Krooninen sairaus

tiivistelmä

Background

Perimän poikkeavuus on yleinen piirre ihmisen syövissä ja on yksi tärkeimmistä mekanismeista, jotka johtavat yli-ilmentyminen onkogeenien ja ali tuumorisuppressorigeeneille. Tutkimuksemme tavoitteena on tunnistaa usein genomista muutoksia haimasyövän.

Materiaalit ja menetelmät

Käytimme joukko vertailevaa genomista hybridisaatiota (array CGH) tunnistamaan toistuvat genomista muutokset ja validoitu proteiinin ilmentymistä valittujen geenien immunohistokemiallisesti.

tulokset

Sixteen voitot ja kolmekymmentäkaksi tappiota esiintyi yli 30% ja 60% kasvaimista, vastaavasti. Korkean tason monistuksissa at 7q21.3-q22.1 ja 19q13.2 ja homotsygoottisia deleetioita 1p33-p32,3, 1p22.1, 1q22, 3q27.2, 6p22.3, 6p21.31, 12q13.2, 17p13. 2, 17q21.31 ja 22q13.1 tunnistettiin. Erityisesti monistaminen AKT2 havaittiin kaksi karsinoomia ja homotsygoottisia poistetaan CDKN2C muissa kahdessa tapauksessa. 15 riippumaton validointi näytettä, olemme huomanneet, että AKT2 (19q13.2) ja MCM7 (7q22.1) monistettiin 6 ja 9 tapauksissa, ja CAMTA2 (17p13.2) ja PFN1 (17p13.2) on homozygously poistettu 3 ja 1 tapausta. AKT2 ja MCM7 olivat yliekspressoituina ja CAMTA2 ja PFN1 oli ali-ilmentynyt haimasyövän kudoksissa kuin morfologisesti normaali operatiivinen marginaali kudoksissa. Sekä synergisillä ja Perimän Workbench ohjelmistoja tunnistettu 22q13.1 sisältävien APOBEC3A ja APOBEC3B ainoana homotsygoottinen deleetio alueella. Ja ekspressiotasot APOBEC3A ja APOBEC3B olivat merkittävästi alhaisemmat kasvainkudoksissa kuin morfologisesti normaali operatiivinen marginaali kudoksissa. Lisävalidointia osoitti, että yli-ilmentyminen PSCA oli merkitsevästi yhteydessä imusolmuke etäpesäke, ja yli-ilmentyminen HMGA2 oli merkitsevästi yhteydessä invasiivisia syvyys haimasyövän.

Johtopäätös

Nämä toistuvat genomista muutokset voivat olla hyödyllisiä paljastaen mekanismi haiman syövän synnyn ja tarjoamalla ehdokas biomarkkereiden.

Citation: Liang JW, Shi ZZ, Shen TY, Che X, Wang Z, Shi SS, et al. (2014) tunnistaminen Perimän Muutokset Haimasyöpä käyttäminen Array-Based Comparative Genominen Hybridisaatio. PLoS ONE 9 (12): e114616. doi: 10,1371 /journal.pone.0114616

Editor: Xin-Yuan Guan, The University of Hong Kong, Kiina

vastaanotettu: 16 heinäkuu 2014; Hyväksytty: 12 marraskuu 2014; Julkaistu 11 joulukuuta 2014

Copyright: © 2014 Liang et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Data Saatavuus: Tällä kirjoittajat vahvistavat, että kaikki tiedot taustalla olevat havainnot ovat täysin saatavilla rajoituksetta. Kaikki asiaankuuluvat tiedot ovat paperin.

Rahoitus: Tätä työtä tukivat National Science and Technology Major Project of China (2012ZX09506001, 2011YQ17006710), ja National Natural Science Foundation of China (81241086), ja Yunnanin maakunnan tutkimus perustutkimusrahaston, Kiina (Grant nro 2013FD012). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Taustaa

Haimasyöpä on yksi malignent syövät maailmassa 5 vuoden eloonjäämisaste alle 5% [1]. Tähän mennessä ei ole tavanomainen hoito, joilla on merkittävä vaikutus kurssin haimasyövän, jotta ennuste potilaille on edelleen heikko. Siksi tunnistaminen molekyylimuutokset taustalla syöpä luo perustan parantamiseksi hoitoa ja tuloksia.

Perimän epävakaus on ominaista lähes ihmisen kasvaimissa [2]. Kopioluvun muutoksia esiintyy usein syövät, ja uskotaan edistää taudin alkamisen ja etenemisen kasvainten monistamalla ja aktivointi onkogeenien tai deleetio-indusoidun-ilmentyminen tuumorisuppressorigeeneille. Useat aikaisemmat tutkimukset ovat tunnistaneet toistuvia kromosomi muutoksia pacreatic syöpää, kuten voitot 1Q, kromosomien 2, 3 ja 5, 7p, 8q, 11q, 12p, 14 q, 17Q, 19q ja 20q, tappiot kromosomeja 1p, 3p, 6 , 8p, 9P, 10q, 13q, 14 q, 15q, 17p ja 18q, ja amplifikaatioita FGFR1, HER2 ja DcR3 [3], [4], [5], [6], [7], [8], [ ,,,0],9]. Kuitenkin käytettävissä olevat tiedot on edelleen vähäistä, etenkin Kiinan haimasyövän.

Tässä tutkimuksessa tunnistettu yhteisiä voittoja, tappioita, monistukset ja homotsygoottisia deleetioita haimasyövän. Arvioimme lisäksi proteiinin ilmentymistason kopiomäärän-lisääntyi geenejä HMGA2 ja PSCA.

Materiaalit ja menetelmät

Tutkimusasetelma

Ensinnäkin geneettisiä poikkeavuuksia haiman karsinoomat olivat havaitaan käyttämällä Agilent 44K ihmisen genomista CGH microarray ja yhteiset genomista muutoksia havaittu. Sitten, me validoitu proteiinin ilmentymistä HMGA2 ja PSCA jotka sijaitsevat yhteisessä poikkeavuus kromosomin alueita pancreactic syöpään.

Potilaat ja näytteet

Juuri resektoitiin kudoksia 93 haimakarsinooma- potilaita kerättiin patologian osaston, Cancer Hospital, Kiina Academy of Medical Sciences, Peking, Kiina vuodesta 2006 vuoteen 2008. Kaikki haimasyövän potilaita hoidettiin radikaalien toimintaa, eikä yksikään niistä saanut mitään hoitoa ennen leikkausta. Edustaja kasvaimen alueet irrotettiin kokeneiden patologit ja välittömästi varastoitiin -70 ° C: ssa, kunnes ne käytettiin. Kaikki käytetyt näytteet tässä tutkimuksessa olivat jäljellä näytteitä diagnoosin jälkeen näytteenoton. Jokainen potilas allekirjoitettu erillinen tietoisen suostumuksen lomakkeet näytteenotto- ja molekyylitason analyysi. Kliiniset ominaisuudet potilaiden käytetään array CGH tutkimuksessa esitetään taulukossa 1. Tutkimuksen hyväksyi eettisen komitean Cancer Institute ja sairaala, Peking unionin Medical College, Kiina Academy of Medical Sciences (nro NCC2013B-30).

Genominen DNA Extraction

Genominen DNA eristettiin kasvainkudoksista käyttäen Qiagen DNeasy Veren Tissue Kit kuten valmistaja on kuvannut (Qiagen, Hilden, Saksa). Kasvainsolun sisältö kaikkien näytteiden oli suurempi kuin 50% HE-värjäys.

Array-pohjainen CGH

Array CGH kokeet suoritettiin käyttämällä standardia Agilent protokollia (Agilent Technologies, Santa Clara, CA) . Kaupallinen ihmisen genomista DNA: ta (Promega, Warrington, UK) käytettiin viitteenä. Kunkin CGH hybridisaatiota, 500 ng viite genomista DNA: ta, ja sama määrä tuumori-DNA: ta pilkottiin Alu I ja RSA-restriktioentsyymiä (PROMEGA, Warrington, UK). Digeroitu viite DNA-fragmentit leimattiin syaniini-3 dUTP ja kasvaimen DNA syaniini-5 dUTP (Agilent Technologies, Santa Clara, CA). Sen jälkeen kun puhdistus, viite ja kasvaimen DNA-koettimet sekoitettiin ja hybridisoitiin päälle Agilent 44K ihmisen genomin CGH mikrosiru (Agilent) 40 tuntia. Pesu, skannaus ja tiedon louhinta menettelyt suoritettiin seuraavan standardin protokollia.

Microarray Data Analysis

Microarray data analysoitiin Agilent Genomic Workbench (Agilent Technologies, Santa Clara, CA) ja BRB-arraytools ( https://linus.nci.nih.gov/BRB-ArrayTools.html). Agilent Perimän Workbench käytettiin laskemiseen log

2

suhde jokaisen koetin ja tunnistaa genomista poikkeavuuksia. Mean log

2

suhde kaikkien koettimien kromosomissa alueen välillä 0,25 ja 0,75 luokiteltiin genomista voitto, 0,75 korkean tason DNA vahvistus, -0,25 kuin hemizygous menetys, ja -0,75 kuten homotsygoottinen poisto. Vuonna polku rikastamiseen analyysi, p-arvo lasketaan kullekin polku perustuu nolla saadun jakauman 1000 ajan satunnaisotannalla.

Reaaliaikainen PCR

PCR-reaktiot suoritettiin kokonaistilavuudessa 20 ui, mukaan lukien 10 ui 2XPower SYBR Green PCR Master Mix (Applied Biosystems, Warrington, UK), 2 ui cDNA: n /genomisen DNA: n (5 ng /ul), ja 1 ui aluketta seosta (10 uM kutakin ). PCR-monistus ja havaitseminen suoritettiin ABI 7300 (Applied Biosystems, Warrington, UK) seuraavasti: ensimmäinen denaturaatio 95 ° C: ssa 10 min; 45 sykliä 95 ° C 15 s ja 60 ° C 1 min. Suhteellisen geeni-ilmentymisen tai suhteellinen kopioluku kohdegeenin laskettiin käyttäen vertailevan CT menetelmä, jonka normalisoitu endogeenisen GAPDH. Suhteellinen että kalibraattorin annettiin kaavalla 2

-ΔΔCt. ACt laskettiin vähentämällä keskimääräinen GAPDH CT keskimääräisestä CT kiinnostuksen kohteena olevan geenin. Suhde määrittelee tason suhteellinen ekspressio tai suhteellinen kopioluku kohdegeenin kuin GAPDH. 2

-ΔΔCt 2,0 asetettiin tavoitteeksi vahvistusta, ja 2

-ΔΔCt 0,25 asetettiin tavoitteeksi homotsygoottinen poisto.

immunohistokemiallinen värjäys

Formaliinifiksoidusta, parafinoidut haimatuumorien saatettiin kudokseen mikrosirulla. Tapauskohtaisesti syöpäkudokset toistettiin kolme kertaa ja viereisten morfologisesti normaaleissa kudoksissa kaksi kertaa. Objektilasit poistettiin parafiini, vedettömät, upotettiin 3% vetyperoksidiliuosta 10 minuutin ajan, kuumennettiin sitraattipuskurissa (pH 6) 25 minuutin ajan 95 ° C: ssa, ja jäähdytettiin 60 minuutin ajan huoneenlämpötilassa. Objektilasit blokattiin 10% normaalia vuohen seerumia ja 30 min 37 ° C: ssa ja inkuboitiin sitten hiiren monoklonaalinen vasta-aine HMGA2 (Abcam, Cambridge, MA) ja kanin polyklonaalinen vasta-aine PSCA: ta vastaan ​​(Abcam, Cambridge, MA) yön yli 4 ° C. Pesun jälkeen PBS: llä, levyt inkuboitiin biotinyloidun sekundaarisen vasta-aineen (laimennettu 1:100) 30 minuutin ajan 37 ° C: ssa, mitä seurasi streptavidiini-peroksidaasi (1:100 laimennos) inkuboitiin 30 min 37 ° C: ssa. Immunoleimaus visualisoitiin seos 3,3′-diaminobentsidiiniä ratkaisu. Counterstaining tehtiin hematoksyliinillä.

Expression taso määritettiin perusteella värjäystä intensiteetin ja prosenttiosuus immunoreaktii- soluja. Negatiivinen ilmaus (pistemäärä = 0) ei ollut tai heikko värjäystä tai kohtalaisesta vahva värjäytyminen 25%: ssa soluista. Heikko ilmaisu (pistemäärä = 1) oli kohtalainen tai voimakas värjäytyminen 25%: sta 50% soluista. Ja vahva ilmaus (pistemäärä = 2) oli 50% soluista, joilla on vahva värjäytyminen.

Tilastollinen analyysi

Studentin t-testiä ja Chi square testi suoritettiin tilasto-ohjelmiston SPSS 15.0 . Erot arvioitiin tilastollisesti merkitsevä, kun vastaava kaksipuolinen

P

arvo oli 0,05.

Tulokset

voitot ja tappiot haimakarsinooma- tunnistanut Array CGH

Viisitoista näytteitä haimakarsinooma- analysoitiin tässä tutkimuksessa ja ne kaikki oli genomista muutokset (arvot: 1-387). Kuusitoista voitot ja kolmekymmentäkaksi tappiot usein havaittu (taajuus voitto 30%, ja tappio 60%). Yleisimmät voitot olivat 8p23.3 (41,7%), 1q44 (40%), 14q32.33 (40%), 19q13.43 (36,7%), 1q21.3 (36%) ja 5q31.1-q31.2 (35,6%), ja yleisin menetykset olivat 11p15.4 (70,7%), 15q15.1-q21.1 (70%), 3p21.31 (68,9%), 17p13.3-p13.2 (66,7%), 19p13.3-p13.2 (66,7%), 5p13.3 (63,3%), 11p11.2 (63,3%) ja 19p13.3-p13.11 (63,3%). Synergisillä analyysi osoitti, että kopioluvun lasku APOBEC3A (22q13.1) ja APOBEC3B (22q13.1) oli merkittävä (Fig. 1 ja taulukko 2).

. Genominlaajuisten taajuus juoni haimasyövän by array CGH analyysi. Viiva oikealla puolella 0% akselin, voitto; viiva vasemmalla 0% akselin, menetys. B. numerot kromosomipoikkeavuuksien haimasyövän. X, kromosomipoikkeavuuksien; Y, tapausten määrä. C. voitot ja tappiot (HDS) tunnistetaan synergisillä.

Amplifikaatiot ja Homozygous poistot haimakarsinooma- tunnistanut Array CGH

Korkean tason tiomonistukset ilmaistu kahdella kromosomissa alueet mukaan lukien 7q21.3-q22.1 ja 19q13.2. Homotsygoottisia deleetioita havaittiin 1p33-p32,3, 1p22.1, 1q22, 3q27.2, 6p22.3, 6p21.31, 12q13.2, 17p13.2, 17q21.31 ja 22q13.1 (taulukko 3). Erityisesti syövän geeni AKT2 (19q13.2) monistettiin kahdessa karsinoomat ja CDKN2C (1p33) oli homozygously poistettiin muissa kahdessa tapauksessa. (Fig. 2). Etsimällä COSMIC tietokanta, olemme havainneet, että amplifikaatio AKT2 liittyi lisääntynyt sentitivity huumeiden Z-LLNIe-CHO. Enemmän kiinnostavaa, homotsygoottinen deleetio 22q13.1 sisältävien APOBEC3A ja APOBEC3B tunnistettiin sekä synergisillä ja Agilent Genomic Workbench analyysi (Fig. 3).

. monistaminen AKT2. B. homotsygoottinen deleetio CDKN2C. Nuolet osoittavat asema AKT2 ja CDKN2C.

Cycles edustavat mittapäiden APOBEC3A ja APOBEC3B.

lisäksi valitaan monistettujen geenien AKT2 (19q13.2 ) ja MCM7 (7q22.1) ja homotsygoottisia poistetut geenit CAMTA2 (17p13.2) ja PFN1 (17p13.2) tehtävän hyväksynnän reaaliaikainen PCR. 15 riippumaton validointi näytteitä, amplifikaatioita AKT2 ja MCM7 havaittiin 6 ja 9 tapauksissa, ja homotsygoottisia deleetioita CAMTA2 ja PFN1d 3 ja 1 tapauksissa, vastaavasti (Fig. 4A ja 4B). AKT2 ja MCM7 olivat yliekspressoituina ja CAMTA2 ja PFN1 oli ali-ilmentynyt haimasyövän kudoksissa kuin morfologisesti normaali operatiivinen marginaali kudoksissa (Fig. 5A ja 5B).

. amplication of AKT2 ja MCM7. B. homotsygoottinen deleetio CAMTA2 ja PFN1. C. homotsygoottinen deleetio APOBEC3A ja APOBEC3B. Ratio = (Copy määrä kandidaattigeenifragmenttikloonien kasvainkudoksissa) /(Copy määrä kandidaattigeenifragmenttikloonien kaupallisissa ihmisen genomista DNA: ta).

. Yliekspressio AKT2 ja MCM7. B. ali CAMTA2 ja PFN1. C. ali APOBEC3A ja APOBEC3B.

Itsenäisessä validointi näytteitä, APOBEC3A ja APOBEC3B olivat homotsygoottisia poistetaan 3 ja 4 kasvaimia, vastaavasti (kuvio. 4C). MRNA ekspressiotasot APOBEC3A ja APOBEC3B kasvainkudoksissa olivat huomattavasti pienemmät kuin morfologisesti normaali operatiivinen marginaali kudoksissa (kuvio. 5C) B

Väylät rikastettiin Kopioi numero muutostyöt

Pathway rikastukseen analyysin avulla Kegg tietokantaa levitettiin CGH tietoja. Huomasimme, että kahden reitin rikastettu geenien kanssa saada ja että kuusi reitit rikastettu geenien menetys. Genominen voitot haimakarsinooma- muutti polkuja gamma-heksakloorisykloheksaani hajoamista ja oksidatiivisen fosforylaation. Kuitenkin syanoamino aineenvaihdunnan, glutationi aineenvaihduntaa, atratsiini hajoamista, tauriinia ja hypotauriini aineenvaihduntaa, arakidonihapon aineenvaihduntaan ja Parkinsonin taudin reittejä muuttivat genominen tappiot (taulukko 4).

validointi HMGA2 ja PSCA haimasyöpä käyttäen immunohistokemia

Kopioi numero lisäystä HMGA2 ja PSCA havaittiin yhdestä neljään kasvain, vastaavasti. Koska niiden merkittävä rooli kasvainten synnyssä [10], [11], [12], [13], olemme analysoineet proteiinin ilmentymistä HMGA2 ja PSCA käyttäen immunohistokemia (IHC). Tulokset osoittivat, että yli-ilmentyminen HMGA2 ja PSCA havaittiin 76,7% ja 65,0% haiman syöpäpotilailla, vastaavasti (Fig. 6). Lisäksi PSCA: n yliekspressio liittyi merkitsevästi imusolmuke etäpesäke (taulukko 5), ja yliekspressio HMGA2 merkittävästi liittyy invasiivisia syvyys haimasyöpä (taulukko 6).

. Vahva ja negatiivinen ilmaus HMGA2. B. Vahvat ja negatiivinen ilmaus PSCA.

Keskustelu

Perimän poikkeamia voivat edistää syövän synnyn ja syövän etenemiseen. Jotta voitaisiin tunnistaa DNA kopioluvun muutoksia haimasyövän, suoritimme array-pohjainen vertaileva genominen hybridisaatio ja totesi, että kuusitoista voitot taajuuden yli 30% ja kolmekymmentä kaksi tappiota yli 60%, jossa on kaksi korkean tason monistuksissa at 7q21.3- q22.1 ja 19q13.2 ja kymmenen homotsygoottisia deleetioita 1p33-p32,3, 1p22.1, 1q22, 3q27.2, 6p22.3, 6p21.31, 12q13.2, 17p13.2, 17q21.31 ja 22q13. 1. Vertaamalla tuloksia CGH esitetyt tiedot progenetix verkkosivuilla [14], [15], huomasimme, että suurin osa genomista poikkeavuuksia olivat yhdenmukaisia. Mutta oli vielä joitakin eroja. Esimerkiksi menetys 9p oli yleisempi kuin menetys 9q in progenetix tietoja, mutta taajuus 9q menetys oli suurempi kuin 9p menetys tutkimuksessamme. Vahvistus 7. kromosomissa oli hyvin yleinen progenetix data, mutta menetys tämä kromosomi oli yleisempää tietomme.

On merkittävää, syövän geeni AKT2 monistettiin kahdella haimasyövän potilaille, ja syövän geeni CDKN2C oli homozygously poistettu muissa kahdessa tapauksessa. Me validoitu monistamisen AKT2 ja MCM7 (7q22.1) ja homotsygoottisia poistetaan CAMTA2 (17p13.2) ja PFN1 (17p13.2) haimasyövän, ja lisäksi havaittiin, että AKT2 ja MCM7 olivat yliekspressoituina ja CAMTA2 ja PFN1 oli ali-ilmentynyt haimasyövän kuin niitä morfologisesti normaali operatiivinen marginaali kudoksissa. Nämä tulokset viittaavat siihen, geenejä, mukaan lukien AKT2, MCM7, CAMTA2 ja PFN1 voisi olla tärkeä rooli haimasyövän. Homotsygoottinen deleetio CDKN2C on löydetty myeloomassa, ja kopioluvun lasku CDKN2C oli merkitsevästi yhteydessä huonompaan eloonjäämiseen [16], [17], [18]. Oli kuitenkin vielä vähän tietoa roolista CDKN2C haimasyövän. Mitä tulee muuttaminen AKT2 ihmisen maligniteettien, Miwa et al. ovat raportoineet monistamisen AKT2 oli 3 12 haimasyövän solulinjoissa ja 3 20 ensisijaisen haiman karsinoomat. Yliekspressio AKT2 havaittiin myös 3 solulinjoissa monistettiin AKT2 [19]. Ylös-säätely AKT2 korreloi ennusteeseen [20]. Tanno et ai. todettiin, että aktiivinen AKT edisti invasiivisuus haiman syöpäsoluja kautta ylös säätelevä IGF-IR ilmaisun [21]. RNAi samanaikaisesti kohdistaminen AKT2 ja K-ras voisi inhibite haiman kasvaimen kasvua [22]. Chen et ai. osoitti, että AKT2 estäminen voisi kumota gemsitabiinia aiheuttaman aktivaation AKT2 ja NF-KB: n, ja edistää gemsitabiinin aiheuttama PUMA säätelyyn ylöspäin, jolloin Chemosensiti- haiman kasvaimia gencitabine [23]. Tuloksemme Lisäksi todennettiin monistamisen AKT2 haimasyövän. Etsimällä COSMIC tietokannasta, Huomasimme myös, että monistuminen AKT2 liittyi lisääntynyt sentitivity lääkkeeseen Z-LLNIe-CHO. Kaikki nämä tulokset viittasivat siihen, että monistuminen AKT2 ehkä kehittyä biomarkkereiden jakaa haimasyövän potilaat eri alaryhmiin soveltamista eri terapia strategiaa. Ja tulevaisuudessa, onko lääke Z-LLNIe-CHO voidaan käyttää hoitoon haimasyövän potilaille, joilla AKT2 vahvistus tulisi tutkia.

Mielenkiintoista, sekä synergisillä ja Perimän Workbench Software tunnistettu 22q13.1 (joka sisältää APOBEC3A ja APOBEC3B) kuten homotsygoottinen deleetio alueella. Reaaliaikainen PCR-määritys osoitti, että APOBEC3A ja APOBEC3B oli ali-ilmentynyt haimasyövän kudoksissa kuin morfologisesti normaali operatiivinen marginaali kudoksissa. APOBEC entsyymit toimivat synnynnäisen immuunivasteen, mukaan lukien ne, jotka kohdistuvat retrovirukset, mikä viittaa siihen, yhteyksiä immuniteetin, mutageneesi ja virusinfektio prosessissa syövän kehittymisen. APOBEC3A voisi aiheuttaa hypermutaatiosta genomisen DNA: n ja DNA: n kaksinkertainen juostekatkoksia, ja katalysoivat siirtyminen terve syöpään genomiin [24], [25]. Pham et ai. raportoitu että APOBEC3A ilmaistiin keratinosyyteissä, ja säädellään ylöspäin ihosyöpä [26]. APOBEC3B oli yli-ilmentynyt useimmissa munasarjasyövän solulinjoissa ja korkealuokkaisesta primääri munasarjojen syöpiä. Improtantly APOBEC3B ilmentyminen korreloi yhteensä mutaion kuormitus sekä kohonneet transversiosta mutaatioiden [27]. Harris et al. kertoi, että APOBEC3B osuus jopa puolet mutaatioprosessiin kuorman rintakarsinoomissa ilmentävät tätä entsyymiä [28]. Muissa syövissä kuten virtsarakon, kohdunkaulan, keuhkojen ja pään ja kaulan, APOBEC3B oli myös voimistunut ja sen edullisia kohdesekvenssin oli usein mutatoitunut ja aihekokonaisuuksien [29]. Poistaminen APOBEC3B heikennettyjä HBV keräily, ja johti HBV-infektio ja suuressa riskissä sairastua maksasyövän [30]. Poistaminen APOBEC3 liittyi myös rintasyövän riskiä naisilla eurooppalaisten syntyperää [31]. Homotsygoottinen poistamisen APOBEC3B oli merkitsevästi yhteydessä epäedullinen tuloksia HIV-1 hankintaa ja etenemistä aids [32]. On mielenkiintoista tutkia roolia samaperintäisestä poistetaan APOBEC3A ja APOBEC3B haiman karsinogeneesissä.

HMGA2 ja PSCA on raportoitu liittyvän haimasyöpä. Piscuoglio et ai. osoitti, että osuus kasvainsolujen HMGA2 ja HMGA1 ydin- immunoreaktiivisuus korreloi positiivisesti yhä pahanlaatuisuuteen laatu ja imusolmukkeen etäpesäke [33], [34]. Ja HMGA2 yllä onkogeenisten RAS-indusoidun epiteelin-mesenkymaalitransitioon ihmisen haimasyövän soluja [35]. Tutkimuksemme osoitti, että voitot HMGA2 ja PSCA havaittiin yhdestä neljään haiman karsinoomat, vastaavasti. Vuonna IHC määrityksessä, yliekspressio HMGA2 havaittiin 76,7% ja PSCA: 65,0% kasvaimia. Ja PSCA: n yliekspressio oli merkitsevästi yhteydessä imusolmuke etäpesäke, ja yli-ilmentyminen HMGA2 oli merkitsevästi yhteydessä invasiivisia syvyys haimasyövän.

Kaiken Tutkimuksemme tunnistettu useita kopiomäärä-muuttunut kromosomialueita haimasyövän. Nämä havainnot tarjoavat tärkeitä oivalluksia molekyylitasolla muutoksia liittyy haiman kasvainten synnyssä. Lisätutkimuksia olisi tehtävä tutkia mahdollisia tuumorigeenisen rooleja näiden kopioluvun muuttunut geenejä.