PLoS ONE: geneettistä vaihtelua ennalta miR-27a antaa kliininen tulos ei-pienisoluinen keuhkosyöpä kiinalaisessa Väkiluku
tiivistelmä
Background
Viimeaikaiset todisteet osoittavat, että MikroRNA (miRNA) voi toimia tuumorisuppressoreilla ja onkogeenit. Yhden emäksen monimuotoisuus (SNP) at miRNA geenit voivat vaikuttaa kypsymistä miRNA tai miRNA-välitteisen transkription säätelyyn. Tavoitteena oli tutkia yhdistys SNP vapautuneilla miRNA kliinisten tutkimusten tulosten kanssa potilailla, joilla on ei-pienisoluinen keuhkosyöpä (NSCLC) kiinalaisessa väestöstä.
Methods
vapautettiin miRNA NSCLC ja niiden SNP tunnistettiin julkisista tietokannoista. Yksittäinen SNP, rs895819 vuonna
pre-miR-27a
, löydettiin sopiva valinta. TaqMan määritykset suoritettiin genotyypin ja arvioida vaikutusta yleiseen eloonjäämiseen (OS) ja kemoterapia vaste 576 pienisoluista keuhkosyöpää.
Tulokset
Log-rank-testiä ja Coxin regressioanalyysi osoitti, että G-alleelin rs895819 liittyi lyhyempi selviytymisen ja lisääntynyt riski kuolla NSCLC [hallitseva malli: 22,0 vs. 46,0 kuukautta,
P
0,001; oikaistu riskisuhde (HR) = 1,71, 95% luottamuksellisia välein (CI): 1,12-2,26]. Edelleen vaiheittainen regressioanalyysi ehdotti, että tämä SNP oli itsenäisesti epäedullinen tekijä ennustetta NSCLC ja vaikutus säilyi merkittävä alaryhmäanalyysissä ositettu kliinisten parametrien ja hoidon tilasta. Lisäksi monimuuttuja logistinen regressio analyysi osoitti, että potilailla, joilla AG /GG genotyypin rs895819 oli merkittävästi vähentynyt vaste platinapohjaiseen kemoterapiaan verrattuna kanssa AA genotyyppi.
Johtopäätös
tulokset viittaavat siihen, että
pre-miR-27a
rs895819 polymorfismi voi vaikuttaa NSCLC potilaiden kliininen tulos. Edelleen suuren otoksen tutkimukset olisi käytettävä vahvistamaan havaintomme.
Citation: Xu J, Yin Z, Shen H, Gao W, Qian Y, Pei D, et al. (2013) geneettisen polymorfismin in
pre-miR-27a
antaa kliininen tulos ei-pienisoluinen keuhkosyöpä kiinalaisessa väestöstä. PLoS ONE 8 (11): e79135. doi: 10,1371 /journal.pone.0079135
Editor: Xifeng Wu, MD Anderson Cancer Center, Yhdysvallat
vastaanotettu: 6. kesäkuuta, 2013 Hyväksytty: 18 syyskuu 2013; Julkaistu: 06 marraskuu 2013
Copyright: © 2013 Xu et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.
Rahoitus: Tämä työ tukivat National Natural Science Foundation of China (81172140, 81272532) ja Priority Academic ohjelmasuunnitteluosastolle Jiangsun korkeakouluista (JX10231801). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.
Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.
Johdanto
Keuhkosyöpä on johtava syy syöpään liittyvien kuolemien maailmanlaajuisesti johtuen sen yleisyydestä, pahanlaatuinen käyttäytymistä ja puute tehokkaan hoidon strategia [1]. Kiinassa on ollut merkittävä lisääntymistä keuhkosyövän sekä kaupungeissa ja maaseudulla kahden viime vuosikymmenen aikana, erityisesti ei-pienisoluinen keuhkosyöpä (NSCLC) [2], [3]. Vaikka platina-pohjainen yhdistelmä kemoterapia on ensilinjan hoitoon potilailla, joilla on kehittynyt NSCLC, vastaus vaihtelee potilaiden joukossa, jotka vaihtelevat 26%: sta 60% [4]. Viiden vuoden aikana (OS) korko on vain 15% Yhdysvalloissa ja on vielä alhaisempi Kiinassa [1]. Vakiintuneita menetelmiä ennustamiseen ennusteen sisältävät kasvain, solmu, ja etäpesäkkeiden (TNM) pysähdyspaikan järjestelmä kuitenkin viimeaikaiset tutkimukset osoittavat, että löytö ja erityistoimenpiteiden prognostisia biomarkkereiden voi parantaa hoidon ja tuloksista potilaiden NSCLC [5]. Huolimatta huomattava määrä tutkimusta [6], [7], [8], hyvin harvat vakaa biomarkkerit on tunnistettu riskinarvioinnissa tai predication kliinisen tuloksen ja lisätutkimukset ovat tarpeen.
MikroRNA (miRNA) ovat luokan pieni endogeenisten ei-koodaavaa RNA: t, jotka toimivat negatiivisina geeni sääntelyviranomaisten suoraan lohkaisemalla kohde-mRNA tai estämällä käännös [9], [10]. Menetys ja voitto tehtävä erityinen miRNA tai poikkeava miRNA ilmaus ajatellaan olevan keskeinen tapahtumista kasvainten synnyssä monien syöpien [11], [12]. NSCLC, miRNA ekspressioprofiileja ja erityisiä miRNA ovat korreloineet potilaiden selviytymisen [13], [14]. Lisäksi on yhä enemmän näyttöä siitä, että yhden emäksen monimuotoisuus (SNP) on merkittävä rooli syövän alttiuden ja lopputulos. Korkea fylogeneettiseen säästön miRNA sekvenssit määrittää, että geneettisiä vaihteluita miRNA voivat vaikuttaa eri biologisiin prosesseihin. Siksi SNP miRNA geenit voivat vaikuttaa ensisijaisen transkriptit (PRI-miRNA), esiaste-RNA: t (pre-miRNA), kypsä miRNA tai miRNA-välitteisen transkription säätelyyn [15].
Hyödynsimme julkisten tietokantojen tunnistamaan vapautettu miRNA NSCLC ja SNP näissä miRNA sekvenssit, kuten ensisijainen, esiaste ja kypsä miRNA. Meidän hakuja tunnistettiin yhden SNP, rs895819 vuonna
pre-miR-27a
, lisätutkimuksia varten. Rs895819 polymorfismi sijaitsee terminaalin silmukan
pre-miR-27a
ja siihen kuuluu A G nukleotidin siirtyminen. HSA-miR-27a on osoitettu toimivan onkogeenin kohdistamalla prohibitin [16], ja on näin ollen kohde syöpälääkkeiden [17], [18]. Metens-Talcott
et al
. [19] osoittivat, että transfektio antisense miR-27a rintasyöpäsoluissa lisännyt ilmentymisen oletetun Sp-repressorin Zinc finger ja BTB domeenin, joka sisältää 10 (ZBTB10), jossa on samanaikaisesti väheneminen ilmentymisen Sp-riippuvaa eloonjäämistä ja angiogeenisten geenien. Näitä ovat verisuonten endoteelin kasvutekijän (VEGF) ja surviviinin [19]. Yli-ilmentyminen VEGF ja elossa olleen liittyy etenemisen tai huono selviytyminen NSCLC [20], [21]. Sun
et al
. [22] raportoitiin rs895819 muuttaa mahalaukun syövän alttiuden moduloimalla ekspressiotasot miR-27a ja sen kohdegeenin
ZBTB10
. Shi
et al
. [23] viittasi siihen, että tämä polymorfismi voisi ennustaa munuaissyövän riskiä kiinalaisessa väestöstä. Meta-analyysi osoitti, että
pre-mir-27a
polymorfismi voi olla merkitystä rintasyövän alttiuden ja syövän kehityksen valkoihoinen [24].
Tähän mennessä ei ole ilmoitettu tutkimuksia suhteesta
pre-mir-27a
polymorfismien ja eloonjäämisen syöpäpotilailla. Nykytietämyksen perusteella biologisen toimintojen HSA-miR-27a ja rooli polymorfismien ennustamisessa syöpäriski, me arveltu, että rs895819 saattaa liittyä kliinistä tulosta pienisoluista keuhkosyöpää. Siksi arvioimme assosiaatiot rs895819 ja NSCLC yleinen (OS), sekä vastauksena platinapohjaiseen kemoterapiaan.
Materiaalit ja menetelmät
Ethics lausunto
Tämä tutkimuksen hyväksyi Institutional Review board of Nanjingin Medical University. Kaikki osallistujat olivat vapaaehtoisia ja kirjallisia tietoon perustuvan suostumuksen ennen osallistuu tähän tutkimukseen.
Tutkimus aiheet
Kaikki koehenkilöt rekrytoitiin First Affiliated sairaala Nanjing Medical University (Jiangsu, Kiina) välillä tammikuuta 2004 ja päivänä syyskuuta 2012. He olivat kaikki äskettäin diagnosoitu, histopatologisesti vahvistetaan ja ei ole aiemmin ollut syöpä tai edellisen kemo- tai sädehoitoa. Kaikkiaan 612 potilasta NSCLC rekrytoitiin, joista kaikki eivät liittyneet etnisten Han kiinalaisia väestöstä (CHB). Strukturoitu kyselylomake väestönkehitys ja ympäristön altistumisesta, kuten ikä, sukupuoli ja tupakointi kulutusta, suoritti koulutettu haastattelijat kautta face-to-face haastattelut potilaille. Lisäksi, 5 ml laskimoverta kerättiin kunkin potilaan genomisen DNA: n uuttaminen. Kohteet, joissa pieni ( 1 savuke päivässä) ja kesto ( 1 vuosi) tupakoinnin määriteltiin tupakoimattomien; kaikki muut luokiteltiin tupakoitsijoita.
Vastaus platinapohjaiseen (sisplatiini tai karboplatiini) kemoterapia potilailla, joilla on edennyt NSCLC arvioitiin jälkeen ensimmäistä kaksi tai kolme jaksoa ja määritellään mukaan Response arviointiperusteet kiinteitä kasvaimia (RECIST) perusteet 1.1 [25]. Potilaat jaettiin seuraaviin kahteen ryhmään niiden vastausten: ne, joilla on täydellinen vaste (CR) ja osittainen vaste (PR) on luokiteltu vasteen; joilla oli stabiili tauti (SD) ja etenevä sairaus (PD) on luokiteltu ei-vastetta. Seuranta toteutettiin välein kolmen kuukauden ajan ilmoittautuminen kuolemaan saakka tai viimeinen suunniteltu seurantaa. Maximun seuranta-aika oli 102,0 kuukautta (viimeinen seuranta helmikuussa 2013) ja mediaalinen seuranta-ajan oli 18,0 kuukautta. Valitsimme potilaalla on täydellinen seurannat ja riittävän DNA-näyte. Potilaat, jotka suorittanut kaikki seurannat ja riittävällä tavalla DNA-näytteen valittiin. Alkuperäisestä 612 potilasta, 576 otettiin ja genotyyppi tutkimuksessamme.
genotyypin
Jokainen verinäyte kerättiin EDTA antikoagulantin putkeen ja säilytettiin -80 ° C: ssa, kunnes DNA: n uuttaminen. Genominen DNA uutettiin seuraavat Vakioprotokollien proteinaasi K: ruoansulatusta ja uutetaan fenoli /kloroformilla. Genotyypitys suoritettiin TaqMan alleeliset erottelutesteissä käyttäen ABI 7900-järjestelmä (Applied Biosystems, Foster City, CA, USA). Prime ja anturit ovat seuraavat: eteenpäin, GGCGGAACTTAGCCACTGT, kääntää, CAGGGCTTAGCTGCTTGTG; FAM-ACTTGGTGTGGACC-MGB ja HEX-ACTTGGCGTGGAC-MGB. TaqMan-määritykset suoritettiin lopullisessa reaktiossa 5 ui, joka sisälsi 0,25 ui aluketta, 0,125 ui koetinta, 2 ui PCR-seos reagenssia ja 25 ng DNA: ta. PCR-reaktio koostui ensimmäinen vaihe 95 ° C: ssa 10 min, mitä seurasi 55 sykliä, denaturointi 95 ° C: ssa 15 s ja pariutuminen 60 ° C: ssa 60 ss. SDS alleelinen syrjintä ohjelmisto (ABI) käytettiin analysoimaan PCR -genotyypitystulosten. Kaksi tyhjää (vesi) kontrollia sisällytettiin kuhunkin 384-hyvin määritys. Vähintään 10% näytteistä valittiin satunnaisesti uusintaa, mikä tuotti 100% aloista. Lisäksi 60 näytettä valittiin satunnaisesti suoraan sekvensointiin vahvistaa TaqMan tuloksia. Jälleen tulokset osoittivat 100% vastaavuutta.
Tilastollinen analyysi
Hardy-Weinberg tasapaino arvioitiin jonka hyvyys fit χ
2 testiä. OS laskettiin välinen aika ensimmäisen hoidon ja kuolema tai viimeinen seurannan tasalla. Välinen assosiaatio genotyypin ja eloonjäämisaste arvioitiin Kaplan-Meier menetelmä ja log-rank-testi. Keskimääräinen elinaika (MST) laskettiin myös. Coxin suhteellisten riskien mallia tehtiin arvioimaan hazard ratio (t) ja niiden 95% luottamuksellisia välein (CI) OS. Coxin vaiheittainen regressiomallin suoritettiin myös määrittämään ennustavan tekijöitä NSCLC ennusteeseen.
P
arvo heterogeenisuus testin perustui χ
2-pohjainen Q test. Kertoimet suhde (syrjäisimmillä alueilla) ja niiden 95% CI laskettiin mittana ero vastausprosentti avulla regressioanalyysimme (hoitovaste vs. ei-vasteen). Kaikki tilastolliset analyysit suoritettiin käyttäen SPSS 18.0 ohjelmistolla (SPSS Inc., Chicago, Illinois, USA), ja
P
0,05 perustuu kahden puolen koe pidettiin tilastollisesti merkitsevä.
tulokset
ominaisuudet tutkimuspopulaation
demografiset ja kliiniset ominaisuudet 576 potilaalla, jotka osallistuivat tähän tutkimukseen, ja niiden yhdessä OS esitetään taulukossa S1. Mediaani-ikä diagnoosin ajankohtana oli 60 vuotta (vaihteluväli, 29-86 vuotta), ja mukana 380 urosta (66,0%) ja 267 tupakoitsijoita (46,4%). Näistä potilaista 381 (66,2%) oli adenokarsinoomat, 166 (28,8%) oli okasolukarsinoomia, ja toiset (29 potilasta, 5,0%) oli suuri solu, erilaistumaton tai seka-solukarsinoomat. Aikana seuranta-ajan, 206 potilasta kuoli NSCLC. Tupakointi tila, kliinisessä vaiheessa ja leikkaus liittyivät merkittävästi elinaika (kaikki log-rank
P
0,001, kuva 1); kuitenkin, kemoterapiaa ja täsmähoitoihin eivät olleet. Huomattavaa on, että diabetes oli 42% merkittävästi vähentynyt riski kuolla, verrattuna ilman diabetesta (54,9
vs
. 42,0 kuukautta; riskisuhde = 0,58, 95% CI: +0,35-+0,97).
Log-rank
P
arvot olivat (A) 0,001, (B) 0,034, (C) 0,001, (D) 0,001, (E) 0,001 ja (F ) 0,001, vastaavasti.
SNP Selection
IGDB.NSCLC tietokanta (https://igdb.nsclc.ibms.sinica.edu.tw) [26] oli käytetään tunnistamaan vapautuneilla miRNA NSCLC. Kaikkiaan 28 säädelty miRNA amplifioidussa alueilla ja 28 alassäädetty miRNA in poistetaan alueilla havaittiin. Patrocles tietokanta (www.patrocles.org) [27] tunnistettiin 5 miRNA 5 oletetun SNP: t sisällä ennalta miRNA tai kypsä miRNA-sekvenssit näistä 56 miRNA (taulukko 1). Näihin sisältyvät rs2043556 sisällä
pre-miR-605
sekvenssin ja rs895819 sisällä
pre-miR-27a
järjestyksessä, jotka molemmat oli pieni alleelifrekvenssi (MMM) 5% vuonna CHB . Rs2043556 jätettiin, koska korkea GC-pitoisuus voi johtaa epäonnistumiseen TaqMan koetin määrityksessä. Siksi vain yksi SNP, rs895819 A G, lopulta valittu.
välisestä assosiaatiosta
pre-miR-27a
Polymorphism ja Survival in NSCLC
genotyyppi taajuudet rs895819 oli Hardy-Weinberg tasapaino (
P
= 0,538). Log-rank testi osoitti merkittävää yhdistyksen välillä rs895819 ja selviytymisen potilailla, joilla NSCLC että codominant ja hallitseva mallien (sekä
P
0,001; Kuva 1). Potilaat, joilla on vähintään yksi variantti alleeli oli lyhyempi OS verrattuna niihin, joilla AA genotyyppi (22,0
vs.
46,0 kuukautta,
P
0,001). Univariate Coxin regressioanalyysi osoitti, että tämä SNP oli merkittävä prognostinen markkeri NSCLC (määräävä malli: HR = 1,74, 95% CI: 1,32-2,28). Yhdistyksen edelleen merkittäviä säädön jälkeen ikä, sukupuoli, tupakointi, diabetes, histologia, kliinisessä vaiheessa, leikkaus ja hoito tila (hallitseva malli: HR = 1,71, 95% CI: 1,12-2,26, taulukko 2).
jotta voitaisiin tunnistaa riippumattomia ennustavat tekijät NSCLC selviytymisen, suoritimme monimuuttuja vaiheittain Coxin regressioanalyysiä käyttäen valikoituja demografisia ominaisuuksia, kliiniset piirteet ja
pre-miR-27a
polymorfismi. Lopullinen ennustava malli sisältyvät SNP rs895819 (
P
0,001), sekä tupakointi (
P
= 0,018), diabetes (
P
= 0,042) ja leikkaus (
P
0,001) (taulukko 3).
ositus ja Vuorovaikutusanalyysi
välinen yhteys
pre-miR-27a
polymorfismi ja NSCLC eloonjääminen edelleen arvioitiin ositettu analyysi ikä, sukupuoli, tupakointi, diabetes, histologia, kliinisessä vaiheessa, leikkaus, kemoterapiaa ja täsmähoitoihin. Kuten taulukosta 4, suurentunut kuolemanriski havaittiin seuraavia aiheita: vanhemmissa koehenkilöissä (oikaistu HR = 2,71, 95% CI: 1,84-4,00); urokset (oikaistu HR = 2,05, 95% CI: 1,46-2,87); tupakoitsijat (oikaistu HR = 2,08, 95% CI: 1,40-3,08); Niille ei diabetesta (oikaistu HR = 1,53, 95% CI: 1,15-2,05); joilla adenokarsinoomat (oikaistu HR = 1,73, 95% CI: 1,19-2,49); ne, jotka eivät leikkaukseen (oikaistu HR = 1,67, 95% CI: 1,18-2,36); saaneet kemoterapiaa (oikaistu HR = 1,66, 95% CI: 1,23-2,25); ja eivät ole saaneet kohdistettu-terapia (oikaistu HR = 1,71, 95% CI: 1,26-2,32). Heterogeenisyys testi kunkin parin väliin kerrostumien osoitti, että heterogeenisuus oli merkittävä tupakoinnista (
P
= 0,019). Kuitenkin geeni-tupakointi vuorovaikutuksen analyysi ei paljastanut mitään merkittävää vuorovaikutusta rs895819 polymorfismin ja tupakointi (tuloksia ei ole esitetty).
välisestä assosiaatiosta
pre-miR-27a
polymorfismi ja Response Platinum-pohjainen Kemoterapia
välinen yhteys rs895819 ja hoitovasteen arvioitiin edelleen. Vain 296 leikkaushoitoon pitkälle NSCLC (IIIb-IV), jotka olivat saaneet platinapohjaisen kemoterapian ensilinjan hoitoa, ja oli täydellinen arviointi kemoterapian vasteen, olivat mukana, jotta vältetään mahdolliset vaikuttavat sekoittavat leikkauksesta, kliiniseen vaiheeseen ja hoidon tyyppi. Yksityiskohtaiset hoito tiedot on esitetty taulukossa S2. Monimuuttujakalibrointi logistinen regressiomalli osoitti, että potilailla, joilla on G-alleelin rs895819 oli merkittävästi vähentynyt vaste platinapohjaiseen kemoterapiaan verrattuna niihin, joilla AA genotyyppi (AG /GG vs. AA: säätää OR = 0,54, 95% CI = 0.32- 0,91) ja näin ollen lisääntynyt kuolemanriski (oikaistu HR = 1,59, 95% CI: 1,09-2,31). Olemme havainneet samanlaisia tuloksia käyttämällä lisäainetta mallia (oikaistu OR = 0,54, 95% CI = ,35-,83; oikaistu HR = 1,59, 95% CI: 0,97-1,63, taulukko 5).
Keskustelu
Tässä tutkimuksessa, huomasimme, että variantti alleeli G rs895819 sisällä
pre-miR-27a
liittyi merkittävästi lisääntynyt riski kuolinajankohta NSCLC. Vaikutus oli vielä voimakkaampi vanhemmilla henkilöillä, miehillä, joilla on adenokarsinoomat ilman diabetesta, ja niissä, joille ei suoritettu leikkaus ja ovat saaneet kemoterapiaa. Lisäksi merkittävästi vähentynyt vaste platinapohjaiseen kemoterapiaan havaittiin kehittyneen NSCLC potilaalla on AG /GG genotyyppiä. Tämä on ensimmäinen raportoitu tutkimus assosiaatiota
pre-miR-27a
rs895819 polymorfismi ja kliinistä tulosta potilaille, joilla on NSCLC.
Vaikka miRNA edustavat vain pientä osaa genomia, ne säätelevät lähes kolmannes ihmisen geenien [28]. Yhä useammat tutkimukset ovat osoittaneet, että miRNA ovat mukana kriittisessä biologisissa prosesseissa, kuten kehitys-, erilaistuminen, apoptoosi ja lisääntymistä, ja se voi siksi olla tärkeä rooli syövän synnyssä kuin kasvain onkogeenien tai vaimentimet [29], [30]. Geneettinen polymorfia miRNA on raportoitu liittyvän monia kasvaimia, mukaan lukien mahasyöpä [31], rintasyöpä [32] ja peräsuolen syövän [33]. Hu
et al
. [14] todettiin, että muunnos homozygoottisia on rs11614913 in
pre-miR-196a2
oli yhteydessä huonoon säilymiseen potilaiden kanssa NSCLC. Hong
et al
. [34] ehdotetaan, että
pre-miR-149
rs2292832 T C polymorfiat liittyi merkittävästi tautivapaan elinajan ja OS NSCLC. Lisäksi geneettinen vaihtelu Mirna-koneen geenejä tai miRNA-sitoutumiskohtia in 3′-alue kohdegeenien on myös raportoitu liittyvän syöpäalttiutta tai prognoosi [35], [36], [37].
on ehdotettu, että geneettinen vaihtelu aiheuttaa rakennemuutos kriittinen alue miRNA voivat vaikuttaa prosessiin ja kypsymisen miRNA [38], [39].
pre-miR-196a2
rs11614913 C-alleeli liittyi merkitsevästi lisääntynyt ilmentyminen kypsän miR-196a ja voi näin ollen vaikuttaa sitoutumiseen miR-196a2 sen kohde-mRNA
LSP1
[14] , [40]. SNP rs11671784 on raportoitu heikentävän kypsymistä miR-27a, mikä vähentää ilmentymistä kypsän miR-27a ja tehostettuun kohteeseensa
HOXA10
[41]. SNP rs895819 on myös tunnistettavissa ennalta miRNA alueet HSA-miR-27a, jossa on MMM 5% CHB. Alustavat toiminnalliset analyysit Sun
et al
. [22] paljasti, että rs895819 G-alleelin siirrettävä korkeampi miR-27a, joka liittyi merkittävästi vähentää
ZBTB10
mRNA. Käytimme RNAfold ohjelma ennustaa vakain toissijainen rakenteet
pre-miR-27a
kahdella eri alleelit. Kuitenkin, ei konformaationaalinen vaikutus eikä vapaan energian vaikutus oli ennustettu (tietoja ei ole esitetty). Sen sijaan, perusteella mallin Zeng ja Cullen, mutaatiot varren pre-miRNA oli merkittävä vaikutus miRNA käsittely [39]. Vaikka SNP sisällä miR-27a sijaitsi terminaalin silmukka, mutantti terminaalin silmukka voi hieman heikentää pri-miRNA käsittely ja DGCR8 sitoutuminen perustuu ssRNA-dsRNA Junction ankkurointi Model [42]. Tällainen mekanismi on osoitettu hnRNP A1 [43].
Huomasimme, että G-alleelin rs895819 sisällä
pre-miR-27a
liittyi merkittävästi vähentynyt vaste platinaa kemoterapian ja huomattavasti kasvanut riski kuolinajankohta NSCLC. HSA-miR-27a on havaittu yliekspressoituvan useita erilaisia kasvaimia, mukaan lukien rintasyövän [44] ja munasarjasyöpä [45]. On osoitettu toimivan onkogeenin kohdistamalla prohibitin [16] ja on tavoite syöpälääkkeiden [17], [18]. Alassäädetty miR-27a voimin voi myös kääntää monilääkeaineresistenssin ruokatorven okasolusyöpä [46]. Vaikka ilmaus miR-27a on raportoitu vähentää huomattavasti sekä kudos- ja seeruminäytteistä NSCLC potilaiden [26], [47], joka on suhteellisesti korkeampi miR-27a ilmentyminen havaittiin kanssa rs895819 G-alleelin verrattuna alleelin [22]. Nämä todisteet voivat osittain tukevat havainnot. Syvällisempää toiminnallisia tutkimuksia edellytetään selvittämiseksi mekanismi miR-27a ja tämä muunnos NSCLC.
Havaitsimme myös kasvua OS potilailla, joilla on sekä NSCLC ja diabetes verrattuna ilman diabetesta (54,9 vs. 42,0 kuukautta;
P
= 0,034). Monimuuttuja vaiheittainen Coxin regressioanalyysiä osoitti, että tämä oli itsenäinen ennustetekijä varten NSCLC, joka on yhdenmukainen useiden kohorttitutkimuksia valkoihoisista [48], [49]. Oraaliset diabeteslääkkeet, erityisesti metformiini, annetaan yleisesti etulinjan hoito potilailla, joilla on diabetes. Sekä perus- ja eläinkokeet ovat osoittaneet, että metformiini välittämää väheneminen insuliiniresistenssin voi liittyä pienempi riski kasvaimen kehitystä [50], [51], [52]. Metformiini antaa yksin tai yhdessä solunsalpaajahoidon on myös raportoitu estää kasvaimen kasvua
in vitro
ja
in vivo
kokeiluja [53], [54], [55]. Havainnot Tan
et al
. [56] osoittaa, että metformiini voi parantaa kemoterapia tuloksia ja selviytymisen NSCLC diabetes. Nämä tutkimukset tukevat tuloksia.
tulkittaessa tuloksemme, useita rajoituksia pitäisi olla huolissaan. Ensinnäkin kaikki asiat rekrytoitiin yhden toimielimen, joka voi ottaa käyttöön valinnan bias. Kuitenkin genotyyppijakauman oli Hardy-Weinberg tasapaino. Toiseksi, meidän otoskoko oli suhteellisen pieni. Olemme kuitenkin saavuttaneet 89% tutkimuksessa teho (kaksipuolinen testi, α = 0,05) havaitsemaan HR 1,71 varten rs895819 G genotyypin hallitseva malli. Kolmanneksi puutteen takia keuhkosyöpään kudosta vastaavan verinäytteen analysoitu, emme pystyneet havaitsemaan ilmentymisen miR-27a ja sen tavoitteet, ja tutkia yhdistyksen välillä ja SNP rs895819. Näistä rajoituksista huolimatta tämä on ensimmäinen tutkimus tutkimaan assosiaatiota
pre-miR-27a
rs895819 polymorfismi ja kliininen tulos NSCLC, ja arvokasta tietoa, joiden avulla voitaisiin ohjata tulevia tutkimuksia ja kliininen käytäntö.
Johtopäätökset
Yhteenvetona tuloksemme mikäli ensimmäisen käsityksen osuus
pre-miR-27a
rs895819 polymorfia kliinisen tuloksen NSCLC. Havainnot korostaa entisestään, että polymorfismeilla miRNA sekvenssit voivat olla tärkeä rooli keuhkosyövän. Vaikka yhdistys näytti olevan tilastollisesti merkitsevä esillä olevassa tutkimuksessa, havainnosta on edelleen validoitu suuri, hyvin suunniteltu tutkimuksissa.
tukeminen Information
Taulukko S1.
Potilaan ominaisuus ja kliiniset piirteet.
doi: 10,1371 /journal.pone.0079135.s001
(DOC) B Taulukko S2.
Hoito ominaisuudet 296 potilasta.
doi: 10,1371 /journal.pone.0079135.s002
(DOC) B