Krooninen sairaus

tiivistelmä

Background

Bcl-2 -associated X-proteiinia (Bax) on proapoptoottiset jäsen Bcl-2-perheen tiedetään aktivoituvan ja voimistuvan apoptoosin aikana. Yhden emäksen monimuotoisuus (SNP) Bax promoottori voi osallistua prosessiin syövän muuttamalla omaa ilmaisua ja syöpään liittyvät geenit. Bax-248 g polymorfismi on liitetty muuttamaan syöpäriskiä, ​​mutta luetellut tulokset ovat ristiriitaisia ​​ja tuloksettomia. Tässä tutkimuksessa, suoritimme meta-analyysi järjestelmällisesti yhteenveto mahdollista yhteyttä tämän polymorfismin kanssa syöpäriskiä.

Menetelmät

Teimme etsimään tapaus-verrokki tutkimukset yhteenliittymien Bax-248 g polymorfismi alttiuteen syövän Pub Med, Science Direct, Wiley Online Library ja käsin. Tiedot kaikista voivat perustuvat tutkimukset joitakin keskeisiä hakutermejä, ja poissulkukriteereitä poimittiin tähän meta-analyysiin. Hardy-Weinberg tasapaino (HWE) kontrolleissa voima laskelma, heterogeenisyys analyysi, Begg n suppilo juoni, Egger n lineaarisen regression testi, metsä juoni ja herkkyysanalyysi tehtiin tässä tutkimuksessa.

Tulokset

syöpäriski liittyy Bax-248 g polymorfismi arvioitiin yhdistettiin kertoimet suhdeluvut (syrjäisimmillä alueilla) ja 95%: n luottamusväli (95% CI). Yhdistetty syrjäisimpien laskettiin alleelin sijaan homotsygoottinen vertailu, heterotsygoottinen vertailu, hallitseva ja väistyvä malli. Tilastollinen merkittävyys tarkasteta Z ja p-arvo metsässä juoni. Yhteensä seitsemän riippumattomien tutkimusten mukaan lukien 1772 tapaukset ja 1708 kontrolleja mukana meidän meta-analyysi. Tuloksemme osoittivat, että kumpikaan alleelifrekvensseiltään eikä genotyypin jakaumat Tämän polymorfismi liittyi riski syövän tahansa geneettisen mallin. Lisäksi Egger testi ei osoittanut mitään merkittäviä todisteita julkaisun puolueellisuudesta.

Johtopäätökset /merkitys

Tämä meta-analyysi viittaa siihen, että Bax-248 g polymorfismi ei ole tärkeä syövän riskitekijä. Kuitenkin ylimääräinen hyvin suunniteltu tutkimuksia suurempi näytekoko keskittyen eri etnisten ryhmien ja syövän tyypit tarvitaan edelleen vahvistaa tulokset.

Citation: Sahu SK, Choudhuri T (2013) puuttuminen Association between Bax Promoottori (- 248 g A) yhden emäksen monimuotoisuus ja herkkyys kohti Cancer: Todisteet meta-analyysi. PLoS ONE 8 (10): e77534. doi: 10,1371 /journal.pone.0077534

Editor: Bhaskar Saha, National Center for Cell Science, Intia

vastaanotettu: 16 huhtikuu 2013; Hyväksytty: 04 syyskuu 2013; Julkaistu 17. lokakuuta 2013

Copyright: © 2013 Sahu, Choudhuri. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: SKS oli tukee neuvoston tieteellisen ja teollisen tutkimuksen, Intian hallitukselle. Tätä työtä tukivat jota sisäiset myöntäminen Institute of Life Sciences, Department of Biotechnology, Intian hallitus. Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

erityinen syövän syiden eivät ole vielä tiedossa. Kuitenkin epidemiologiset tutkimukset edistävät ehdottaa suhdetta geneettistä vaihtelua syöpään herkkyys. Geneettiset yhdistys tutkimukset yhden emäksen monimuotoisuus (SNP) kohdistaminen syöpä on syntymässä tutkimusala. SNP voidaan määritellä genomisen lokuksen, jossa kaksi tai useampia vaihtoehtoisia emäksiä esiintyä huomattavia taajuus on suurempi kuin 1% [1]. Yhteensä noin 10 miljoonaa SNP on jaettu koko ihmisen genomin taajuudella ainakin yksi 1000 emäsparin ja on alhainen mutaatioaste [2]. Aiemmat tutkimukset ovat osoittaneet, että SNP-onkogeenien (esim Ras [3], mdm2 [4]: ​​n ja VEGF [5]) ja kasvaimen synnyssä (esim p53 [6], Rb ja p16 [7]) voi suojata tai lisätä alttiutta kohti syöpäriskiä. Näin ollen, SNP-analyysi voi olla väline, joka selittää geneettisen monimutkaisuutta vastuussa syövän kehittymisen jossain määrin. Se lupaa tunnistamisen helpottamiseksi uusien syöpään liittyvien geenin bio-markkeri ennustaa yksilön todennäköisyys sairastua syöpään. Bax-geeni on hyvin tutkittu tuumorisuppressorigeenin erilaisissa solutyypeissä. Bax koodaa kuusi eksonit ja ilmaisee monimutkainen kuvio vaihtoehtoisia Silmukointi joka muodostaa 21 kDa: n kalvo (α) ja kahta sytosolin proteiiniin (β ja γ). Se kuuluu proapoptoottiset jäseneksi Bcl-2-perheen ja on liitetty apoptoosin [8]. Se on käyttämättömänä sytosolissa ei-apoptoottisten solujen aikana homeostatic olosuhteissa. Kun solun kuoleman signaalin, Bax käy läpi konformaation muutoksen, joka johtaa ne liitetään, oligomerointi ja muodostumista suuria huokosia ulomman mitokondriokalvon [9]. Monet apoptogenic tekijät, kuten sytokromi c [10,11], Smack /Diablo [12], Omi /HtrA2 [13], endonukleaasi G [14] ja apoptoosia indusoivan tekijän [15] vapautuvat kautta huokosten ja rekrytoi erilaisia ​​molekyylejä apoptoottisten reittien . Lukuisat tutkimukset ovat osoittaneet, että vuorottelu Bax ilmentymisen on tärkeä rooli patogeneesissä syövän [16-21]. Geneettinen muutos Bax geeni voi olla erottaa merkitystä syövän taudin alkamisen ja etenemisen, koska sillä on joukko kohdegeenien kuten monet onkogeenit ja tuumorisuppressorigeeneille [22-26]. Tutkimukset yhdistyksen välillä SNP Bax ja ihmisen syövän ovat antaneet uutta tietoa molekyylimekanismeihin syövän kehittymisen. Tähän mennessä ainakin 111 Bax SNP on raportoitu Enterzdatabase. Siinä tapauksessa, ruoansulatuskanavan syöpä, joiden mutaatiot Bax-geenin kodonissa 169 (Thr Ala tai Thr Met) aiheuttaa inhibitio proapoptoottiset proteiinin aktiivisuutta ja parantaa syövän kehittymisen [27]. Guaniini korvaamalla adenosiini asemassa 125 (G125A) on Bax promoottori liittyy suurempi vaiheisiin kroonisen lymfaattisen leukemian (KLL) ja jättäminen hoitovastetta [28]. Hiljainen pistemutaatio Bax kodonien 184 (TCG TCA) on raportoitu keuhkosyövän potilaalle [29]. Vaikka Bax-geenin polymorfismi on viittaa sen potentiaali osallistuminen syövän kehittymisessä, nykyinen tietämys SNP sijaitsevat 5′-alueen tietokoneanalyysia promoottorin Bax-geenin, 248 g A, syövässä on edelleen dispersiivinen ja rajoitettu. Bax-248GA polymorfismi on liitetty down-regulation Bax-geenin ilmentymisen, edenneen taudin vaiheessa, alempi hoitovasteen ja laski eloonjäämismahdollisuus CLL ja keuhkosyöpää. Lisäksi on olemassa ristiriitaisia ​​raportteja, joissa puute välistä yhteyttä tämän polymorfismin kanssa riski KLL ja rintasyöpä. Niinpä jotkut tutkijaryhmä raportoitu Bax-248GA polymorfismi voisi olla biologinen markkeri alttius tai protectibility syövälle [30-32], kun taas muut [33-37] osoittaa puutetta yhdistys. Kuitenkin suhteellisen pienestä otoksesta, nämä entiset tutkimukset tarjotaan vähän tietoa eikä voinut tehdä convincible johtopäätös. Siksi teimme meta-analyysi kaikkien käytettävissä olevien tutkimusten (tarkistuslista S1. PRISMA tarkistuslistan.) Antaa luotettavamman johtopäätös suhteesta Bax-248GA polymorfismi ja syöpäriskiä.

Materiaalit ja menetelmät

Julkaisut haku

laaja haku suoritettiin Pub Med, Science Direct, Wiley Online Library ja käsin yhdistelmä seuraavista hakutermit: Bax, polymorfismi, SNP, mutaatio ja /tai syövän jopa maaliskuussa 2013. Arvioimme kaikki siihen liittyviä julkaisuja tunnistaa kaikkein tukikelpoisten kirjallisuudesta. Valintamenettely Tämän tutkimuksen on esitetty kuvassa 1. Tulokset rajoittuivat julkaistuista Englanti. Lopuksi seitsemän tutkimusta todettiin voivat artikkelit tässä meta-analyysi Bax-248GA polymorfismi, joista neljä tutkimukset CLL (812 tapausta ja 462 kontrollit), yksi tutkimus okasolusyöpä (814 tapausta ja 934 kontrollit), yksi tutkimus keuhkosyöpä (93 tapausta 230 tarkastukset) ja yksi tutkimus rintasyövästä (53 tapausta 82 kontrollit).

Tämä perustuu julkaisun haku, ja poissulkukriteereitä.

Inclusion ja Poissulkukriteerit

seuraavat kriteerit käytettiin valita tutkimuksiin tähän meta-analyysi (a) julkaistu alan lehdissä, (b) artikkeleita Bax-248GA polymorfismi ja riski syöpiä ja (c) tuotteet, jotka sisältävät hyödyllisiä alleeli ja genotyyppi taajuus. Poissulkukriteerit olivat (a) ei tapausverrokkitutkimukset, (b) kontrolli populaatio myös tapauksia syövistä, ja (c) päällekkäisyyksien aiemman julkaisun.

Data Extraction

Kaksi tutkijat (SKS ja TC) tarkistetaan ja uutetaan tiedot kaikista oikeutettuja julkaisuista toisistaan ​​riippumatta mukaisesti ja poissulkukriteereitä yllä. Seuraavat ominaisuudet kerättiin kunkin tutkimuksen: ensimmäinen tekijän nimi, julkaisuvuosi, alkuperämaan, syövän tyypistä, genotyypitysmenetelmää arvioimiseksi Bax-248GA polymorfismi, kokonaismäärä valvontaa ja tapauksissa, joissa G /G, G /A ja A /A genotyyppien.

tilastollinen analyysi

ensin arvioitiin Hardy-Weinberg tasapaino (HWE) kunkin tutkimuksen avulla SNPalyze ohjelmistoa (DYNACOM, Japani) tunnistaa järjestelmällisen genotyypitys virheitä. Tehon laskenta suoritettiin ennalta käyttäen PS: Virta ja Sample Size laskentaohjelma (https://biostat.mc.vanderbilt.edu/twiki/bin/view/Main/PowerSampleSize), joka osoitti, että näyte koko lähes 200 valvonta ja tapaukset antaisi teho on yli 50%. Genotyypin ja alleelin frekvenssi laskettiin käsin laskentaa. Kaikki tilastollisen analyysin kuluvan meta-analyysi suoritettiin kattavia meta-analyysin versio 2 ohjelmisto. Yhdistys Bax-248GA polymorfismi syövän arvioitiin laskemalla kertoimet suhdeluvut (syrjäisimmillä alueilla) ja 95%: n luottamusvälit (CI) eri malleissa: (i) alleelin kontrasti (A vs. G), (ii) homotsygoottinen vertailu (AA vs. GG), (iii) heterotsygoottista vertailu (GA vs. GG), (iv) hallitseva malli (AA + GA vs. GG) ja (v) resessiivinen malli (AA vs. GG + GA) tutkimuksessa I, II, III, IV ja V.. Myös Z ja p-arvot laskettiin metsän tontti (Kuva 2.) Kaikissa tapauksissa tulokset heterogeenisyys testin olivat P

heterogeenisyys 0,05, joten syrjäisimmät alueet yhdistettiin mukaan sattumanvaraiset vaikutukset malli (Der Simonian ja Laird menetelmä). Lisäksi I

2 tilastoja käytettiin määrittämään muun tutkimuksen vaihtelu, joka voi johtua heterogeenisuus sattuman sijaan. Se vaihtelee välillä 0% ja 100%, kun arvo on 0% kertoo ole missään heterogeenisyys ja suuremmat arvot osoittavat yhä heterogeenisuuden aste (I

2 = 0-25%, ei heterogeenisyys; I

2 = 25 -50%, kohtalainen heterogeenisyys; I

2 = 50-75%, suuri heterogeenisyys; I

2 = 75-100%, äärimmäinen heterogeenisyys). Kohtalainen heterogeenisuus havaittiin useimmissa malleja, jotka olivat mukana analyysissä (Kaiken alleeli A vs. G: P

heterogeenisyys 0,0001, I

2 = 79,42; homotsygoottinen vertailu, AA vs. GG: P

heterogeenisyys = 0,01, I

2 = 69,92; heterotsygoottinen vertailu, GA vs. GG: P

heterogeenisyys = 0,008, I

2 = 65,72; Yleisesti hallitseva malli, AA + GG vs. GG: P

heterogeenisyys 0,0001, I

2 = 75,54; Yleisesti väistyvä malli, AA + GG vs. GG: P

heterogeenisyys = 0,03, I

2 = 62.07).

neliöt ja vaakasuorat viivat vastaavat tutkimuskohtaiset kertoimet tunnusluvut (syrjäisimmillä alueilla) ja 95% luottamusvälit (CI) vastaavasti. Alueella neliöiden heijastaa tutkimuksen ominaispaino (käänteistä varianssi). Timantti edustaa yhdistettyä syrjäisimpien alueiden ja 95%: n luottamusväli.

Tulokset

Tutkimus Ominaisuus

Havaitsimme 230 mahdollisesti merkitystä artikkeleita meidän löytynyt julkaistun kirjallisuuden sekä joka 196 artikkelia jätettiin jälkeen alustavan tarkastelun. Siten yhteensä 34 tutkimukset tunnistettiin valinta perustuu kriteerit. Aikana tietojen poiminta 25 artikkeleita, jotka eivät ole merkityksellisiä Bax-248GA polymorfismi ja syöpiä jätettiin pois. Lopuksi jälleen kaksi tutkimusta suljettiin jälkeen koko tekstin tarkastelun yksi johtuu puutteellisesta luokittelun valvonta /tapausten [33] ja toinen ei olennaisten tietojen toimittaminen [38]. Siksi seitsemän tapausverrokkitutkimukset lukien 1772 tapaukset ja 1708 tarkastuksia (päivitetty maaliskuussa 2013) tunnistettiin ja sisällytetty lopulliseen meta-analyysi (kuva 1) tärkeimmät ominaisuudet esiteltiin taulukossa 1. Näyte koon seitsemän tutkimusta vaihteli 59 1748. seitsemän tutkimukset sisältävät väestöä Yhdysvallat (USA), Yhdistynyt kuningaskunta (UK), Saksa, Kanada, Ruotsi, Venäjä, Turkki ja Suomi [30-32,34-37]. Jakauman Bax-248GA polymorfismi taajuus keskuudessa tapausten ja kontrollien seitsemän tutkimusten eri syöpätyyppejä (KLL, levyepiteelikarsinooma, keuhkosyöpä ja rintasyöpä) on lueteltu taulukossa 1. genotyyppi taajuus valvonta kaikki tutkimukset ovat totellen HWE paitsi tutkimus Kuznestova et al [32].

ensimmäisen tekijän, vuosi, Viite

Maa

Cancer tyyppi

genotyypin menetelmä

Otoskoko

Controls

Kotelot

p

arvo HWE

Virta (%) B (ohjaus /Case) GGGAAAGGGAAAA.Saxena, 2002 [30] Kanada Krooninen lymfaattinen leukemiaPCR25 /342410221200.9117J. Starczynski, 2005 [33] UKChronic lymfosyyttinen leukemiaPCR135 /2031151911574420.8282A. Skogsberg, 2006 [34], Ruotsi, Germeny, FinlandChronic lymfosyyttinen leukemiaPCR207 /4631634043738460.4099H. Nuckel, 2006 [35] GermanyChronic lymfosyyttinen leukemiaPCR95 /11279151872140.7658K. Chen, 2007 [36] USASquamous solu carcinomaPIRA-PCR934 /81472320011627170170.49100Irina A. Kuznetsova, 2012 [32] RussiaLung CancerPCR-RFLP230 /931118039672150.000580Yemilha Yildiz, 2013 [37] TurkeyBreast cancerPCR82 /5363190431300.2339Table 1. jakauma Bax-248 g genotyypin keskuudessa syöpätapausta ja valvonta sisältää meta-analyysissä.

HUOMAUTUS: PCR; polymeraasiketjureaktio, PIRA; Primer-käyttöön restriktioanalyysillä, HWE; Hardy-Weinberg tasapaino. CSV Lataa CSV

Meta-analyysin tulokset

Kaikkiaan seitsemästä itsenäisesti tutkimuksia tutkittiin ja niiden tulokset olivat meta-analysoitiin. Metsäviljelmien kuvassa 2, osoitti yksityiskohtaisesti tulokset Bax-248GA polymorfismi ja syöpäriskiä. Kokonaisanalyysi havaittiin kaikki geneettiset mallit (OR = 1,032, 95% CI = +0,687-+1,549, Z-arvo = 0,151, p-arvo = 0,880 A vs. G tutkimuksessa I, OR = 0,903, 95% CI = 0,308 ja 2,646, Z-arvo = -0,186, p-arvo = 0,852 AA vs. GG tutkimuksessa II OR = 1,028, 95% CI = 0,714-1,480, Z-arvo = 0,147, p-arvo = 0,883 GA vs. GG tutkimuksessa III OR = 1,031, 95% CI = 0,680-1,561, Z-arvo = 0,142, p-arvo = 0,887 varten hallitseva malli AA + GA versus GG tutkimuksessa IV; OR = 0,932, 95% CI = +0,360-+2,417, Z-arvo = -0,144, p-arvo = 0,886 varten väistyvä malli AA vs. GG + GA tutkimuksessa V). Kaikissa tapauksissa p-arvot olivat 0,05. Niinpä mikään malli osoitti merkittäviä yhdistysten Bax-248GA polymorfismi ja syöpäriskiä.

herkkyysanalyysi

Herkkyysanalyysit tehtiin arvioimaan vakautta tulosten peräkkäisellä jättäminen henkilökohtaisen opintosuunnitelman joka kerta. Tämä heijastelee yksittäisten tietojen asetettu yhdistettiin syrjäisimmille alueille. Merkitys yhdistettyä syrjäisimpien ei vaikuttanut liikaa jättämällä pois jokin yksittäinen tutkimus (täydentävä luvut: S1, S2, S3, S4, S5, S6 ja S7).

Julkaisu Bias

Begg n suppilo juoni ja Egger n lineaarinen regressio testit [39] tehtiin arvioida julkaisun bias raporteissa mukana meta-analyysissä. Suppilon juoni on kuvaaja mitta tutkimuksen koko (yleensä keskivirhe tai tarkkuus) pystysarakkeessa funktiona vaikutus koko vaaka-akselilla. Muoto suppilo tontteja ei ilmennyt näyttöä epäsymmetrian kaikissa vertailun mallit: (i) alleelin kontrasti (A vs. G), (ii) homotsygoottinen vertailu (AA vs. GG), (iii) heterotsygoottista vertailu (GA versus GG), (iv) hallitseva malli (AA + GA vs. GG) ja (v) resessiivinen malli (AA vs. GG + GA) tutkimuksessa I, II, III, IV ja V (kuvio 3). Sitten, Egger n testiä käytettiin antamaan tilastollista näyttöä suppilon juoni symmetria. Tämä testi arvioi bias käyttämällä tarkasti ennustamaan standardoitu vaikutus. Tässä esillä analyysit tutkimus I: siepata = 0,91, 95% CI = -3,51-+5,35, P-arvo = 0,61, SE = 1,72, t-arvo = 0,53, df = 5; Opiskelua II: siepata = 0,45, 95% CI = -7,13-+8,05, P-arvo = 0,86, SE = 2,38, t-arvo = 0,19, df = 3; Opiskelua III: siepata = 1,09, 95% CI = -2,21-+4,40, P-arvo = 0,43, SE = 1,28, t-arvo = 0,85, df = 5; Opiskelua IV: siepata = 0,97, 95% CI = -3,06-+5,02, P-arvo = 0,56, SE = 1,57, t-arvo = 0,62, df = 5; Opiskelua V: siepata = 0,36, 95% CI = -6,39-+7,11, P-arvo = 0,87, SE = 2,12, t-arvo = 0,17, df = 3. Tulokset eivät osoittaneet mitään todisteita julkaisun bias (taulukko 2 .).

Jokainen piste edustaa erillistä tutkimusta. OR merkittiin Logaritmiasteikolla vastaan ​​tarkkuus (käänteisluku SE) jokaisen tutkimuksen.

Vertailut

Egger n regressioanalyysi

heterogeenisuus analyysi

Malli käyttää meta -analyysiohjelman

Intercept

95%: n luottamusväli

P- arvo

SE

t-arvo

df

P

heterogeenisyys

I

2 (%)

A vastaan ​​G0.91-3.51 on 5.350.611.720.535 0.000174.92RandomAA vs GG 0,45-7,13 jotta 8.050.862.380.1930.0169.92RandomGA vs GG1.09-2.21 että 4.400.431.280.8550.00865.72RandomAA + GA vs GG0.97-3.06 on 5.020.561.570.625 0.000175.54RandomAA vs GG + GA0.36-6.39 on 7.110.872.120.1730.0362.07RandomTable 2. tilastot testata julkaisu bias ja heterogeenisyys meta-analyysi Bax -248G polymorfismi ja syöpäriskiä.

CSV Lataa CSV

keskustelu

Apoptoosi on tapahtuma, joka johtaa kuolemaan solujen vapauttamatta haitallisia aineita kudokseen . Mitokondrioita välittämä apoptoottisen solukuoleman Bax toimii olennaisena reitittimeen Aktivoinnin peruuttamattomasti sitoutuu suurinta solut kuolevat [40,41]. Sitä on tutkittu laajasti suhdettaan eri syöpien, kuten haimasyövän [19,42], virtsarakon [21], mahalaukun [18], ja peräsuolen [43,44], ruokatorven [16], keuhko [32,45 , 46], kohdunkaulan [47], paksusuolen [48,49], eturauhassyöpä [50,51], levyepiteelisyöpä pään ja kaulan [36], nenänielun karsinooma [52], rintasyövät [32,53], munasarjakarsinooma [54], munuaisten ja siirtymäkauden syöpä [55], gliooma [56], CLL [30,31,33-35,38,57], Hodgkinin lymfooma [17], ei-Hodgkinin lymfooma [58], myelooma [59], akuutti leukemia [60] jne Bax promoottori sisältää vastauksen elementtejä tärkeä tuumorisuppressoriproteiinia p53 ja tämä vaikuttaa geenin ilmentymisen [28]. Suhteessa tärkeitä rooleja Bax apoptoosin, se on biologisesti todennäköistä, että sen polymorfismi voi moduloida syöpäriskiä. Altered ilmentyminen Bax-proteiinin näyttää merkitystä Karsinogeneesin mutta mutaatiot johtavat sääntelyn ja korrelaatiot näiden mutaatioiden kanssa syöpä on herättänyt huomiota keskuudessa tutkija. Useat ryhmät ovat tutkineet suhteita Bax-248GA polymorfismi ja syövän eri tutkimuksissa toistaiseksi. Alkuperäisessä raportissa Saxena et al. vuonna 2002 tehdyssä tutkimuksessa 25 valvonnan ja 34 CLL he ovat osoittaneet, että lisääntynyt genotyyppi taajuuden Bax-248GA polymorfismi potilaan kontrolleihin verrattuna, etenkin korkea taudin vaiheessa. Tässä tutkimuksessa genotyypin taajuus kontrolliryhmässä oli 5,7% GA genotyyppien, mikä oli 68,7% ja KLL vaiheessa I-IV [30]. Tämä havainto tukivat tutkimus Moshynska et al. jossa he ovat osoittaneet tämän SNP kuin heikentyneen Bax-proteiinin ilmentymisen [31], joka voi olla syynä lääkeresistenssin CLL potilaalle. Tuoreessa tutkimuksessa Kuznestova et al. vuonna 2012, osoittivat merkittävää kasvua taajuuden -248G alleelin (88.33%) ja -248GG genotyyppi (72,04%) vuonna keuhkosyöpäpotilaita jotka olivat 65,65% ja 48,26% vastaavasti terveiden verrokkien. Näin ollen ne ovat osoittaneet suojaava rooli tämän polymorfismin.

Kuitenkin tulokset muilta ryhmiltä raportoitu puute yhdistyksen tämän polymorfismin ja syöpäriskiä. Starczynski et ai. niiden tutkimuksessa todettiin 23% KLL ja 15% valvonnan ilman merkittävää alleelifrekvensseiltään kahden ryhmän välillä [33]. Skosberg et ai. niiden CLL potilaalla ei havaittu huomattavia eroja kokonaiselossaoloaikaa kanssa tai ilman Bax polymorfismi [34]. Nuckel et ai. osoittivat genotyyppi jakautuminen CLL (87 GG, 21ag, 4 AA) ja terveillä verrokeilla (79 GG, 15 AG, 1 AA) eivät olleet merkittävästi erilaiset viittaa siihen, että tämä polymorfismi ei saa lisätä alttiutta CLL (G-alleelin taajuus CLL : 0,87; valvonta: 0,91) [35]. Chen et ai. ei löytänyt mitään tilastollisesti merkittävää eroa frekvenssijakaumat Bax-248 G SNP tapausten ja kontrollien välillä (P = 0,625). Kun Bax GG-genotyyppi otettiin vertailuryhmään, ei assosioitunut AA ja AG variantti genotyypit kanssa levyepiteelisyövän pään ja kaulan (SCCHN) induktiohoitoon riski [36]. Yildiz et ai. osoittivat, että Bax Bax-248GA genotyypin ja alleelifrekvensseiltään välillä valvonnan ja rintasyöpäpotilaiden eivät olleet tilastollisesti merkitseviä (p = 0,866, p = 0,856 vastaavasti) [37]. Kokonaisuutena tulokset noin yhdistyksen välillä Bax-248GA polymorfismi ja syövän riskiä edelleen ristiriitaisia ​​ja tuloksettomia. Ristiriitainen Tulokset ovat mahdollisesti koska pieni vaikutus Bax-248GA polymorfia syöpäriskiin tai suhteellisen alhainen tilastollisen tehon julkaistuja tutkimuksia. Eli tämä meta-analyysi oli tarpeen osoittaa kvantitatiivista lähestymistapaa yhdistämällä eri saatavilla tuloksia. Meta-analyysi on tehokas menetelmä, joka voidaan yhdistää havainnot useiden riippumattomien vastaavien tutkimusten kanssa ristiriitaisia ​​tuloksia tuottaa yksittäisen arvion suuri vaikutus tiiviimmän tarkasti [39]. Tässä esillä olevassa meta-analyysi, yhteensä seitsemän tapausverrokkitutkimukset analysoitiin tarjota kattava arvio yhdistyksen välisen Bax-248GA polymorfismi ja yleistä syöpäriskiä. Tutkimuksissa mukana tässä meta-analyysissä olivat suhteellisen pieniä, mutta määrä koko valvonnan ja tapaukset olivat huomattavia, mikä lisäsi tilastollinen voima analyysin. Tapaus-verrokkitutkimuksissa sisällytetty tähän analyysiin olivat tyydyttäviä, koska ne täyttyvät meidän ennalta kriteerit. Emme havainneet mitään julkaisu bias viittaa siihen, että koko yhdistettyä tulokset olivat puolueeton.

Kerroin suhteita käytettiin määrittämään suhteellinen kertoimella esiintymisen syöpäriskin Bax-248GA polymorfismi ja 95%: n luottamusväli arvioida tarkkuus OR. Suuri CI osoittaa matalan tason tarkkuus OR, kun taas pieni CI tarkoittaa suurta tarkkuutta OR. Meidän tulokset esitetään kuviossa 2, yksilöiden alleeli oli lisääntynyt syöpäriski verrattuna villityypin alleelin A (OR = 1,032, 95% CI = 0,687-1,549). Yksilöt, joilla on homotsygoottinen variantti AA oli alentunut syöpäriski verrattuna villityypin GG variantti (OR = 0,903, 95% CI = +0,308-+2,646) ja joilla on heterotsygoottinen variantti GA oli lisääntynyt syöpäriski verrattuna villityypin GG variantti (OR = 1,028, 95% CI = 0,714-1,480). Vuonna hallitseva malli, yksilöiden genotyypin (AA + GA) oli lisääntynyt syöpäriski verrattuna villityypin GG variantti (OR = 1,031, 95% CI = +0,680-+1,561) ja resessiivinen mallissa homotsygoottinen variantti AA oli pienentynyt riski syöpä verrattuna (GA + GG) genotyyppi (OR = 0,932, 95% CI = +0,360-+2,417). Mutta koko yllä viiden vertailu malli p-arvot olivat 0,05 jossa ehdotettiin puute merkittävää yhteyttä kohti nousu tai lasku syöpäriskiä vuoksi Bax-248GA polymorfismi.

heterogeenisuus havaittiin näistä tutkimuksista kautta I

2 arvo. Heterogeenisuus saattaa johtua useista eri tekijöistä, kuten monimuotoisuutta väestön ominaisuus, tutkimuksen suunnittelu, eroista tapausten määrä ja valvonnan, genotyyppi menetelmä, jne. Jotkut voivat julkaisematon julkaisuja ei ollut saatavilla sisällyttää esillä meta-analyysi, joka saattaa vaikuttaa tuloksiin. Valinta bias voinut pelata rooli vaikuttaa tulokseen, koska genotyyppijakauman tämän polymorfismin poikkesi HWE yhdessä tutkimuksessa [32]. Tulokset perustuvat oikaisemattomaan arvioihin, kun taas tarkempi tilastollinen analyysi pitäisi tehdä, jos yksittäinen aineisto oli saatavilla. Tämä mahdollistaisi tutkijalta säädön muiden sekoittavien muuttujia kuten ympäristötekijät ja muiden elämäntapojen.

Parhaan tietomme tämä on ensimmäinen meta-analyysi koskien kattava arviointi suhdetta Bax-248GA polymorfismia syöpäriskiä. Tuloksemme eivät tue geneettistä yhdistyksen välillä tämän polymorfismin ja syöpäalttiuteen vahvistavat joidenkin edellisen tapausverrokkitutkimukset [34-37]. Kumpikaan alleelifrekvensseiltään eikä genotyypin jakaumat olivat merkitsevästi yhteydessä syöpäalttiuteen joka hypoteesit että Bax-248GA polymorfismi voi olla mitään roolia syövän haavoittuvuutta. Lisäksi koska suhteellisen pieneen otokseen, tulos tarvitaan edelleen validointi ja vahvistuksen suuren otoksen tutkimukset.

jälkeen käytännön suosituksia, jotka muodostavat toimintapisteitä voi olla harkita tulevaisuudessa assosiaatiotutkimuksiin:

puute yhdistys tässä tutkimuksessa Bax-248GA polymorfismi ja syövän riski olisi toistettu biologisia toimintoja paremmin motivoida tutkimuksen ja mahdollistaa tulosten tulkintaan. Histopatologisia ja kliiniset tiedot voivat sub luokitella tyyppi ja vaihe monet syöpätapauksista saada enemmän homogeeninen populaation analysoitavaksi.

Yritä pienentää väärien positiivisten ja negatiivisten tulosten suorittamalla tutkimuksia suuressa näytteessä jaottelu iän, sukupuoli, ruoka tottumus, elämäntapa ja etnisyys.

Tutkimuksissa yhdistetyt vaikutukset eri Bax polymorfismin tai eri polymorfismia Bax liittyvien geenien (esim Bcl2) olisi tutkittava.

rooli ympäristötekijät ja epistaattinen vuorovaikutus ei pidetä tässä tutkimuksessa puutteen vuoksi tiedon alkuperäisen julkaistut artikkelit, jotka on tutkia tarkemmin tehdä luotettavampia johtopäätöksiä.

Johtopäätös

Tämä tutkimus ei paljasta merkittäviä yhdistys Bax -248GA SNP syöpäriski on osoituksena kaikkien geneettisissä malleissa. Lisäksi olisi valaisevaa laajentaa tutkimuksen laajempaa väestössä lukien eri syöpätyyppejä, joka voi johtaa parempaan, kokonaisvaltainen käsitys yhdistyksen välinen polymorfismin ja alttiutta syöpään. Kyky toteuttaa osallistumista tämän SNP kohti syövän etiologiasta ja yksilön mahdollisuus sairastua syöpään tarkastelemalla Suositusehdotuksen auttaa tulevaisuudessa. Tämä voi lisäksi kääntää perustutkimuksessa tai kliininen käytäntö pelastaa ihmishenkiä.

tukeminen Information

tarkistuslista S1.

PRISMA tarkistuslista.

doi: 10,1371 /journal.pone.0077534.s001

(DOC) B Kuva S1.

Puun tontti (A) ja suppilo juoni (B) Bax-248 g polymorfismi yhdessä syövissä jälkeen poisjättäminen A. Saxena et al. (2002) tutkimuksessa.

metsä tontti (A), neliöitä ja vaakaviivat vastaavat tutkimuskohtaiset kertoimet tunnusluvut (syrjäisimmillä alueilla) ja 95% luottamusvälit (CI) vastaavasti. Alueella neliöiden heijastaa tutkimuksen ominaispaino (käänteistä varianssi). Timantti edustaa yhdistettyä syrjäisimpien alueiden ja 95%: n luottamusväli. Vuonna suppilo tontti (B), kukin piste edustaa erillisessä tutkimuksessa. OR merkittiin Logaritmiasteikolla vastaan ​​tarkkuus (käänteisluku SE) jokaisen tutkimuksen.

Doi: 10,1371 /journal.pone.0077534.s002

(TIF) B Kuva S2.

Puun tontti (A) ja suppilo juoni (B) Bax-248 g polymorfismi yhdessä syövissä jälkeen poisjättäminen J. Starczynski et al. (2005) tutkimuksessa.

metsä tontti (A), neliöitä ja vaakaviivat vastaavat tutkimuskohtaiset kertoimet tunnusluvut (syrjäisimmillä alueilla) ja 95% luottamusvälit (CI) vastaavasti. Alueella neliöiden heijastaa tutkimuksen ominaispaino (käänteistä varianssi). Timantti edustaa yhdistettyä syrjäisimpien alueiden ja 95%: n luottamusväli. Vuonna suppilo tontti (B), kukin piste edustaa erillisessä tutkimuksessa. OR merkittiin Logaritmiasteikolla vastaan ​​tarkkuus (käänteisluku SE) jokaisen tutkimuksen.

Doi: 10,1371 /journal.pone.0077534.s003

(TIF) B Kuva S3.

Puun tontti (A) ja suppilo juoni (B) Bax-248 g polymorfismi yhdessä syövissä jälkeen poisjättäminen A. Skogsberg et al. (2006) tutkimuksessa.

metsä tontti (A), neliöitä ja vaakaviivat vastaavat tutkimuskohtaiset kertoimet tunnusluvut (syrjäisimmillä alueilla) ja 95% luottamusvälit (CI) vastaavasti. Alueella neliöiden heijastaa tutkimuksen ominaispaino (käänteistä varianssi). Timantti edustaa yhdistettyä syrjäisimpien alueiden ja 95%: n luottamusväli. Vuonna suppilo tontti (B), kukin piste edustaa erillisessä tutkimuksessa. OR merkittiin Logaritmiasteikolla vastaan ​​tarkkuus (käänteisluku SE) jokaisen tutkimuksen.

Doi: 10,1371 /journal.pone.0077534.s004

(TIF) B Kuva S4.

Puun tontti (A) ja suppilo juoni (B) Bax-248 g polymorfismi yhdessä syövissä jälkeen poisjättäminen H. Nuckel et al. (2006) tutkimuksessa.

metsä tontti (A), neliöitä ja vaakaviivat vastaavat tutkimuskohtaiset kertoimet tunnusluvut (syrjäisimmillä alueilla) ja 95% luottamusvälit (CI) vastaavasti. Alueella neliöiden heijastaa tutkimuksen ominaispaino (käänteistä varianssi). Timantti edustaa yhdistettyä syrjäisimpien alueiden ja 95%: n luottamusväli. Vuonna suppilo tontti (B), kukin piste edustaa erillisessä tutkimuksessa. OR merkittiin Logaritmiasteikolla vastaan ​​tarkkuus (käänteisluku SE) jokaisen tutkimuksen.

Doi: 10,1371 /journal.pone.0077534.s005

(TIF) B Kuva S5.

Puun tontti (A) ja suppilo juoni (B) Bax-248 g polymorfismi yhdessä syövissä jälkeen poisjättäminen K. Chen et al. (2007) tutkimuksessa.

metsä tontti (A), neliöitä ja vaakaviivat vastaavat tutkimuskohtaiset kertoimet tunnusluvut (syrjäisimmillä alueilla) ja 95% luottamusvälit (CI) vastaavasti. Alueella neliöiden heijastaa tutkimuksen ominaispaino (käänteistä varianssi). Timantti edustaa yhdistettyä syrjäisimpien alueiden ja 95%: n luottamusväli. Vuonna suppilo tontti (B), kukin piste edustaa erillisessä tutkimuksessa. OR merkittiin Logaritmiasteikolla vastaan ​​tarkkuus (käänteisluku SE) jokaisen tutkimuksen.

Doi: 10,1371 /journal.pone.0077534.s006

(TIF) B Kuva S6.

Puun tontti (A) ja suppilo juoni (B) Bax-248 g polymorfismi yhdessä syövissä jälkeen poisjättäminen Irina A. Kuznetsova et al. (2012) tutkimuksessa.

metsä tontti (A), neliöitä ja vaakaviivat vastaavat tutkimuskohtaiset kertoimet tunnusluvut (syrjäisimmillä alueilla) ja 95% luottamusvälit (CI) vastaavasti. Alueella neliöiden heijastaa tutkimuksen ominaispaino (käänteistä varianssi). Timantti edustaa yhdistettyä syrjäisimpien alueiden ja 95%: n luottamusväli. Vuonna suppilo tontti (B), kukin piste edustaa erillisessä tutkimuksessa. OR merkittiin Logaritmiasteikolla vastaan ​​tarkkuus (käänteisluku SE) jokaisen tutkimuksen.

Doi: 10,1371 /journal.pone.0077534.s007

(TIF) B Kuva S7. Alueella neliöiden heijastaa tutkimuksen ominaispaino (käänteistä varianssi).