistys tutkimukset (GWASs) ovat ilmoittaneet merkittävistä yhteenliittymien useita geneettisiä variantteja mahalaukun syövän riski Kiinan väestön sekä Japanin ja Korean väestö [19], [20]. SNP on

TNFAIP2

geeni ei joukossa ilmoiteta top-osumia, koska vain alleelinen yhdistysten sijaan geneettisten mallien, kuten väistyvä malli, testattiin näissä GWAS tutkimuksissa. Tässä tutkimuksessa, jossa on rajoitettu otoskoko, valitun SNP rs8126 T C SNP

TNFAIP2

miRNA sitoutumiskohdan, SNP, joka ei ollut mukana, eikä LD kanssa sisällyttänyt GWAS siru, liittyi mahasyöpä. Tämä havainto on kuitenkin tarvitsee lisävalidointia suurempien tutkimuksissa.

Harvat tutkimukset ovat tutkineet roolia SNP miRNA sitoutumiskohdat etiologiassa mahasyövän. A case-control yhdistys tutkimus on japanilainen populaatio 552 tapausta ja 697 valvontaa osoittaneet, että rs2910164 CC genotyyppi ennalta miRNA (miR-146a) oli tilastollisesti liittyy suurentunut mahalaukun syövän riski [21]. Toinen vastaava mahasyöpä tutkimuksessa kiinalainen väestö osoitti huomattavasti kohonneeseen riskiin henkilöillä, joilla variantti CC homotsygootit Mir-196a-2 verrattuna villityypin homotsygoottisia TT ja heterotsygoottinen CT harjoittajille. Tämä SNP on myös osoittanut, että vahva yhdessä imusolmuke etäpesäke [22]. Samanlaisia ​​vaikutuksia havaittiin yhdistetyn rs895819 AG + GG genotyypin tunnin-mir-27a kiinalaisessa tekemään tutkimukseen Qingmin S

et al

[23]. Lisäksi toiminnalliset analyysit osoittivat, että variantin C-alleeli saattaa olla vastuussa kohonnut ilmentyminen miR-27a, vähentämällä mRNA ilmentymistä sen kohdegeenin,

ZBTB10

(Sinkki sormi ja BTB domain sisältää 10), mahdollinen mekanismi jossa

HSA-mir-27a

SNP on merkitystä mahasyövän herkkyys [23]. Ei kuitenkaan julkaistut tutkimukset ovat tutkineet roolia SNP asuvat miRNA sitovan sekvenssin mahasyövän.

TNFAIP2

(

B94

) on sytokiini perustuva primäärivasteen geeni, joka kloonattiin alun perin TNF-α-indusoituva transkriptio ihmisen stimuloitujen endoteelisolujen [15]. Lisätutkimukset havaittiin, että se voitaisiin aktivoida muut tekijät kuin TNF lukien interleukiini-1β tai lipopolysakkaridin [24]. Ilmaisu on

TNFAIP2

on paljastunut olevan olemassa alkion maksan ja munuaisten sekä miehen kypsä itusolujen ja hematopoieettisten ja imukudoksen [25]. Vaikka toiminta

TNFAIP2

geeni on vielä juurikaan tunneta, on ehdotettu, että

TNFAIP2

voi olla useita rooleja kehittämisessä elinten, kuten vaskulogeneesin veren solujen erilaistumista, myelopoiesis ja spermatogeneesiin . Lisäksi todettiin, että geeni oli tukahdutettu ydinsolua akuutista promyelosyyttinen leukemia (APL) potilaita ja että sen tavoite mRNA: iden voitaisiin ajan säätelee kaikkien-tans-RA (retinoiinihappo) [26].

MiR-184 on yhden kopion geeni ja evolutiivisesti konservoituneita nukleotiditasolla kärpäset ihmisiin. Vaikka sen toiminta on edelleen epäselvä, jotkut tutkimukset ovat osoittaneet, miR-184 mahdollisena kasvaimia synnyttävän ehdokas. Yksi tutkimuksen levyepiteelisyöpä (SCC) kielen osoitti, että miR-184 saattavat vaikuttaa osittain anti-apoptoosin ja leviämisen kielen SCC soluihin [27]. Toinen tutkimus ensinnäkin osoittaneet, että miR-184 vähensi merkittävästi kasvainten kehittymiseen ja kasvanut eloonjäämisestä potilaalle tehdä hiirimallissa neuroblastooma [28]. Myöhemmin tutkimuksessa todettiin, että miR-184 oli mukana yhteisen geneettinen reitin kautta kohdistettu seriini /treoniinikinaasin AKT2 toimimalla kanssa MYCN transkriptiotekijä estävän neuroblastoomasolu- eloonjääminen [29]. Yhdessä nämä tutkimukset viittaavat mahdolliseen rooliin miR-184 moduloinnissa syöpäriskiä. Ei kuitenkaan ole selvää, onko SNP sen sitoutumiskohdista voi edelleen muuttaa tätä modulaatiota.

Edellisessä tutkimuksessa 1077 potilasta, joilla levyepiteelisyövän pään ja kaulan (SCCHN) induktiohoitoon ja 1073 syöpää ilmaiseksi tarkastuksia ei-latinalaisamerikkalainen valkoisen väestön, jossa arvioitiin yhdistysten SNP

TNFAIP 2

geenin SCCHN riski [24], huomasimme myös, että verrattuna rs8126 TT genotyyppi, variantti CT ja CC genotyypit olivat liittyy lisääntynyt SCCHN riskin alleeli-annosvaste tavalla [18]. Kun genotyyppi-fenotyyppi korrelaatio analyysi 37 SCCHN solulinjojen ja perifeerisen veren mononukleaaristen solujen (PBMC: t) 43 SCCHN potilailla rs8126CC genotyyppi liittyy alentunut ilmentyminen

TNFAIP2

mRNA. Yhdessä nämä havainnot viittaavat siihen, että miR-184 sitoutumiskohta SNP (rs8126T C) 3’UTR on

TNFAIP2

on toiminnallinen, mahdollisesti muuntamalla

TNFAIP2

ilmaisun ja edistää SCCHN herkkyys [18]. Meidän havainnot mahasyövän ovat yhdenmukaisia ​​pään ja kaulan alueen syöpä.

Vaikka tutkimuksessa ei havaittu pääasiallinen vaikutus muiden SNP miRNA sitoutumiskohtiin

TNFAIP2

kokonaisriskiä mahasyöpä, löysimme että rs8126 CC variantti homotsygoottinen genotyyppi verrattuna yhdistetyn genotyyppien (TC + ​​TT), liittyi merkittävästi lisääntynyt syöpäriskiä. Tilastolliset todisteet, jotka voivat säilyttää vain yhdellä alaryhmässä juovat osituksen analysoi ehdottaa hyvin rajallinen otoskoko tämän tutkimuksen. Vaikka tupakointi ja alkoholijuomien kulutus on pidetty suuria riskejä mahasyövän, meidän matching suunnittelu oli tarkoitus valvoa niiden sekoittavia tärkeimmistä vaikutuksista valittujen SNP, jossa overmatching saattavat johtua mahdollinen assosiaatioita Matching (ikä ja sukupuoli) ja tunnettuja riskitekijöitä (tupakointi ja juominen) tässä tutkimuksessa väestön. Ylimääräisiä haplotyyppianalyysissä, kun taas neljä yhteistä haplotyyppien onnistunut osoittamaan mitään tilastollista syöpäriski yhdistys, vähäinen taajuus haplotyyppi rs8126 /rs1052823 /rs710100: C-G-G osoittautuivat kasvaneen riskin verrattuna yhteiseen haplotyyppi T-G-G. Analyysi matalataajuista haplotypes viittaa erilaiseen johtopäätökseen, nimittäin, että voi olla tyypittömässä matalataajuista SNP, joka liittyy syöpään. Lisätutkimukset ovat tarpeen vahvistaa tämän tuloksen.

Koska tässä tutkimuksessa on, että tietomme, ensimmäinen tutkimus

TNFAIP2

SNP ja mahalaukun syövän riski, meidän havainnot ovat parhaiten pidetään alustavia, ja suurempia tutkimuksia taataan edelleen arvioida rooli näiden SNP etiologiassa mahasyövän. Toinen rajoitus nykyisessä tutkimuksessa oli puute tiedon

H. pylori

infektiotilanteesta aiheista. Koska

H. pylori

infektion mahalaukun potilailla oli suhteellisen epätavallisia Yhdysvalloissa [30], verrattuna Etelä-Amerikassa [31] ja Aasian maat [32], potilaiden palvelukseen tutkimuksessamme ei testattu tartuttamisessa heidän vierailunsa sairaala. Siksi sisällyttäminen

H. pylori

tietoja pitäisi pitää tulevaisuudessa suurempia tutkimuksissa.

Kiitokset

Kiitämme Margaret Lung ja Jessica Fiske heidän avustaan ​​rekrytoimaan aiheita ja kerätä kyselylomakkeet tiedot ja Jianzhong Hän, Kejing Xu, ja Min Zhao ja heidän avustaan ​​veren käsittely ja DNA: n uuttaminen.