PLoS ONE: ilmentyvät eri geenien ja allekirjoitus Väylät of Human Eturauhassyöpä
tiivistelmä
Perimän tekniikoita kuten mikrosiruja ja seuraavan sukupolven sekvensointi ovat mahdollistaneet sukupolven molekyyli allekirjoitusten eturauhassyövän. Listat erilaisesti ilmaisi geenien välillä pahanlaatuiset ja ei-pahanlaatuiset tilat ajatellaan olevan hedelmällinen lähteitä otaksuttu eturauhassyövän biomarkkerit. Kuitenkin tällaiset luettelot erilaisesti ilmaisi geenit voivat olla erittäin vaihteleva useita syistä. Sinänsä katsomalla differentiaalikaavojen yhteydessä geenin sarjaa ja polkuja on vankempi. Käyttäen seuraavan sukupolven Genomikartoituksen tietoja Cancer Genome Atlas, ero geenien ilmentyminen välillä iän ja vaiheessa- sovitettu ihmisen eturauhasen kasvaimia ja ei-pahanlaatuiset näytteet arvioitiin ja käytettiin veneen reitin allekirjoitus eturauhassyöpää. Ylä- ja alas geenien jaettiin polkuja koostuvat kuratoituja toisiinsa liittyvien geenien useita tietokantoja. Merkitys näiden reittien sitten arvioitu määrä ilmentyvät eri geenien löytyy koulutusjakson ja niiden asema reitin käyttäen Gene Set rikastus Analysis and Signaling Pathway Impact Analysis. ”Transformoiva kasvutekijä-beeta signalointi” ja ”Ran sääntely sukkularihmaston muodostumista” polut olivat yhteydessä eturauhasen syöpään. Useita muita merkittäviä väyliä vahvistavat raportoitu havainnot microarray tiedot, jotka viittaavat siihen aktiinisytoskeletonin sääntelyä, solusyklin, mitogeeniaktivoidut proteiinikinaasi signalointi, ja kalsium signalointi ovat myös muuttaa eturauhassyövässä. Siten olemme osoittaneet toteutettavuudesta koulutusjakson analyysi ja havaitsi underexplored alue (Ran) tutkittavaksi eturauhassyövän synnyssä.
Citation: Myers JS, von Lersner AK, Robbins CJ, Sang Q-XA (2015) ilmentyvät eri geenit ja allekirjoitus Väylät Ihmisen eturauhassyöpä. PLoS ONE 10 (12): e0145322. doi: 10,1371 /journal.pone.0145322
Editor: Jian Cao, Stony Brook University, Yhdysvallat