PLoS ONE: Distinct rooli CD86 polymorfismit (rs1129055, rs17281995) in Risk of Cancer: Todisteet meta-analyysi
tiivistelmä
Tausta ja tarkoitus
Aikaisemmat tutkimukset koskevat roolista
CD86
polymorfismien (rs1129055 ja rs17281995) syövän pysty antamaan varmaa näyttöä. Tutkimuksen tavoitteena oli tutkia roolia yhteisten polymorfismien syöpäriskiä meta-analyysi.
Methods
Käyttämällä hakutermejä klusterin Differentiation 86 /
CD86 Twitter /B7-2 /polymorfismi /polymorfismien /syöpä, etsimme PubMed, EMBASE, CNKI ja Wanfang ja määritti neljä tutkimukset rs1129055 (2137 potilasta) ja rs17281995 (2856 henkilöä) vastaavasti. Syöpäriski arvioitiin kerroinsuhde (OR) ja 95%: n luottamusväli (95% CI).
Major Havainnot
Kaiken havaitsimme merkittävää pienentää syöpäriskiä suhteessa rs1129055. Verrattuna yksilöiden AA genotyyppi, yksilöiden kanssa GG-genotyyppi näytti olevan 62% vähentynyt riski kehittää syöpä (GG vs. AA: OR, 0,62; 95% CI, 0,49-0,79; p
het., 0,996). Samanlaisia vaikutuksia ilmoitettu G verrattuna alleelin malli ja GG vs. GA + AA geneettinen malli (OR, 0,83; 95% CI, ,74-,93; P
het., 0,987, OR, 0,63; 95% CI, 0,50-0,79; p
het., 0,973). Lisäksi löysimme genotyypin rs17281995 ollut suuri vaikutus yleiseen syövän riskiä (CC versus GG: OR, 2,38; 95% CI, 1,43-3,95; p
het., 0,433; C versus G: OR, 1,23; 95% CI, 1,06-1,43; p
het., 0,521; CC versus GC + GG: OR, 2,38; 95% CI, 1,45-3,93; p
het., 0,443). Yhdistys havaittiin myös valkoihoisilla ja peräsuolen syövän. Ei selvää julkaisu bias havaittiin tähän meta-analyysiin.
Johtopäätökset
Nämä tiedot paljastavat, että rs1129055 voi olla suojaavia vaikutuksia syöpäriskiin aasialaisilla ja rs17281995 on omiaan edistämään syöpäriskiä erityisesti kolorektaalisyövän valkoihoisilla.
Citation: Geng P, Zhao X, Xiang L, Liao Y, Wang N, Ou J, et al. (2014) Erilliset rooli CD86 polymorfismit (rs1129055, rs17281995) in Risk of Cancer: Todisteet meta-analyysi. PLoS ONE 9 (11): e109131. doi: 10,1371 /journal.pone.0109131
Editor: William B. Coleman, University of North Carolina School of Medicine, Yhdysvallat
vastaanotettu: 18 tammikuu 2014; Hyväksytty: 08 syyskuu 2014; Julkaistu 4 marraskuuta 2014
Copyright: © 2014 Geng et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.
Rahoitus: Tämä työ tuettiin osittain lupanumeroon 81172115 National Natural Science Foundation of China (ja HJL) (www.nsfc.gov.cn). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.
Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.
Johdanto
Useita mekanismeja syöpä on laajalti tutkittu. Mutta jatkuvasti kasvava maailmanlaajuinen syövän aiheuttamaa rasitetta voi heijastaa hetkellä epätäydellinen tietämys synnyssä ja etiologian mekanismit [1]. Tulehdus, koska yksi näistä mekanismeista, näyttelee edistävää rooli useissa biologiset ominaisuudet kuten yllä proliferatiivinen signalointi, kiertää kasvu vaimentimet, vastustavat solukuoleman, joka mahdollistaa replikatiivisia kuolemattomuus, angiogeneesin, ja aktivoimalla invaasio ja etäpesäkkeiden joita tarvitaan monivaiheisessa inhimillisen syövät [2]. Tulehduksellinen aktivointi on pitkään tunnettu osasyynä syövän edistämiseen ja etenemiseen johtuen potentiaalisuus heikentäen kudoksen säilyttämisen homeostaasin ja korjata [3].
Cluster of Differentiation 86 (CD86, joka tunnetaan myös B7- 2) asuvia antigeeniä esitteleviä soluja on kostimulatorista molekyyliä. On tärkeää autoimmuniteetin, elinsiirrot, ja kasvainimmuniteetin [4], [5]. Vaihtelu
CD86
voi tehdä immuunisolujen vahingollisia ja aiheuttaa uuden systeemisen tulehdusreaktioita [6].
CD86
toimii keskeisenä välittäjänä aktivoitumisesta T-solujen immuunivasteeseen [7]. Puute
CD86
voi johtaa T-solujen inaktivoinnissa ja kato kasvaimen soluihin, ja siten mahdollistaa pahanlaatuisen etenemisen syövän [8].
CD86
kromosomissa 3q21 koostuu kahdeksasta eksonia. Kaksi yleisintä polymorfismien, rs1129055 (+1057 G A) ja rs17281995 (+ 2379G C), joka sijaitsee eksonissa 8 ja 3’untranslated alue säätelydomainin vastaavasti, on moduloiva rooli tason proteiinikinaasi C fosforylaatiota
CD86
sytoplasmahännän [9]. Useita väestöpohjainen tapausverrokkitutkimukset on aloitettu itsenäisesti tutkia niiden roolit erilaisissa syövissä [10] – [13]. Mutta lopullinen rooli on vielä perustettava. Siksi on erittäin tärkeää kokonaisvaltaisesti ymmärtämään polymorfismien ja toiminnan häiriön tarjota uusia oivalluksia alalla syövän patofysiologian. Esillä olevassa tutkimuksessa olemme kohdennettuja rs1129055 ja rs17281995 että
CD86
geeni ja suorittaa meta-analyysi, jonka tavoitteena on esitellä pakottavia tilastollista näyttöä niiden geneettinen alttius syöpään.
Materiaalit ja menetelmät
tunnistaminen ja kelpoisuuden asiaankuuluvien tutkimusten
käyttämällä hakusanat ”Cluster of Differentiation 86”, ”CD86”, ”B7-2”, ”polymorfismi”, ”polymorfismit”, ja ” syöpä ”yhdessä ja erikseen, teimme kirjallisuusluettelo haun Englanti tietokantoja (PubMed, EMBASE) sekä kiinan tietokantoja (CNKI, Wanfang), tunnistaa kaikki julkaisut katsomalla aihe esillä olevassa tutkimuksessa. Haku päättyi 30. marraskuuta 2013. asetettu mitään rajoituksia kieltä. Jos tietoja puuttuu käyttökelpoista raakadataa, myös tarkistetaan viittaukset lainattu alkuperäisartikkelia.
Tutkimukset, jotka täyttivät kaikki seuraavat kriteerit otettiin huomioon meta-analyysi:
Tekijät on rekrytoida ihmisen syöpätapausta ja hyvin verrokit;
julkaisun on keskityttävä assosiaatiosta
CD86
polymorfismien (rs1129055 ja rs17281995) ja syövän riskiä;
Tekijät oli esitettävä täydellinen data arvioida kertoimet suhde (OR), jossa 95%: n luottamusväli (CI);
tutkimus on julkaistu verkossa 30. kesäkuuta 2013.
tutkimuksessa käytettiin itsenäisenä tapauspopulaatio ilman asiaan päivitys; jos kuitenkin kyseessä paneeli laajennettiin tutkimuksessa suuremmalla useita aiheita oli mukana.
Kaksi tekijää itsenäisesti etsinyt tietokantoja ja sitten valitaan tutkimukset vastaavat mukaanottokriteereihin kuten yllä.
data louhinta
Perustuu saavuttaman aiemmin, kaksi riippumatonta kirjoittajat uuttaa tietoa ja tallennetut ominaisuudet kunkin tutkimuksen seuraavasti: ensimmäinen kirjoittaja, julkaisuvuosi, tutkimus maa, lähde hallintalaitteiden, etnisen , genotyypitysmenetelmää, geneettiset ja alleelifrekvensseiltään tapausten ja kontrollien välillä, ja syöpätyyppi. Jos yksittäinen tutkimuksessa tutkittiin kaksi itsenäistä tapauskohtaisesti kontrolliryhmää, me käsitellään erikseen ja luokitella ne valkoihoinen tai aasialainen.
Tilastollinen
syöpäriski [kerroinsuhde (OR) ja 95%: n luottamusväli (95% CI)] suhteessa
CD86
polymorfismien arvioitiin tutkimusta varten. Ensin tehdään vertailuja kaikilla koehenkilöillä, jonka jälkeen kerrostuneisuus analyysit sukupuolen mukaan (naisten ja miesten) varten rs1129055, ja syövän tyypin (peräsuolen syövän ja haimasyövän) ja etnisyys (valkoihoinen ja Aasian) varten rs17281995.
χ
2-pohjainen Q-tilastoa testiä käytettiin havaitsemaan tutkimusten välisten heterogeenisuus syntyneestä menetelmiin tai kliinisistä erilaisuus eri tutkimuksissa [14]. Heterogeenisuus katsottiin merkitseväksi kun P 0,10. Arvot kunkin tutkimuksen tiivistetysti käyttäen kiinteän vaikutus malli Mantel-Haenszelin menetelmää, kun tutkimukset eivät olleet tilastollisesti heterogeenisiä; muuten random-vaikutus malli on johdettu Dersimonian ja Laird menetelmää käytettiin yhdistämään tulokset [15], [16]. Merkitys yhdistetystä syrjäisimpien alueiden tarkastettiin Z-testi ja se saavutti merkittävän tason, kun P 0,10. Metsäviljelmien käytettiin kuvaavat tuloksia sisältyi tutkimuksia. Herkkyysanalyysi suoritettiin peräkkäin poistamalla kunkin yksittäisen tutkimuksen ja laskematta syrjäisimmille alueille. Suppilo juoni yhdessä Egger testi käytettiin tutkia mahdollisia julkaisu puolueellisuudesta meta-analyysi [17], [18]. χ
2 testiä levitettiin laajuuden selvittämiseksi poikkeamat Hardy-Weinberg tasapaino (HWE) genotyypin jakeluun valvontaa. Kaikki analyysit tehtiin käyttäen Stata 12,0 (Stata Corporation, College Station, TX). Merkitsevyystasoksi asetettiin P 0,10.
Tulokset
Ominaisuudet tutkimusten
Olemme vihdoin tunnistettu kuusi julkaisut [8], [10] – [13], [19]
CD86
polymorfismien ja syöpäriskiä. Yksityiskohtainen prosessi tutkimuksen tunnistaminen on esitetty kuviossa 1. Me tiivistää tärkeimmät ominaisuudet kunkin tutkimuksen taulukossa 1.
rs1129055, neljä julkaisua olivat mukana ja erilaisia syöpiä (peräsuolen syöpä, osteosarkooman, Ewingin sarkooma, haimasyövän) tutkittiin. Kaikki tapausverrokkitutkimukset oli conduced Kiinassa. Lisäksi ne on valittu kiinalaiset koehenkilöistä, käytetty väestö perustuvat tarkastukset ja soveltaa PCR-RFLP (polymeraasiketjureaktio-restriktiofragmenttipituuspolymorfismin) in genotyypin määritys.
Kuitenkin rs17281995 useita tutkimus maat osallistuivat vaihdellen Tsekin Iraniin. Niistä sisältyi tutkimuksia, kaksi syöpätyypit (kolme peräsuolen syövän ja yksi haimasyövän) tutkittiin, ja molemmat valkoihoinen ja Aasian aiheita käytettiin.
Kaikki genotyyppijakauman verrokeilla oli mukaisesti HWE kanssa lukuun ottamatta yhtä tutkimusta varten rs17281995 [13].
Herkkyysanalyysit
jotta voidaan havaita vaikutusta kunkin aineisto on yhteenveto tuloksista, teimme herkkyysanalyysissä peräkkäin poistamalla yksittäinen tutkimuksissa mukana meta-analyysi. Syrjäisimpien alueiden ei olennaisesti muutettu peräkkäinen muutot, syytetään meidän tulokset olivat vakaita ja uskottavia (tuloksia ei esitetty).
Julkaisu bias
Julkaisu bias tarkistettiin Begg n suppilo juoni ja Egger testi. Kaikkien geneettisissä malleissa
CD86
polymorfismien, muoto suppilon tonttien paljasti vain vähän näyttöä ilmeinen epäsymmetria. Tilastollisesti tukevia todisteita siitä, että ei ollut olemassa merkittävää julkaisua bias edelleen esitetty Egger testi (Kuva 2: suppilo kuvaaja rs1129055, P
Begg = 0,731, P
Egger = 0,331 alla GG vs. AA;).
Syöpä riskejä rs1129055
Yhdistämällä neljä tutkimukset rs1129055, me saatiin 2137 aiheita tähän meta-analyysiin. Kaiken kaikkiaan olemme havaittu merkittävää vähenemistä syöpäriskiä suhteessa rs1129055. Verrattuna yksilöiden AA genotyyppi, yksilöiden kanssa GG-genotyyppi näytti olevan 62% vähentynyt riski kehittää syöpä (GG vs. AA: OR, 0,62; 95% CI, 0,49-0,79; p
het., 0,996). Samanlaisia vaikutuksia on lisäksi ilmoittanut G verrattuna alleelin malli ja GG vs. GA + AA geneettinen malli (OR, 0,83; 95% CI, 0,74-0,93; p
het., 0,987, OR, 0,63; 95% CI , 0,50-0,79; p
het., 0,973) (kuvio 3). Päinvastoin, kun suoritetaan vertailuja mies- ja yksikään geneettisten mallien osoitti vaikutuksen muuttamista syöpäriskiä. Tutkimukset olivat tilastollisesti homogeeninen kaikissa geneettinen mallit (kuva 2, taulukko 2).
neliöt ja vaakasuorat viivat vastaavat syrjäisimpien ja 95% CI erityisiä tutkimuksen ja alueen ruutujen heijastaa tutkimuksen paino (käänteisarvo varianssi). Timantti edustaa yhdistettyä syrjäisimpien alueiden ja sen 95% CI.
Syöpä riskejä rs17281995
Seuraavaksi arvioitiin vaikutuksia rs17281995 syövän riskin perusteella kolmeen julkaisuihin , joista neljä itsenäistä tapaus-verrokki-populaatioissa, joissa on yhteensä 2856 osallistujaa. Löysimme genotyyppien rs17281995 ollut suuri vaikutus yleiseen syövän riskiä (CC versus GG: OR, 2,38; 95% CI, 1,43-3,95; p
het., 0,433; C versus G: OR, 1,23; 95% CI , 1,06-1,43; p
het., 0,521; CC versus GC + GG: OR, 2,38; 95% CI, 1,45-3,93; p
het., 0,443).
kerrostunut analyysi syövän tyypin, tulokset osoittivat merkittävää yhteyttä peräsuolen syövän alle CC versus GG, C versus G, ja CC vs. GC + GG mallit (OR, 2,38; 95% CI, 1,43-3,95; p
het. , 0,433, OR 1,25; 95% CI, 1,07-1,47; p
het., 0,358, OR, 2,38; 95% CI, 1,45-3,93; p
het., 0,433). Yhdenmukainen tulosten analysointiin syövän tyypin, ilmeisesti lisääntynyt riski todettiin myös valkoihoinen väestö (taulukko 2).
Keskustelu
CD86
on yksi- kopio geenistä ihmisissä. Sillä on ratkaiseva rooli säätelyssä T-soluvasteiden, kuten T-solujen aktivaation ja suvaitsevaisuutta kautta CD28 /CTLA-4-reitin [5], [20].
CD86
on havaittu immuunijärjestelmän soluissa ja on mukana patogeneesissä laajan tulehdukseen liittyvien sairauksien, kuten astman ja siihen liittyvien allergisten häiriöiden (21) [21], pansytopenia [22], lepra [23], sepsis [24] ja maksansiirron [25]. Kuitenkin edellä mainittujen lisäksi sairauksia, tarkka rooli
CD86
syövän alttiuden edellyttää myös olla seurattava lisääntymään ja toiminnallisia tutkimuksia määrittämään lopullisen kausaalinen rooli.
Tällä hetkellä huomattava meneillään on yhdistää ihmisen fenotyypit poikkeavuuskertoimen DNA-tasolla. Uskotaan, että ihmisen geneettinen vaihtelut voivat aiheuttaa fenotyyppisiä eroja yksilöiden välillä ja suurin osa näistä muutoksista tulisi vallitsevasti osoitetaan yhden emäksen monimuotoisuus [26] Siten, jotta tyhjentää biologinen toiminta näiden polymorfismien pahanlaatuisten sairauksien, erityisesti erilaisissa syövissä muut itsenäiset suuret tutkimukset ovat välttämättömiä tarjota hyödyllistä tietoa ja laajentaa nykyistä tietämystä.
rs1129055 (+1057 G A) ja rs17281995 kaksi laajalti tutkittu polymorfismien
CD86
geeni. Koska ensimmäinen raportti yhdistys rs17281995 ja riskin satunnaista kolorektaalisyövän valkoihoiset julkaistiin vuonna 2008 [27], useat tapaus-verrokki assosiaatiotutkimuksiin on seurattu [10] – [13]. Nämä tutkimukset kuitenkin käyttää suhteellisen riittämätön otoskoko ja keskittynyt eri syöpätyyppien, jotka voivat johtaa väärien positiivisten tai negatiivisten-myönteinen lopputulos. Lisäksi puute meta-analyysi
CD86
polymorfismien ja syöpäriski sai meidät suorittamaan tässä tutkimuksessa tulosten validointiin.
Tutkimuksessamme selvitimme kaksi polymorfismien, nimittäin rs1129055 ja rs17281995 . Meta-analyysin tuloksia, löysimme genotyypin rs1129055, varsinkin GG genotyyppi, liittyi ilmeisesti kuollut syöpäriskiä. Tarkempi analyysi välillä naisten ja miesten osoitti, että naisilla ei todennäköisesti kehittää syövän kuin miehillä. Päinvastoin, sillä rs17281995, havaitsimme merkittävästi lisääntynyt riski yleistä syöpään. Yhdistys havaittiin myös alaryhmiin etnisyys ja syövän tyyppi: Valkoihoisista ja peräsuolen syövän alle CC versus GG, C versus G, ja CC vs. GC + GG malleja.
rs1129055 on useita yhtäläisyyksiä neljä tutkimukset: kaikki koehenkilöiden aasialaiset, lähde valvonta oli tasaisen väestöpohjainen, ja tutkimuksissa käytettiin samaa genotyypitysmenetelmää. Tämä voi olla merkittävä syy homogeenisuus eri tutkimuksissa. Sillä rs17281995, merkittävää yhteyttä havaittiin ainoastaan valkoihoinen väestö, mutta ei Aasian väestöstä. Kohtuullinen tulkinta on merkittävä ero tutkimuksessa koko (2075 vs. 781), koska lager näyte on todennäköisesti johtaa päätelmään, joka on lähellä todellista -alueella.
Useat tekijät tulisi ottaa huomioon tulkittaessa tuloksemme. Ensinnäkin, vaikka on koottu kaikki tiedot
CD86
polymorfismien ja syövän riskiä, koko näyte vielä laajentumiselle. Toiseksi vain Aasian väestöstä on mukana analyysi rs1129055, ja useimmissa tutkimuksissa on rs17281995 ovat valkoihoisesta väestöstä. Siksi on mukavaa sisällyttää enemmän tutkimuksia eri etnisten ryhmien pitää tunnistaa lopulliset roolit vaihtelevissa populaatioissa. Kolmanneksi, koska syöpä on monitekijäinen sairaus, mikä lisää sekoittavat tekijät, kuten ikä, tupakointi, alkoholin käyttö on vielä tutkittava. Samaan aikaan useita vahvoja puolia meidän meta-analyysi olisi käsiteltävä. Ensimmäinen vahvuus on, että tämä on ensimmäinen tutkimus tarkastelemalla verkoston
CD86
polymorfismien ja syöpäriski mennessä, ja yhdistykset arvioitiin käyttäen tiukkaa menetelmällä. Toinen vahvuus viittaa vakautta ja luotettavuutta tuloksia. Koska mukana tutkimukset eivät ole tilastollisesti heterogeeninen eikä havaittu merkittävästi julkaisun bias kirjallisuudessa.
Yhteenvetona, esillä oleva meta-analyysi tuettu Merkitsevä yhteys rs1129055 genotyyppien ja laski syöpäriskiä aasialaisilla. Kuitenkin ilmeisesti lisännyt syöpäriskiä havaittiin yleisanalyysi sekä alaryhmäanalyyseissa etnisyys ja syövän tyyppi rs17281995. Olipa
CD86
polymorfismien voisi toimia biomarkkeri geneettinen alttius syöpään tarvitsee edelleen validoitu tulevaisuudessa.
tukeminen Information
tarkistuslista S1.
doi: 10,1371 /journal.pone.0109131.s001
(DOC) B