LFA-1 ja MHC-luokan I ja II molekyylien on isäntä riippuva
Vertaileva tutkimukset osoittivat, että useat proteiinit on jo todettu pakata HIV-1 hiukkasia kautta erityistä vuorovaikutusta viruksen proteiineja tai nukleiinihappoja havaittiin myös HIV-2 ja apinan immuunikato viruksen hiukkasia. Joidenkin proteiinien niiden säilyttäminen ulotettiin kauempana retroviruksia, kuten HTLV-1. Näiden merkittävyyden yhtäläisyyksiä on kyseenalainen. Se voi olla joko väitti säilyttämistä yhteisen monistusmekanismi koko viruksen evoluutio, tai se voidaan pitää todisteena epäspesifisen yhdistyksen proteiinien kanssa etäistä sukua viruksia. Bay 11-7082 Bay 11-782
Joissakin tapauksissa, myös joillekin kinaasien, näyttöä suojelusta vuorovaikutuksen motiiveja virusproteiineja yhdessä toiminnan tutkimuksessa virusten pysty paketoida nämä cellular tekijät osoittaneet, että nämä komponentteja säilyttää evoluutiossa konservoituneen toiminto. Sen lisäksi, että on vaikeaa liittyy kohdella eri isäntä tekijöitä, jotka selektiivisesti tai passiivisesti pakattu viruksia, tunnistaminen solun proteiinien upotettu viruspartikkelien on teknisesti complicated.The kriittisintä on ehdottoman välttämätöntä erotella virus-sisällyttää komponentteja ja solujen tekijöiden saastuttavia virus preparations.The Jälkimmäiseen ryhmään proteiineja telakoituna ulkopuolella soluttoman virionien. Tähän ryhmään kuuluu myös solun sisältämät proteiinit mikrovesikkeleille ja eksosomeiksi koot ja tiheydet verrattavissa viruksia, että co-sedimentti virus- valmisteita ja edustavat saastu jälkeenkin tiheysgradientti erottaminen viruspartikkelien.
Niinpä näytteen valmistus tulisi suorittaa huolellisesti. Kaksi viittaus protokollia on kehitetty tuottamaan valmisteita hyvin puhdistettua HIV-1. Yksi lähestymistapa käsittää ruoansulatusta viruksen näytteitä käyttämällä ei-spesifinen seriiniproteaasi subtilisiinia. Subtilisiini pilkkomalla HIV-1 valmiste seliminates yli 95% Mikrovesikkeliin liittyviä proteiineja ja poistaa epäpuhtaudet telakoituna virusten ulkopuolelle. Tehokkuutta tämän protocolis määritetään pienentäminen gp41 transmembraanisen kuoren glykoproteiinin. Tämä menetelmä soveltuu erityisesti tutkimuksen proteiinien sisällä virionien. Vaihtoehtoisesti, CD45 immuno affiniteetti väheneminen HIV-1 voidaan käyttää eristämään viruksia solujen eksosomeiksi.
Tämä tekniikka, joka on kehitetty perustuu siihen havaintoon, että CD45 kalvomolekyyliä heitetään pois HIV-1 tuotettujen virusten hematopoieettisista soluja, on aikaisemmin yhdistetty masss pectrometry analyysi tuottaa vaikuttava lista solun tekijöitä paketoidaan HIV-1 tuotetuilla ensisijainen makrofageissa. CD45 ehtyminen on hyödyllisin tutkimuksista, jotka vaativat ulkopuolen virionien olla ehjä. Joka tapauksessa, elektronimikroskoopilla kuvantaminen tarjoaa luotettavan menetelmän erottamaan koottu viruksia ja eksosomeiksi peräisin morfologinen näkökulmasta ja vahvistaa läsnäolo isännän proteiinien virionien, kuten aiemmin raportoitu. Toinen tekninen ominaisuus harkita, kun tutkitaan HIV-1-liittyvä solutekijöiden on solutyyppi ja viruksen isolaatti tai kanta valmistuksessa käytetään biologista samples.The joukko pakattuja solun proteiinien voi vaihdella suuresti riippuen käytetystä isäntäsolusta levittää virusta .
Tätä näkökohtaa on hyvin dokumentoitu kalvomolekyyliä upotettu kirjekuoressa virionien tuotettu eri T-solulinjoja. Hankinta CD55 ja CD59 täydennys rappeutuminen tekijät, LFA-1 ja MHC-luokan I ja II molekyylien on isäntä-dependent.Distinct sisällyttäminen profiilit on raportoitu myös kun virukset valmistetaan pysyviä solulinjoja tai ensisijainen ääreisveren mononukleaariset solut analysoitiin. Mitä sytosolin proteiinit, tässä vaiheessa ei ole kattavasti tutkittu. Kuitenkin, LC-MS /MS-analyysi viruksia kasvatettiin makrofagien ei havaita joitakin komponentteja, jotka tunnistettiin viruksia kasvatetaan T-lymfosyyttien. VX-661 1152311-62-0
On huomattava, ERK-2, akinase havaitaan HIV-1HZ321 eristää kasvatettu HUT78 T-lymfosyyttejä ja HIV-1ELI virusten valmistettu MT4-soluissa, ei havaittu HIV- 1NLAD8 kasvanut ensisijainen makrofageissa. Toiminnallinen merkitys näiden erojen on edelleen tuntematon, ja sen korrelaatio biologiaan HIV-1: n replikaation erillistä solutyypeissä vielä analysoitava.